基于网络药理学探究红花注射液治疗原发性痛经的作用机制

目的 基于网络药理学探究红花注射液治疗原发性痛经的作用机制.方法 利用网络药理学技术筛选红花注射液治疗原发性痛经的潜在活性成分及靶点,构建"活性成分-潜在靶点"网络和潜在蛋白互作网络.筛选核心靶标,并对潜在靶点进行GO分析、KEGG通路富集及与临近基因的富集分析.建立原发性痛经大鼠模型,考察红花注射液干预后相关通路蛋白...     

基于网络药理学及分子对接探讨圣愈汤治疗原发性痛经的作用机制

目的:通过网络药理学和分子对接对圣愈汤治疗原发性痛经的作用机制进行预测。方法:利用TCMSP数据库收集圣愈汤的活性成分并预测其靶点,通过GeneCards与OMIM数据库,获取与原发性痛经相关的靶点。通过STRING数据库构建PPI蛋白互作网络。对核心靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。采用AutoDock Vina软件进行分子对接验证,并用PyMOL软件展示其相互作用。结果:筛选得到圣愈汤作用靶点216个,原发性痛经相关靶点共646个。圣愈汤治疗原发性痛经共52个活性成分,34个药物-疾病共同靶点,其作用机制可能与流体剪切应力与动脉粥样硬化、RAGE、HIF-1等96条信号通路相关。分子对接结果显示槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇与VEGFA、PPARG、HMOX1对接良好。结论:圣愈汤活性成分可以通过镇痛、抗炎、免疫调节等方面,通过多条信号通路,改善组织缺氧状况及血管微循环状态,达到治疗原发性痛经的作用。     

基于网络药理学的真武汤治疗糖尿病肾病的潜在机制探索

目的:运用网络药理学及生物信息学方法对真武汤治疗糖尿病肾病(DN)的潜在作用靶点进行研究,探索真武汤多成分-多靶点-多途径-多通路治疗DN的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库(TCMSP)中筛选出真武汤中药物的活性成分,通过STITCH数据库预测作用靶点;同时应用GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库筛选DN疾病相关靶点,并对潜在作用靶点进行映射。利用STRING数据库进行蛋白互作网络分析,使用Cytoscape构建蛋白相互作用网络,采用DAVID数据库进行GO分析和KEGG信号通路富集分析。结果:筛选出真武汤中活性成分59个,预测潜在靶点95个;其中与DN疾病相关靶点54个;信号通路66条。结论:真武汤治疗DN具有多成分、多靶点、多途径、多通路的作用特点;其潜在作用机制极大可能是通过调控DN疾病发生及发展中的肿瘤坏死因子信号通路、结节样受体信号通路、NF-κB信号通路等过程对其进行干预及治疗。     

“香附-郁金”药对治疗乳腺增生病的药理机制

目的:应用网络药理学分析对“香附-郁金”药对治疗乳腺增生病的作用机制进行探讨与分析。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对香附、郁金的有效活性成分进行筛选,并提取其作用靶点,再利用GeneCards数据库获取乳腺增生病相关基因。映射疾病靶点与药物靶点,通过STRING在线数据库构建关键蛋白之间所产生的相互作用关系图;Cytoscape 3.8.0建立“药物-有效成分-作用靶点”网络图,并对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:共获得“香附-郁金”药对33个活性成分,包括异鼠李素、槲皮素、豆甾醇等,与疾病潜在靶点取交集后得到88个共同作用靶点,包括ESR1、EGFR、PGR等,GO分析得到104个分子功能、41个细胞组分和1262个生物过程,KEGG通路分析主要涉及119条通路,主要相关通路为PI3K/AKT信号通路。结论:“香附-郁金”药对治疗乳腺增生病多成分、多靶点协同发挥作用机制,可能通过调节人体内激素内分泌水平,从而发挥治疗乳腺增生病的作用,为临床应用奠定了良好的理论基础。     

基于网络药理学研究巴戟天抗抑郁的分子作用机制

目的运用网络药理学的方法探讨巴戟天治疗抑郁症的分子作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP数据库)筛选出巴戟天的活性成分和对应的作用靶点;利用GeneCard、OMIM等数据库筛选出抑郁症的潜在靶点;采用Cytoscape 3.6.1软件构建药物-成分-疾病-靶点的可视化网络;以STRING数据库对关建靶点构建蛋白互作网络分析;最后进行基因本体论(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果从巴戟天中筛选出有效成分20个,得到可作用于抑郁症的靶点22个。GO分析富集得到65个生物学功能,KEGG通路分析富集得到48条信号通路。结论巴戟天通过多靶点、多通路发挥对抑郁症的治疗作用,其作用机制可能与胆碱能突触、神经活性配体-受体相互作用、甲状腺激素信号通路、PI3K-Akt信号通路、雌激素信号通路等相关。     

基于网络药理学探讨温胆汤治疗高血压分子机制

目的运用网络药理学探讨温胆汤治疗高血压的分子机制。方法通过TCMSP和中医药整合药理学研究平台(TCMIP)筛选温胆汤的潜在活性成分和作用靶点,通过药物靶标数据库(TTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、GeneCards数据库收集高血压疾病靶点,STRING数据库进行蛋白相互作用分析,采用Cytoscape v3.7.1构建网络,再用ClueGO进行GO功能和KEGG通路富集分析,最后以适合的分子和靶点进行分子对接。结果共筛选出温胆汤141个潜在活性成分和108个潜在治疗靶点;通过cytoHubba中MCC算法筛选出排位前20的核心靶点,GO分析包含164条显著性条目,包括生物过程133条、分子功能24条、细胞定位7条。KEGG通路富集筛选出7条枢纽通路,且活性成分与靶点间对接良好。结论温胆汤可通过多途径、多靶点治疗高血压,可为其临床应用提供数据。     

穿心莲内酯对胰腺癌细胞顺铂敏感性的作用机制研究

目的：应用网络药理学分析对“香附-郁金”药对治疗乳腺增生病的作用机制进行探讨与分析。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）对香附、郁金的有效活性成分进行筛选,并提取其作用靶点,再利用GeneCards数据库获取乳腺增生病相关基因。映射疾病靶点与药物靶点,通过STRING在线数据库构建关键蛋白之间所产生的相互作用关系图;Cytoscape 3.8.0建立“药物-有效成分-作用靶点”网络图,并对关键靶点进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：共获得“香附-郁金”药对33个活性成分,包括异鼠李素、槲皮素、豆甾醇等,与疾病潜在靶点取交集后得到88个共同作用靶点,包括ESR1、EGFR、PGR等,GO分析得到104个分子功能、41个细胞组分和1 262个生物过程,KEGG通路分析主要涉及119条通路,主要相关通路为PI3K/AKT信号通路。结论：“香附-郁金”药对治疗乳腺增生病多成分、多靶点协同发挥作用机制,可能通过调节人体内激素内分泌水平,从而发挥治疗乳腺增生病的作用,为临床应用奠定了良好的理论基础。     

基于网络药理学和分子对接研究三仁汤治疗肺癌的分子机制

目的：采用网络药理学方法筛选三仁汤君药药对（SRJMP）的活性成分及核心靶点，探讨三仁汤君药药对治疗肺癌的作用机制。方法：依托中药系统药理学分析平台（TCMSP），检索三仁汤 3 味中药相关的所有化学成分及预测作用靶点，采用STRING 数据库与 Cytoscape 软件构建“药物-活性成分-靶点”网络和蛋白互作网络，通过 ClusterProfiler、ClueGO、DAVID 数据库对核心靶点进行基因本体（GO）分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集。把候选作用靶点映射在 KEGG 通路图上分析结果，最后应用 AutoDock 软件进行分子对接。结果：共筛选出 40 个活性成分和 222 个相应蛋白靶点。首要分析核心靶点47 个，GO 分析共包含 117 条富集结果，KEGG 通路富集筛选出 30 条通路。结论：通过网络药理学验证了 SRJMP 多成分、多靶点、多通路的特点，其可能是通过调控免疫细胞分化，肿瘤相关信号通路以及干预细胞代谢过程，达到抗肿瘤作用。     

基于网络药理学和分子对接研究淫羊藿治疗抑郁症的抗炎作用机制

目的:采用网络药理学方法预测淫羊藿治疗抑郁症的抗炎靶点及相关信号通路,探讨其抗抑郁作用的潜在机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库搜集和筛选淫羊藿的活性成分;利用PharmMapper服务器,TCMSP数据库对蛋白靶点进行预测和筛选;利用OMIM数据库,CTD数据库和GeneCards数据库筛选抑郁症的相关靶点以及抗炎靶点;通过DAVID数据库对关键抗炎靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用Cytoscape 3.6.0软件构建淫羊藿"活性成分-作用靶点-信号通路"网络图,并对网络拓扑结构分析;采用GOLD分子对接软件对活性成分与关键抗炎靶点进行结果验证。结果:筛选得到淫羊藿与抑郁症相关的12个活性成分,30个作用靶点,5个关键抗炎靶点;GO功能富集得到生物过程65个,细胞组成4个,分子功能1个,KEGG通路富集分析得到41条,其中与炎症相关的信号通路9个;分子对接验证淫羊藿苷与关键抗炎靶点能够形成最佳复合体。结论:揭示了淫羊藿通过抗炎靶点及其相关信号通路网络作用于抑郁症的分子机制,为进一步研究淫羊藿抗抑郁作用提供了基础。     

基于网络药理学的苓桂术甘汤治疗阿尔茨海默病的潜在作用机制研究

目的利用网络药理学技术研究苓桂术甘汤治疗阿尔茨海默病(AD)的潜在作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)、Swiss、SuperPred和Stitch数据库寻找与苓桂术甘汤中4味中药相关的化学成分及其作用靶点,并以口服利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为阈值对化合物进行筛选,再通过文献查找加以补充;通过OMIM、TTD、GAD、Pharm Gkb数据库获取与AD疾病相关的靶标,并进一步筛选得到苓桂术甘汤治疗AD的潜在作用靶点;采用DAVID6.8数据库对相关潜在作用靶点进行GO分析及KEGG代谢通路富集分析;利用Cytoscape软件构建"单味药-活性成分-作用靶点"相互作用网络并进行度值和中介度分析,确认可能的关键靶点和关键通路。结果在苓桂术甘汤中,共筛选出126个与AD相关的潜在活性成分和120个潜在作用靶点;GO生物功能分析共包含565条富集结果,其中生物过程396条,分子功能121条,细胞组成48条,主要涉及蛋白结合、细胞、氧化还原过程等;KEGG富集得到67条代谢通路,主要包括神经活性配体-受体相互作用通路、癌症通路、5-羟色胺能突触通路和钙信号通路等。结论网络药理学研究结果揭示了苓桂术甘汤治疗AD的多成分、多靶点、多途径的作用特点,并预测了其可能的活性成分、作用通路和关键靶点,为其药效物质基础和作用机制研究提供了理论基础。     

基于网络药理学预测定清片治疗白血病的潜在靶点及其机制研究

目的基于网络药理学,预测定清片治疗白血病的潜在靶点及其机制研究。方法应用TCMSP数据库筛选出本处方6味中药潜在活性成分,通过Drugbank、STITCH和DRAR-CPI数据库分析筛选作用靶点;从TTD、KEGG和DisGeNET数据库查询白血病疾病靶点;分别采用韦恩图取得交集,PPI数据库构建定清片和白血病的交互靶点调控功能;同时利用DAVID、KEGG、STRING分析平台进行GO分析和KEGG信号通路的富集。结果本研究共筛选出55个潜在的活性成分和与疾病映射后的43个靶点蛋白。处方中药物活性成分主要作用于RXRA、CASP3、ESR1、AR、RB1等靶蛋白,调控PI3K-Akt和JAK-STAT信号通路等,发挥治疗白血病作用。结论定清片可以通过阻滞细胞周期抑制肿瘤细胞增殖和促进细胞凋亡的多靶点-多途径干预治疗白血病。     

苗药定痛汤治疗偏头痛网络药理学研究

目的:基于网络药理学初步筛选苗药定痛汤治疗偏头痛的作用靶点并探索其可能的分子机制。方法:通过TCMSP筛选苗药定痛汤潜在活性成分和作用靶点,利用TTD、GeneCards、OMIM数据库整理偏头痛疾病靶点,STRING数据库进行蛋白互作分析,Cytoscape_v3.8.0构建药物-疾病-靶点多维网络,再利用DAVID、ClueGO进行GO功能和KEGG进行基因富集分析。结果:运用TCMSP、TTD、GeneCards、OMIM,共筛选出苗药定痛汤129个潜在活性成分,2712个疾病靶点,共获得69个交集基因作为潜在治疗靶点; GO分析包含生物学过程582个条目、分子功能60个条目,细胞组分64个条目。KEGG通路富集筛选出73条关键通路,发现其作用机制可能与P13K/Akt、MAPK、NF-κB、SIRT1等多条信号通路相关。结论:苗药定痛汤具有多成分、多靶点、多途径的作用特点,对该方的药理机制研究及进一步的临床应用具有指导意义。     

基于网络药理学探讨穿心莲治疗新型冠状病毒肺炎机制研究

目的:通过网络药理学方法探索穿心连治疗新型冠状病毒肺炎的作用靶点及分子机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选穿心莲的活性成分及相关的药物靶点,同时在GeneCards数据库筛选出新型冠状病毒肺炎的相关疾病靶点,交集基因即为穿心莲治疗新冠肺炎的核心靶点。随后利用Cytoscape3.7.2软件和String数据库构建药物活性成分-靶点网络和蛋白质相互作用关系的网络图。最后通过DAVID数据库对交集靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,并构建成分-靶点-通路图。结果:筛选出穿心莲的活性成分24个及作用靶点53个,新型冠状病毒肺炎的靶点259个,交集靶点14个。KEGG富集分析涉及通路17条,主要包括癌症、细胞凋亡、肌萎缩性侧索硬化症(ALS)、MAPK信号通路、神经营养蛋白信号通路等。结论:穿心莲中的多种活性成分可以通过介导多靶点、多通路发挥治疗新型冠状病毒肺炎的作用。     

基于网络药理学方法探讨六君子汤抗肺癌的作用机制

目的:基于网络药理学方法研究六君子汤抗肺癌的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库(TCMSP)获得LJS活性成分,采用Swiss Target Prediction平台预测活性成分的潜在靶点,并检索Online Mendelian Inheritance in Man等疾病靶点数据库,以获得LJS抗肺癌的作用靶点。借助String数据库和Cytoscape 3.2.1软件构建PPI网络,筛选degree值排名前10的靶点。采用Metascape平台对LJS抗肺癌作用靶点进行KEGG通路分析。结果:从LJS中筛选出178个活性成分,59个与LJS抗肺癌相关靶蛋白。KEGG通路富集结果显示其参与调节PI3K-Akt信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药、白介素17信号通路等信号通路。结论:LJS通过"多成分-多靶点-多通路"方式发挥抗肺癌作用。     

当归芍药散治疗原发性痛经作用机制探讨——基于网络药理学

目的:探讨当归芍药散治疗原发性痛经的作用机制。方法:在TCMSP平台筛选当归芍药散的活性成分与靶点,构建药物-成分-靶点网络进行分析;在OMIM、GeneCards、DrugBank数据库检索原发性痛经相关靶点;构建韦恩图得到共同靶点;在STRING数据库对共同靶点构建蛋白互作网络,用Cytoscape软件可视化处理并进行拓扑参数、cytoHubba、MCODE分析;使用Metascape数据库对共同靶点进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析。结果:经筛选,当归芍药散作用靶点共144个,原发性痛经相关靶点335个,共同靶点40个;蛋白相互作用degree的平均值为17.6,cytoHubba得分较高的关键靶点共10个,如PTGS2、ESR1、TP53、IL6、CXCL8等,MCODE分析共有3个模块;富集分析共涉及1 037个生物过程、19个细胞组分、68个分子功能及98条信号通路,如花生四烯酸代谢、雌激素信号途径、胆碱能突触、T细胞受体信号通路等。结论:当归芍药散治疗原发性痛经通过激素调节、中枢镇痛、炎症、免疫及细胞存活等方面发挥作用,具有多成分、多靶点、多通路的特点,为今后临床观察与实验研究提供理论参考。     

基于网络药理学和分子对接探讨肉苁蓉苯乙醇总苷对肝细胞癌的潜在分子机制

目的：通过网络药理学及分子对接技术,探讨肉苁蓉苯乙醇总苷(CPhGs)治疗肝细胞癌(HCC)的潜在分子机制。方法：应用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）等数据库及文献收集肉苁蓉苯乙醇总苷的活性成分及潜在作用靶点。通过TTD,GeneCards等数据库获得与HCC相关的疾病基因,得到药物靶点与疾病靶点的交集为肉苁蓉苯乙醇总苷治疗HCC的潜在作用靶点,将交集靶点导入蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,筛选关键靶点。将关键靶点导入DAVID数据库,进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最终,利用Autodock vina软件对筛选出的蛋白与肉苁蓉苯乙醇总苷活性成分进行分子对接。结果：肉苁蓉苯乙醇总苷中有29种活性成分及410个靶基因,涉及PI3K-AKT信号通路、癌症信号通路、癌症蛋白聚糖通路、VEGF信号通路等以发挥治疗HCC的作用。分子对接结果显示,筛选的靶点受体蛋白与活性成分具有较好的结合活性。结论：肉苁蓉苯乙醇总苷可能通过多组分、多靶点和多途径的方式调节癌细胞、血管生成等相关靶标和途径,从而对HCC产生治疗作用。     

基于“寒凝血瘀”关键病机理论探讨新加良附方治疗胃癌的网络药理学研究

目的:通过网络药理学方法探讨新加良附方治疗胃癌的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中获取高良姜、香附、穿山龙的有效成分及靶蛋白,通过Genecards、OMIM数据库筛选出胃癌的靶点,利用Venn软件获取共同靶点,使用Cytoscape3.7.2进行"化合物-靶点-疾病"的网络图构建。通过String数据库获取蛋白互作网络(PPI),最后进行GO功能、KEGG通路富集分析。结果:从新加良附方中筛选出高良姜素、槲皮素、木犀草素、薯蓣皂苷元等主要有效活性成分,作用于87个胃癌靶点,筛选出AKT1、MYC、CASP3、EGFR等关键靶点,并确定了PI3K-Akt信号通路、p53信号通路、Wnt信号通路等关键代谢信号通路,参与蛋白结合、转录因子活性、酶活性调节、受体活性等过程。结论:新加良附方通过多个靶点、多条通路发挥治疗胃癌的作用。     

基于网络药理学探讨肾衰饮治疗糖尿病肾病的作用机制

目的:根据网络药理学方法对肾衰饮治疗糖尿病肾病(DKD)的作用机制进行探讨。方法:利用中药分子机制生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)、中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对肾衰饮中有效成分进行筛选及靶点预测,检索GeneCards、TTD、DisGeNET数据库筛选DKD靶点,利用韦恩图在线平台筛选肾衰饮治疗DKD交集靶点,借助网络拓扑分析插件CytoNCA筛选五苓散治疗DKD核心靶点,使用Cytoscape 3.7.1建立化合物-疾病-靶点调控网络,基于DAVID数据库对核心靶点进行GO功能富集和KEGG信号通路富集分析。结果:基于BATMAN-TCM、TCMSP得到肾衰饮的178个有效成分和280个潜在靶点,筛选获得与DKD疾病发生、发展相关的靶点2 699个,借助网络拓扑分析插件CytoNCA筛选肾衰饮治疗DKD核心靶点31个,GO功能富集分析得到条目346个,其中生物过程条目278个、分子功能条目44个、细胞组成条目24个,主要包括氧化应激、脂质反应、生长因子受体结合、细胞因子受体结合、转录因子结合、血小板α颗粒等功能途径;KEGG信号通路富集分析得出条目101个,主要包括AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、FoxO信号通路、MAPK信号通路等通路途径。结论:基于网络药理学初步探讨并验证了肾衰饮治疗DKD多成分、多靶点、多通路的整体调节作用特点,预测了肾衰饮治疗DKD的潜在作用机制,以期为其活性成分研究与实验研究提供科学依据。     

基于网络药理学的四物汤治疗原发性痛经的作用机制研究

该文通过网络药理学研究预测四物汤治疗原发性痛经的多成分、多靶标、多途径作用机制,建立其"化合物-靶标-通路-疾病"的网络药理研究模式。利用网络药理学方法,针对已报道的四物汤活性成分,采用Swiss Target Prediction服务器依据反向药效团匹配方法预测四物汤活性成分靶标,并通过DrugBank,OMIM,TTD等数据库筛选出FDA批准的治疗原发性痛经靶标。通过对靶标的KEGG通路富集分析,采用Cytoscape软件构建四物汤"成分-靶标-通路-疾病"网络。网络分析表明,20个活性成分共涉及通路114条,预测出16个成分、16个靶标蛋白和24条通路与原发性痛经相关。四物汤可能通过作用于激素调节、中枢镇痛、解痉、炎症及免疫相关的蛋白靶标及通路,起到治疗原发性痛经的作用。该研究初步揭示了四物汤治疗原发性痛经的潜在活性成分及其可能的作用机制,为进一步的药效物质基础和作用机制实验研究提供了理论依据。     

基于网络药理学探究中药川芎治疗高血压的药理作用机制

目的:采用网络药理学的研究方法,探讨活血化瘀中药川芎治疗高血压的药理作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库(TCMSP)检索并筛选川芎的有效成分及其作用靶点,通过Gene Cards、OMIM等数据库检索与高血压相关基因,利用Cytoscape构建并合并活性成分-靶点网络和疾病-靶点网络,通过网络拓扑分析筛选核心靶点,并采用DAVID数据库进行关键靶点的GO分析和KEGG通路富集分析,探讨其治疗高血压的分子机制。结果:通过数据库筛选和文献查阅共得到川芎有效成分23个,得到川芎与高血压的交集靶点为41个;将这些靶点进行PPI网络分析,得到degree较大的14个靶点蛋白,表明它们是川芎治疗高血压的主要作用靶点;并且发现这些关键靶点与15条信号通路相关,分别是HIF-1信号通路、钙信号通路、VEGF信号通路、PI3K-Akt信号通路、c GMP-PKG信号通路、雌激素通路等。结论:本研究从网络药理学的角度初步揭示了川芎治疗高血压的分子机制,为其进一步的药效物质基础分析和分子机制研究提供一定依据。