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1.
基因分型技术首次应用于类孟买型家系ABO基因的研究 总被引:3,自引:0,他引:3
目的 探计将基因分型技术用于解决临床输注中血型血清学难题。方法 报告首次在国内用基因分型技术用于一个类孟买型家系5口人ABO基因多态性的研究。在吸收放散试验、唾液血型物质凝集抑制等血清学试验基础上,采用快速盐析法提取外周血中的DNA,用PCR—SSP法扩增ABO血型等位基因。结果 一家5人中,兄弟3人均为类孟买型,ABO基因分型分别为A102B、A102B、Al20O1,而其父母血型基因与血清学血型相符合。结论 ABO PCR—SSP基因分型是一种方便、快速、可靠的技术,与血型血清学相比有着显优势。 相似文献
2.
目的研究HLA—A、B和DRB1基因与糖尿病视网膜病变的相关性。方法收集48名临床诊断为糖尿病视网膜病变(DR)患者的血样,采用rSSO HLA流式磁珠分型方法进行HLA—A、B和DRB1基因定型.统计DR患者HLA—A、B和DRB1三个基因座的基因频率;并引用以往本实验室调查的汉族健康对照人群的HLA基因频率数据,采用Woolf法计算相对危险度值。结果48例DR患者中。HLA—A、B基因频率的分布与正常对照组无显著差异.而DR患者HLA-Ⅱ类DRB1基因.DRB1*01基因频率显著高于正常对照组.而DRBI*12基因频率显著低于正常对照人群,计算RR值分别为5.32和0.34。结论DR患者HLA—A、B基因频率分布与正常对照人群无显著差异,但HLA—DRB1基因与DR具有相关性。 相似文献
3.
背景:HLA复合体是极其复杂的遗传系统,对其多态性的研究在法医学个体识别和亲权鉴定、群体遗传学、移植免疫、疾病相关等医学领域有重要的应用价值。
目的:了解HLA-Cw,-DQB1基因座的等位基因在深圳汉族人群中的分布规律。
设计、时间及地点:样本基因型的统计学分析,于2007-01/2008-06深圳市血液中心免疫遗传研究室完成。
材料:样本来自中国造血干细胞捐献者资料库深圳地区志愿捐献者,使用EDTA-K2抗凝管采集外周血。
方法:采用聚合酶链式反应-序列测定方法对深圳地区226名无关供者HLA-Cw,-DQB1基因座的2,3外显子进行序列测定与分析。等位基因频率采用直接计数法计算,Hardy-Weinberg平衡检验采用x2检验。
主要观察指标:样本HLA-Cw,-DQB1基因座的基因型。
结果:226个样本中共检测到25个Cw等位基因。其中Cw*0102,Cw*0702的频率最高(0.1881),其他频率较高的等位基因依次为Cw*0304,Cw*0302,Cw*0401及Cw*0801,Cw*0303,Cw*0602。该位点基因型观察值与期望值经χ2检验符合Hardy-Weinberg平衡定律(x2=116.00,u=1.78, ν=91,P > 0.05)。226个样本中共检测到17个DQB1等位基因。其中DQB1*0301占绝对优势,其基因频率为0.2124。其他频率较高的等位基因依次为DQB1*0303,DQB1*0601,DQB1*0502,DQB1*0602,DQB1*0302,DQB1*0401。该位点基因型观察值与期望值经χ2检验符合Hardy-Weinberg平衡定律(x2=101.34,u=0.78,ν=91,P > 0.05)。经计算HLA-Cw位点的杂合度为0.887 8,个体识别力为0.976 9,非父排除率为0.773 1,多态性信息含量为0.875 7;HLA-DQB1位点的杂合度为0.889 4,个体识别力为0.976 2,非父排除率为0.753 3,多态性信息含量为0.965 9。
结论:深圳汉族人群HLA-Cw及DQB1基因座是高度杂合、具有较高鉴别力和丰富信息含量的遗传标记,能较好地反映群体遗传特征。 相似文献
4.
目的 研究红细胞ABO血型系统中B放散型的ABO基因分子遗传基础.方法 通过标准血型血清学试验鉴定了3例Bel亚型及15例对照B型样本,采用ABO基因分型PCR序列特异性引物、ABO基因第6及第7外显子PCR产物直接测序及克隆测序等方法进行ABO基因及亚型的定型.结果 在1例血型血清学检测为Bel亚型标本中,发现一个新的B等位基因.该等位基因与B101标准等位基因相比,差异仅在于ABO基因的第7外显子上nt952位G>A突变,导致多肽链Val318Met,定为B放散型(Bel)新基因,GenBank注册号为EF117687.而其余2例Bel型样本及15例对照B型样本含正常标准B基因.结论 首次在ABO基因编码区核苷酸930位后的错义突变中发现并报道了新B等位基因,表明1,3半乳糖基转移酶基因G952A多态性可能是Bel分子遗传机制之一. 相似文献
5.
目的研究中国南方汉族无关男性群体中DYS426等17个Y—STR基因座的遗传多态性,以应用于法医学鉴定。方法采用AmpFlSTRYfiler^TMPCR复合扩增试剂盒和ABIprism^TM3100基因测序仪荧光检测方法.检测119份无关男性个体血样.调查南方汉族的17个Y—STR基因座的单倍型频率,并计算单倍型遗传多样性。结果在119份无关男性样本中,共检出118种Y—STR单倍型,其中117种单倍型仅出现1次。另一单倍型15/12/23/28/16/15/13,13/13/10/11/20/14,12,14,10,18出现2次.单倍型多样性达0.9999。结论AmpFISTRYfiler复合扩增试剂盒所包含的17Y—STR基因座,在南方汉族无关男性个体中具有丰富的遗传多态性和较高的非父排除能力.在法医学个体识别和亲子鉴定中具有广泛应用价值。 相似文献
6.
混合脐血成人移植定量监测植入状态的实验研究 总被引:4,自引:0,他引:4
为了定量监测和研究双份异基因脐血用于成人白血病患者移植后两份脐血的植入状态、嵌合体类型、供者细胞相对数量的动态变化及演变规律 ,采用荧光标记复合扩增短串联重复 (STR)位点嵌合体定量检测技术 ,对 1例急性髓细胞白血病成人患者移植两份 (脐血 1有核细胞数为 2 .5× 10 7/kg ,脐血 2有核细胞数为 1.5 3× 10 7/kg)HLA各 1个位点不相合的异基因脐血前后的序列血样进行 9个STR位点的检测 ;利用供、受者之间的差异位点定性判断脐血是否植入以及嵌合体类型 ;而后根据 377XLDNA测序仪上荧光扫描后两供者差异基因检出峰的峰面积计算脐血植入后患者体内两份脐血的细胞相对数量 ,定量分析供体细胞植入程度及演变规律 ;并与采用HLA差异基因对植入状态的分析结果进行对比。结果表明 :移植后 15天两份脐血同时植入 ,植入状态为完全双份供者嵌合体 ,患者体内脐血 1的相对细胞数量占 5 1.3% ,脐血 2占 4 8.7% ;30天时脐血 1嵌合体细胞上升为 70 .0 % ,脐血2嵌合体细胞下降为 30 .0 %。 5 2天时只检测到脐血 1的基因 ,植入状态转为完全单份供者嵌合体 ,有核细胞数少的一份脐血被排斥 ,有核细胞数多的一份长期植入。结论 :荧光标记复合扩增STR嵌合体定量检测可精确地描述两份脐血的植入程度及变化过程 ,为临床脐 相似文献
7.
目的探讨无关供者骨髓/外周血造血干细胞移植(BMT/PBSCT)后的急性移植物抗宿主病(aGVHD)的发生与供/受者HLA-CW等位基因匹配程度的相关性.方法选择HLA-A、B、DRBI相同、并业已进行BMT/PBSCT的无关供/受者对,采用PCR-SSP方法对供受者进行HLA-CW位点的高分辨基因定型,并收集移植后患者的临床资料,对HLA-CW基因与aGVHD的相关性进行回顾性分析.结果观察4例HLA-A、B、DRBI相同的移植患者,即急淋(ALL)患者1例、慢性髓细胞白血病(CML)患者2例、急性髓细胞白血病(AML)患者1例,HLA-CW等位基因完全相合、半相合和完全不相合的患者分别为1例、2例和1例,结果1例CML及1例AML患者中出现Ⅲ度aGVHD.结论无关供者骨髓/外周血造血干细胞移植中,供受者HLA-CW等位基因匹配程度对急性GVHD具有重要影响,并建议对HLA-CW基因进行常规检测. 相似文献
8.
背景:移植后造血干细胞植活的判断主要依赖于体内各种遗传标记,其在敏感性和有效性方面各不相同,故亟待建立一种鉴别力强、敏感性高、不受性别限制的检测方法。目的:观察异基因造血干细胞移植供受者移植前及受者移植后不同时间段的血样DNA短串联重复序列遗传位点检测情况。设计:观察测量实验。单位:深圳市血液中心输血医学研究所免疫遗传重点实验室。对象:选择2004-02/2005-12在深圳市血液中心输血医学研究所免疫遗传实验室配型成功并进行造血干细胞移植的18对供受者血样,18例患者中,男10例,女8例,平均35岁。接受血缘关系供者移植6例,无关供者移植12例。所有受试对象均对检测项目知情同意。方法:采用荧光标记复合扩增短串联重复序列(STR)检测技术,对18例进行造血干细胞移植的血液病患者移植后的系列血样及移植前供、受者的血样进行15个STR位点和1个性别位点的检测,找出供受者间的差异基因,观察移植后供者的STR基因在受者体内的植入情况及变化过程,找出最早检测到供者STR基因的时间及完全嵌合体最早出现的时间。主要观察指标:①观察移植前供受者差异基因。②供者STR基因及完全嵌合体最早出现时间。结果:供受者18对均进入结果分析。①供受者中能区分出彼此差别的平均STR差异位点数为12.4(8~15)个。②患者移植后最早可检测到供者STR基因的平均时间为8(5~14)d,由受者型向完全供者型转化的平均时间为14(9~23)d。植入状态由供受者嵌合型转为完全供者嵌合型。结论:荧光标记复合扩增STR检测方法可精确地描述异基因造血干细胞移植植入状态及其演变过程,可为临床提供一个准确、可靠的实验依据。 相似文献
9.
中华骨髓库HLA分型质控工作中分型结果错误原因的分析及探讨 总被引:1,自引:0,他引:1
目的对中国造血干细胞捐献者资料库(简称中华骨髓库)中人类白细胞抗原(HIA)分型数据质控抽枪中发现的错误分型情况进行归纳总结,探讨其产生的原因及解决策略,以提高造血干细胞捐献者HLA分型的准确性。方法采用聚合酶链反应(PCR)-序列特异件引物(sequence specific primers, SSP)
、PCR-序列特异性寡核苷酸探针(sequence specific oligonucleotide probes, SSOP)及基因测序( sequence based typing,SBT)分型方法,对中华骨髓库按比例随机抽取的7313份已完成HLA-A、B、DRB1基因分型的标本进行复检,使用与所抽检标本原始分型试剂小同的试剂盲检,对结果不符者,采用第3种试剂及其原始分型试剂复检;对于难以确定的结果,采用SBT方法确认。采用直接计数法进行HLA差错统计。结果质控抽检6期共7313份标本,发现HLA分型结果错误标本数183份,平均错误率为2.50%。HLA基因分型错误率逐年降低,6期错误率分别为8.18%、3.84%、2.85%、1.70%、1.10%、0.84%。HLA-A位点错误率为0.49%,其中漏检现象占A位点错误的61.11%;HLA-B位点错误率为0.85%,其中以同一宽特异性组之间的业型判断错误者居多,占B位点错误的41.94%;HLA-DRB1位点错误率为0.66%;另外,可能由于标本搞错导致的HLA-A、B、DRB1 3个位点分型全错有41例,错误率为0.56%。结论错误产生的原因有实验人员的技术操作水平及工作责任心上的原因,也有分型方法及试剂本身的原因。采用DNA分型技术,使用特异性、重复性好的合格试剂及加强质控监督,有助于提高HLA分型的准确性,并将有助于提高骨髓库造血干细胞捐献者HLA分型的质量。 相似文献
10.
目的采用参比链介导的构象分析(referencestrandmediatedconformationanalysis,RSCA)技术,建立新型、可靠的HLAA、B高分辩基因分型方法,应用于HLA基因分型及供、受者组织配型。方法采用一对座位特异性引物,扩增HLAA、B基因的第2、3外显子和第2内含子。扩增产物与单链标记荧光物质的参比链按一定比例混合,经变性、退火反应及脱水处理后,在杂交产物中掺入分子量内参标准物,用ABI377型基因测序仪电泳检测。用ABIGeneScan3.1软件分析每一泳道内异源双链波峰的迁移值、峰高及峰面积值,RSCAHLATyper1.3软件分析HLA等位基因型。应用本方法,对第13届国际组织相容性协作组(IHW)送检的20份盲检样本,以及2份HLA等位基因型已知的质控样本进行了检测。结果2份质控DNA的检测结果,与已知的HLA基因型完全相符;20份盲检样本HLAA、B座位的检测结果,与IHW公布的结果完全相同,准确率达100%。结论RSCA为新型、高分辨水平的HLA基因分型方法,并且出现模棱两可结果的情况少,分型结果准确、可靠。 相似文献