胃癌患者唾液蛋白质组学分析

目的 应用差异蛋白质组学方法筛选唾液中与胃癌相关的蛋白质分子.方法 采用双向凝胶电泳(2-DE)分离胃癌患者和正常人群唾液总蛋白,从中选取差异表达蛋白质点,通过基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(MALD I-TOF-TOF-MS)鉴定差异表达的蛋白质;Western blot 验证蛋白质组学分析的结果.结果 通过两组人群唾液的双向凝胶电泳图谱分析发现15个差异蛋白质斑点,质谱鉴定出9种蛋白质,在胃癌患者唾液中高表达的有3个,其余6个在胃癌患者唾液中低表达.Western blot对表达增高的蛋白鸟嘌呤核苷酸解离抑制因子2(RhoGDI2)进行检测,结果与蛋白质组学分析结果一致.结论 蛋白质组学研究是筛选胃癌患者唾液中特异性标记物的有效手段.     

胃癌患者唾液蛋白质组学分析

目的 应用差异蛋白质组学方法筛选唾液中与胃癌相关的蛋白质分子.方法 采用双向凝胶电泳(2-DE)分离胃癌患者和正常人群唾液总蛋白,从中选取差异表达蛋白质点,通过基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(MALD I-TOF-TOF-MS)鉴定差异表达的蛋白质;Western blot 验证蛋白质组学分析的结果.结果 通过两组人群唾液的双向凝胶电泳图谱分析发现15个差异蛋白质斑点,质谱鉴定出9种蛋白质,在胃癌患者唾液中高表达的有3个,其余6个在胃癌患者唾液中低表达.Western blot对表达增高的蛋白鸟嘌呤核苷酸解离抑制因子2(RhoGDI2)进行检测,结果与蛋白质组学分析结果一致.结论 蛋白质组学研究是筛选胃癌患者唾液中特异性标记物的有效手段.     

蛋白质组学方法分析PRL-3功能相关蛋白

目的 蛋白质组学方法分析转染肝再生磷酸酶-3(PRL-3)后结肠癌细胞LoVo的蛋白表达改变.方法 构建绿色荧光蛋白载体PAcGFP-C3-PRL-3并转染至结肠癌细胞LoVo中,获得稳定表达GFP-PRL-3的结肠癌细胞LoVo-PRL-3.Western blot检测转染后细胞的PRL-3表达.采用双向凝胶电泳(2-DE)分离LoVo-PRL-3细胞及转染空载体PAcGFP-C3的LoVo-Control细胞总蛋白,从中选取差异表达蛋白质点,通过基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(MALD I-TOF-TOF-MS)鉴定差异表达的蛋白质.结果 Western blot结果显示PRL-3在LoVo-PRL-3细胞中高表达,而未检测到在LoVo-Control细胞中表达.通过双向凝胶电泳图谱分析发现20个差异蛋白质斑点,质谱成功鉴定出17种蛋白.与LoVo-Control细胞比较,10种蛋白在LoVo-PRL-3细胞中高表达,而7种蛋白在LoVo-PRL-3细胞中表达降低.结论 成功鉴定出PRL-3功能相关蛋白,为进一步研究PRL-3促进结直肠癌转移机制奠定基础.     

低分化胃癌患者血清中相关标志物的筛查和鉴定

目的 初步探讨蛋白质组技术在血清研究中的应用，建立低分化胃癌患者血清和健康者血清双向凝胶电泳图谱；筛查并鉴定低分化胃癌患者血清和健康者血清中的差异表达蛋白质，期望从中发现有意义的胃癌分子标志物。方法 采用双向凝胶电泳（2-DE）分离低分化胃癌患者血清和健康者血清总蛋白，银染显色，PDQuest软件分析，从中选取差异表达蛋白质，通过基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）鉴定差异表达的蛋白质。结果 获得重复性和分辨率较好的血清双向凝胶电泳图谱；鉴定得到6个仅在胃癌组血清中表达的蛋白质和4个仅在对照组血清中表达的蛋白质。结论 在低分化胃癌患者血清与健康者血清中存在差异表达蛋白质，利用蛋白质组学这一高通量的筛查技术可望从中发现与低分化胃癌相关的标志物。     

胃癌细胞甲硫氨酸依赖性的蛋白质组学研究

目的 应用蛋白质组学的技术筛选并鉴定与胃癌SGC-7901细胞甲硫氨酸依赖性相关的蛋白质.方法 将胃癌细胞株SGC-7901在同型半胱氨酸替代甲硫氨酸的培养液(M-H+)和正常培养液(M+H-)连续培养5 d后抽提细胞总蛋白,应用双向电泳与质谱技术筛选并鉴定差异表达的蛋白质,并用Western blot方法 进一步验证差异表达的蛋白质.结果 筛选并鉴定出10个差异表达的蛋白.这些蛋白质的功能主要涉及信号传导、抗氧化和药物代谢、细胞内蛋白运输等.结论 限制甲硫氨酸环境可能通过激活p38激酶信号传导通路、破坏胃癌细胞抗氧化防御机制及药物解毒功能来抑制肿瘤细胞生长.     

前列腺癌骨转移血清蛋白质组学研究

目的:应用蛋白质组学双向凝胶电泳和质谱技术筛选前列腺癌骨转移血清标志物。方法:收集前列腺癌伴骨转移、不伴骨转移各5例血清样本。血清样品用除白蛋白试剂盒除去血清中的白蛋白后进行双向凝胶电泳,ImageMaster 2D Platinum软件分析,有意义的差异蛋白质点行基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定。结果:双向凝胶电泳显示,前列腺癌骨转移组血清蛋白中有15个斑点与前列腺癌无骨转移组有显著差异,前列腺癌骨转移患者血清中10个蛋白质表达水平显著增加,5个蛋白质表达水平显著下降。5个差异蛋白点进行胶内原位酶解,肽质量指纹图谱分析成功得到了3个蛋白质肽质量指纹图谱,并查询数据库初步鉴定了该3个蛋白质分别为锌α2糖蛋白、结合珠蛋白和载脂蛋白CⅢ。结论:双向凝胶电泳结合质谱鉴定是血清差异蛋白质组学研究的可靠平台和有力工具。所鉴定出的蛋白质与前列腺癌骨转移的发生、发展有关,可能是前列腺癌骨转移潜在的血清标志物。     

SM22蛋白在结肠癌组织中的表达

目的 通过比较结肠腺癌与正常结肠黏膜的蛋白质组表达差异,寻找结肠腺痛相关的蛋白质.方法 运用蛋白质组学技术,对8例结肠腺癌组织和8例正常结肠黏膜组织进行胶内差异双向电泳(2-D),选择差异表达超过2倍的蛋白质进行MALDI-TOF/TOF质谱分析和生物学信息分析,并对结肠癌组织中表达下调的蛋白SM22进行Western blot验证.结果 成功建立结肠腺癌和正常结肠黏膜的双向凝胶电泳图谱,结肠腺癌和正常黏膜组织凝胶电泳图谱中平均蛋白质斑点数分别为3289和3122,其中表达差异超过2倍的斑点共有22个,质谱分析和数据库检索共鉴定出14种蛋白质,包括keratin 8、S100A6、protein disulfide isomerase、SM22等.从功能分析,这些差异蛋白与癌细胞的发生、增殖、分化、转移等相关;SM22在结肠癌组织中的表达水平Western blot结果与电泳结果一致.结论 蛋白质组学能提示结肠腺癌与正常组织间的蛋白质表达差异,SM22在结肠癌组织中表达下降,可作为结肠癌组织的分子标记物.     

大鼠肝移植急性排斥反应的淋巴细胞蛋白质组学研究

目的 利用差异蛋白质学寻找肝移植急性免疫排斥反应相关功能蛋白.方法 选取SD大鼠与Wistar大鼠,建立大鼠同种异体肝移植的动物模型(急性排斥组)和大鼠同基因移植的动物模型(对照组);使用组织化学方法 对移植肝脏进行形态学观察;利用ELISA检测受体血清细胞因子;通过双向凝胶电泳分离急性排斥组和对照组肝移植后受体大鼠脾脏的淋巴细胞蛋白质,通过软件比较两组蛋白质的质纹图谱,进行差异点分析;选取差异点用基质辅助激光解析-飞行时间质谱进行蛋白鉴定;选取部分鉴定蛋白通过Western blot法进行检测,验证蛋白质组学的分析结果 .结果 ELISA检测结果 表明,移植术后3 d同种异体肝移植大鼠血清中IL-2和IFN-γ的表达上调;急性排斥组肝组织HE染色切片证实均有Ⅱ a～Ⅱ b级(Banff标准)排斥反应表现;差异蛋白质组学分析共鉴定出25个淋巴细胞蛋白质在急性排斥反应中的表达量发生了改变,其中13个蛋白点表达上调,12个蛋白点表达下调;Western blot法验证结果 显示,其中的2个相关蛋白(β-actin和碳酸酐酶)在急性排斥反应中的表达量变化与差异蛋白质组学分析结果 一致.结论 本实验筛选出25个大鼠肝移植急性排斥反应的相关功能蛋白,其中的β-actin和碳酸酐酶在排斥反应中有重要功能,为进一步系统研究这一免疫学现象奠定了基础.     

蛋白质组技术在胃癌相关标志物筛查中的应用

目的 建立胃癌组织和正常胃组织双向凝胶电泳图谱，鉴定差异表达蛋白，从中发现有意义的胃癌相关标志物。方法 采用双向凝胶电泳（2-DE）分离胃癌组织和正常胃组织总蛋白，银染显色，PDQuest软件分析，从中选取差异表达蛋白质点，通过基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）或MALDI-TOF-TOF-MS鉴定差异表达的蛋白质。结果 获得重复性和分辨率较好的胃组织双向凝胶电泳图谱；发现23个差异表达蛋白质，其中15个得到鉴定，在肿瘤组织中高表达的有10个，其余5个在肿瘤组织中低表达。结论 建立了胃癌组织和正常胃组织双向凝胶电泳图谱，并应用质谱技术鉴定了15个差异表达蛋白质。     

胰腺癌组织中差异表达蛋白的筛选与鉴定

目的:筛选并鉴定胰腺癌组织中的差异表达蛋白,并探讨其临床意义。方法:应用双向凝胶电泳技术对12对胰腺癌组织和癌旁组织样品进行分析,筛选出差异表达蛋白质;应用MALDI-TOF-MS/MS技术对差异表达蛋白质进行鉴定。结果:优化的胰腺组织双向凝胶电泳技术具有良好的分辨率和可重复性;应用双向凝胶电泳技术筛选出胰腺癌组织中30个差异表达蛋白质;应用MALDI-TOF-MS/MS技术鉴定了胰石蛋白、钙囊素、热休克蛋白B6等24个蛋白质,其中15个蛋白质在胰腺癌组织中表达上调,9个蛋白质表达下调。结论:双向凝胶电泳、生物质谱等蛋白质组学技术在胰腺癌的基础研究中有重要价值和应用前景,有助于筛选蛋白标志物和阐明分子发病机制。胰腺癌组织中有多个异常表达蛋白质,这些蛋白质与胰腺癌的发生相关,可能成为胰腺癌蛋白标志物和药物治疗的靶蛋白。     

胃癌基因表达谱和蛋白质表达谱的分析研究

目的从转录组水平和蛋白质组水平寻找胃癌组织与正常胃组织间的差异表达基因和蛋白。方法应用含有14592个已知基因及表达序列标签的cDNA表达谱芯片获取基因表达谱信息．50％以上样本中Cy3／Cy5荧光强度比大于或等于2和小于或等于0．5的基因分别为在胃癌中表达上调或下调的基因。采用双向凝胶电泳（2-DE）分离32例经手术切除的胃癌患者的胃癌组织和正常胃组织总蛋白．对差异表达蛋白质点利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI—TOF—MS）进行分析．获取肽质量指纹图谱（PMF）。同时搜索SWISS-PROT数据库鉴定蛋白质。结果与正常组织相比．胃癌组织中差异表达基因共有387个,其中表达上调的有149个基因．上调超过3倍的有29个基因：表达下调的有238个基因．其中下调超过5倍的有21个基因。在蛋白质水平鉴定了15个差异表达蛋白．在肿瘤组织中高表达的有10个．其余5个在肿瘤组织中低表达。胃癌中过表达的基凶与蛋白产物主要与细胞骨架运动、细胞增殖及信号传导有关．表达下调的则主要与细胞免疫防御、毒理代谢有关。结论从转录组水平和蛋白质组水平对胃癌基因表达谱进行分析．不仅有助于从分子水平全方位理解胃癌的发病机制及生物学特性．同时也有助于进一步发现新的胃癌相关标志物和基因治疗的靶点。     

Identification of a novel prostate cancer-associated tumor antigen

BACKGROUND: The identification of antigens that distinguish cancer cells from normal cells is of major importance for the definition of therapeutic targets in human malignancies. Using sera from cancer patients, we have previously reported on the identification of immunologically recognized proteins that belong to the family of cancer testis antigens (CTAs). METHODS: A normal testicular cDNA library was screened with pooled allogeneic sera from patients with prostate cancer using a modified SEREX approach. Subsequently we have identified and characterized a novel antigen, T21, with an expression pattern similar to that of CTAs. mRNA expression of T21 was determined using a panel of whole tissues and prostate cell lines using Q-RT-PCR. For laser microdissection, fresh prostate cancer and benign tissue was obtained using our novel validated harvesting technique. Protein expression and cellular localization of T21 were assessed in prostate cell lines using Western blotting, confocal microscopy and flow cytometry. RESULTS: T21 showed tissue-restricted mRNA expression in gastric, kidney and prostate cancers, and in normal testis and prostate tissues. Following laser microdissection, T21 was significantly over-expressed in malignant compared to benign prostatic epithelium. We have demonstrated expression of T21 at the protein level and confocal microscopy on PC3 cells probed with a T21-monospecific antibody revealed cytoplasmic localization of T21 protein. CONCLUSIONS: The highly restricted expression pattern of T21 makes it an attractive vaccine target for prostate cancer. Several CTAs reportedly induce cytotoxic T-lymphocyte responses, therefore it is reasonable to assume that T21 will be a valuable target for cancer immunotherapy.     

利用二维胶内差示凝胶电泳技术检测胃癌的血清学肿瘤标记物

目的 分离胃癌、胃溃疡、正常人之间的差异蛋白质,检测胃癌的血清学肿瘤标记物.方法 从定量比较蛋白质组分析入手,利用二维胶内差示凝胶电泳技术(2D-DIGE)分离包括胃癌、胃溃疡和正常人共27例血清样本,以基质辅助激光解吸附电离串联质谱对差异蛋白点进行检测,检索Mascot数据库.结果 共检测出14个差异表达蛋白.正常人和胃溃疡比较有3种差异蛋白质,2种被鉴定出;胃溃疡和胃癌比较发现1个下调的蛋白质;胃癌与正常人中发现10个差异表达蛋白质,6个点在胃癌患者血清中上调.结论 2D-DIGE技术是一项有效的筛选胃癌患者血清中差异蛋白的技术手段,检测出的蛋白质有可能成为胃癌诊断的分子标记物.     

胃癌细胞多药耐药相关蛋白质筛选鉴定的蛋白质组学研究

目的 在胃癌细胞株SGC7901及稳定的耐药细胞株SGC7901/VCR中寻找与胃癌多药耐药(MDR)直接相关的蛋白质,观察其功能.方法 胃癌细胞株SGC7901和稳定的耐药细胞株SGC7901/VCR培养后提取总蛋白,采用蛋白质组学技术(双向凝胶电泳和基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱鉴定)筛选并鉴定差异表达的蛋白质,并应用蛋白印迹试验法对鉴定出的部分蛋白质在胃癌细胞株中的表达进行验证.结果 在两种细胞株中找到表达差异明显的蛋白质点9个,经质谱分析,7种蛋白质得到鉴定,为S60核糖体蛋白L23、电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1、锌指蛋白394、角蛋白Ⅰ型细胞骨架9、核糖核酸3'-端磷酸化酶1、matrin型锌指蛋白2、Sideroflexin-1.这些蛋白质与胃癌MDR直接相关.蛋白印迹试验法检测部分蛋白质在胃癌细胞株中的表达,与蛋白质组学所得结果一致.结论 胃癌细胞SGC7901和SGC7901/VCR蛋白质表达存在差异.

Abstract：

Objective To investigate multidrug resistance related proteins in human gastric carci noma cell lines SGC7901 and SGC7901/VCR by comparative proteomics.Methods After culture,the holoproteins of human gastric carcinoma cell lines SGC7901 and GC7901/VCR were extracted,and then measured by two-dimensional gel electrophoresis and matrix assisted laser desorption/ionization time-offlight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS).Some proteins obtained through proteomics were tested by Western blotting in the cell lines.Results There were different proteins in these 2 human gastric carcinoma cell lines.Nine different protein spots were found in these 2 gastric carcinoma cell lines,and 7 spots were identified by MALDI-TOF-MS,and these proteins were 60S ribosomal protein L23 ( RL23),voltagedependent anion-selective channel protein-1 (VDAC1),zinc finger protein (ZNF) 394,keratin,type Ⅰcytoskeletal 9 ( KIC9),RNA 3' -terminal phosphate cyclase 1 ( RTC1 ),zinc finger matrin-type protein 2,Sideroflexin-1.These proteins had a direct relationship with multidrug resistance in gastric carcinoma.Results of Western blotting about protein expression were in consonance with those of proteomics.Conclusion Different proteins were found in human gastric carcinoma cell lines SGC7901 and SGC7901/VCR.     

外周血中hMAM表达与乳腺癌微转移关系的研究

目的 研究乳腺癌患者外周血中人乳珠蛋白(hMAM-mRNA)的表达与乳腺癌微转移的关系.方法 以MCF-7乳腺癌细胞为阳性对照,利用Nested-RT-PCR技术检测92例乳腺癌术后患者、20例乳腺良性肿瘤患者、10例其他系统恶性肿瘤患者、10例正常人群外周血hMAM-mRNA表达情况.结果 hMAM-mRNA仅在乳腺癌患者外周血中表达.92例乳腺癌患者外周血中hMAM-mRNA表达率为43.5%(40/92),hMAM-mRNA在外周血中的表达与ER、PR状态,患者月经状况,肿瘤大小无关.与HER-2、CEA、CA15-3在外周血中是否阳性表达及患者年龄相关.与腋窝淋巴结转移状况密切相关.结论 外周血中hMAM-mRNA检测是乳腺癌血微转移可供参考的临床指标.