一例NPHP1纯合缺失所致的Joubert综合征

患儿,男,因"6月龄竖头欠稳"于浙江大学医学院附属儿童医院康复科就诊。查体发现双眼追视欠灵活,竖头欠稳,不会翻身,双手握拳,双下肢负重差,四肢肌张力低。磁共振结果显示小脑蚓部小,中脑呈"磨牙状"改变,诊断为Joubert综合征。全外显子组测序及Sanger测序发现患儿存在AHI1基因的杂合移码突变(c.533_534delAA),该突变位点遗传自母亲;而针对已知致病基因的拷贝数变异分析提示NPHP1基因可能存在纯合型缺失。经多重连接探针扩增(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)方法进行验证,结果表明患儿的NPHP1基因确实存在纯合型缺失,且父母均为NPHP1杂合缺失的携带者。这是国内首次报道的由NPHP1纯合缺失所导致的Joubert综合征病例。由于NPHP1基因突变与肾脏损害相关性较高,应注意对此类突变患儿的密切随访。     

孕妇血浆中胎儿游离DNA片段浓度和长度均值的计算方法研究

目的:建立计算孕妇外周血中胎儿游离DNA片段(cffDNA)浓度和长度均值的新的数学模型。方法:根据孕妇外周血中母亲和胎儿的DNA片段的长度分布不同的现象,利用K-means算法和EM算法开发新的算法。用提出的新方法分析孕妇外周血样本的DNA片段长度分布,cffDNA浓度和片段长度均值。结果:(1)三份样本中来源于母亲的DNA片段长度均值,分别为167bp,166bp和165bp;cffDNA的长度均值为160bp,163bp和158bp;(2)孕妇血浆中cffDNA的浓度分别为10.4%,5.5%,17.4%。此结果与基于Y染色体的百分含量的方法计算所得的结果相近。结论:用本课题组提出的新方法分析孕妇外周血的cffDNA的浓度和长度均值是有效的、准确的。     

子痫前期患者外周血IGH-CDR3免疫组库的变化

目的:探讨子痫前期患者外周血中IGH-CDR3序列的多样性与免疫学特性。方法:分离子痫前期患者外周血中的B淋巴细胞,逆转录为cDNA后用ARM-PCR扩增H链CDR3区序列,利用高通量测序并与IMGT数据库对比揭示子痫前期患者IGH-CDR3受体库的多样性及免疫学特征。结果:5例子痫前期患者外周血IGH-CDR3的数目和种类差别较大,从1127条read到47385read;子痫前期患者有独有的免疫学特性,包括IGH-CDR3长度、N末端碱基的添加数、V、J区域使用偏好基因及末端去除的碱基数;子痫前期患者外周血中存在某些寡克隆异常增殖的情况。结论:子痫前期患者外周血IGH-CDR3免疫组库有其独有的特点。     

单基因病遗传变异自动化分析和解读研究

目的研究单基因病遗传变异的自动化分析和智能化解读,以满足单基因病相关临床和科研的精准医学需求。方法该研究采用信息学技术,建立单基因病基因变异参考数据库,参考GATK最佳实践对遗传变异进行分析和识别,参考ACMG单基因病变异临床致病性分级标准对遗传变异进行分级,根据患者疾病表型、遗传变异的变异类型、人群发生频率、预测的变异功能、临床显著性分级、数据库证据等信息对遗传变异进行综合评分和推荐。结果单基因病基因变异参考数据库整合了5 654种单基因病相关的26 109个基因上的648 814个遗传变异。基于云的单基因病遗传变异分析解读系统实现了单基因病遗传变异的自动化分析和智能化解读,并通过www.pgenomics.cn提供免费共享服务。结论单基因病遗传变异分析解读系统可帮助单基因病领域相关的临床医生进行遗传学精准诊断,加快单基因病领域相关科研人员的研究发现。