2012－2014年乌鲁木齐市5岁以下急性腹泻儿童患者诺如病毒感染及基因型研究

目的了解2012 — 2014年新疆维吾尔自治区（新疆）乌鲁木齐市＜5岁住院儿童患者诺如病毒的分子流行病学特征。方法收集2012 — 2014年乌鲁木齐市895例＜5岁急性腹泻儿童患者粪便标本和流行病学资料,应用实时荧光反转录聚合酶链式反应（RT-PCR）进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析。结果诺如病毒的检出率为16.8%（150/895）,不同年份阳性率差异有统计学意义（χ2＝21.080,P＜0.05）;不同年龄组阳性率差异有统计学意义（χ2=13.367,P＝0.020）。 137份样本获得聚合酶区序列,其中89份获得衣壳蛋白区序列。聚合酶区和衣壳区分别包括11和9个基因型。根据89株双分型结果,GⅡ.4 Den Haag 2006b和GⅡ.Pe/GⅡ.4 Sydney 2012分别占21.3%和32.6%,GⅡ.P12/GⅡ.3占29.2%。 根据衣壳区分型结果,在GⅡ.4基因型中,2012 — 2014年GⅡ.4 DenHaag 2006b所占比例分别为90.0%、0%和0%;GⅡ.Pe/GⅡ.4 Sydney 2012所占比例分别为10.0%、100%和100%。结论新疆乌鲁木齐市急性腹泻儿童诺如病毒具有遗传多样性;GⅡ.Pe/GⅡ.4 Sydney 2012在新疆地区出现,逐渐替代GⅡ.4 DenHaag 2006b成为新的流行优势株。     

广州市腹泻监测病例诺如病毒分子流行病学特征

目的 了解广州市腹泻监测病例中诺如病毒分子流行病学特征。方法 2014-2015年选取广州市两家医院的门诊科室作为监测哨点,每间哨点医院每周采集5岁以下和5岁及以上腹泻病例粪便样本各3份,将采集的标本送至广州市疾病预防控制中心检测诺如病毒。阳性标本进行基因序列测定并进行同源性分析。通过中国传染病疫情和突发公共卫生事件网络直报系统收集2014-2015年广州市报告的诺如病毒感染引起的暴发疫情数据,开展流行病学分析。结果 共收集腹泻标本732份,诺如病毒阳性136份,阳性率为18.58%。各年龄组诺如病毒阳性率不同（2=20.39,P=0.001）,其中5岁以下年龄组最高（24.21%）。基因分型结果显示GⅡ组133份（97.80%）,GⅠ组3份（2.20%）。分别对2014年（4份）及2015年（5份）阳性标本进行测序,结果提示,2014年诺如病毒流行株以GⅡ.4 Sydney_2012变异株（75.00%）为主,2015年以GⅡ.17变异株（55.60%）为主。2014-2015年共报告诺如病毒感染性腹泻暴发疫情23起,其中14（60.80%）起由GⅡ组引起。结论 广州市诺如病毒感染性腹泻流行毒株仍以GⅡ组为主,其中2014年优势毒株为GⅡ.4 Sydney_2012变异株,2015优势毒株为GⅡ.17变异株。     

2018-2019年湖北省5岁及以下腹泻儿童诺如病毒感染特征和病原学分析

目的 了解2018-2019年湖北省≤5岁腹泻儿童诺如病毒感染流行病学及分子特征.方法 收集2018-2019年湖北省病毒性腹泻监测哨点医院≤5岁腹泻儿童粪便标本,共计922份.采用实时荧光反转录聚合酶链式反应(real-time RT-PCR)方法进行诺如病毒G Ⅰ和GⅡ组核酸检测.对诺如病毒检测阳性的标本应用rea...     

杭州地区2010~2011年急性腹泻患儿病原诺如病毒基因型及分子特征研究

摘要:目的：探讨杭州地区2010~2011年婴幼儿急性腹泻病原诺如病毒(NV)基因型及其分子特征。 方法：用多重RT-PCR方法对325份5岁以下急性腹泻患儿粪便标本进行NV检测,选择阳性扩增片段进行基因测序,并对序列进行系统进化分析。 结果：杭州地区急性腹泻患儿感染NV的阳性率为13.85%（45/325）,NV GⅠ型7株,GⅡ型38株;序列结果分析显示3株NV GⅠ型与AB522407.1、EU085525.1、EU085523.1和FJ383829.1的同源性达93.2%～100%,进化树显示其亲缘关系较近;进化树显示12株属于GⅡ-4型,且与GQ845367.2、AB291542.2、JQ934814.1和JQ613509.1的同源性高达94.7%～100%;4株GⅡ-3型与JF896130.1和EU400377.1同源性高达97.9%～100%;1株GⅡ-4型与GQ380647.1的同源性仅为93.6%。 结论：NV是2010~2011年导致杭州地区儿童急性腹泻的重要病原之一,以NV GⅡ-4型为主,可能是流行优势株。     

2016-2019年我国诺如病毒暴发疫情的分子流行病学特征分析

目的 了解中国诺如病毒监测网络(CaliciNet China)的发展及2016-2019年中国诺如病毒分子流行特征.方法 收集2016年10月至2019年9月诺如病毒暴发流行病学和病例临床信息及标本,应用荧光反转录聚合酶链式反应(real-time,RT-PCR)进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序,...     

2016年浙江省急性胃肠炎患者诺如病毒的分子流行病学特征分析

摘要：目的：探讨2016年浙江省急性胃肠炎患者中诺如病毒的流行病学和基因特征。 方法：收集2016年1月至12月共1 308份急性胃肠炎患者的临床流行病学资料和粪便标本,用一步法双重荧光RT-PCR技术检测诺如病毒GⅠ和GⅡ型,用分层抽样抽取阳性标本核酸进行普通RT-PCR扩增,并对扩增产物进行测序分析。 结果：诺如病毒阳性率为10.55%（138/1 308）,其中GⅠ型12例,GⅡ型118例,GⅠ/GⅡ型混合感染8例。诺如病毒在不同年龄组的阳性率随患者年龄上升而下降,以≥60岁组最低;不同性别组间的阳性率差异无统计学意义;诺如病毒感染全年分布,其中12月阳性率达到顶峰,为37.50%。测序结果显示GⅠ的基因亚型主要是GⅠ.6;GⅡ的基因亚型以GⅡ.4与GⅡ.17为主,分别占40.91%（18/44）和34.09%（15/44）。 结论：诺如病毒是引起2016年浙江省急性胃肠炎的重要病原体,且GⅡ.4和GⅡ.17是主要的基因亚型。     

镇江地区诺如病毒分子流行病学特点及基因型分析

目的分析2015-2016年镇江地区诺如病毒(No V)的分子流行病学特点及基因型分布。方法收集镇江地区腹泻患者粪便标本,逆转录PCR(RT-PCR)检测No V衣壳蛋白基因的表达水平,并对PCR产物行基因测序验证;Mega软件构建系统进化树,并进行序列进化和基因型分析。结果 No V总阳性率为5.30%(85/1 605),GⅠ组检出率为0.87%(14/1 605),GⅡ组检出率为4.55%(73/1 605),其中2份样本同时检出感染GⅠ/GⅡ。GⅡ组在10~20岁组中的阳性率最高(17.80%)。2015年No V的检出率以1月最高,11月、2月次之;2016年以12月最高,3月、4月次之。2015年No V的基因型以新GII.17型变异株为主(63.89%),2016年以GII.4 Sydney_2012株为主(35%)。结论镇江地区的No V以GII组为主,青少年患者阳性率高,主要流行季节为11月至次年4月,主要流行基因型为GII.17型变异株和GII.4 Sydney_2012株。     

2009-2015年福建省福州市急性腹泻儿童中诺如病毒基因多样性及动态变化研究

目的 通过定点监测了解2009-2015年福建省福州市急性腹泻儿童中诺如病毒基因多样性及动态变化趋势。方法 采集2009-2015年福州市儿童医院因急性腹泻入院的5岁以下儿童的粪便标本,应用实时荧光定量聚合酶链反应（Real-time PCR）筛查诺如病毒阳性标本。应用反转录聚合酶链反应（RT-PCR）方法扩增完整的VP1区和部分RdRp区并测序,应用在线基因分型工具和种系进化分析方法了解福州市5岁以下儿童中诺如病毒基因型/亚型的分布。结果 在随机抽取的93份标本中,Real-time PCR法检测阳性有91份;共获得其中73份完整VP1区和72份部分RdRp区基因序列。在完整的VP1分型中,GⅡ.4_2006b型43份,GⅡ.4 Syndeny_2012型16份,GⅡ.3型10份,GⅡ.4 New Orleans_2009型2份,GⅡ.12型1份,GⅡ.7型1份。在部分RdRp区分型中,共发现GⅡ.P4_2006b型43份,GⅡ.Pe型16份,GⅡ.P12型10份,GⅠ.P4型1份,GⅠ.Pa型1份,GⅡ.P21型1份。结论 应用双命名系统分型的方法,发现2009-2015年福州市急性腹泻儿童中诺如病毒具有遗传多样性,其中2009-2012年流行的优势毒株为GⅡ.P4_2006b/GⅡ.4_2006b型,2013-2015年流行的优势毒株为GⅡ.Pe/GⅡ.4 Sydney_2012型。此外,GⅡ.P12/GⅡ.3为福州市持续流行的型别。     

2019年天津市急性胃肠炎人群诺如病毒基因分型分析

目的分析2019年天津市急性胃肠炎人群中诺如病毒的基因特征。方法本研究采集2019年全年天津市各区疾病预防控制中心送检的散发、暴发、聚集性腹泻诺如病毒阳性粪便标本,采用反转录聚合酶链式反应（RT-PCR）方法将标本进行扩增,对阳性产物进行聚合酶区和衣壳区序列测定,构建系统进化树。结果诺如病毒总体阳性率为6.01%（97/1615）,除1月无样本检测外,其他各月份均有诺如病毒的检出。 其中GⅠ组检出率1.11%（18/1615）,GⅡ组检出率5.02%（81/1615）。 聚合酶区和衣壳区基因分型结果:2019年的基因型别为GⅡ.2［P16］、GⅡ.4［P31］、GⅡ.17［P17］、GⅠ.3［P13］、GⅡ.6［P7］、GⅠ.5［P4］、GⅡ.3［P12］、GⅠ.5［P12］、GⅠ.1［P1］、GⅠ.2［P2］等。 13起急性胃肠炎暴发或聚集性腹泻病例中占比前3位的基因重组株为GⅡ.2［P16］（30.77%,4/13）、GⅡ.4［P31］（23.08%,3/13）、GⅡ.17［P17］（23.08%,3/13）。结论天津市诺如病毒感染的基因型呈多样性,不同基因型持续共同进化和循环,需进一步加强诺如病毒病原监测及分子分型鉴定工作。     

北京市门头沟区2018-2020年急性胃肠炎患者诺如病毒基因型分析

目的 了解北京市门头沟区急性胃肠炎患者诺如病毒基因型.方法 采用实时荧光定量PCR方法对急性胃肠炎患者粪便标本进行诺如病毒核酸检测,普通RT-PCR法对诺如病毒GⅡ基因群标本的多聚酶和衣壳蛋白区域扩增,对扩增产物序列测定.结果 粪便标本诺如病毒阳性检出率为10.75％,其中GⅡ基因群占95.89％,GI基因群占4.11...     

河南省某高校一起诺如病毒感染性腹泻暴发调查

河南省某高校发生一起感染性腹泻暴发,专业人员进行了流行病学调查、处理,同时采集样本进行检测。本次疫情仅涉及一所高校,发生病例753例,罹患率3.39%,疫情持续27 d。病例临床表现以腹泻、腹痛、呕吐、恶心胃肠道症状为主。98份病例样本中诺如病毒GⅡ型检测阳性率31.63%。     

一起诺如病毒感染性腹泻爆发疫情的调查分析

仪征市某外国语实验学校于2007年1月1～20日发生该市首起诺如病毒感染性腹泻爆发疫情,现将疫情调查处理报告如下。1对象与方法1.1病例定义自2007年1月1日起,该校学生、教职员工     

东莞市一起社区诺如病毒腹泻爆发调查分析

目的 对东莞市某社区发生的一起腹泻爆发疫情进行调查和分析.方法 采用现场流行病学调查方法了解病例发生情况及可疑传播因素;采用ELISA、RT-PCR等方法对人体和外环境标本进行检测.结果 本次疫情从2007年2月11日开始至18日结束,共发生腹泻病例173例,罹患率2.40%.从4份病人粪便标本中均检测出诺如病毒核酸片段.疫情特点符合经水传播传染病特征.结论 本次疫情为一起由诺如病毒引起的社区腹泻爆发,可疑传播因素为被污染的水.     

一起幼儿园诺如病毒暴发疫情调查及分子流行病学特征分析

  目的   调查2021年西安市一起幼儿园诺如病毒暴发疫情的流行特征和暴发原因,并对病原体进行分子鉴定分型。  方法   根据诺如病毒疑似病例定义主动搜索病例,同时开展现场卫生学调查;采用描述性流行病学方法描述病例的临床症状和三间分布特征,结合队列研究方法分析疫情暴发原因;采集典型病例肛拭子样本进行诺如病毒核酸检测和基因测序分型。  结果   该起暴发疫情共持续3 d,累计报告病例31例,病例均为幼儿,罹患率为14.16%（31/219）,其中4岁病例占比最大（93.55%,29/31）,小（4）班罹患率最高（40.00%,12/30）;病例临床症状主要为呕吐（100%）、腹泻（12.90%）和腹痛（6.45%）,无重症和死亡病例。 流行曲线提示疫情为一次性暴露后同源感染引起。 队列研究显示近距离暴露呕吐物幼儿发病风险是远距离暴露幼儿的3.98倍（相对危险度 = 3.98,95% 置信区间: 2.159～7.334）。 病例样本诺如病毒阳性检出率为61.54%（8/13）,经基因测序和鉴定分型确定渉疫毒株为GⅡ.3[P12]基因型诺如病毒。  结论   该起疫情暴发原因是托幼儿童暴露于首发病例呕吐物形成的气溶胶,感染毒株为GⅡ.3[P12]基因型诺如病毒。 建议托幼机构加强教职工诺如病毒疫情防控知识培训,尤其是对病例呕吐物和排泄物的应急处置,防止类似疫情再次发生。     

扬州地区急性散发性诺如病毒感染性腹泻的临床特点分析

目的：分析55例急性散发性诺如病毒性腹泻患者的流行病学特征和临床特点,为该病的防治提供科学依据。方法收集扬州市三家哨点医院2013年1月～12月门诊腹泻患者大便标本513份,分析临床资料,同时用 RT-PCR方法检测诺如病毒。结果诺如病毒阳性者55例,阳性率10.7％。感染者的年龄与未感染诺如病毒患者比较差异有统计学意义（χ2＝4.27,P＜0.05）,而性别、职业、是否为食源性疾病与未感染诺如病毒患者比较差异无统计学意义（χ2＝0.086～3.21,P值均＞0.05）。临床症状的发生诺如病毒感染者更易出现发热（χ2＝4.6,P＜0.05）,而其他症状如腹泻次数（≥5次/天）、腹痛、恶心、呕吐等与未感染诺如病毒患者比较差异无统计学意义（χ2＝0.139～3.636,P值均＞0.05）。结论诺如病毒是急性腹泻的常见病原体,发病率较高,单凭临床症状很难与其他腹泻相鉴别,需通过病原学诊断确诊。     

2014-2019年成都地区诺如病毒聚集性疫情时空分布特征分析

  目的  应用地理信息系统（GIS）对成都地区诺如病毒聚集性疫情进行时空分布特征分析,为诺如病毒疫情防控提供依据。  方法  以成都地区2014 — 2019年聚集性疫情病例资料建立数据库,利用GIS软件与成都地区矢量地图关联,应用集中度法与圆形分布法分析疫情时间聚集性,Moran’s Ⅰ 法分析空间自相关。  结果  成都地区诺如病毒聚集性疫情M值为0.3927872,具有一定时间聚集性,冬季高于其他季节,夏季最低;不同型别的平均发病日与发病高峰期不同,时间集中于11月至次年3月。 空间分布呈现中心城区高于郊区特点,不同季节“热点”与“冷点”区域不同。  结论  成都地区诺如病毒聚集性疫情时空聚集性显著,应关注重点区域开展防控。     

一起涉及7所学校的Ⅰ型诺如病毒感染性腹泻暴发调查

目的调查2008年3月浙江省杭州市余杭区塘栖三中等7所学校发生Ⅰ型诺如病毒感染性腹泻暴发疫情的原因,并采取控制措施。方法开展问卷调查和病例对照研究,采用SPSS13.0软件进行数据分析;采集病例肛拭子、咽拭子及呕吐物等样本进行诺如病毒PCR检测。结果检出诺如病毒阳性标本32份;饮桶装水量与患病之间呈正相关(r=0.900,P=0.037);饭前便后洗手频次与患病间呈负相关(r=-1.000,P=0.000);同宿舍或同伴存在病例与患病间存在统计学关联[χ2=21.947,P=0.000,OR(95%CI)=3.264(1.957～5.443)]。结论Ⅰ型诺如病毒病原体污染的桶装水为共同暴露源,同时存在学生间的密切接触传播和患者呕吐物、粪便形成的气溶胶传播等多种传播途径。     

济南地区秋冬季腹泻中轮状病毒及诺如病毒的感染分析

目的分析济南地区腹泻中轮状病毒(RV)及诺如病毒(NV)的流行状况,为腹泻的诊治提供依据。方法采集2013年及2014年9~12月济南市腹泻患者粪便标本579例,实时荧光定量PCR检测A组RV及GⅠ/GⅡ型NV,采用SPSS 13.0统计软件对临床及流行病学资料进行统计分析。结果 579例腹泻患者中265例检测阳性,阳性率为45.77%(265/579);其中A组RV阳性166例,阳性率为28.67%;GⅠ型NV阳性2例,阳性率为0.35%;GⅡ型NV阳性97例,阳性率为16.75%。感染RV和NV的病例中,男女比例分别为2.53∶1(119/47)及1.30∶1(56/43);RV阳性病例年龄主要集中于2岁以下(80.12%),尤其是1岁以下幼儿所占比例最大(51.20%);NV感染对象主要为小于2岁的婴幼儿(56.57%)及20岁以上成年人(38.38%)。RV和NV感染患者职业均以儿童及学生为主(90.96%和62.63%);两者均以腹泻和恶心呕吐为主要临床症状(95.18%和84.85%)。结论 A组RV是2013~2014年济南地区秋冬季腹泻的主要病原体,GⅡ型NV也是引起散发性腹泻的主要病原;2岁以下幼儿是RV和NV感染的高危人群,NV还易引起成年人感染,腹泻和恶心呕吐为主要临床症状。     

我国诺如病毒感染性腹泻流行现状及防制措施建议

目的为加强我国诺如病毒感染性腹泻监测与防控工作,更新相关技术指南,提出技术关键点的措施建议。方法收集2006—2013年在全国突发公共卫生事件报告系统所报告的其他感染性腹泻暴发数据、全国病毒性腹泻监测网络2006—2012年数据以及国内外诺如病毒感染监测和控制技术指南及有关文献,分析我国诺如病毒发病情况、病原分型和暴发危险因素,监测及防控工作中存在的问题,比较国内外相关防控技术指南。结果2006—2013年全国诺如病毒腹泻暴发疫情报告数逐年上升,共报告56起,发病4979例,平均每起暴发89例病例,主要病原类型包括GⅠ型、GⅡ型。在病毒性腹泻监测哨点医院住院的5岁以下儿童腹泻病例中,诺如病毒检出率从2007年的11.2%上升至2011年20.3%,2012年为15.3%。结论我国诺如病毒感染性腹泻暴发和住院病例呈上升趋势,暴发规模较大,暴发监测的敏感性有待改进。本研究提出诺如病毒感染性腹泻防控主要技术措施建议,对指导开展我国诺如病毒腹泻防控工作,更新技术指南有重要参考价值。     

一起诺如病毒感染性腹泻和流感疫情暴发消毒处理措施

目的有效控制病毒性腹泻和流感疫情。方法采取现场调查和有效的消毒措施,积极开展有效的疫源地消毒。结果7月2~15日,江西省南昌某高校发生感染性腹泻145例和流感94例,经过现场流行病学调查证明感染性腹泻为诺如病毒感染。通过有效的临床积极救治和疫源地消毒以及医院消毒隔离措施,使疫情得到了有效控制,所有病例解除隔离,未出现死亡病例。结论积极的临床救治,迅速地进行流行病学调查确诊,有效地开展消毒隔离措施和疫源地消毒措施,使疫情得到迅速控制。