重庆地区汉族人群MDR1基因单核苷酸多态性及单倍型分析

目的：研究重庆地区汉族人群多药耐药基因1（MDR1）C1236T,G2677A/T,C3435T单核苷酸多态性（SNP）及单倍型的频率.方法：采用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性（PCR-RELP）方法,对重庆地区196（男112,女84）名没有亲缘关系的汉族健康个体MDR1基因C1236T,G2677T/A,C3435T等3个SNPs位点进行基因分型.用SHEsis软件分析MDR1基因的连锁不平衡及单倍型频率.结果：重庆地区汉族人群中C1236T位点、等位基因频率1236C为33.7%,1236T为66.3%;G2677T/A位点、等位基因频率2677G为44.4%,2677T为43.1%,2677A为12.5%;C3435T位点、等位基因频率3435C为56.4%,3435T为43.6%.重庆地区汉族人群中MDR1基因1236-2677-3435位点构成的3种主要单倍型率（频率〉10%）TTT为31.1%,TGC为21.7%,CGC为15.5%.结论：重庆地区汉族人群MDR1基因C1236T,G2677T/A,C3435T等3个SNPs位点的基因型频率、等位基因频率和单倍型频率,为研究该地区MDR1基因单核苷酸多态性与药物效果、药物毒副作用以及疾病易感性之间的相关性提供依据.     

MDR1基因多态性与急性髓细胞白血病化学疗法结果的相关性研究

目的研究多药耐药基因（MDR1）12外显子C1236T、21外显子G2677T／A、26外显子C3435T基因多态性与急性髓细胞白血病（AML）化疗预后相关性。方法本研究纳入44位AML患者,采用聚合酶链反应．限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法以及直接测序的方法分析了患者MDR1第12、21、26位点基因型,并在诱导化疗第一疗程结束后进行骨髓形态学检查,结合临床指标判断患者是否完全缓解。Χ^2分析MDR1各等位基因的分布是否符合Hardy-Weinberg平衡,完全缓解（CR）率与临床特征的相关性使用Χ^2分析或Fisher＇S精确检验。结果中国人C1236T、G2677T／A和C3435T基因突变发生频率与其他种族相比差异有统计学意义,中国健康人以上三个位点基因型发生频率与急性髓细胞白血病患者相比差异无统计学意义。初发AML患者外周血白细胞数量与CR率有显著相关性（Χ^2=7．207,P=0．007）;MDR1C1236T及C3435T基因多态性与CR率无显著相关性（P=0．349,P=0．074）;MDR1G2677T／A多态性与CR率有显著相关性（Χ^2=6．214,P=0．045）,携带G／G基因型患者与非G／G基因型患者相比CR率较低（Χ^2=6．142,P=0．013）;携带MDR1C3435TC／T基因型患者与携带非C／T基因型患者相比CR率较低（Χ^2=3．991,P=0．046）,同时显著低于T／T基因型患者（Χ^2=5．134,P=0．023）。结论MDR1外显子12、21、26基因型发生频率存在种族差异,AML患者以上三个位点基因型发生频率与健康人相比差异无统计学意义。G2677T／A基因多态性可以作为预测AML患者第一疗程是否CR的预测因素,为个体化给药提供理论基础。     

溃疡性结肠炎激素敏感性与多药耐药基因多态性的相关性研究

目的探讨溃疡性结肠炎患者激素治疗敏感性与多药耐药基因(MDR1)多态性之间的相关性。方法研究对象为入院治疗的86例溃疡性结肠炎患者,根据入院时的病史采集将86例患者分为3组:溃疡性结肠炎患者初诊组30例、溃疡性结肠炎患者激素治疗敏感型组30例、溃疡性结肠炎患者激素治疗耐药型组26例。采用序列特异性聚合酶链反应(PCR-SSP)进行基因多态性分析,测定86例溃疡性结肠炎患者MDR1基因C3435T位点及G2677T/A位点的基因型频率和等位基因频率,并进行统计分析。结果溃疡性结肠炎患者激素治疗耐药型组与初诊组C3435T位点CC、CT、TT基因型的差异具有统计学意义,激素治疗耐药型组与激素治疗敏感型组C3435T位点CC、CT、TT基因型的差异也具有统计学意义。3组患者C3435T位点等位基因频率的差异均无统计学意义。而对于MDR1基因G2677T/A位点,各组基因型的差异及G、T、A等位基因频率的差异均无统计学意义。结论溃疡性结肠炎患者激素治疗耐药型与MDR1基因C3435T位点多态性之间存在相关性,该位点基因突变型患者更易出现激素耐药。     

多药耐药基因1 C1236T多态性与癫痫患者对药物反应性的相关性

目的 了解多药耐药基因1(MDR1) C1236T多态性在癫痫患者中的分布,并探讨其与癫痫患者耐药的相关性。方法 选择70例难治性癫痫患者及88例对抗癫痫药物敏感的癫痫患者,提取其外周血DNA,应用多聚合酶链反应（PCR）扩增后继以限制性内切酶片断长度多态性（RFLP）分析,检测基因MDR1的第12个外显子中C1236T的多态性。结果 两组病例的基因型频率和等位基因频率相比较,差异均无统计学意义（P＞0.05）。结论 MDR1C1236T多态性与癫痫患者对抗癫痫药物反应没有相关性。     

多药耐药基因1C3435T多态性对汉族儿童外周血单个核细胞mRNA表达的影响

目的 探讨多药耐药基因1(multidrug resistance gene 1,MDR1)C3435T多态性与健康汉族儿童外周血单个核细胞中mRNA表达的关系.方法 以130例(男性83例,女性47例)无亲缘关系的中国健康汉族儿童为研究对象,采用PCR-RFLP技术检测其MDR1基因C3435T位点的基因型,实时荧光定量PCR法检测其外周血单个核细胞中MDR1 mRNA表达水平.结果 130例儿童中,51例为CC型,63例为CT型,16例为TT型,基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);CC、CT、TT各基因型组间外周血单个核细胞MDR1 mRNA表达水平差异无统计学意义(P>0.05).结论 汉族儿童中MDR1基因C3435T多态性对外周血单个核细胞中mRNA表达无显著性影响.汉族儿童C3435T位点多态性不能作为推测MDR1表达水平的依据.     

脑腓呔基因单核苷酸多态性与阿尔茨海默病相关性研究

目的探讨浙江地区汉族人群脑腓呔基因159C／T多态性与晚发性阿尔茨海默病（AD）的相关性。方法采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）技术检测141例AD患者（AD组）和145例健康体检者（对照组）脑腓呔基因159C／T位点多态性,并分析基因与疾病的相关性。结果两组脑腓呔159C／T等位基因频率及基因型构成差异无统计学意义（P〉0.05）。两组女性等位基因和基因型的分布频率差异有统计学意义（χ^2=7．717、8968,P〈0．05或0.01）C／C基因型与AD患病相关。结论脑腓呔159C等位基因的多态性及C／C基因型可增加女性患者AD的风险;推测脑腓呔与雌激素有一定的相互作用。     

中国汉族、维吾尔族和哈萨克族人MDR1-C3435T基因多态性研究

目的 了解MDR1-C3435T的基因多态性在汉族、维吾尔族和哈萨克族健康人群中的分布差异,为临床用药提供参考.方法 用PCR-RFLP的方法检测汉族、维吾尔族和哈萨克族MDR1-C3435T等位基因突变位点的分布情况.计算各民族基因型频率,并与已报道的其他民族的基因型频率和等位基因频率进行比较.结果 MDR1-C3435T基因在汉族、维吾尔族和哈萨克族三个民族中最常见的等位基因是MDR1-3435T,频率依次为汉族43.3％、维吾尔族58.0％和哈萨克族56.9％.等位基因MDR1-3435T在汉族中的发生频率显著低于维吾尔族和哈萨克族,而突变频率在维吾尔族和哈萨克族之间则无明显差异.汉族的基因突变发生频率与其他亚洲人相似,与高加索人差异显著;而维吾尔族和哈萨克族的发生频率介于亚洲人和高加索人之间.结论 汉族、维吾尔族和哈萨克族的MDR1-C3435T基因型分布有明显的差异,对临床用药将产生显著影响.     

肺表面活性蛋白D基因多态性与RSV毛细支气管炎的关系

目的探讨杭州地区肺表面活性蛋白（surfactant protein,SP）-D基因变异是否与儿童呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus,RSV）毛细支气管炎易感性有关。方法采用MGB测序法检测150例RSV毛细支气管炎和150例健康对照组SP-D基因2个位点的多态性,并进行基因型、等位基因型频率分析。各组的基因型、等位基因型频率比较采用χ2检验。结果病例组SP-D Met11Thr位点TT、CT、CC三种基因型频率分别为7.3%、44.0%、48.7%,T、C等位基因频率分别为29.3%、70.7%。三种基因型及等位基因频率与对照组比较差异有统计学意义（χ^2=6.751、5.823,P〈0.05）。SP-D Ala160Thr位点AA、GA、GG三种基因型频率分别为4.0%、29.3%、66.7%,A、G等位基因频率分别为18.7%、71.3%,2组基因型及等位基因频率与对照组比较无统计学意义（χ^2=0.182、0.181,P〉0.05）;但该位点A、G等位基因在轻中度和重度患儿间的差异有统计学意义（χ^2=3.954,P〈0.05）,携带A等位基因的个体患重度RSV毛细支气管炎的风险升高。结论杭州地区汉族儿童存在SP-D基因多态性,SP-DMet11Thr位点与RSV毛细支气管炎疾病易感性存在关联,C等位基因可能是易感基因;而SP-D Ala160Thr位点与RSV毛细支气管炎疾病易感性未存在关联。SP-D Ala160Thr等位基因A可能是影响RSV毛细支气管炎严重程度的一个候选基因。     

内蒙古地区汉族新生儿呼吸窘迫综合征与SP-B 1580位点基因多态性的相关性研究

目的 研究肺表面活性物质蛋白B（SP-B）基因1580位点与内蒙古地区汉族新生儿呼吸窘迫综合征（NRDS）的关系.方法 采用前瞻性研究方法,选择100例汉族NRDS患儿（病例组）与100例汉族正常新生儿（对照组）作为研究对象,应用PCR基因分析技术检测SP-B 1580位点基因多态性,分析多态性与NRDS的关系.结果 内蒙古地区汉族SP-B 1580位点基因型均可检出3种基因型：即TT、CT及CC型.汉族NRDS组此3种基因型频率分别为：9.0％、27.0％和64.0％,T等位基因频率为19.5％,C等位基因频率为80.5％.汉族正常对照组3种基因型分别为13.0％、40.0％和47.0％,T等位基因频率为33.0％,C等位基因频率为67.0％.汉族NRDS组SP-B 1580位点基因型以C等位基因分布频率显著增高,关于SP-B 1580位点基因多态性汉族NRDS组与汉族正常对照组相比有统计学差异（x2=5.499,P=0.019）.结论 内蒙古汉族新生儿SP-B基因型及等位基因频率在不同性别、出生体质量、胎龄、生产方式等无明显关联;SP-B 1580C等位基因可能是内蒙古地区汉族新生儿患RDS的易感基因之一.     

宁夏回、汉族人群MTHFR基因多态性与冠心病的关联性研究

目的研究宁夏回、汉族亚甲基四氢叶酸还原酶（MTHFR）基因C677T多态性与冠心病之间的关系。方法对回、汉族186例冠心病患者和175例对照者,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法（PCR—RFLP）分析检测MTHFR基因C677T多态性。结果回、汉族冠心病组和对照组MTHFR C677T CC、CT、TT三种基因型分布（回族,χ^2=5．523,P=0．063;汉族,χ^2=3．810,P=0．149）和等位基因频率分布（回族,χ^2=0．000,P=0．984;汉族,χ^2=1．366,P=0．243）差异无统计学意义;冠心病组和对照组内回、汉不同民族基因型分布和等位基因频率分布差异亦无统计学意义。结论亚甲基四氢叶酸还原酶基因MTHFR C677T存在多态性,回、汉族间差异无统计学意义。     

多药耐药基因多态性及其表达物与抗癫痫药疗效的相关性研究

目的研究癫痫患者外周血中多药耐药基因(MDR1)C3435T位点基因多态性及其表达物与患者血药浓度及疗效的相关性。方法选取服用卡马西平的癫痫患者49例,根据疗效分为有效组(NIE组)26例和耐药组(IE组)23例,测定其血药浓度;采用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)技术检测MDR1C3435T位点的基因型;用流式细胞仪检测MDR1的表达物P-糖蛋白(Pgp)的表达。比较NIE组、IE组的CBZ血药浓度、Pgp的表达、MDR1 C3435T基因型。另纳入健康查体者28例为健康对照组。结果 IE组血清Pgp(3.6%±0.3%)明显高于NIE组(2.6%±0.5%)和健康对照组(2.3%±0.4%),差异有统计学意义(P<0.05);而IE组及NIE组基因型及CBZ血药浓度的差异却无统计学意义(P>0.05)。结论 MDR1 C3435T基因多态性与抗癫痫药CBZ的血药浓度及疗效没有显著相关性。     

宁夏回族癫痫患者ABCB1 C3435T与癫痫耐药相关性研究

目的了解宁夏回族癫痫患者ABCB1 C3435T多态性及与癫痫耐药的关系。方法收集宁夏地区回族癫痫患者123例,其中癫痫药物敏感者60例,耐药者63例,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）技术,对两组癫痫患者ABCB1基因C3435T位点的多态性进行检测,并分析其与癫痫耐药的关系。结果耐药组CC基因型和C等位基因频率高于敏感组（P〈0.01）。结论宁夏回族癫痫患者中ABCB13435CC基因型及C等位基因与癫痫耐药有关,该位点的多态性可能影响癫痫患者对抗癫痫药物的反应性。     

MDR1 C3435T polymorphism in patients with breast cancer

BACKGROUND: The human multidrug-resistant gene (MDR1) encodes P-glycoprotein (Pgp), a membrane-bound efflux transporter conferring resistance to a number of natural cytotoxic drugs and potentially toxic xenobiotics. Single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in MDR1 gene are associated with phenotypic variation in Pgp expression levels of tissue. SNPs may alter the physiological protective role of Pgp and, therefore, influence disease risk. METHODS: In our study we identified the MDR1 C3435T polymorphism in breast cancer patients (n = 57) and healthy subjects (n = 50). DNA was extracted from peripheral blood samples by standard phenol/chloroform extraction method. Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism was used for the detection of C3435T single nucleotide polymorphism. RESULTS: We obtained CC, CT and TT genotype frequencies in breast cancer patients as 12.3%, 57.9% and 29.8%, respectively. In the control group, frequencies of genotypes were found as 36% for CC, 46% for CT and 18% for TT. We observed difference in SNPs in MDR1 gene C3435T polymorphism between breast cancer patients and healthy controls (chi(2) = 8.66, df = 2, p = 0.013). The C allele frequency was found in 41.2% and the T allele frequency was found in 58.8%. C3435T MDR1 gene allele frequencies in breast cancer patients as compared to results in control group were as follows: [OR = 1.5 (95% CI: 1.09-1.96)]. In the patient group, T allele frequency was significantly higher than controls (p <0.01). Clinicopathological parameters of patients with breast cancer were compared for C3435T polymorphism. We did not find any significant difference between clinicopathological parameters and MDR1 phenotype of breast cancer patients. The progression-free survival rate in a subgroup analysis based on MDR1 genotypes with CC genotype was 71.4%, CT genotype was 75.7%, and TT genotype was 88.2%, respectively. This difference was not statistically significant (log rank p = 0.63). CONCLUSIONS: Results of the present study demonstrated a 1.5-fold increased risk for development of breast cancer in T allele carriers.     

mdr1基因C3435T多态性与口服FK506后血药浓度关系的实验研究

目的 调查中国汉族肾脏移植人群mdr1基因C3435T单核苷酸多态性与口服FK506后血药浓度的关系.方法 采用不同引物进行PCR扩增了17例中国汉族人群的基因组,判断人群的C3435T基因型,结合其口服FK506 12 h后血药浓度,判断二者是否存在关联.结果 口服相同剂量的FK506以后,基因类型为T/T的患者血药浓度最高,C/T次之,C/C最低,三者存在显著差异(P＜0.05).结论 mdr1基因的C3435T与口服FK506后的血药浓度密切相关,检测汉族肾脏移植患者mdr1基因的C3435T,对指导临床上FK506的使用有一定帮助.     

鼻咽癌放射敏感性与MDR1基因多态性的关系

目的 探讨多药耐药基因(MDR1)多态性(21外显子G2677T和26外显子C3435T)与鼻咽癌放射敏感性差异的相关性.方法 对59例行根治性放疗的鼻咽癌病人,采用DNA限制性片断长度多态性法测定其MDR1 G2677T、C3435T和两者的单体型,并用基因测序法验证.结果 C3435T CC基因型放射敏感性显著高于CT和TT基因型(p=0.026);G2677T GG基因型行根治性放疗的疗效优于GT和TT基因型,但差异无显著性;携带有2677G-3435C单体型的病人放射敏感性显著强于其他单体型携带者(P=0.017).结论 MDR1 G2677T和C3435T多态性可能是鼻咽癌根治性放疗疗效的影响因素之一.     

MDR1和CYP3A5基因多态性对伊马替尼治疗慢性骨髓性白血病预后的影响

目的研究MDR1和CYP3A5基因多态性对伊马替尼治疗慢性骨髓性白血病（CML）预后的影响。方法选择100例采用 伊马替尼治疗的慢性骨髓性白血病患者作为研究对象,其中50例细胞遗传学复发患者作为研究组,另外50例无复发患者作为 对照组,随访45个月。分析MDR1基因中的C1236T、C3435T、G2677T/A和CYP3A5基因中的A6986G位点的单核苷酸多态性 与细胞遗传学复发风险之间的关系。结果MDR1-C1236T与MDR1-C3435T多态性位点中CC基因型细胞遗传学复发的风险 均明显比CT+TT基因型患者高（P<0.05）。MDR1-C3435T和MDR1-C1236T多态性位点的TT基因型患者的无复发生存时间 中位数显著高于CC基因型和CT基因型,差异均有统计学意义（P<0.05）。研究组患者中血液毒性和中性白细胞减少症的发生 率明显比对照组患者高,差异有统计学意义（P<0.05）。MDR1-C3435T基因型和伊马替尼谷浓度是细胞遗传学复发的独立预测 因子。结论MDR1 基因的C1236T 和C3435T 位点多态性和伊马替尼谷浓度水平显著影响CML细胞遗传学复发的风险。 MDR1-C3435T基因型可用于预测CML患者细胞遗传学复发风险的潜在生物标志物。     

A meta-analytic review of ERCC1/MDR1 polymorphism and chemosensitivity to platinum in patients with advanced non-small cell lung cancer

Background Platinum-based regimens are used as standard first-line chemotherapy in non-small cell lung cancer (NSCLC) patients. To study if pharmacogenetic approach may allow a tailored selection of platinum chemotherapy for advanced NSCLC, we performed a meta-analysis to compare chemosensitivity to platinum with different ERCC1 C118T/ MDR1 C3435T single-nucleotide polymorphism (SNP).

Methods Relevant studies were identified by searching the PubMed, Embase, Cochrane, OVID, Springer, EBSCO and CNKI databases. Inclusion criteria were patients with advanced NSCLC who received platinum-based chemotherapy, an evaluated polymorphism of ERCC/MDR1 and overall response rate. We excluded duplicate publications, letters and review articles. The RevMan 4.2 and STATA 11 package were used to do comprehensive quantitative assessment.

Results A total of 11 studies were included in this meta-analysis. For studies evaluating ERCC1 C118T, test for heterogeneity was done (χ²=13.41, P=0.1), and the odds ratio (OR) for the wild-type C/C genotype versus the heterozygous C/T and T/T genotypes was 1.50 (95% CI 1.09–2.06, P=0.01). In four studies evaluating MDR1 polymorphism, test for heterogeneity was also done (χ²=3.22, P=0.36), and the OR for the wild-type C/C genotype versus the heterozygous C/T and T/T genotypes was 2.30 (95% CI 1.44–3.68, P=0.0005).

Conclusions The results indicated that platinum-based chemotherapy sensitivity was significantly associated with polymorphism of ERCC1 C118T and MDR1 C3435T SNP. In further perspective studies, the ERCC1/MDR1 SNPs might serve as simple and less invasive biomarkers for personalized chemotherapy with platinum-based anticancer drugs.

     

ABCB1基因多态性与肾移植受者环孢素所致肝功能异常的相关性研究

目的研究肾移植术后患者ABCB1基因多态性对环孢素A（cyclosporin A,CsA）所致肝功能异常的影响。方法采用聚合酶链反应（polymerase chain reaction,PCR）-限制性片段长度多态性（restriction fragment lengthpolymor-phism,RFLP）方法（PCR-RFLP）,对339名服用CsA的肾移植患者进行ABCB1基因1236C〉T、2677G〉T/A和3435C〉T多态性检测,根据肾移植患者发生肝脏损伤的情况分为CsA致肝功异常组、其他原因肝损伤组和对照组。结果在339名肾移植患者中,ABCB1基因1236C〉T、2677G〉T/A和3435C〉T突变等位基因频率分别为64.25%、51.54%和35.75%。ABCB1基因1236C〉T、2677G〉T/A和3435C〉T多态性在CsA致肝功异常组、其他原因肝损伤组和对照组3组之间的分布频率无统计学差异（P〉0.05）。结论 ABCB1基因1236C〉T、2677G〉T/A和3435C〉T多态性与CsA所致的肝功异常无明显相关性。