2018-2019年湖北省5岁及以下腹泻儿童诺如病毒感染特征和病原学分析

  目的  了解2018 — 2019年湖北省≤5岁腹泻儿童诺如病毒感染流行病学及分子特征。  方法  收集2018 — 2019年湖北省病毒性腹泻监测哨点医院≤5岁腹泻儿童粪便标本,共计922份。 采用实时荧光反转录聚合酶链式反应（real-time RT-PCR）方法进行诺如病毒GⅠ和GⅡ组核酸检测。 对诺如病毒检测阳性的标本应用real-time RT-PCR分别扩增RNA聚合酶和衣壳蛋白片段,将获得的PCR产物直接测序并进行基因型别分析。  结果  湖北省≤5岁腹泻患儿粪便标本中,诺如病毒核酸阳性样本为122份,阳性率13.23%。其中诺如病毒GⅡ组119例（97.54%）,诺如病毒GⅠ组3例（2.46%）。 男女童感染者差异有统计学意义（χ2=8.805,P=0.003）。 ≤5岁儿童以6～12月龄为主要发病人群。 诺如病毒感染季节为冬春季,呈现2个流行峰,10 — 12月为高流行峰;诺如病毒主要为GⅡ组,聚合酶区和衣壳区基因分型主要为GⅡ.4 Sydney［P31］（27.71%）、GⅡ.2［P16］（26.51%）、GⅡ.3［P12］（26.51%）和GⅡ.4 Sydney［P16］（16.87%）。  结论  2018 — 2019年湖北地区≤5岁腹泻患儿感染诺如病毒存在多种基因型和不同的重组亚型,加强诺如病毒的基因型别监测和重点人群防护有助于诺如病毒腹泻感染的防控。     

2017-2019年新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市5岁以下腹泻住院患儿诺如病毒分子流行病学特征

  目的  了解2017 — 2019年新疆维吾尔自治区（新疆）乌鲁木齐市5岁以下腹泻住院患儿诺如病毒的分子流行病学特征。  方法  收集2017 — 2019年乌鲁木齐市5岁以下腹泻住院患儿粪便标本和相应临床资料,应用实时荧光反转录聚合酶链式反应（real time RT-PCR）进行诺如病毒核酸检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析,并结合临床资料分析流行病学特征。  结果  腹泻住院患儿粪便标本核酸检测阳性率为25.20%（246/976）,不同年份阳性率差异有统计学意义（χ2＝40.724,P<0.0001）;0.5～1岁年龄组最高（30.61%,101/330）,不同年龄组阳性率差异无统计学意义。 110份样本获得ORF1/ORF2重叠区序列,包括7个基因型,其中GⅡ.4 Sydney［P31］为流行优势株,占59.09%（65/110）,其次是GⅡ.3［P12］（18.18%,20/110）和GⅡ.2［P16］（17.27%,19/110）,其他型别包括GⅡ.6［P7］（2.72%,3/110）、GⅡ.4 Sydney［P16］（0.91%,1/110）、GⅡ.1 ［P16］（0.91%,1/110）和GⅠ.4［P4］（0.91%,1/110）。GⅡ.2［P16］自2017年第二季度出现,在2019年第三季度成为流行优势株。  结论  在新疆地区诺如病毒是引起5岁以下儿童腹泻的主要病原之一,GⅡ.4 Sydney［P31］、GⅡ.3［P12］和GⅡ.2［P16］是该地区流行的主要基因型。     

2016-2019年我国诺如病毒暴发疫情的分子流行病学特征分析

  目的  了解中国诺如病毒监测网络（CaliciNet China）的发展及2016 — 2019年中国诺如病毒分子流行特征。  方法   收集2016年10月至2019年9月诺如病毒暴发流行病学和病例临床信息及标本,应用荧光反转录聚合酶链式反应（real-time, RT-PCR）进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序,将数据录入CaliciNet China数据库并进行基因分型。  结果  2016年10月至2019年9月,共报告诺如病毒疫情1 153起,对其中776起疫情（67.3%）的阳性样本进行了基因分型。 94.9%的暴发疫情与人–人传播有关,发生在托幼机构或学校（94.4%）,每年11月至次年3月为诺如病毒暴发的流行高峰（65.0%）。 57.6%的诺如病毒暴发由GⅡ.2［P16］引起。  结论  GⅡ.2［P16］是 2016年10月至2019年9月引起我国诺如病毒暴发的主要基因型,主要发生在托幼机构或或学校,CaliciNet China正在进行的监测提供了有关毒株基因分型和暴发特征的信息。     

2019年天津市急性胃肠炎人群诺如病毒基因分型分析

目的分析2019年天津市急性胃肠炎人群中诺如病毒的基因特征。方法本研究采集2019年全年天津市各区疾病预防控制中心送检的散发、暴发、聚集性腹泻诺如病毒阳性粪便标本，采用反转录聚合酶链式反应（RT-PCR）方法将标本进行扩增，对阳性产物进行聚合酶区和衣壳区序列测定，构建系统进化树。结果诺如病毒总体阳性率为6.01%（97/1615），除1月无样本检测外，其他各月份均有诺如病毒的检出。 其中GⅠ组检出率1.11%（18/1615），GⅡ组检出率5.02%（81/1615）。 聚合酶区和衣壳区基因分型结果:2019年的基因型别为GⅡ.2［P16］、GⅡ.4［P31］、GⅡ.17［P17］、GⅠ.3［P13］、GⅡ.6［P7］、GⅠ.5［P4］、GⅡ.3［P12］、GⅠ.5［P12］、GⅠ.1［P1］、GⅠ.2［P2］等。 13起急性胃肠炎暴发或聚集性腹泻病例中占比前3位的基因重组株为GⅡ.2［P16］（30.77%，4/13）、GⅡ.4［P31］（23.08%，3/13）、GⅡ.17［P17］（23.08%，3/13）。结论天津市诺如病毒感染的基因型呈多样性，不同基因型持续共同进化和循环，需进一步加强诺如病毒病原监测及分子分型鉴定工作。     

一起GⅡ.4 ［P16］ 型诺如病毒感染暴发疫情调查

  目的   分析2021年山东省某小区一起诺如病毒感染暴发疫情流行因素,为制定有效的防控措施提供科学依据。  方法   采用现场流行病学方法调查、分析疾病的流行情况,采集水样本、典型病例的粪便或呕吐物、密切接触者的肛拭子标本进行胃肠炎病毒检测,对阳性样本进行基因分型。  结果   搜索到病例69例（9例为小区内幼儿园儿童,60例为社区居民）, 临床表现主要为呕吐（76.81%）,腹泻（69.57%）。 0～5岁儿童罹患率最高（21.18%）。 17份病例标本和2份密切接触者标本GⅡ组诺如病毒阳性,基因型均为GⅡ.4［P16］。  结论   本次事件是由GⅡ.4［P16］型诺如病毒引起的暴发疫情,是由患病儿童呕吐物造成环境污染,社区人员密切接触导致,及时识别和妥善处置是疫情防控的关键。     

2013－2019年浙江省湖州市急性胃肠炎病例GⅡ.P7-GⅡ.6型诺如病毒基因特征分析

  目的  分析2013 — 2019年浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒基因特征,为疾病监测和防控提供参考。  方法  采用荧光定量反转录聚合酶链式反应（RT-PCR）方法对2013年12月、2014年4、12月、2019年3月发生的4起学校/托幼机构急性胃肠炎患者送检粪便标本进行诺如病毒核酸检测。 采用RT-PCR法对核酸阳性标本的多聚酶和衣壳蛋白部分区域进行扩增,并对扩增产物进行序列测定。 利用在线分型工具和系统进化分析对病原序列进行基因特征分析。  结果  共计28份标本中分别有5、4、2、5份为GⅡ型诺如病毒核酸阳性,阳性率为57.1%（16/28）。 4次疫情各有1份标本测序成功;在线分型和系统进化分支分析显示,4起疫情的病原均为GⅡ.P7-GⅡ.6重组型诺如病毒,但进化分支不同,其中2013年疫情标本检出GⅡ.P7-GⅡ.6c型;2014年2起疫情均为GⅡ.P7-GⅡ.6b型,2019年疫情中检出的GⅡ.P7-GⅡ.6a型。  结论  GⅡ.P7-GⅡ.6型重组型诺如病毒是引起湖州市2013 — 2019年4起急性胃肠炎暴发疫情的病原体,每年毒株存在一定基因进化分支的差异。 鉴于该病毒在全球范围内具有持续和广泛的流行能力,应进一步加强对该型别重组型诺如病毒的监测。     

2018－2019年北京市西城区6起学校急性胃肠炎聚集性疫情的GⅠ诺如病毒病原鉴定与溯源研究

  目的  分析2018—2019年北京市西城区6所学校发生的急性胃肠炎疫情GⅠ诺如病毒的基因型别特征。   方法   收集2018—2019年西城区6所学校急性胃肠炎病例的粪便标本37份。 采用实时荧光定量反转录聚合酶链式反应（real-time RT-PCR）对提取的GⅠ和GⅡ诺如病毒核酸进行检测。 采用RT-PCR进行GⅠ诺如病毒聚合酶区和衣壳蛋白VP1区部分片段的扩增和测序。 用诺如病毒在线分型工具对测序成功的毒株进行初步鉴定和基因分型,用BioEdit 7.0.9.0软件进行序列比对,用MEGA 6.06 软件构建进化树。  结果   6所学校（18,S1～S4和19,S5～S6）发生的诺如病毒急性胃肠炎疫情均为聚集性疫情,GⅠ诺如病毒核酸阳性率为83.78%（31/37）,GⅡ诺如病毒未检出;聚合酶区和衣壳蛋白VP1区进化分析分别显示,1起疫情的4株诺如病毒毒株分别与GⅠ.Pd参考株和GⅠ.3b参考株在同一分支,5起疫情的19株诺如病毒毒株与GⅠ.Pb参考株和GⅠ.6a参考株在同一分支;每所学校毒株相似性为100.0%。双区分型合并结果,1起疫情由GⅠ.Pd-GⅠ.3b引起,该重组株与GⅠ.3[P13]/Hu/MT008455/2018/Shanghai/CHI相似性高达99.6%;5起疫情由GⅠ.Pb-GⅠ.6a引起, 这重组株与GⅠ.6[P11]/Hu/MZ227264/2016/US相似性高达98.1%。  结论   2018—2019年北京市西城区6所学校诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情分别由GⅠ.Pd-GⅠ.3b和GⅠ.Pb-GⅠ.6a重组株引起。 应加强对诺如病毒重组株分子流行病学监测,为诺如病毒疫情提供预警预测的依据。     

2016年浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒感染状况及其基因型别特征

目的 调查浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒的感染状况、基因型别及其动态变化趋势。方法 于2016年采集湖州市食源性疾病主动监测哨点医院的急性胃肠炎病例粪便标本。采用特异性引物探针,应用real-time RT-PCR对标本进行诺如病毒核酸检测。同时对阳性标本衣壳蛋白基因片段进行扩增和测序,结合在线分型工具和序列系统进化分析诺如病毒基因型别。结果 501份急性胃肠炎患者粪便标本检出诺如病毒阳性101份,阳性率20.16%,以GⅡ基因组为主（86.14%）;男性检出率为20.75%（50/241）,女性检出率为19.54%（51/260）,差异无统计学意义。不同年龄段病例均检出诺如病毒,5岁儿童检出率最高。诺如病毒感染全年均有发生,但6-9月呈低流行状态。2016年湖州市流行的诺如病毒基因型别多样,包括GⅡ.17、GⅡ.4 Sydney_2012、GⅡ.3、GⅡ.13、GⅠ.6、GⅡ.2、GⅡ.6、GⅠ.7共8种基因型别。GⅡ.17和GⅡ.4 Sydney_2012呈月份交替流行。结论 湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒基因型别多样,且呈交替流行现象,应进一步加强监测各型别诺如病毒在本地的流行范围及型别分布变化情况。     

2018-2020年浙江省湖州市食源性疾病监测结果分析

  目的   了解浙江省湖州市食源性疾病的感染状况和流行病学特征。  方法   收集湖州市2018 — 2020年6家食源性疾病监测哨点医院（重点监测点和常规监测点各3家）上送的沙门菌、副溶血弧菌、致泻性大肠埃希菌、志贺菌分离菌株,再对分离菌株进行血清分型和毒力基因检测;采用real-time PCR方法进行诺如病毒核酸检测。  结果   共检测6783 例腹泻病例标本,检出病原体1373份,检出率为20.24%。 致泻性大肠埃希菌检出率为6.49%,主要以肠聚集性大肠埃希菌和产肠毒素大肠埃希菌为主;副溶血弧菌检出率5.31%,血清分型以 O3∶K6 为主,毒力基因以tdh 为主;沙门菌检出率为2.85%,以鼠伤寒沙门菌为主;诺如病毒阳性率为11.65%,基因型别以GⅡ.2［P16］为主。 致病菌引起的发病高峰在夏季,诺如病毒引起的发病高峰在冬春季, 20～39岁为主要感染人群。  结论   2018 — 2020年引起湖州市感染性腹泻的病原体为诺如病毒、致泻性大肠埃希菌、副溶血弧菌和沙门菌,发病呈现明显的季节性和年龄分布。 应加强对食源性病原体的监测,有效控制食源性疾病的发生。     

2014年浙江省湖州市急性腹泻患者诺如病毒感染及基因特征研究

目的 了解2014年浙江省湖州市急性腹泻患者诺如病毒感染状况及基因特征,为加强感染性腹泻监测与综合防控工作提供依据。方法 收集2014年湖州市综合性三级乙等和二级甲等各一家医院的粪便标本797份,采用实时荧光定量PCR方法进行诺如病毒核酸检测,并对诺如病毒核酸阳性标本进行衣壳蛋白区的序列测定和分析。结果 797份粪便标本中149份检出诺如病毒核酸阳性,阳性率18.70%（149/797）,以GⅡ基因型为主,占89.26%（133/149）。衣壳蛋白区序列的系统进化分析显示检出的诺如病毒有5种GⅠ型别和7种GⅡ型别,包括GⅠ.1、GⅠ.2、GⅠ.5、GⅠ.6、GⅠ.7、GⅡ.2、GⅡ.3、GⅡ.4、GⅡ.6、GⅡ.8、GⅡ.17、GⅡ.21,以GⅡ.4 Sydney_2012（55.5%）、GⅡ.17（25.5%）型为主。结论 诺如病毒在湖州市急性腹泻患者中存在较高感染,并且基因型别复杂,除了流行优势型别GⅡ.4外,2014年底还出现GⅡ.17型诺如病毒的流行,因此应加强诺如病毒腹泻监测工作,为今后疫情防控提供科学依据。     

浙江省湖州市诺如病毒GⅡ.17型变异株的全基因组序列分析

目的分析浙江省湖州市检出的诺如病毒GⅡ.17型变异株的基因序列和系统发育与进化关系,为国内诺如病毒的遗传进化研究提供序列参考。方法根据GⅡ.17型诺如病毒保守序列,自行设计3对引物,扩增覆盖整个基因组的3个重叠片段,对来自急性胃肠炎病例的一株诺如病毒GⅡ.17型毒株进行全基因序列测定和系统发育和进化分析。结果在2015年3月湖州市急性胃肠炎病例标本中分离鉴定出一株诺如病毒株GⅡ.17［P17］变异株（毒株编号:NS15217）,获得该病毒基因组全长7556 bp,编码3个开放阅读框（ORF）,ORF1长5109 bp（5～5113 nt）;ORF2长1623 bp（5094～6716 nt）;ORF3长780 bp（6716～7495 nt）。 湖州NS15217毒株在ORF1和ORF2中均属于GⅡ.17型基因型,且与LC037415.1/Hu/GⅡ.17/Kawasaki308和湖州MG692610毒株最接近。 在VP1结构域中有106个插入/缺失/替换的残基,13个（12.3%）在S区,30个（28.3%）位于P1区;大多数替换和插入是位于P2域,有63个氨基酸（59.4%）。结论湖州地区2015年分离的诺如病毒GⅡ.17型变异株进化分支属于3b簇。 其全基因组序列将有助于诺如病毒的遗传进化研究以及快速诊断试剂的研制。     

2015－2016年浙江省台州市感染性腹泻轮状病毒分子流行病学研究

目的分析2015 — 2016年浙江省台州市腹泻病例轮状病毒感染的流行病学特征、病毒基因型别及变化特征,为感染性腹泻的预防与控制提供实验室支持。方法收集2015 — 2016年台州市哨点医院感染性腹泻就诊患者信息及粪便标本,采用双重荧光方法检测A/B组轮状病毒,对A组轮状病毒阳性的标本进行G/P基因分型和测序,并对主要型别的VP7基因进行同源性和系统进化分析。结果轮状病毒总检出率为5.10%（81/1 589）,其中A组轮状病毒占98.77%（80/81）,B组轮状病毒占1.23%（1/81）。 流行特征显示年龄、季节、职业等差异有统计学意义,性别和籍贯等差异无统计学意义。 A组轮状病毒基因型别主要包括G9P［8］（53.75%）、G2P［4］（25.00%）、G3P［8］（11.25%）、G1P［8］（2.50%）、G4P［6］（2.50%）。 VP7基因同源性和进化分析显示,G9P［8］型主要是G9-Ⅵ亚型,相同基因型轮状病毒同源性高。结论轮状病毒是台州市感染性腹泻人群中的常见病原体; A组轮状病毒在本地区呈现多样性和稳定性。 建议将G9型引入疫苗株,并对腹泻人群尤其是儿童进行持续性的病原学监测。     

2019年浙江省学校诺如病毒胃肠炎暴发疫情分析

  目的  了解浙江省学校诺如病毒感染暴发疫情的流行特征,提出当前防控特点。  方法  收集2019年1月1日至12月31日浙江省学校发生的诺如病毒胃肠炎暴发疫情资料,采用描述性流行病学方法。  结果  2019年报告173起学校诺如疫情,涉及170所学校,累计3172例病例,波及161711人,总罹患率为1.96%。 诺如病毒疫情主要发生在小学（53.18%）和托幼机构（27.16%）,病例的年龄集中在7～12岁（47.95%）。 疫情在春季和秋冬季均有发生,传播途径主要为人传人（94.80%）,食源性传播和水源性传播引起的疫情较少。 临床症状以腹泻、呕吐为主,基因型以GⅡ型为主（121起,69.94%）。  结论  浙江省学校诺如病毒胃肠炎暴发疫情主要发生在小学和幼儿园,传播途径多为人传人,学校应重视病例的排泄物/呕吐物及环境消毒处理。     

2015-2016年天津市哨点医院腹泻病例诺如病毒感染状况调查

目的 了解2015 — 2016年天津市腹泻散发病例中诺如病毒感染状况,为制定相关防治策略提供依据。 方法 收集2015年1月至2016年12月天津市5家哨点医院上报的1 249例腹泻散发病例的流行病学资料,留存患者粪便样本,使用实时荧光定量反转录–聚合酶链式反应（RT-PCR）方法检测诺如病毒核酸,并对结果进行基因型别分析。 结果 1 249例腹泻患者中诺如病毒检出率为14.41%（180/1 249）;＜1岁年龄组检出率最高,为26.07%（85/326）,各年龄组检出率差异有统计学意义（P＜0.01） ;一、四季度诺如病毒检出率明显高于二、三季度;滨海新区（30.00%）检出率高于城区（16.62%）和农村地区（11.89%）;基因型以GⅡ型为主,GⅡ型单独感染占86.05%,GⅠ型单独感染占11.05%,GⅠ和GⅡ共同感染占2.91%。6 ~ 45岁GⅠ型所占比例较其他组高,最高达33.33%;GⅠ型主要分布在4 — 9月。 结论 天津市哨点医院腹泻病例诺如病毒感染率较高,冬春季节高发,滨海新区是高发地区,婴幼儿为高发群体,优势基因型为GⅡ型,GⅠ型在中青年群体和夏季所占比例相对较高。 应根据诺如病毒流行特征开展防控工作,并针对重点人群进行主动监测。      

轮状病毒G9P ［8］ -E2基因型重配株在我国的流行趋势分析

  目的  研究我国轮状病毒（RV）流行毒株G9P［8］基因型的全序列分子特征及进化规律。  方法  采用反转录–聚合酶链式反应（RT-PCR）方法,对2018年收集的64份（广东省深圳市和吉林省长春市各32份）G9P［8］基因型RV阳性标本进行扩增。  结果  成功获取54份（深圳市30份, 长春市24份）G9P［8］基因型A组轮状病毒（RVA）标本的全基因组节段。序列分析表明,54份G9P［8］基因型RVA中, 28份为Wa-like G9P［8］-E1株,26份为非结构蛋白NSP4基因节段重配的G9P［8］-E2株,G9P［8］-E2株在深圳和长春市阳性样本中分别占60.0%、33.3%。  结论  2018年深圳和长春市流行的RVA中G9P［8］-E2重配株已经成为优势株,且在深圳市的优势程度大于在长春市的,推测该基因型重配株RVA可能已在我国广泛传播。     

2019－2020年北京市海淀区中小学校食堂厨工诺如病毒隐性感染和聚集性疫情分析

  目的  了解2019—2020年北京市海淀区中小学校食堂厨工诺如病毒隐性感染情况,结合同时期中小学校食堂厨工隐性感染诺如病毒的聚集性疫情流行病学特征,分析诺如病毒感染的影响因素,为有效防止疫情发生提供科学依据。  方法  采取分层抽样和横断面调查方法,采集中小学校食堂厨工粪便标本或肛拭子进行诺如病毒核酸检测,同时采用问卷调查法收集食堂厨工个人基本信息和对诺如病毒的认知情况,根据检测结果进行统计学分析,并对中小学校食堂厨工隐性感染诺如病毒的疫情进行统计学分析,分析感染影响因素。  结果  共有30家中小学校的785名食堂厨工参与本次调查和采样,问卷回收有效率94.27%（740/777）。 标本诺如病毒核酸阳性检出率0.27%（2/740）;阳性组和阴性组在性别、年龄、文化水平、诺如病毒检测阳性时间、进入食品操作间之前是否更换工作服、佩戴一次性口罩、是否洗手、饭前便后是否洗手、是否爱吃生冷海鲜产品、诺如病毒是否具有传染性的认知情况、出现呕吐、腹泻等急性胃肠炎不适症状是否去医院就诊,差异均无统计学意义（P>0.05）;出现呕吐、腹泻等急性胃肠炎不适症状是否及时上报食堂管理者,差异有统计学意义（χ2=27.044,P＜0.05）。 中小学校因食堂厨工隐性感染诺如病毒的疫情发病率与非食堂厨工感染的疫情发病率差异有统计学意义（χ2= 17.122,P＜0.05）,疫情单位标本阳性率差异有统计学意义（χ2=61.750,P＜0.05）。  结论  海淀区中小学校食堂厨工诺如病毒隐性感染率为0.27%,诺如病毒感染在流行期存在引起聚集性疫情发生危险,应加强食堂厨工诺如病毒防控知识的培训,提高警惕性,做好健康监测,出现胃肠道不适症状及时上报并暂时脱岗隔离;在诺如病毒流行高发期,定期对食堂厨工采样检测,严格落实阳性检测者隔离措施,有效防止疫情发生和蔓延。     

2015－2018年湖南省株洲市其他感染性腹泻病原学监测结果分析

目的了解2015 — 2018年湖南省株洲市其他感染性腹泻病原学的构成和流行特征。方法2015年5月至2018年11月收集在哨点医院就诊的并符合腹泻病例相关信息,采集粪便标本进行肠道致病菌和病毒核酸检测。结果共调查并检测580例腹泻病例,病例形成秋、冬两个小高峰并且主要集中在≤5岁人群（82.59%,479/580）。 病例检测总阳性率为56.72%。 细菌阳性检测率为30.17%,以沙门菌为主,其次是空肠弯曲菌和致泻性大肠埃希菌。 病毒检测阳性率为37.07%,以轮状病毒A组为主,其次是诺如病毒GⅡ型。 各年龄组中病毒检出率均高于细菌。 季节分布明显,夏季以沙门菌为主,秋季以诺如病毒为主,冬、春季以轮状病毒为主。 不同性别病原谱构成基本一致。 乡村病例病原体（细菌31.63%、病毒41.83%）检出率高于城区（细菌29.88%、病毒36.09%）。结论株洲市其他感染性腹泻病毒感染高于细菌;轮状病毒A组、沙门菌、诺如病毒GⅡ型是引起株洲市感染性腹泻的主要病原体。     

2015年湖北省武汉市5岁以下儿童病毒性腹泻病原学研究

目的 调查2015年湖北省武汉市＜5岁儿童病毒性腹泻的流行病学特征。 方法 收集2015年武汉市儿童医院＜5岁全部腹泻患儿粪便标本及相关临床信息,采用酶联免疫吸附试验检测A组轮状病毒（RV）,PCR方法检测肠道腺病毒（AdV）,反转录聚合酶链式反应（RT-PCR）检测诺如病毒（NoV）、札如病毒（SaV）、B组和C组轮状病毒及星状病毒（AstV）,利用巢式RT-PCR对轮状病毒进行G/P基因分型。 分析病毒性腹泻病原分子流行特征。 结果 2015年武汉市＜5岁全部腹泻患儿3 009例,病毒性腹泻病例流行季节以RV最为明显, 9— 11月病例数占阳性病例数的50.3%;NoV的流行高峰在9 — 10月,占阳性比例的40.9%。 AdV占2.0%、AstV占1.8%,SaV、B组和C组RV未检出。 病毒性腹泻的发病年龄主要为＜2岁婴幼儿。 RV毒株G型与P型血清型分型结果显示,G型与P型组合则主要以G3P［8］和G1P［8］为主,构成比分别为37.4%和17.9%。 结论 武汉市儿童病毒性腹泻病例携带的病原体具有多样性,以RV为主,主要流行株为G3P［8］。      

2013-2015年吉林省病毒性腹泻监测资料分析

目的 分析2013-2015年吉林省诺如病毒胃肠炎的流行病学特征和规律,并针对疫情防控提出措施和建议。方法 对2013-2015年吉林省监测的疑似病毒性腹泻病例进行描述性分析和统计学检验。结果 2013-2015年吉林省共报告疑似病毒性腹泻病例2489例,389例检出诺如病毒核酸阳性,阳性率为15.63%。其中16例检出诺如病毒GⅠ组,371例检出GⅡ组,2例同时检出GⅠ组和GⅡ组,GⅠ组检出率为0.72%（18/2489）,GⅡ组检出率为14.99%（373/2489）。2015年诺如病毒检出率（17.26%）高于2013年（P=0.030）,第一、二季度的检出率（31.00%、18.66%）高于第三、四季度（P=0.000）,12月至次年5月诺如病毒的检出率依次为27.59%、30.22%、36.36%、27.39%、25.33%和19.70%,高于其他月份。不同性别（P=0.374）、城市和农村（P=0.122）的诺如病毒检出率差异无统计学意义。不同年龄组诺如病毒检出率差异有统计学意义（P=0.001）,85岁以上和5岁以下年龄组检出率较高,分别为22.73%和18.90%。商业服务（44.44%）和儿童（18.11%）检出率较高。结论 2013年以来吉林省诺如病毒检出率呈逐年升高趋势,第一、二季度检出率高于第三、四季度,以诺如病毒GⅡ组占优势,85岁以上和5岁以下年龄组,商业服务人员和儿童易受诺如病毒感染。     

2017-2018年浙江省湖州市急性胃肠炎病例GⅠ型诺如病毒感染状况及其基因型别特征

目的了解浙江省湖州市急性胃肠炎病例中GⅠ型诺如病毒的感染状况及基因型别特征。方法收集2017年4月至2018年6月湖州市2家哨点医院诊断为急性胃肠炎病例的粪便标本1 259份。 采用实时荧光定量反转录–聚合酶链式反应（real time RT-PCR）对提取的病毒RNA进行GⅠ和GⅡ型诺如病毒核酸检测。采用RT-PCR对GⅠ型阳性标本进行RdRp区和VP1区部分片段的扩增和测序。 综合在线分型工具和系统进化分析的结果判定病毒基因型别。结果诺如病毒核酸阳性171份，阳性率13.58%。 GⅡ型和GⅠ型诺如病毒的检出阳性率分别为11.83%（149/1 259）和2.70%（34/1 259），GⅡ型诺如病毒为检出的主要型别。 GⅠ型诺如病毒主要检出于2018年上半年。 2018年2 — 6月各月GⅠ型诺如病毒的检出阳性率均大于监测期间GⅠ型的平均检出阳性率。 基因分型结果显示，2018年检出的GⅠ型诺如病毒包括GⅠ.P4-GⅠ.5、GⅠ.P2-GⅠ.2、GⅠ.P1-GⅠ.1、GⅠ.Pd-GⅠ.3、GⅠ.P4-GⅠ.4、GⅠ.P2-GⅠ.5。 其中GⅠ.P4-GⅠ.5、GⅠ.P2-GⅠ.5和GⅠ.Pd-GⅠ.3重组型诺如病毒首次在湖州市检出。结论湖州市流行的GⅠ型诺如病毒基因型别多样，重组现象明显。 应加强GⅠ型诺如病毒在当地的分子流行病学监测，以及时发现新的变异或重组株。