广州市腹泻监测病例诺如病毒分子流行病学特征

目的 了解广州市腹泻监测病例中诺如病毒分子流行病学特征。方法 2014-2015年选取广州市两家医院的门诊科室作为监测哨点,每间哨点医院每周采集5岁以下和5岁及以上腹泻病例粪便样本各3份,将采集的标本送至广州市疾病预防控制中心检测诺如病毒。阳性标本进行基因序列测定并进行同源性分析。通过中国传染病疫情和突发公共卫生事件网络直报系统收集2014-2015年广州市报告的诺如病毒感染引起的暴发疫情数据,开展流行病学分析。结果 共收集腹泻标本732份,诺如病毒阳性136份,阳性率为18.58%。各年龄组诺如病毒阳性率不同（2=20.39,P=0.001）,其中5岁以下年龄组最高（24.21%）。基因分型结果显示GⅡ组133份（97.80%）,GⅠ组3份（2.20%）。分别对2014年（4份）及2015年（5份）阳性标本进行测序,结果提示,2014年诺如病毒流行株以GⅡ.4 Sydney_2012变异株（75.00%）为主,2015年以GⅡ.17变异株（55.60%）为主。2014-2015年共报告诺如病毒感染性腹泻暴发疫情23起,其中14（60.80%）起由GⅡ组引起。结论 广州市诺如病毒感染性腹泻流行毒株仍以GⅡ组为主,其中2014年优势毒株为GⅡ.4 Sydney_2012变异株,2015优势毒株为GⅡ.17变异株。     

2015-2016年天津市哨点医院腹泻病例诺如病毒感染状况调查

目的 了解2015 — 2016年天津市腹泻散发病例中诺如病毒感染状况,为制定相关防治策略提供依据。 方法 收集2015年1月至2016年12月天津市5家哨点医院上报的1 249例腹泻散发病例的流行病学资料,留存患者粪便样本,使用实时荧光定量反转录–聚合酶链式反应（RT-PCR）方法检测诺如病毒核酸,并对结果进行基因型别分析。 结果 1 249例腹泻患者中诺如病毒检出率为14.41%（180/1 249）;＜1岁年龄组检出率最高,为26.07%（85/326）,各年龄组检出率差异有统计学意义（P＜0.01） ;一、四季度诺如病毒检出率明显高于二、三季度;滨海新区（30.00%）检出率高于城区（16.62%）和农村地区（11.89%）;基因型以GⅡ型为主,GⅡ型单独感染占86.05%,GⅠ型单独感染占11.05%,GⅠ和GⅡ共同感染占2.91%。6 ~ 45岁GⅠ型所占比例较其他组高,最高达33.33%;GⅠ型主要分布在4 — 9月。 结论 天津市哨点医院腹泻病例诺如病毒感染率较高,冬春季节高发,滨海新区是高发地区,婴幼儿为高发群体,优势基因型为GⅡ型,GⅠ型在中青年群体和夏季所占比例相对较高。 应根据诺如病毒流行特征开展防控工作,并针对重点人群进行主动监测。      

2018-2019年湖北省5岁及以下腹泻儿童诺如病毒感染特征和病原学分析

  目的  了解2018 — 2019年湖北省≤5岁腹泻儿童诺如病毒感染流行病学及分子特征。  方法  收集2018 — 2019年湖北省病毒性腹泻监测哨点医院≤5岁腹泻儿童粪便标本,共计922份。 采用实时荧光反转录聚合酶链式反应（real-time RT-PCR）方法进行诺如病毒GⅠ和GⅡ组核酸检测。 对诺如病毒检测阳性的标本应用real-time RT-PCR分别扩增RNA聚合酶和衣壳蛋白片段,将获得的PCR产物直接测序并进行基因型别分析。  结果  湖北省≤5岁腹泻患儿粪便标本中,诺如病毒核酸阳性样本为122份,阳性率13.23%。其中诺如病毒GⅡ组119例（97.54%）,诺如病毒GⅠ组3例（2.46%）。 男女童感染者差异有统计学意义（χ2=8.805,P=0.003）。 ≤5岁儿童以6～12月龄为主要发病人群。 诺如病毒感染季节为冬春季,呈现2个流行峰,10 — 12月为高流行峰;诺如病毒主要为GⅡ组,聚合酶区和衣壳区基因分型主要为GⅡ.4 Sydney［P31］（27.71%）、GⅡ.2［P16］（26.51%）、GⅡ.3［P12］（26.51%）和GⅡ.4 Sydney［P16］（16.87%）。  结论  2018 — 2019年湖北地区≤5岁腹泻患儿感染诺如病毒存在多种基因型和不同的重组亚型,加强诺如病毒的基因型别监测和重点人群防护有助于诺如病毒腹泻感染的防控。     

2016年浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒感染状况及其基因型别特征

目的 调查浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒的感染状况、基因型别及其动态变化趋势。方法 于2016年采集湖州市食源性疾病主动监测哨点医院的急性胃肠炎病例粪便标本。采用特异性引物探针,应用real-time RT-PCR对标本进行诺如病毒核酸检测。同时对阳性标本衣壳蛋白基因片段进行扩增和测序,结合在线分型工具和序列系统进化分析诺如病毒基因型别。结果 501份急性胃肠炎患者粪便标本检出诺如病毒阳性101份,阳性率20.16%,以GⅡ基因组为主（86.14%）;男性检出率为20.75%（50/241）,女性检出率为19.54%（51/260）,差异无统计学意义。不同年龄段病例均检出诺如病毒,5岁儿童检出率最高。诺如病毒感染全年均有发生,但6-9月呈低流行状态。2016年湖州市流行的诺如病毒基因型别多样,包括GⅡ.17、GⅡ.4 Sydney_2012、GⅡ.3、GⅡ.13、GⅠ.6、GⅡ.2、GⅡ.6、GⅠ.7共8种基因型别。GⅡ.17和GⅡ.4 Sydney_2012呈月份交替流行。结论 湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒基因型别多样,且呈交替流行现象,应进一步加强监测各型别诺如病毒在本地的流行范围及型别分布变化情况。     

2018－2020年上海市5岁以下住院儿童病毒性腹泻病原学特征分析

  目的  对2018 — 2020年上海市5岁以下感染性肠胃炎住院患儿进行主要病毒病原学检测,了解目标人群中病毒的分子流行病学迁移变化特征,为病毒性腹泻的防控和疫苗研发及应用提供数据支撑。   方法  采集上海市某儿科医院5岁以下腹泻住院患儿的粪便标本,并收集相关流行病学资料。 采用ELISA、荧光PCR以及巢式PCR方法对轮状病毒、杯状病毒（包括诺如病毒和札如病毒）、星状病毒和肠道腺病毒进行检测和分子分型。   结果  共采集粪便标本805份（男性543份,女性262份）,病毒检出率为47.33%,检出率最高的病毒为杯状病毒（31.18%）,其次为A组轮状病毒（17.64%）;杯状病毒中诺如病毒GⅡ型的占比最高（95.62%）。 轮状病毒以G9P［8］为主要流行型别（占比90.85%）。 诺如病毒GⅡ型以GⅡ.4［P31］和GⅡ.3［P12］为主要流行株（占比分别为32.08% 和19.58%）;但2020年以来,新兴亚型GⅡ.4［P16］和GⅡ.2［P16］检出率明显高于2018和2019年（χ2=17.337,P＜0.001; χ2=11.044,P=0.001）。 此外本地首次从1名4月龄患儿粪便中发现1株乐儿德轮状病毒疫苗株。   结论  杯状病毒检出率高于轮状病毒的趋势加剧,使杯状病毒（主要是诺如病毒）疫苗的研发和上市需求愈发迫切。研究首次揭示了住院儿童中诺如病毒GⅡ型的主要流行和新兴亚型,为多效价的诺如疫苗研发提供了参考依据。轮状病毒G9型别近年检出率升高,需要对轮状病毒型别变化保持警戒、追踪和深究。     

2019年天津市急性胃肠炎人群诺如病毒基因分型分析

目的分析2019年天津市急性胃肠炎人群中诺如病毒的基因特征。方法本研究采集2019年全年天津市各区疾病预防控制中心送检的散发、暴发、聚集性腹泻诺如病毒阳性粪便标本，采用反转录聚合酶链式反应（RT-PCR）方法将标本进行扩增，对阳性产物进行聚合酶区和衣壳区序列测定，构建系统进化树。结果诺如病毒总体阳性率为6.01%（97/1615），除1月无样本检测外，其他各月份均有诺如病毒的检出。 其中GⅠ组检出率1.11%（18/1615），GⅡ组检出率5.02%（81/1615）。 聚合酶区和衣壳区基因分型结果:2019年的基因型别为GⅡ.2［P16］、GⅡ.4［P31］、GⅡ.17［P17］、GⅠ.3［P13］、GⅡ.6［P7］、GⅠ.5［P4］、GⅡ.3［P12］、GⅠ.5［P12］、GⅠ.1［P1］、GⅠ.2［P2］等。 13起急性胃肠炎暴发或聚集性腹泻病例中占比前3位的基因重组株为GⅡ.2［P16］（30.77%，4/13）、GⅡ.4［P31］（23.08%，3/13）、GⅡ.17［P17］（23.08%，3/13）。结论天津市诺如病毒感染的基因型呈多样性，不同基因型持续共同进化和循环，需进一步加强诺如病毒病原监测及分子分型鉴定工作。     

2014年浙江省湖州市急性腹泻患者诺如病毒感染及基因特征研究

目的 了解2014年浙江省湖州市急性腹泻患者诺如病毒感染状况及基因特征,为加强感染性腹泻监测与综合防控工作提供依据。方法 收集2014年湖州市综合性三级乙等和二级甲等各一家医院的粪便标本797份,采用实时荧光定量PCR方法进行诺如病毒核酸检测,并对诺如病毒核酸阳性标本进行衣壳蛋白区的序列测定和分析。结果 797份粪便标本中149份检出诺如病毒核酸阳性,阳性率18.70%（149/797）,以GⅡ基因型为主,占89.26%（133/149）。衣壳蛋白区序列的系统进化分析显示检出的诺如病毒有5种GⅠ型别和7种GⅡ型别,包括GⅠ.1、GⅠ.2、GⅠ.5、GⅠ.6、GⅠ.7、GⅡ.2、GⅡ.3、GⅡ.4、GⅡ.6、GⅡ.8、GⅡ.17、GⅡ.21,以GⅡ.4 Sydney_2012（55.5%）、GⅡ.17（25.5%）型为主。结论 诺如病毒在湖州市急性腹泻患者中存在较高感染,并且基因型别复杂,除了流行优势型别GⅡ.4外,2014年底还出现GⅡ.17型诺如病毒的流行,因此应加强诺如病毒腹泻监测工作,为今后疫情防控提供科学依据。     

2016年浙江省急性胃肠炎患者诺如病毒的分子流行病学特征分析

摘要：目的：探讨2016年浙江省急性胃肠炎患者中诺如病毒的流行病学和基因特征。 方法：收集2016年1月至12月共1 308份急性胃肠炎患者的临床流行病学资料和粪便标本,用一步法双重荧光RT-PCR技术检测诺如病毒GⅠ和GⅡ型,用分层抽样抽取阳性标本核酸进行普通RT-PCR扩增,并对扩增产物进行测序分析。 结果：诺如病毒阳性率为10.55%（138/1 308）,其中GⅠ型12例,GⅡ型118例,GⅠ/GⅡ型混合感染8例。诺如病毒在不同年龄组的阳性率随患者年龄上升而下降,以≥60岁组最低;不同性别组间的阳性率差异无统计学意义;诺如病毒感染全年分布,其中12月阳性率达到顶峰,为37.50%。测序结果显示GⅠ的基因亚型主要是GⅠ.6;GⅡ的基因亚型以GⅡ.4与GⅡ.17为主,分别占40.91%（18/44）和34.09%（15/44）。 结论：诺如病毒是引起2016年浙江省急性胃肠炎的重要病原体,且GⅡ.4和GⅡ.17是主要的基因亚型。     

2017-2018年浙江省湖州市急性胃肠炎病例GⅠ型诺如病毒感染状况及其基因型别特征

目的了解浙江省湖州市急性胃肠炎病例中GⅠ型诺如病毒的感染状况及基因型别特征。方法收集2017年4月至2018年6月湖州市2家哨点医院诊断为急性胃肠炎病例的粪便标本1 259份。 采用实时荧光定量反转录–聚合酶链式反应（real time RT-PCR）对提取的病毒RNA进行GⅠ和GⅡ型诺如病毒核酸检测。采用RT-PCR对GⅠ型阳性标本进行RdRp区和VP1区部分片段的扩增和测序。 综合在线分型工具和系统进化分析的结果判定病毒基因型别。结果诺如病毒核酸阳性171份，阳性率13.58%。 GⅡ型和GⅠ型诺如病毒的检出阳性率分别为11.83%（149/1 259）和2.70%（34/1 259），GⅡ型诺如病毒为检出的主要型别。 GⅠ型诺如病毒主要检出于2018年上半年。 2018年2 — 6月各月GⅠ型诺如病毒的检出阳性率均大于监测期间GⅠ型的平均检出阳性率。 基因分型结果显示，2018年检出的GⅠ型诺如病毒包括GⅠ.P4-GⅠ.5、GⅠ.P2-GⅠ.2、GⅠ.P1-GⅠ.1、GⅠ.Pd-GⅠ.3、GⅠ.P4-GⅠ.4、GⅠ.P2-GⅠ.5。 其中GⅠ.P4-GⅠ.5、GⅠ.P2-GⅠ.5和GⅠ.Pd-GⅠ.3重组型诺如病毒首次在湖州市检出。结论湖州市流行的GⅠ型诺如病毒基因型别多样，重组现象明显。 应加强GⅠ型诺如病毒在当地的分子流行病学监测，以及时发现新的变异或重组株。     

中小学及托幼机构急性胃肠炎患者诺如病毒流行病学研究

目的 分析常州市武进区突发公共卫生事件中来自中小学及托幼机构的急性胃肠炎患者诺如病毒感染流行病学特征,以期为该地区诺如病毒的科学防控提供依据。方法 收集常州市武进区2020年11月—2022年10月突发公共卫生事件中涉及中小学及托幼机构的有急性胃肠炎症状者(n=231)及与其密切接触的无症状人员(n=95)的肛拭子样本,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)法对样本进行诺如病毒及基因分型检测。结果 326份样本中,诺如病毒阳性检出率为45.09%(147/326);诺如病毒基因分型以GⅡ型为主,占85.71%(126/147)。140例诺如病毒阳性的急性胃肠炎患者的主要临床表现为呕吐(占95.71%, 134/140),且GⅠ型诺如病毒感染患者的呕吐症状更严重。4～6月的诺如病毒阳性检出率最高,为59.21%(45/76);男性感染诺如病毒的风险更高,诺如病毒阳性检查率达54.94%(89/162)。年龄小是诺如病毒的易感因素,0～6岁婴幼儿的诺如病毒阳性检出率最高(56.69%),其次为7～12岁儿童(46.43%)。结论 常州市武进区突发公共卫生事件中,诺如病毒感染患者的临床症状多为呕...     

一起高校多基因型诺如病毒感染暴发疫情的病原特征分析

目的 分析2020年一起急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒基因特征,为加强学校诺如病毒感染暴发疫情防控提供依据.方法 收集2020年9月2-10日甘肃省某高校一起诺如病毒感染暴发疫情中有呕吐腹泻症状在校人员的232份粪便标本,初步采用实时荧光PCR法进行初筛和基因组鉴定,随后采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)对诺如病毒...     

2020年甘肃省兰州市某高校一起诺如病毒感染暴发疫情调查

目的 调查2020年甘肃省兰州市某大学发生的一起诺如病毒感染疫情的流行病学特征及环境因素,为诺如病毒的防控提供依据。方法 设计调查表收集病例资料及其他疫情数据,采集健康、患病学生等的肛拭子和粪便样本以及环境涂片,使用诺如病毒(GⅠ/Ⅱ)核酸检测试剂盒,应用实时荧光聚合酶链式反应技术进行检测。对于GⅡ型诺如病毒阳性的样品,扩增部分RNA依赖RNA聚合酶区和衣壳区核苷酸序列并进行分析,利用诺如病毒基因在线分型工具鉴定基因型。率的比较采用χ²检验。结果 此次疫情共发现459例临床病例,罹患率为3.01%。其中女性罹患率(3.75%)高于男性(2.13%),差异有统计学意义(χ²=34.185,P<0.001)。A、B、C、D宿舍区学生罹患率差异有统计学意义(χ²=32.314,P<0.001),D区最高(3.73%),病例占总病例数的64.05%。腹泻组和无症状组诺如病毒阳性率分别为78.52%和40.82%,差异有统计学意义(χ²=6.760,P=0.009)。食堂职工与后勤职工诺如病毒阳性...     

2018－2019年北京市西城区6起学校急性胃肠炎聚集性疫情的GⅠ诺如病毒病原鉴定与溯源研究

  目的  分析2018—2019年北京市西城区6所学校发生的急性胃肠炎疫情GⅠ诺如病毒的基因型别特征。   方法   收集2018—2019年西城区6所学校急性胃肠炎病例的粪便标本37份。 采用实时荧光定量反转录聚合酶链式反应（real-time RT-PCR）对提取的GⅠ和GⅡ诺如病毒核酸进行检测。 采用RT-PCR进行GⅠ诺如病毒聚合酶区和衣壳蛋白VP1区部分片段的扩增和测序。 用诺如病毒在线分型工具对测序成功的毒株进行初步鉴定和基因分型,用BioEdit 7.0.9.0软件进行序列比对,用MEGA 6.06 软件构建进化树。  结果   6所学校（18,S1～S4和19,S5～S6）发生的诺如病毒急性胃肠炎疫情均为聚集性疫情,GⅠ诺如病毒核酸阳性率为83.78%（31/37）,GⅡ诺如病毒未检出;聚合酶区和衣壳蛋白VP1区进化分析分别显示,1起疫情的4株诺如病毒毒株分别与GⅠ.Pd参考株和GⅠ.3b参考株在同一分支,5起疫情的19株诺如病毒毒株与GⅠ.Pb参考株和GⅠ.6a参考株在同一分支;每所学校毒株相似性为100.0%。双区分型合并结果,1起疫情由GⅠ.Pd-GⅠ.3b引起,该重组株与GⅠ.3[P13]/Hu/MT008455/2018/Shanghai/CHI相似性高达99.6%;5起疫情由GⅠ.Pb-GⅠ.6a引起, 这重组株与GⅠ.6[P11]/Hu/MZ227264/2016/US相似性高达98.1%。  结论   2018—2019年北京市西城区6所学校诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情分别由GⅠ.Pd-GⅠ.3b和GⅠ.Pb-GⅠ.6a重组株引起。 应加强对诺如病毒重组株分子流行病学监测,为诺如病毒疫情提供预警预测的依据。