EZH2基因多态性与结直肠癌遗传易感性的关联性研究

摘要：目的：探讨EZH2(en hancer of zeste homolog 2)基因单核苷酸多态性（SNPs)与结直肠癌（CRC）遗传易感性的相关性。 方法：用病例-对照方法分析EZH2基因的2个SNPs位点（rs887569与rs1880357）在中南地区汉族人群中的分布。提取96例CRC患者与100例体检健康者的外周血DNA;用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性法（PCR-RFLP）检测EZH2基因型并计算相应等位基因频率;DNA测序验证基因分型结果。 结果：CRC组与健康对照组年龄分布（t=0.693,P=0.489）与性别构成（χ²=0.403,P=0.526）差异无统计学意义。CRC组与健康对照组EZH2基因rs887569位点与rs1880357位点基因频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡（P均>0.05）,证明所观察的样本具有群体代表性。EZH2基因rs887569位点TT、CC和TC基因型（χ²=1.531,P=0.465）及rs1880357位点GG、CC和GC基因型（χ²=0.670,P=0.413）在CRC患者和健康对照者间分布差异无统计学意义。对等位基因而言,rs887569位点C>T与rs1880357位点C>G等位基因分布在CRC患者与健康对照者间差异亦无统计学意义（OR=0.875,95%CI:0.488~1.566,P=0.667;OR=0.793,95%CI:0.403~1.563,P=0.503）。 结论：EZH2基因rs887569与rs1880357 SNPs位点多态性可能与CRC发病风险无关。     

基于WGCNA和ssGSEA的胰腺癌预后模型构建

［摘要］　目的　通过加权基因共表达网络分析（WGCNA)和单样本基因富集分析（ssGSEA）构建胰腺癌预后模型。方法　获取胰腺癌组织转录组测序数据和患者预后信息,ssGSEA对各肿瘤组织17 810条通路进行评分,利用WGCNA、单因素分析和Lasso回归筛选各通路参数,构建多因素Cox比例风险回归模型对胰腺癌患者的预后情况进行预测,并对模型进行评价。结果　经ssGSEA发现,不同胰腺癌组织各通路评分不同,如GO RECEPTOR REGULATOR ACTIVITY、GO MONOSACCHARIDE BINDING等通路,提示不同患者各通路活性有差异,这可能是引起肿瘤向不同结局发展的重要原因。经WGCNA分析采用动态剪切树法合并表达相似的通路模块,最终得到7个通路模块。其中,Blue模块中包含的通路最多,含3 098条通路。Red模块与胰腺癌患者生存状态有较高的正相关性（r=0.33,P<0.001）,Black模块也与其生存有显著的相关性（r=0.11,P=0.03）。同时,Red模块（r=0.30,P<0.001）和Blue模块（r=0.24,P=0.002）与胰腺癌组织学分期有显著的正相关性;Blue模块（r=0.27,P<0.001）、Yellow模块（r=-0.17,P=0.03）、Black模块（r=0.30,P<0.001）和Magenta模块（r=0.15,P=0.03）与胰腺癌肿瘤分期有明显的相关性。使用单因素分析、Lasso回归筛选Red模块中与生存预后相关的通路,共得到11条与胰腺癌患者生存预后相关的通路。进一步利用多因素Cox回归建立多通路预后预测模型,最终得到由5条通路构成的胰腺癌预后预测模型,C指数为0.7,赤池信息准则（AIC）为776.49,且该模型具有良好的预测效能（AUC=0.742）。结论　WGCNA和ssGSEA技术在胰腺癌预后模型的构建中有重要作用。     

硒蛋白P基因多态性与结直肠癌遗传易感性的关联性分析

目的:探讨硒蛋白P(Sepp1)基因rs7579位点单核苷酸多态性(SNPs)与结直肠癌遗传易感性的关系,为结直肠癌的遗传学机制研究提供理论依据。方法:采用病例对照研究方法,采用四引物扩增阻碍突变体系聚合酶链反应(tetra-primer ARMS-PCR)技术检测130例结直肠癌患者及153名体检健康者Sepp1基因rs7579位点基因型和等位基因频数,并经测序验证。分析Sepp1基因rs7579位点基因型、等位基因与结直肠癌遗传易感性的关联性,并分析不同临床特征结直肠癌患者Sepp1基因rs7579位点基因型与结直肠癌遗传易感性的关联性。结果:结直肠癌组和健康对照组研究对象Sepp1基因 rs7579 位点多态性分布情况均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),结直肠癌组患者和健康对照者Sepp1基因rs7579位点GG、GA和AA基因型频数及G、A等位基因频数比较差异无统计学意义(P>0.05)。分层分析,年龄≥55岁组中,结直肠癌组和健康对照者组研究对象rs7579位点GG、GA和AA基因型频数比较差异有统计学意义(χ²=3.228,P=0.050),结直肠癌组患者AA基因型频率明显低于健康对照组(χ²=3.228,P=0.050,OR=0.566,95%CI:0.320-0.999)。结论:Sepp1基因rs7579位点多态性与结直肠癌的发病无关联,A等位基因可能是55岁以上中国人群降低结直肠癌发病的保护性因素之一。