食管癌易感性与细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4基因多态性的关系

目的 探讨细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4(CTLA4)基因3个位点基因型及单倍型频率分布与食管癌易感性的关系.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,检测205例食管癌患者(男113例,女92例)和205例与病例组同性别、同年龄的正常对照者CTLA4基因第一外显子区+49A/G、启动子区-1661A/G和-1772A/G位点的基因型,采用条件Logistic回归模型分别进行基因多态性、单倍型与食管癌易感性的相关分析.结果 CTLA4+49位点基因型AG和AA均增加食管癌发病风险(P＜0.01,OR=2.280;P＜0.O1,OR=2.192).-1661位点AG基因型频率在病例组也高于对照组(P＜0.01,OR=1.848),而GG基因型在两组间分布差异无统计学意义(P＞0.05);-1772位点各基因型频率在病例组和对照组分布差异均无统计学意义(P＞0.05).单倍型分析显示AAG单倍型可增加食管癌的风险(P＜0.01,0R=5.035),而GAA单倍型则降低食管癌风险(P＜0.01,0R=0.413).结论 CTLA4基因+49A/G和-1661A/G位点基因多态性与食管癌易感性相关,单倍型分析进一步证实AAG单倍型为食管癌的危险因素,而GAA单倍型是其保护因素.     

肿瘤抑制基因HTPAP单体型构建及其与肝癌转移潜能的关系

目的探讨肝细胞癌(HCC)患者肿瘤组织DNA的HTPAP基因单体型与肝癌转移潜能的关系。方法提取864例HCC手术样本DNA,应用焦磷酸测序行SNPs检测,并予单体型构建,分析其与肝癌转移潜能的关系。构建HTPAP启动子单体型pGL3质粒,并分别转染MHCC-97H、HepG2肝癌细胞和正常的肝Hela细胞,分析不同HTPAP启动子单体型对基因转录活性的影响。结果共发现6个SNPs位点[-1053A/G、+64G/C、+357C/G、+1648-/TAAG(无插入和插入TAAG等位基因分别以T/G示,后同)、+1838A/G、+3528C/T]。单体型构建发现HTPAP中共存在11个单体型,其中AGCTAC、GCGGGT、AGCTGC、GCGGAT四种单体型占94.75%。临床病理特征分析提示单体型GCGGGT与高转移潜能正相关(P=0.0003)。启动子序列中两个SNPs(-1053AG和+64GC)存在完全LD,故只有三种启动子单体型(-1053AA/+64GG、-1053AG/+64GC GC和-1053GG/+64CC);双荧光报告法发现三种单体型的HTPAP启动子都具有显著转录活性,其中-1053AA/+64GG单体型启动子转录活性较-1053GG/+64CC和-1053AG/+64GC单体型启动子强,差异具有统计意义(P=0.005,0.009)。结论肿瘤转移抑制基因HTPAP的GCGGGT单体型与HCC高转移潜能正相关。HTPAP启动子单体型对基因的转录活性有显著影响并与术后复发密切相关,提示HCC中HTPAP的不同SNP单体型可能是潜在侵袭转移和复发预后的预测指标。     

非小细胞肺癌患者中肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体基因多态性及单倍型研究

目的 探讨肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)基因多态性及单倍型与非小细胞肺癌(NSCLC)的关系.方法 收集NSCLC患者592例,健康对照者636例,聚合酶链反应(PCR)扩增TRAIL目的基因后,直接测序检测TRAIL基因3’非编码区(G1525A/G1588A/C1595T)3种单核苷酸多态性,并做TRAIL单倍型分析.结果 与对照组比较,TRAIL G1525A突变等位基因(A)和基因型(GA+ AA)的频率在NSCLC组中明显降低(P＜0.01);NSCLC组TRAIL GI588A和C1595T两位点突变等位基因(A)和(T)的频率亦明显低于对照组(P＜0.01).进一步分层分析显示,Ⅰ期+Ⅱ期NSCLC患者中TRAIL C1595T突变等位基因(T)和(CT+ TT)基因型频率分别为47.89％和62.01％,Ⅲ期+Ⅳ期NSCLC患者中分别为58.80％和74.65％,两组差异均有统计学意义[优势比(OR)值分别=1.553和1.804,95％可信区间(CI):1.234 ～1.955和1.268～2.567,P＜0.01].Ⅲ期+Ⅳ期NSCLC患者中TRAIL G1525A突变等位基因(A)的频率为47.54％,较Ⅰ期+Ⅱ期NSCLC患者明显增加(40.75％,OR=1.318,95％ CI:1.658 ～1.047,P＜0.05).单倍型分析TRAIL基因(G1525A/G1588A/C1595T)3个位点紧密连锁,NSCLC组中AAT单倍型频率显著低于对照组(42.45％比58.23％,95％CI:1.525～2.824,P＜0.01);GAT单倍型频率在NSCLC组中明显增高(9.98％比0.21％,95％ CI:0.015～0.059,P＜0.01).结论 TRAIL(G1525A/G1588A/C1595T)基因多态性及单倍型与NSCLC的易感性密切相关.     

β-纤维蛋白原-455G/A基因多态性与胆囊癌的相关性研

目的 通过检测胆囊癌患者β-纤维蛋白原（Fgβ）-455G/A基因，探讨Fgβ-455G/A基因多态性与胆囊癌的相关性。方法 采集50 例胆囊癌患者（胆囊癌组）和50 例胆囊结石伴慢性胆囊炎患者（胆囊炎组）的静脉血，应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）方法对Fgβ-455进行基因分型。 结果 Fgβ-455 基因GA杂合型和AA纯合子在胆囊癌中的频率显著高于胆囊炎组，显著增加胆囊癌发生的危险性，OR值（95%CI）分别为2.526（1.052～6.068）和4.306（1.177～15.749）。结论 Fgβ-455G/A位点G/A单个碱基的改变可能在胆囊癌的发病中起着重要的作用。     

白介素-16基因多态性与膝关节原发骨性关节炎易感性韵关联研究

[目的]探讨白介素-16(IL-16)基因多态性与膝关节原发性骨性关节炎(OA)的易感关联.[方法]采用病例-对照研究,纳入95例中国汉族膝OA患者和95例年龄、性别匹配的健康对照者.用聚合酶链反应和限制性片段长度多态性等方法筛查IL-16基因的三个单核苷酸多态性(SNP)位点,并测序验证酶切结果.进行拟和优度x2检验、H-W平衡检验、连锁不平衡分析、单个位点和单倍型的非条件Logistic回归,分析IL-16基因多态性与膝OA的易感关联.[结果]三个SNP位点均符合H-W平衡.显性遗传模式非条件Logistic回归显示,rs11556218位点中,T/G基因型对膝OA可能有保护作用(OR=0.40,95%CI=0.21-0.73,P=0.008);rs4072111中,C/T可能增加发病风险(OR=1.98,95%CI=1.08-3.65,P=0.036).连锁不平衡分析提示rs11556218与rs4778889存在连锁不平衡(D'=0.625,r2=0.217),单倍型TTT可能增加发病风险(OR=2.42,95%CI=1.15-5.10,P=0.021),GCC可能减低发病风险(OR=0.43,95%CI=0.19-0.98,P=0.045).[结论]中国汉族人群中,IL-16基因的rs11556218、rs4072111、rs4778889位点的多态性可能与膝OA易感性相关.     

白介素-18基因多态性与结直肠癌易感性的关系

目的探讨白介素-18（m-18）基因单核苷酸多态性及其单倍型与结直肠癌易感性之间的关系。方法以170例结直肠癌患者和160名健康对照者为研究对象,应用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）的方法对IL．18基因-137G／C、-607C／A单核苷酸多态性进行基因分型,同时用SHEsis软件分析IL-18基因的连锁不平衡及单倍型频率。结果IL-18基因-607C／A多态性在结直肠癌患者和健康人群中的分布差异无统计学意义（P〉0．05）．而IL-18基因-137G／C多态性在两组人群中的分布差异有统计学意义（P〈0．05）。等位基因频率的相对风险分析显示．C等位基因携带者患结直肠癌的风险是G等位基因的1．814倍（OR=1．814,95％CI：1．246～2．642）。联合基因型分析显示,IL-18基因-137G／C、-607C／A单核苷酸多态性存在着强烈的连锁不平衡（ID＇｜=0．945）,-137C／-607A单倍型频率在结直肠癌患者中显著高于健康人群（P〈0．05）。-137C／-607A单倍型携带者显著增加了结直肠癌的发病风险（OR=1．637,95％CI：1．100～2．437）。结论IL—18基因-137G／C多态性和-137C／-607A单倍型与结直肠癌的发病具有相关性．其中-137C等位基因可能是结直肠癌的遗传易感基因。     

瘦素基因启动子区-2548 G/A多态性与胆囊胆固醇结石的相关性分析

目的探讨瘦素基因启动子区-2548 G/A功能多态性与胆囊胆固醇结石之间的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术对118例胆囊结石患者和53例正常对照人群进行瘦素基因启动子区-2548 G/A基因多态性分析,研究等位基因和基因型分布规律。结果瘦素基因启动子区-2548 G/A多态性在2组中的分布差异有统计学意义,胆囊结石组中AA+GA基因型频率明显高于对照组(2χ=4.251,P=0.039),AA+AG基因型患胆囊结石的风险是GG基因型的2.813倍(OR=2.813,95%CI=1.020～7.757)。等位基因频率在2组中分布也存在差异,胆囊结石组A等位基因频率明显高于对照组(2χ=5.791,P=0.016),A等位基因携带者患胆囊结石的风险是G等位基因携带者的1.777倍(OR=1.777,95%CI=1.110～2.844)。结论瘦素基因启动子区-2548 G/A功能多态性与胆囊结石易感性有关,A等位基因是胆囊结石发病的遗传易感基因,G等位基因是胆囊结石的保护基因。     

HES7基因多态性与先天性脊柱侧凸的关联分析

目的:探讨我国汉族人群HAITRY-AND-ENHANCER-OF-SPLIT-7(HES7)基因多态性与先天性脊柱侧凸(congenital scoliosis,CS)的关联性.方法:2005年9月～2007年5月在我院住院治疗的性别与年龄完全匹配的CS患者和非发育性畸形疾病患者(对照组)各123例,均为汉族,从外周血中提取基因组DNA.从美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库选取HES7基因rs3027279和rs1442849两个单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphisms,SNPs)位点,采用超高通量SNP分型系统对这两个位点进行基因分型,对检测的结果进行Hardy-Weinberg(H-W)平衡检验、卡方(X2:)检验、连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析、单位点非条件Logistic回归分析和多位点单倍型非条件Logistic回归分析,判断HES7多态性与CS易感性是否存在关联性.结果:两个SNP位点都具有多态性,且均符合H-W平衡.rs3027279位点中,C和A两种等位基因的频率在对照组和CS组间的差异具有显著性(X2=4.651,P<0.05);C/C和C/A两种基因型在两组间的差异具有显著性(X2=5.857,P<0.05).rs1442849位点中,A和G两种等位基凶在两组间的差异具有显著性(X2=7.963,P<0.05);G/G、G/A和MA 三种基因型在两组问的差异有统计学意义(X2=7.919,P<0.05).非条件logistic回归分析表明m1442849位点的A/A基因型对CS可能具有保护作用(P=0.018<0.05,OR=0.35.95%CI=0.17～0.74),而rs3027279位点的C/A基因型可能会增加CS的发病风险(P=0.015<0.05,OR=1.93,95%CI=1.13～3.30).LD分析示该两位点存在连锁不平衡关系(D'=0.923,r2=0.3812),单倍型非条件Logistic回归分析表明单倍型Hap3-GA可能会增加CS的发病风险(P=0.008<0.01,OR=2.14,95%CI=1.23～3.74).结论:中国汉族人群HES7的rs3027279和rs1442849两个位点存在多态性,该两个位点的多态性可能与CS的易感性有一定关联性.     

COX-2基因启动子区单核苷酸多态与肝癌遗传易感性的关系

目的 探讨COX-2基因启动子区的单核苷酸多态与肝癌发生风险的关系.方法 研究对象包括270例肝癌病人和540例正常对照.采用PCR-限制性片段长度多态方法 进行COX-2基因启动子区-1290A＞G,-1195G＞A和-765G＞C多态的基因型分析,不同基因型与单体型携带者发生肝癌的相对风险度的评估使用比值比(OR)及95%可信区间(CI).结果 多变量logistic回归分析显示-1195AA和-765GC基因型与肝癌风险增高相关,OR值分别为1.57(95%CI=1.01～2.44)和2.89(95%CI=1.65～5.08).单体型分析显示:与A_1290-G-1195-G_765相比较,含有-1195A等位基因的A-1290-A-1195-G-765和A-1290-A-1195-C-765两种单体型发生肝癌的相对风险增高,OR值分别为1.27(95%CI=1.01～1.60)和7.95(95%CI=1.76～36.02).同时包含-1195A等位基因和-765C等位基因的单体型发生肝癌的OR值较高.结论 COX-2基因启动子区的-1195G＞A和-765G＞C单核苷酸多态与肝癌遗传易感性相关.     

SLC2A9基因多态性与机体代谢及肾结石的相关性研究

目的:探讨葡萄糖易化转运蛋白9(SLC2A9)基因SNP位点多态性与机体生化代谢及肾结石的相关性和可能机制。方法:选择2015年1月～2017年12月在我院就诊的华东地区汉族人群肾结石患者300例(结石组)和健康志愿者300例(健康对照组),用聚合酶链式反应(PCR)扩增SLC2A9基因3个SNP位点(rs938552、rs1014290和rs4311316)序列,Sanger法测序扩增产物;同时检测结石组血清、尿液中钙、磷、尿酸等生化代谢指标。分析结石组与健康对照组中基因型分布差异以及结石组中不同基因携带者的血、尿电解质、尿酸等代谢水平的差异。结果:SLC2A9基因SNP位点rs938552存在多态性,其基因型分布在结石组和健康对照组之间比较差异有统计学意义(OR=0.341,95%CI:0.206～0.563,P0.01),携带有杂合型(C/T)和突变型(T/T)的人群患肾结石的风险是携带野生型(C/C)人群的2.933倍;结石组中C/C基因型者血尿酸、尿尿酸、尿钙均低于C/T+T/T基因型者,C/C基因型者尿pH值高于C/T+T/T基因型者,差异均有统计学意义(P0.05),其他代谢指标无统计学意义;C/C基因型与C/T+T/T基因型比较,后者结石的主要成分草酸钙和尿酸的比例明显高于前者(P0.05)。位点rs1014290和rs4311316在结石组和健康对照组基因型分布比较差异无统计学意义(OR=0.608,95%CI:0.364～1.014,P0.05;OR=0.641,95%CI:0.407～1.008,P0.05),其C/C基因型与C/T+T/T基因型比较,血尿生化及结石主要成分无统计学意义(P0.05)。结论:SLC2A9基因rs938552位点多态性与华东地区汉族人群患肾结石的风险有关联,SLC2A9基因rs938552位点可能通过调节尿酸和钙的代谢来影响结石的形成。     

广东汉族人群HBV基因型、基本核心启动子/前C区突变与肝癌易感相关性研究

目的研究广东汉族肝癌HBV基因型、基本核心启动子(BCP)/前C区突变与肝癌易感性的相关关系。方法按照病例对照研究设计方法,纳入HBV合并肝癌患者(病例组)100例和HBV携带者(对照组)100例,收集血清样本,提取HBV DNA,采用巢式PCR扩增HBV S区、BCP及前C区片段,双向测序,分析HBV基因型、BCP/前C区基因突变与HBV合并肝癌易感性的相关性。结果病例组BCP区A1762T/G1764A突变及前C区T1858C突变高于对照组,分别为92.0%和73.0%(P0.05)、52.0%和32.0%(P0.05);对照组A1775G突变发生率高于病例组,分别为31.0%和14.0%(P0.05)。多因素Logistic回归分析显示,HBV BCP区A1762T/G1764A突变和前C区T1858C突变与HBV合并肝癌发生独立相关[OR 6.508(95%CI:1.287~16.739,P0.05)和3.371(95%CI:2.268~8.163,P0.05)];而BCP区A1775G突变则为保护因素[OR=0.163(95%CI:0.043~0.489,P0.05)]。结论 HBV C基因型是广东深圳地区HBV合并肝癌的主要流行株,HBV BCP区A1762T、G1764A、A1775G、前C区T1858C基因多态性与HBV合并肝癌的易感性具有密切关系。     

止血带应用时间和手术时间对胫腓骨骨折术后深静脉血栓发生率的影响

目的探讨止血带应用时间和手术时间对胫腓骨骨折术后深静脉血栓的影响。方法回顾性分析自2014-07—2015-12诊治的胫腓骨骨折119例,记录手术过程中止血带应用时间和手术时间,分别比较止血带应用时间(A、B、C)3组及手术时间(X、Y、Z)3组术后深静脉血栓的发生率。结果在止血带应用上,A组50例中4例发生DVT,发生率8%;B组48例中6例发生DVT,发生率12.5%;C组21例中6例发生DVT,发生率28.5%,止血带应用时间3组两两比较无统计学意义(P0.05)。在手术时间上,X组42例中2例发生DVT,发生率4.7%;Y组50例5例发生DVT,发生率10%;Z组27例中9例发生DVT,发生率33.3%。Z组深静脉血栓的发生率高于X组和Y组,差异有统计学意义(χ2=10.01,P=0.002;χ2=6.41,P=0.010),X组和Y组比较,差异无统计学意义(χ~2=0.83,P0.05)。结论止血带的应用时间对胫腓骨骨折术后深静脉血栓的发生率无影响,但手术时间超过150 min明显增加了术后深静脉血栓的发生率。     

妇科疾病患者发生症状性下肢深静脉血栓和症状性肺栓塞的临床对比分析

目的寻找妇科疾病患者从深静脉血栓进展为肺栓塞的高危因素,识别可能直接发生肺栓塞的高危患者并及时加以预防,在避免过度治疗的同时降低肺栓塞的发生。方法复习单纯深静脉血栓、单纯肺栓塞以及深静脉血栓合并肺栓塞的妇科患者的临床资料。结果从2000年1月1日至2012年10月31日,共有87 587名妇科疾病患者住院。其中0.43‰发生深静脉血栓(深静脉血栓组38例),0.18‰发生肺栓塞(肺栓塞组16例),0.21‰发生深静脉血栓合并肺栓塞(深静脉血栓合并肺栓塞组18例)。3组之间,血清纤维蛋白原水平具有显著性差异(P=0.007)。肺栓塞组和深静脉合并肺栓塞组中,67.7%的患者疾病原发于卵巢、输卵管或腹膜。在深静脉血栓组,65.8%的患者疾病原发于子宫、阴道和外阴(P=0.009)。双下肢深静脉血栓更易触发肺栓塞(P=0.015)。多元回归分析显示,疾病原发灶位于卵巢/输卵管/腹膜(P=0.004,OR=3.985),体重指数25.0kg/m2(P=0.018,OR=1.239),和双侧深静脉血栓(P=0.017,OR=6.81)的患者更容易发生肺栓塞。凝血酶时间值越低,越容易术前发生血栓(P=0.004,OR=2.416)。结论原发疾病位于卵巢/输卵管/腹膜、体重指数25.0kg/m2或者双侧深静脉血栓是深静脉血栓基础上发生肺栓塞,或者直接发生肺栓塞的危险因素。     

肝细胞肝癌CDH1基因启动子C/A单核苷酸多态性与蛋白表达的关系

目的 探讨原发性肝细胞肝癌CDH1基因启动子-160位点的C/A单核苷酸多态性(SNP)与其蛋白表达的关系.方法 以34例肝癌手术病人为对象,DNA直接测序法检测其血液标本中CDH1基因启动子-160位点C/A SNP,免疫组化法检测组织标本中CDH1的蛋白产物--上皮钙黏素(E-cadherin)的表达情况,比较分析C/A SNP与E-cadherin表达的关系.结果 E-cadherin高表达组18例(52.9%),低表达组16例(47.1%),两组的基因型出现率CC与CA,AA比较差异均有统计学意义(P<0.05),CA与AA间差异无统计学意义(P>0.05),A、C等位基因频率在两组差异有统计学意义(P<0.05).结论 CDH1基因启动子-160位点的C/A SNP在肝癌E-cadherin表达中可能发挥重要作用,且A等位基因的出现与E-cadherin表达下调相关.     

白细胞介素-18基因启动子区单核苷酸多态性与慢性丙型肝炎患者干扰素应答关系的研究

目的 探讨白细胞介素18(IL-18)基因启动子区-607C/A和-137G/C位点的单核苷酸多态性(SNP)与慢性丙型肝炎患者干扰素(IFN)疗效间的关系.方法 选取2005年9月23日至2012年8月20日山西医科大学第一医院感染科收治的199例慢性丙型肝炎患者,另选取180名健康人群作为对照.199例患者均采用普通IFNα或聚乙二醇干扰素α(PegIFNα)联合利巴韦林治疗.应用聚合酶链反应(PCR)及限制性片段长度多态性(RFLP)方法检测2组人群IL-18基因启动子区-607 C/A及-137G/C位点的基因型,采用x2检验分析-607C/A和-137G/C位点的基因型和等位基因分布频率,及以上两个位点的SNP与IFN治疗后获得持续病毒学应答(SVR)之间的关系.结果 慢性丙型肝炎组中IL-18基因启动子区-137GG基因型和-137G等位基因的分布频率显著高于健康对照组(x2 =6.612和6.476,P=0.010和0.011),而-137GC基因型分布频率低于健康对照组(x2=5.548,P=0.019).-607位点为AA基因型的慢性丙型肝炎患者经IFN治疗后获得SVR率显著高于CA和CC基因型患者(x2 =4.195和5.230,P=0.041和0.022),且-607位点为A等位基因的患者获得SVR率显著高于C等位基因的患者(x2 =5.903,P =0.015).-137位点为GC基因型的患者获得SVR率显著高于GG基因型患者(x2 =5.869,P=0.015),且-137位点为C等位基因的患者获得SVR率显著高于G等位基因患者(x2=3.885,P=0.049).结论 IL-18基因启动子区-137位点G等位基因可能与HCV的遗传易感性有关.-607AA和-137GC基因型患者容易获得SVR,-607位点A等位基因及-137位点C等位基因有助于慢性丙型肝炎患者经IFN抗病毒治疗后获得SVR.     

细胞因子基因多态性与胃腺癌发生及其临床病理特点的关系

目的 探讨肿瘤坏死因子α（TNF-α）和白细胞介素6（IL-6）基因单核苷酸多态性（SNP）与胃腺癌合并或未合并幽门螺杆菌（Hp）感染的关系.方法 采用基因芯片技术检测130例胃腺癌患者（胃癌组）和142例健康对照人群（对照组）中TNF-α-238G/A,-308G/A和IL-6-597G/A,-174G/C,-572G/C位点多态性.同时应用酶联免疫吸附试验（ELISA）测定两组血清中Hp-IgG/IgM/IgA型抗体浓度.结果 胃癌组Hp的感染阳性率明显高于对照组（P＜0.01, 相对危险度[OR]=2.59）.TNF-α-238GA基因型和A等位基因频率,胃癌组明显高于对照组（P＜0.01,OR=2.44 ;P＜0.01,OR=2.13）;Hp阳性胃癌组明显高于Hp阴性胃癌（P＜0.05,OR=4.53 ;P＜0.01,OR=3.52）;低分化胃癌组显著高于高分化胃癌组（P＜0.05,OR=4.16）.胃癌组IL-6-572CC基因型频率明显低于对照组（P＜0.01,OR=0.17）.未见TNF-α和IL-6其他位点的SNP与胃癌组或Hp阳性胃癌组有任何相关性.结论 TNF-238GA基因型及其等位基因A与胃腺癌或感染Hp的胃腺癌易感性相关,而IL-6-572CC基因型则能降低胃腺癌易感性.     

云南红河地区哈尼族与昆明地区汉族Runx2基因多态性比较研究

目的 比较云南红河地区哈尼族与昆明地区汉族Runx2基因多态性。方法 将昆明医科大学第一附属医院120名汉族健康体检者作为汉族人群，云南省红河地区126名哈尼族作为哈尼族人群。应用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性 (PCR-IFLP)方法分析Runx2基因第一启动子P1-330G/T位点等位基因多态性，应用RT-PCR TaqMan SNP基因分型技术分析 Runx2基因第二启动子P2-1025T/C位点等位基因多态性，并测序验证基因型。采用超声测量仪测量研究人群右足跟骨的骨密度（BMD)。比较汉族人群和哈尼族人群在基因型分布和等位基因频率之间的差异，分析哈尼族人群BMD与影响因素之间的关系。结果 Runx2基因P1-330G/T位点GG、GT、TT基因型分布以及G、T等位基因频率，Runx2基因P2-1025T/C位点 TT、TC、CC基因型分布以及T、C等位基因频率在云南昆明地区汉族、云南红河地区哈尼族人群间无统计学差异（P > 0. 05)。 Runx2基因P1-330G/T位点GG和GT基因型，Runx2基因P2-1025T/C位点TC和TT基因型在哈尼族人群BMD正常和减低组间的差异有统计学意义(P <0.05)。Logistic回归分析显示，BMD与哈尼族人群Runx2基因P1-330 G/T位点、P2-1025T/C 位点、以及年龄因素的 OR 值和 95%CI 分别为：1.337，0.649 ~2.756;0. 132，0.024 ~0.710;1. 101，1.041 -1. 163。结论 云南红河地区哈尼族与昆明地区汉族Runx2基因P1-330G/T位点和P2-1025T/C位点的基因型分布以及等位基因频率无人群间差异和地域性差异。Runx2基因P1-330G/T位点和P2-1025T/C位点的基因型分布以及等位基因频率在云南省红河地区哈尼族人群BMD正常和减低组间存在显著差异。Runx2基因P1-330G/T位点与BMD无关，年龄是BMD的危险因素，Runx2基因 P2-1025T/C位点可能是BMD的保护因素，该位点的T等位基因可能是BMD的保护基因。     

IL-1基因多态性与胃腺癌发生的关系

目的:探讨白介素-1B(IL-1B)和白细胞介素-1RN(IL-1RN)基因多态性与胃腺癌及幽门螺杆菌(Hp)感染胃腺癌发生发展的相关性。方法:采用基因芯片技术检测130例胃腺癌患者和142例健康对照人群中IL-1B-31C/T、-511C/T位点单核苷酸多态性(SNP);以琼脂糖凝胶电泳检测IL-1RN基因多态性(VNTR),同时应用酶联免疫吸附试验(ELISA)测定了其血清中HP-IgG/IgM/IgA型抗体浓度。结果:感染Hp阳性率胃腺癌明显高于对照组(P=0.007,OR=2.53)。IL-1B-31TT频率,胃腺癌组明显高于对照组(P<0.05,OR=2.16),在低分化胃腺癌组明显高于高分化胃腺癌组(P<0.05,OR=6.55)。IL-1B-511TT基因型频率在胃腺癌组明显高于对照组(P<0.05,OR=1.81);在Hp阳性胃腺癌组-511TT基因型及T等位基因频率明显高于Hp阴性胃腺癌(P<0.05,OR=2.25及P<0.05,OR=1.78)。胃腺癌组T-T单体型频率显著高于对照组(χ2=4.56,P<0.05)。未见IL-1RN基因及IL-1B其他位点的SNP与胃腺癌组或Hp阳性胃腺癌组有显著相关性。结论:IL-1B-31TT基因型与胃腺癌特别是低分化胃腺癌易感性相关,IL-1B-511TT基因型与胃腺癌或感染Hp的胃腺癌易感性相关。T-T单体型可能是胃腺癌的遗传易感因素。     

结肠癌易感性与细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4的关系

目的:探讨细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4(CTLA-4)基因外显子49位点及启动子1661位点单核苷酸多态性(SNP)及临床病理参数与青岛地区人群结肠癌的发病的关系。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态分析(PCR-RFLP)检测来自青岛地区人群结肠癌患者及对照组中位CT-LA-4+49A/G,-1661A/G基因多态性的分布,并研究多态性与结肠癌临床病理参数的关系。结果:1)CT-LA-4+49A/G:与AA基因型携带者相比,AG及GG基因型人群罹患结肠癌的风险都显著增加(P=0.00),携带GG基因型罹患结肠癌的风险明显增加5.12倍,且男性、吸烟结肠癌患者携带AG及GG基因型明显增加;2)CTLA-4-1661A/G:以AA基因型为对照,AG+GG基因型携带者的患病风险显著增高,为对照组的2.50倍(P=0.001),多态性与结肠癌患者的性别、年龄、肿瘤分化程度及TNM分期无相关性。结论:CTAL-4+49A/G及-1661A/G基因多态性与结肠癌的遗传易感性相关,性别、吸烟与否也是影响因素。     

草酸钙尿石症患者肾组织γ-谷氨酰基羧化酶基因启动子序列分析及其活性研究

目的 分析草酸钙尿石症患者肾组织γ-谷氨酰基羧化酶(GGCX)基因启动子序列多态性,并探讨该序列变化对启动子活性的影响.方法 分别以42例草酸钙尿石症患者肾组织(尿石组)与31例非结石肾组织(肾肿瘤癌旁正常组织,对照组)基因组DNA为模板,PCR扩增GGCX基因5'-侧翼启动子区1329 bp片段(-1270～+58 bp),电泳鉴定后,分别对两组PCR产物测序.筛选差异启动子序列克隆至萤光素酶报告基因载体pGL3-basic,转染293细胞,双萤光素酶检测启动子活性.结果 与Emembl正常序列比较,尿石组启动子片段测序共发现4处变异位点,-804 bp处TT缺失(refsnp ID:rs11433794),-704 bp处A→G、-511 bp处A→G、-115 bp处T→C.其中尿石组rs1143794SNP发生明显高于对照组(P＜0.05).构建含rs11433794SNP位点的萤光素酶重组子pGL3-GGCX Promoter(804TT),与正常序列的重组子pGL3-GGCX Promoter比较,pGL3-GCA2X Pro-motet(804TF)转录活性明显下降(P＜0.01).结论 GGCX启动子区rs11433794 SNP位点可能与草酸钙尿石症发生存在一定关系,该SNP位点可导致启动子转录活性下调,导致GGCX基因表达下降.