1起疑似食源性诺如病毒感染暴发疫情的流行病学调查

摘要:目的 调查1起小学内出现多名急性胃肠炎病例的感染事件,提出预防控制措施。方法 按照病例定义开展病例搜索,采用描述性流行病学方法和病例对照研究方法进行分析;样本采用RT-PCR方法进行肠道病毒核酸检测。结果 武进区某小学2015年3月2日-11日,出现149例以呕吐症状为主的学生,罹患率为9.0%,3月2日出现发病高峰,病例发病急、班级分布广。现场采集患者肛拭子或呕吐物、对照及食堂工作人员肛拭子、食物和环境样本等共42份,其中2名患者肛拭子、2名患者呕吐物及1名食堂工作人员肛拭子检测出诺如病毒GII型。结论 这是1起由诺如病毒GII型引起的急性胃肠炎暴发疫情,暴发原因可能是由带毒食堂工作人员污染部分食物所致,以食源性传播为主。     

南宁市某公司因蓄水池被诺如病毒污染引起急性胃肠炎暴发调查

目的 对H公司1起诺如病毒感染引起的急性胃肠炎暴发开展调查,分析感染原因和传播途径。方法 根据病例定义开展病例搜索,对供水系统进行卫生学调查,对危险因素进行病例对照研究,采集病例肛拭子、自来水、桶装水进行诺如病毒核酸检测。结果 疫情历时4d,共搜索到病例184例,罹患率10.09%（184/1823）;临床症状主要为腹泻（100%）、腹痛（65.76%）、恶心（50.07%）、呕吐（50.35%）、发热（40.21%）;市政供水进入蓄水池A、B前余氯为0.17mg/L,浊度正常;蓄水池A供应的综合楼6楼和18楼末梢水浊度分别为11.7NTU和11.5NTU,有臭味,余氯均为0mg/L;4份现症病例肛拭子和5份蓄水池A样品均检出GⅡ型诺如病毒,而桶装水和蓄水池B均未检出。食用蓄水池A水洗过的水果和用蓄水池A水洗杯子后装桶装水喝是急性胃肠炎发病的危险因素（OR=6.295,95%CI:4.018~9.862;OR=2.665,95%CI:1.424~4.987）。结论 本次急性胃肠炎暴发是由于污水管道堵塞导致生活饮用水受诺如病毒污染引起的,应加强饮用水卫生管理。     

1起疑似气溶胶传播的诺如病毒暴发疫情调查

目的调查1起学校内胃肠炎暴发疫情,查清病原、感染来源和传播的危险因素,提出针对性防控措施。方法在全校师生以及家庭成员中搜索病例,对学校的供水、食堂、食品加工、卫生学环境以及学生的就餐、饮水情况进行调查,采集饮用水、食堂剩余食品以及病例的咽拭子、肛拭子等样本进行实验室检测。结果共发现12例病例,全部为学生,罹患率为1.13%;病例全部为同班学生,罹患率为29.27%。3名病例的肛拭子检出诺如病毒GII型阳性(包括首发病例),其他为阴性。结论本起疫情为诺如病毒GII型引起的胃肠炎暴发疫情,原因可能为首发病例呕吐物形成的气溶胶扩散,通过人-人接触模式传播。     

应用实时荧光定量RT-PCR技术快速检测基因Ⅱ型诺如病毒

目的建立基因Ⅱ型诺如病毒的实时荧光定量RT-PCR检测方法,并应用于临床标本的检测。方法二氧化硅法提取粪便中的病毒RNA,使用针对基因Ⅱ型诺如病毒N/S结构域的引物和探针建立荧光定量PCR方法,对罗城县急性胃肠炎疫情的34份标本进行检测,并与常规RT-PCR和ELISA检测结果比较;还用该法对2006年2月至2007年1月广西急性胃肠炎暴发及散发病例粪便样本305份做了临床检测。结果用实时荧光定量RT-PCR法成功地从罗城疫情样本中检测出基因Ⅱ型诺如病毒,实时荧光定量RT-PCR、常规RT-PCR和ELISA的检出率分别为为85.3%、76.5%和26.5%。而实时荧光定量RT-PCR对114份对急性胃肠炎暴发疫情及191份散发病例样本的基因Ⅱ型诺如病毒检出率分别为56.1%和23.6%。结论诺如病毒的实时荧光定量RT-PCR检测方法具有快速、灵敏和特异的优点,不但能对标本中病毒浓度进行定量检测,还能鉴别诺如病毒基因型别。同时也发现基因Ⅱ型诺如病毒感染在广西急性胃肠炎暴发疫情和散发病例中较常见。     

1起学校诺如病毒急性胃肠炎暴发的病原学检测

目的 对1起学校急性胃肠炎暴发疫情进行病原学检测分析。方法 对该学校暴发疫情的急性胃肠炎病例、厨房工作人员及病例对照采集肛拭子标本,提取核酸RNA,应用实时荧光RT-PCR试剂盒进行诺如病毒、札如病毒、轮状病毒、腺病毒、星状病毒检测,对阳性标本进行核衣壳编码区RT-PCR扩增、序列测定和系统进化分析。结果 21份患者肛拭样本中有16份GII型诺如病毒实时荧光RT-PCR阳性;所有标本的札如病毒、轮状病毒、腺病毒、星状病毒检测阴性。14份诺如病毒核酸阳性标本获得321bp目标片段序列,彼此间核苷酸相似性100%,提示同一来源;GenBank的BLAST结果显示,本次诺如病毒疫情毒株与GⅡ.2的参考株AY134748(Snowmoutain/1976/US)、X81879 (Melksham/1989)同源性最高,进化树上处于同一进化分支,属于GⅡ.2群。结论 该起学校急性胃肠炎暴发疫情是由诺如病毒GⅡ.2感染所致。     

苏州市14起诺如病毒胃肠炎暴发疫情流行特征分析

目的了解苏州市诺如病毒胃肠炎暴发疫情的流行病学特征。方法对2010-2014年发生的14起诺如病毒胃肠炎暴发疫情进行描述性流行病学分析,采用聚合酶链反应对病例肛拭子、粪便、呕吐物、水、环境涂抹标本进行核酸检测。结果 2011-2014年,苏州市共报告14起诺如病毒胃肠炎暴发疫情,罹患率波动范围为0.89%~21.18%。14起疫情中12起(85.71%)发生于托幼机构和中小学校,医院、农村各1起。全年均有发生,但以寒冷季节发生较多。仅1起查明与二次供水受到污染有关,13起未证实暴发原因。核酸检测结果12起由诺如病毒GII基因组引起,2起由GI基因组引起。结论诺如病毒已成为苏州市急性胃肠炎暴发疫情的重要病原,托幼机构和学校是高发场所,GII基因组是主要基因组。在暴发疫情处理中,应加强传染源和传播途径的调查。     

一起水源性污染导致的诺如病毒胃肠炎暴发调查

目的通过对一起诺如病毒胃肠炎暴发疫情开展流行病学调查,为类似事件调查处置提供参考。方法根据诺如病毒调查问卷,对所有病例进行流行病学调查,采用荧光PCR检测诺如病毒核酸。结果此次疫情共有诺如病毒感染病例47例,采集现症患者粪便标本3份,经检测3份为诺如病毒GII阳性;罹患率为27.65%。平均年龄51岁,临床表现为腹泻(100.00%)、腹痛(80.85%)、恶心(89.36%)、呕吐(8.51%)等等胃肠道症状。结论本次疫情为一起由GII型诺如病毒引起的胃肠炎暴发疫情,供水管网泄漏为本次疫情的危险因素。     

北京市东城区一起GⅠ型诺如病毒感染暴发疫情的调查报告

目的 通过对某小学（以下称F小学）一起GⅠ型诺如病毒引起的急性胃肠炎暴发疫情进行调查和分析,为有效控制学校内发生的急性胃肠炎暴发疫情提供科学依据和经验借鉴。方法 采用现场流行病学调查方法,对F小学的急性胃肠炎暴发疫情中病例进行个案调查,采集病例和餐饮人员样本和环境样本,采用实时荧光PCR方法检测肠道病毒核酸。结果 2018年10月19 - 22日,F小学共报告急性胃肠炎病例145例,罹患率为21.77%。采集呕吐物及粪便标本29份,采集环境涂抹标本10份, 经检测9份粪便标本和2份涂抹标本为GⅠ型诺如病毒病毒核酸阳性。结论 此次疫情为一起由GⅠ型诺如病毒引起的小学生急性胃肠炎暴发疫情,餐饮人员隐性感染可能与本次疫情有关。     

牡蛎养殖区人群诺如病毒感染监测对暴发的预警作用

目的了解牡蛎养殖区人群诺如病毒感染病例的流行特征,研究病例监测对暴发的预警作用。方法 2014年1—12月,采用多阶段抽样方法从牡蛎养殖区选取部分社区人群进行入户调查,回顾其过去4周内急性胃肠炎的发病情况。采用实时RT-PCR与半巢式PCR相结合的方法检测诺如病毒,测序并绘制系统发育树。结果调查共发现75例急性胃肠炎病例,年发病率为0.10次/人年;诺如病毒阳性率为20.0%(15/75);系统发育分析显示,诺如病毒优势流行株为GII.4 Sydney 2012;发现新型GII.17变异株,检出时间为2014年3月。结论 GII.4 Sydney 2012仍是引起当地诺如病毒感染急性胃肠炎的主要流行株,在牡蛎养殖区哨点医院诺如病毒感染病例监测中发现的GII.17变异株对2014年冬季的暴发流行具有早期预警作用。     

饮用不洁桶装水引起的一起诺如病毒急性胃肠炎暴发调查

目的调查一起学校急性胃肠炎暴发疫情,查明原因,采取针对性措施,及时有效控制疫情。方法采用现场流行病学调查方法,描述病例分布和临床特征,分析危险因素;采集病例、食堂工作人员肛拭子,桶装水、食物样本,饮水机、食堂餐具涂抹样等标本,进行实验室检测。结果本次疫情涉及7所学校,共有病例259例,学生罹患率为2.53%,教职员工罹患率为0.13%。在33份病例肛拭子样本中,6份检出诺如病毒GII型阳性;9份未开封桶装水中,4份菌落总数和大肠菌群均超标,2份大肠菌群超标,1份菌落总数超标,部分结果严重超标。桶装水溯源调查发现海盐县发病学校使用桶装水的生产厂家及生产时间与同期邻近市诺如病毒暴发疫情学校使用桶装水的生产厂家及生产时间相同。两地送检的12份未开封桶装水水样中1份诺如病毒阳性。检测用于生产水源的溪水,结果诺如病毒阳性。结论本次疫情为一起由GII型诺如病毒引起的急性胃肠炎暴发疫情,主要为饮用不洁桶装水所致。     

1起诺如病毒引发校园急性胃肠炎暴发疫情的流行病学调查分析

目的 掌握连云港市某学校一起诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情的原因和流行特征。 方法 对连云港市某学校诺如病毒急性胃肠炎病例进行个案调查,对调查数据完成描述性及分析性流行病学分析;采集病例肛拭子、呕吐物以及厨房冷菜、荤菜刀板涂抹样、22日三餐食物标本、直饮水滤芯涂抹样,用PCR法进行肠道病毒核酸检测。 结果 2018年5月22日10:00—5月24日4:00连云港市某学校3 720名学生中共计发生急性胃肠炎80例,罹患率2.15%,其中男生罹患率2.14%(52例),女生罹患率2.17%(28例),差异无统计学意义(P>0.05)。小学部罹患率3.89%(35例)高于初中部的1.19%(24例)和高中部的2.61%(21例)。5份肛拭子、1份呕吐物以及厨房冷菜刀板涂抹样核酸检测诺如病毒GⅡ阳性。5月22日晚餐中食用京酱肉丝(含生黄瓜丝)是发病的危险因素(OR=6.00,95%CI:1.30～27.70),并且随着该菜食用比例的增加,急性胃肠炎的发病呈明显升高趋势(χ2=5.561,P=0.020)。 结论 此次疫情是由诺如病毒GⅡ型引起的胃肠炎暴发,学校应重视对食品加工过程中的卫生清洗、消毒工作,确保水果及凉菜的安全卫生,同时积极开展健康教育工作,加强学生预防传染病的意识。     

泰州市急性胃肠炎学校聚集性疫情病原学鉴定及分子溯源

目的 了解2018年10月至2019年1月间泰州地区急性胃肠炎疫情主要致病原,掌握其传播流行规律。方法 采集学校聚集性疫情中患者的咽拭子和肛拭子标本,进行病原学核酸检测,测定阳性疫情株VP1基因序列,构建系统发生树,分析疫情株所属流行亚群,推测该流行亚群做传染病人口学模型和传播路径,以及VP1基因变异性分析。结果 共采集疫情样100人份,检出诺如病毒GII型阳性45份,测定其中20份标本VP1基因序列,除1份为GII.3型外,其余均为GII.2亚型,该GII.2型疫情株间同源性平均达99.4%,其与2016-2017年中国、日本流行株属于同一流行亚群,该亚群起源于上海地区,且仍处于流行上升阶段。结论 本时间段泰州市急性胃肠炎学校聚集性疫情的主要致病原是GII.2型诺如病毒,其属于一个活跃的流行亚群。     

长沙地区诺如病毒基因型分析

目的确定长沙地区引起急性胃肠炎诺如病毒的类型。方法从128例腹泻患者粪便中,提取RNA。将RNA进行逆转录、扩增、测序,并通过构建基因进化树进行分析导致长沙地区患者感染的诺如病毒的主要种类。结果63个样品中含有诺如病毒,分别为GII-3、GII-4、GII-12三种类型,其中GII-4为主要病原体。结论在长沙地区,诺如病毒GII-4是引起病毒性胃肠炎的的主要致病株。GII-4基因进化快速,已成为全球范围内导致急性胃肠炎的最常见病毒株。     

一起高校诺如病毒感染引发急性胃肠炎聚集性疫情的调查

  目的  调查一起诺如病毒引发的急性胃肠炎聚集性疫情案例,为防控诺如病毒感染引起的急性胃肠炎疫情提供科学依据。  方法  2019年3月,采用现场流行病学调查方法,收集湖州师范学院基本情况和患病学生相关信息资料,进行流行病学特征分析,采集病例的粪便标本进行实验室检测。病例定义、具体检测标准和步骤依据《感染性腹泻诊断标准》(WS 271—2007)和《诺如病毒感染暴发调查和预防控制技术指南(2015版)》。  结果  自2019年3月15—20日,疫情共报告13例确诊病例,均为同班学生,男生1例,女生12例,罹患率分别为25.00%(1/4)和37.50%(12/32),差异无统计学意义(χ2=2.05,P>0.05)。实验室检测采集10名病例学生肛拭子标本,检测结果均为Ⅱ型诺如病毒阳性,阳性率为100%。  结论  疫情为一起Ⅱ型诺如病毒感染引发的急性胃肠炎暴发,可能是班级群体活动中存在排泄物污染传染源,经人际传播所致。建议学校加强传染病防控知识教育,提高师生防护意识和能力。     

2016 - 2018无锡市腹泻病疫情中诺如病毒的分子流行病学特征

目的 鉴定无锡市2016年3月 - 2018年3月急性腹泻病突发疫情中诺如病毒的感染流行情况,并对病原体进行分子特征研究。方法 对疫情上送的暴发急性病例标本,采用荧光PCR初步判定病原体,常规RT - PCR检测诺如病毒RNA聚合酶和衣壳蛋白基因片段,并进行序列测定和分子特征分析。结果 在30起暴发疫情中共有162份标本经荧光PCR检测均为诺如病毒核酸阳性,其中154份标本RT - PCR检测判为GII型诺如病毒,120份标本成功测序。测序结果显示,2016 - 2018年突发疫情中有5种基因型,分别是GII.P16 - GII.2、GII.P17 - GII.17、GII.4_Sydney2012、GII.4_NewOrleans和GI.6,2017年之前以GII.17病毒株流行为主,2017之后新的GII.P16 - GII.2重组株成为无锡市病毒性腹泻疫情中的绝对优势株。结论 诺如病毒是无锡市腹泻病疫情的最常见病原体,其最新的优势流行株是GII.P16 - GII.2重组株,和全国趋势一致。     

诺如病毒RdRp区和核心区部分基因克隆及序列分析

目的:明确引起急性胃肠炎暴发的诺如病毒RdRp区和衣壳区部分核酸序列,确定病毒基因亚型。方法:采集腹泻病人粪便标本,提取病毒核酸,通过RT-PCR扩增长度为387 bp的病毒RNA多聚酶区(RdRp)区和核心区部分核酸序列,并克隆至T载体,转化大肠杆菌,筛选阳性菌落,对插入片段测序,进行遗传进化分析。结果:确认此次流行株与韩国Seoul/0559/株和美国Shelby株核酸序列相似性最高。结论:国内首次发现诺如病毒GII/12亚型引起急性胃肠炎暴发。