MicroRNA-146a前体区基因多态性与江苏地区汉族人群喉癌遗传易感性的关联性分析

目的探讨microRNA-146a（miR-146a）前体区基因多态性位点rs2910164 G〉C与喉癌的关联性。方法建立病例一对照研究,选取204例喉癌患者和440例健康对照者,收集一般人口学资料和临床病理学特征,采用TaqMan探针对miR-146a rs2910164位点进行基因分型,logistic回归模型用于评价rs2910164位点与喉癌发病风险的关联性强度。结果rs2910164多态性位点与增加罹患喉癌风险显著相关（GC/CCVS．CC：OR调整=2．49,95％CI=1．57-3．94）。分层分析显示,与携带GG基因型个体相比,携带C等位基因的吸烟、饮酒以及无肿瘤家族史个体罹患喉癌风险显著增加（P均〈0．05）,吸烟、饮酒与miR-146a rs2910164位点的共同作用效应更加显著（吸烟与rs2910164GC/CC：OR=6．39,95％CI=2．72-15．0;饮酒与rs2910164GC/CC：OR=4．19．95％CI=2．24-7．83）。结论miR-146ars2910164C等位基因与增加罹患喉癌风险有关,可以作为预测喉癌发病风险的潜在生物标志物。     

蒙古族人MicroRNA-149和196a2单核苷酸多态性肝细胞癌易感性

目的研究蒙古族人肝细胞癌发展中的miR-196a2 rs2910164, miR-149 rs2292832的多态性,为进一步对蒙古族肝细胞癌的预防及诊断提供可靠的参考依据。方法收集2018年10月至2019年12月内蒙古医科大学属医院的蒙古族肝癌患者80例(各个盟市来我院的就诊患者)和蒙古族60例对照受试者,采集其血液,提取DNA进行PCR,酶切分析miR-196a2 rs2910164, miR-149 rs2292832的多态性。结果对照组miR-196a2rs11614913, miR-149 rs2292832的基因型分布符合哈迪-温伯格平衡定律,人口的抽样合格。miR-196a2rs11614913的TT基因型和T等位基因与CC基因型相比,肝细胞癌危险性分别增加了2.26倍和1.50倍。发现miR-196a2 rs11614913的TT基因型和T等位基因与肝细胞癌危险性增加有显著相关性。结论 miR-196a2rs11614913的多态性可以作为蒙古族人肝细胞癌的诊断标记。     

miR-196a2 T>C基因多态与宫颈癌易感性的关系研究

目的:探讨miR-196a2 T>C基因多态与江苏人群宫颈癌遗传易感性的关系?方法:选择经组织学确诊的509例新发宫颈癌患者作为病例组,与病例组人群不存在生物学相关的562例正常人群作为对照组,利用Taqman实时荧光定量PCR技术检测基因型;选择宫颈鳞状细胞癌标本20例,实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测各基因型miR-196a的表达量;Logistic回归模型计算基因型与人群罹患宫颈癌的风险比(odds ratio,OR)及其95%的可信区间(95%CI)?结果:携带miR-196a2突变纯合子CC个体罹患宫颈癌的风险明显高于TT基因型个体(OR=1.45,95%CI:1.04~2.09),携带TC/CC基因型个体增加约33%的宫颈癌发病风险(OR = 1.33, 95%CI:1.06~1.81);对宫颈鳞状细胞癌(cervical squamous cell carcinoma,CSCC)分析,与TT基因型比较,含突变纯合子CC个体罹患CSCC的风险明显升高(OR=1.49,95%CI:1.05~2.11),携带TC/CC基因型个体增加约31%的CSCC发病风险(OR = 1.31,95%CI:1.00~1.73);RT-qPCR显示,在宫颈鳞癌组织中CC及CT/CC基因型与TT基因型相比,成熟miR-196a的表达水平明显升高?结论:MiR-196a2 T>C多态变异与中国江苏人群宫颈癌遗传易感性关联密切?     

miR-196a2成熟区单核苷酸多态性对靶基因LSP1表达的影响

目的:研究miR-196a2成熟区单核苷酸多态性rs11614913(T/C)对预测靶基因LSP1表达的影响.方法:构建含有不同基因型miR-196a2的真核表达载体pCDNA3.1-miR196a2-C和pCDNA3.1-miR196a2-T;同时利用化学合成含有不同基因型的成熟miR-196a2探针miR-196a2-C和miR-196a2-U.将靶基因LSP1的3'UTR序列克隆至pMIR-REPORTTM Luciferase载体中而获得LSP1报告基因载体pMIR-LSP1.采用所构建的miR-196a2真核表达载体以及化学合成的成熟miR-196a2探针分别与靶基因LSP1报告基因载体组建两套转染体系.分别共转染于HEK293、A549和CHO 三种细胞后进行荧光素酶活性分析.结果:miR-196a2真核表达载体与靶基因LSP1报告基因表达载体共转染于HEK293、A549和CHO三种细胞后进行荧光素酶活性分析.pCDNA3.1-miR196a2-C等位基因荧光素酶相对活性与pCDNA3.1-miR196a2-T等位基因相比均有显著降低(P<0.05);含不同基因型的化学合成的成熟miR-196a2探针与靶基因LSP1报告质粒共转染HEK293、A549和CHO三种细胞,miR-196a2-C等佗基因荧光素酶活性与miR196a2-T等位基因相比也有显著降低(P<0.05).结论:荧光索酶活性强弱间接反映了miR-196a2与靶基因LSP1结合能力的大小.当miR-196a2成熟区rs11614913位点为C时,miR-196a2可能更为有效地与预测靶基因LSP1结合,从而在转录后水平调控靶基因表达.     

食管鳞状细胞癌C20orf54基因多态性与吸烟、饮酒及体质量指数的相关性研究

目的探讨食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)C20orf54基因多态性rs13042395位点与吸烟、饮酒、体质量指数的相关性。方法选取7 673例患者和11 013例正常者C20orf54基因多态性rs13042395位点基因分型资料(基因分型采用sequenom芯片)。比较各组间基因型和等位基因频率的分布。结果病例组与对照组间C20orf54基因多态性rs13042395位点基因型和等位基因频率分布,差异具有统计学意义(P<0.05),C20orf54T等位基因降低ESCC患病风险(P=1.21E-11,OR=0.86,95%CI=0.82～0.90)。C20orf54基因多态性位点rs13042395在吸烟/不吸烟、饮酒/不饮酒及各级BMI人群中未观察到与ESCC的相关性。结论 C20orf54基因多态性、rs13042395遗传多态性与ESCC的易感性相关,与吸烟、饮酒、体质量指数无明显相关性。     

miR-499、miR-196a2、miR-149单核苷酸多态性与系统性红斑狼疮的关联性

目的探讨系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)患者与miR-499、miR-196a2及miR-149单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的关联性。方法选取111例SLE患者(SLE组)与120例健康者(对照组)为研究对象,收集临床资料并抽取2mL外周静脉血,提取基因组DNA。利用PCR-RFLP技术对研究对象miR-499rs22928323、miR-196a2rs11614913、miR-149rs3746444的单核苷酸多态性进行检测,分析SLE与SNP的关联性。结果 miR-196a2rs11614913表现为TT、TC、CC 3种基因型,与miR-196a2基因型TT+TC相比,基因型为CC的患者发病风险增加,OR=1.28,95%CI为1.03~1.84,P=0.017;miR-149rs22928323表现为TT、TC、CC 3种基因型,与miR-149基因型TT+TC相比,基因型为CC的患者发病风险不增加,OR=0.61,95%CI为0.38~1.38,P=0.283;miR-499rs3746444表现为AA、AG、GG 3种基因型,与miR-449基因型AA+AG相比,基因型为GG的患者发病风险不增加,OR=0.78,95%CI为0.58~1.11,P=0.188。结论miR-196a2内的SNP rs11614913与中国华东地区人群SLE的遗传易感性有关;miR-499、miR-149内的SNPs rs3746444、rs22928323与中国华东地区人群SLE的遗传易感性无关。     

pre-miR-196a2(rs11614913)、pre-miR-146a(rs2910164)基因多态性与中国皖南地区汉族人群支气管哮喘的相关性

目的:探讨pre-miR-196a2 (rs11614913)和pre-miR-146a(rs2910164)的基因多态性与中国皖南地区汉族人群支气管哮喘的相关性.方法:选择来自皖南地区的汉族支气管哮喘患者591例及健康对照者621例,采用PCR及飞行时间质谱分型法(MALDI-TOF MS)分析比较两组的基因型、等位基因频率.结果:两组pre-miR-1962 (rs11614913)位点等位基因T和C的分布相比,x2=12.785,p＜0.01,TT、TC、CC基因型分布相比,x2=13.446,p＜0.01;相对于TT基因型,CC、CT、TC +CC基因型的OR(95％CI)分别为1.647(p＜0.01)、1.500(p＜0.01)和1.542(p＜0.01),表明该位点的多态性可能增加支气管哮喘的危险性.两组pre-miR-146a(rs2910164)位点等位基因G和C的分布相比,x2=15.766,p＜0.01,CC、CG、GG基因型分布相比,x2=58.545,p＜0.01;相对于GG基因型,CC、CG、CC+ CG基因型的OR(95％ CI)分别为2.175(p＜0.01)、3.283(p＜0.01)和2.755(p＜0.01),表明该位点的多态性可能增加支气管哮喘发生的危险性.结论:pre-miR-196a T/C(rs11614913)和pre-miR-146a G/C(rs2910164)位点的多态性可能与中国皖南地区汉族人群支气管哮喘的发生有相关性.     

醌氧化还原酶1基因多态性与肝癌易感性关系研究

目的探讨肝癌易感性与醌氧化还原酶1(NQO1)基因多态性的关系。方法以桂林医学院附属医院136例肝癌患者为病例组,选择同期该院的123例无肿瘤患者为对照组,进行肝癌相关危险因素的问卷调查,应用荧光探针(Taqman MGB)技术检测NQO1基因609位点的多态性。结果 NQO1基因3种基因型在两组间差异有统计学意义(χ2=17.345,P<0.05),且携带有NQO1突变杂合子(C/T)和突变纯合子(T/T)的个体发生肝癌的危险性较携带野生纯合子(C/C)个体高,NQO1基因携带突变基因型T与经常吸烟可以增加罹患肝癌风险[OR=2.643,95%CI(1.379,5.066)]。结论 NQO1基因多态性在肝癌发生过程中,突变基因型可能是一个危险因素,且与吸烟存在协同作用。     

miRNA-196a2及miRNA-499基因多态性与膀胱癌的相关性研究

目的微小RNA(microRNA,miRNA)基因多态性与肿瘤的关系密切。文中探讨rs11614913(miRNA-196a2)及rs3746444(miRNA-499)的基因多态性与膀胱癌及其病理参数的相关性。方法选取膀胱癌患者283人作为膀胱癌组,正常体检者283人作为正常对照组。利用Massarray单核苷酸多态性检测技术对膀胱癌组和正常对照组的rs11614913(miRNA-196a2)及rs3746444(miRNA-499)基因多态性进行分析;采用Logistic回归模型分析各基因型与膀胱癌发生的关系并比较不同基因型与膀胱癌及其病理参数的关系。结果 rs11614913位点的各基因型在2组中分布差异有统计学意义(χ2=15.077,P<0.001),其中TT基因型在膀胱癌组中的频率(19.08%)显著低于对照组(33.95%),差异有统计学意义(P<0.05);TT基因型发生膀胱癌的风险是CC基因型的0.45倍(ORadjusted=0.45,95%CI:0.28~0.73)。rs3746444位点的各基因型在2组中分布差异无统计学意义(χ2=5.107,P=0.078),但GG基因型在膀胱癌组中分布频率(7.77%)显著高于对照组(3.56%),差异有统计学意义(P<0.05);GG基因型发生膀胱癌的风险是AA的2.39倍(ORadjusted=2.39,95%CI:1.10~5.17)。rs11614913及rs3746444位点的基因型分布频数在不同肿瘤分期、周围淋巴结转移、远端淋巴结转移组间的差异无统计学意义(P>0.05)。然而,在不同分化程度的肿瘤分组中2个位点的基因型分布频数差异有统计学意义(rs11614913:χ2=15.066,P=0.005;rs3746444:χ2=11.120,P=0.025)。结论 rs11614913(miRNA-196a2)及rs3746444(miRNA-499)基因多态性与膀胱癌的发生相关,2个位点的基因多态性与肿瘤的分化程度相关。     

MicroRNA 基因单核苷酸多态性与类风湿关节炎的相关性研究

目的 分析类风湿关节炎（RA）患者和健康人群microRNA-146a（miR-146a）、miR-499a、 miR-149 及miR-196a 多态性位点的相关rs2910164、rs3746444、rs2292832 及rs11614913 等位基因和基因型 频率分布的差异。探讨其与类风湿关节炎（RA）发病风险的相关性,以及与疾病活动性及严重性的关系。 方法 收集600 例RA 患者和398 例健康人群的外周静脉血,提取基因组DNA,采用基于连接酶检测反应的 单核苷酸多态位点（SNP）分型技术对研究对象的4 个SNP 位点进行检测。结果 rs3746444 位点的CT 基 因型与中国汉族人群RA 疾病的活动性和严重性相关,并且rs11614913 位点（miR-196a）与性别存在交互作用, 可能与RA 发病有关。结论 miR-499a 的rs3746444 位点的CT 基因型可能与中国汉族人群RA 疾病的活动 性和严重性相关。     

miRNA-196a-2基因多态位点rs11614913与胃癌易感性的关联研究

目的：探讨miRNA-196a-2的单核苷酸多态（single nucleotide polymorphisms,SNPs）位点rsll614913与胃癌易感性的关系。方法：采用病例一对照研究设计,研究对象为232例经组织学确诊的胃癌病例和250例按年龄、性别进行匹配的无肿瘤史的社区对照人群。采用探针法SNP基因分型技术检测miRNA-196a-2基因的C／T多态的基因型,计算rsll614913多态位点基因型在病例与对照中的分布情况,采用logistic回归计算校正相对危险度（oddsratio,OR）和95％置信区间（95％confidenceinterval,95％CI）．评价基因型对胃癌易感性的影响。结果：miRNA-196a-2基因多态位点rsll614913CC、CT和1Tr基因型在胃癌人群中的分布频率为44．0％、47．0％和9．0％,与对照组（28．8％,54．4％和16．8％）相比差异有统计学意义（均P〈0．05）;与CC基因型相比,携带1Tr或CT基因型的个体胃癌发病危险度降低（OR=0．369,95％CI：0．204～0．659;OR=0．564,95％CI：0．387～0．830）;携带突变T碱基（CT／TT）的胃癌患者发生淋巴结转移的危险度降低（OR=0．618,95％CI：0．438～0．795;P=0．010）。讨论：miRNA-196a-2基因的C／T多态性与中国汉族人群胃癌的遗传易感性相关。     

miRNA-146a基因多态性与长江以南女性汉族人群系统性红斑狼疮(SLE)的病例对照研究

 目的   研究miRNA-146a (microRNA-146a)基因rs2910164、rs57095329、rs6864584多态性与中国长江以南汉族女性人群系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)易感性间的关系。方法    采用病例-对照研究设计纳入病例和对照各179例,应用限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)等分子生物学技术分型,利用单因素及多因素Logistic回归,在多个遗传模型(加性、隐性、显性)下,研究miRNA-146a基因多态性与SLE的关系,用χ2检验分析基因多态与临床表型的关系。结果    miRNA-146a基因rs2910164等位基因G相对于C可能增加SLE的患病风险(P=0.003,OR=1.572,95%CI:1.169~2.114);多因素Logistic回归提示rs57095329在3个模型下均与SLE相关(加性:P=0.007,OR=1.849,95%CI:1.182~2.893;显性:P=0.031,OR=3.478,95%CI:1.121~10.792,隐性:P=0.010,OR=2.081,95%CI:1.189~3.642 ),且相对于AA基因型来说,AG、GG基因型的个体患SLE的风险增加。单纯病例设计中,表型研究提示,rs2910164等位基因G相对于C增加肾脏损害风险及抗SM异常;rs57095329位点A相对于G等位基因降低肾脏、关节、神经系统损害风险;而 AA基因型携带者抗RNP异常风险下降。结论  miRNA-146a基因rs2910164位点与rs57095329位点多态在长江以南汉族女性人群中与SLE易感性存在相关性,且与临床表型(如肾损伤)和免疫学指标(抗RNP)存在相关,但是rs6864584位点多态性可能与SLE的易感性无关。     

PTEN基因多态性与抑郁症风险的相关性研究

正抑郁症患者的临床特征主要包括持续缓慢的思维、抑郁情绪以及认知障碍,对日常生活活动的兴趣下降~([1])。抑郁症的发病机制复杂,与多种因素有关,如年龄、性别、婚姻状况、种族、教育、环境和遗传因素等,其中遗传因素是目前研究者们关注的热点之一。PTEN基因(gene of phosphate and tension homology deleted on chrom-some ten,PTEN)是一种肿瘤抑制     

Bax基因P53结合位点多态性与食管鳞癌易感性的关联研究

目的探讨Bax基因P53结合位点多态性与我国西南地区食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carci-noma,ESCC)发病的关联性。方法利用SNaPshot技术检测201例食管鳞癌病例组及183例健康对照的Bax基因rs1009316位点多态性的分布情况,分析不同基因型与食管鳞癌易感性的关联。结果食管鳞癌病例组和对照组中rs1009316的CC和CT/TT基因型频率分别为59.2%、40.8%和73.2%、26.8%,CT/TT相比CC增加食管鳞癌的发病风险(OR值为1.884,95%CI为1.224～2.901),T等位基因增加食管鳞癌的发病风险(OR值1.620,95%CI为1.103～2.379)。分层分析发现,无吸烟史群体中,T等位基因(OR值为1.858,95%CI为1.050～3.288)及CT/TT基因型(OR值为2.178,95%CI为1.143～4.147)分别增加食管鳞癌的发病风险。结论在中国西南地区人群中,Bax基因P53结合区域的多态性位点rs1009316是食管鳞癌的危险因素之一。     

EFNB2基因多态性与精神分裂症的相关性以及microRNA-137在其中的作用探讨

目的 研究EFNB2基因rs550067317位点单核苷酸多态性与精神分裂症的相关性以及microRNA-137(miR-137)在其中的作用探讨。方法 随机选择2015年8月-2017年12月期间我院收治的85例精神分裂症患者作为研究组,85例健康体检者作为对照组。分析所有受试者EFNB2基因rs550067317位点基因型以及血浆中miR-137水平。结果 研究组患者EFNB2基因rs550067317位点C等位基因是精神分裂症发生的保护因素(OR=0.413, 95%CI=0.226-0.750, P=0.002)。野生型受试者血浆miR-137水平显著高于突变型,差异有统计学意义(P&amp;amp;lt;0.01)。miR-137诊断精神分裂症的AUC为0.8619(P&amp;amp;lt;0.0001),敏感度为72.94%,特异度为85.88%,cut-off值为2.45。结论 EFNB2基因rs550067317位点基因多态性与精神分裂症风险相关,血浆miR-137水平检测精神分裂症具有较高的诊断价值。     

广西壮族人群白细胞介素-27基因rs181206C／T位点多态性的分布特点

目的：探讨广西壮族人群白细胞介素-27（ IL-27）基因rs181206 C／T位点的分布特点及其与不同地区和种族人群的差异。方法采用单碱基延伸的聚合酶链反应技术检测168例广西壮族人IL-27 rs181206C／T多态性,并与国际人类基因组计划（ HapMap）公布的中国北京人、日本人、非洲人和意大利人的 rs181206C／T位点的基因型和等位基因频率比较。结果168例广西壮族人中,检出rs181206C／T位点有3种基因型,分别为CC、CT和TT。 IL-27基因rs181206C／T位点最常见的基因型是TT（75．1％）,最常见的等位基因型是 T（85．7％）。男性及女性间 IL-27基因rs181206多态性位点基因型及等位基因频率比较,差异无统计学意义（ P＞0．05）;广西壮族人IL-27 rs181206C／T基因型及等位基因频率与北京人、日本人比较,差异无统计学意义（P＞0．05）,但与意大利人、非洲人比较,差异有统计学意义（P ＜0．05）。结论 IL-27基因rs181206 C／T位点基因型和等位基因频率在广西壮族人群中的分布与其他种族和地区人群相比有差异。     

IGF2BP2基因rs4402960多态性与内蒙古地区汉族人群2型糖尿病的相关性研究

目的 探讨内蒙古地区汉族人群胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白(IGF2BP2)基因rs4402960单核苷酸多态性的等位基因和基因型频率分布与2型糖尿病(type 2 diabetes,T2DM)的相关性.方法 采用等位基因特异性聚合酶链反应(AS-PCR)对360例内蒙古地区汉族人(T2 DM组166例,正常对照组194例)rs4402960进行基因分型.结果 T2 DM组中rs4402960的T等位基因频率和TT、GT基因型频率分别为41.6％、12.1％和59.0％,均高于正常对照组的10.6％、3.6％和13.9％(P均＜0.05);而T2 DM组的GG基因型频率为28.9％,低于正常对照组的82.5％ (P＜0.05).携带T等位基因是患T2 DM的危险因素(OR=6.02,95％CI=4.075～8.895).结论 IGF2BP2基因rs4402960多态性位点的T等位基因可能是T2 DM的风险等位基因,该位点G/T多态性与内蒙古地区汉族人群T2 DM具有相关性,可能是内蒙古地区汉族人T2 DM的易感基因之一.