A组链球菌基因组学研究进展

A组链球菌是重要的人类致病菌之一,常可引起多种感染。为从分子水平上深入认识A组链球菌相关疾病的发病机制,近些年已有多个分离自不同疾病表型的菌株完成了全序列测定,基因组水平的对A组链球菌表型与基因型的关联研究也日益深入。本文综述了自第一个A组链球菌测序以来近十年内其基因组学研究进展。     

鼠疫菌pYC质粒对菌体蛋白质组影响的初步研究

目的 了解鼠疫菌pYC质粒对菌体蛋白质组的作用。方法 将含有pYC质粒的鼠疫菌与不含该质粒的鼠疫菌通过双向电泳的方法进行蛋白质组比对,并将差异蛋白进行质谱鉴定。结果 含有pYC质粒的鼠疫菌与不含该质粒的鼠疫菌的蛋白图谱可识别的蛋白点均在500个以上,两者总体上相似性较高;前者较后者在大小约70×103、等电点5.0左右处,明显多一个蛋白点簇,该蛋白簇经质谱鉴定均为伴侣蛋白GroEL,但该蛋白并非是pYC质粒编码蛋白。结论 pYC质粒对菌体蛋白质组有影响,其编码蛋白pYC_p10与pYC_p11,可能调控GroEL高表达。     

我国脑膜炎奈瑟菌孔蛋白PorA、PorB的多态性分析

目的以蛋白质组学研究为基础,分析2003—2005年我国流脑暴发流行期间C群脑膜炎奈瑟菌菌株特征,建立以致病性相关蛋白多态性为目标的新分型方法。方法利用双向电泳和MALDI-TOF质谱鉴定分析2003—2005年流脑流行期内分离的66株C群脑膜炎奈瑟菌菌株及2株参考菌株的蛋白表达,重点分析与致病性相关的蛋白多态性特征。结果根据孔蛋白PorA、PorB在双向电泳中的多态性,建立了12个特征菌型。安徽菌株的PorA和PorB蛋白电泳谱型显示出了高度的一致性,而其他地区的菌株则显示出高度的多态性。结论PorA和PorB蛋白2-DE电泳谱型可以作为一种新的菌株分型方法,可能在菌型变迁检测和流脑暴发预警中具有重要应用前景。     

黑龙江地区幽门螺杆菌毒力基因型与胃十二指肠疾病关系的研究

幽门螺杆菌（Hp）感染除与宿主和环境因素有关外，菌株的毒力差异对临床结果的影响也是不可忽视的因素。Hp基因亚型的分布具有明显的地域性，地理差异在导致不同临床结局中所起的作用仍是当前研究的热点。本研究旨在阐明Hp主要毒力基因亚型在黑龙江地区的分布情况及其与胃、十二指肠疾病的关系。     

幽门螺杆菌中国菌株致病相关基因cagA、iceA、vacA及HP0519分布分析

目的分析中国不同人群及不同胃部疾病病例来源的幽门螺杆菌致病相关基因cagA、iceA、vacA及HP0519的分布.方法采用特异引物聚合酶链式反应（PCR）方法分析150株幽门螺杆菌上述基因的多态性分布特点,并对其分布作初步统计分析.结果93%（139/150）中国菌株cagA基因3′端重复序列的PCR产物具有东方菌株特征.75%（113/150）菌株iceA基因为iceA1,19%（29/150）为iceA2,不同地区间iceA基因的分布差异无统计学意义.云南菌株iceA1、iceA2的分布与菌株分离个体的种族特点及临床疾病类型无显著关系.96%中国菌株（144/150）vacA基因s区的等位基因为s1;m区等位基因m2、m1b和m1b-m2的比例分别为57%（85/150）、27%（41/150）和11%（16/150）,仅2株福建菌株为m1a.不同地区间vacA s1、m2、m1b分布的差异无统计学意义.云南菌株m1b-m2的分布高于福建和北京菌株.云南菌株vacA s区等位基因的多样性与分离个体的种族及临床疾病类型无显著关系.vacA m区等位基因的多样性与分离个体的临床疾病类型无显著关系,但不同民族间m2的分布有显著差异,白族人群m2的分布显著少于汉族和纳西族.93%（140/150）的中国菌株HP0519基因具有24 bp和15 bp DNA插入和缺失的多态性特点.不同地区间HP0519基因的多态性无显著不同.云南菌株HP0519的多态性与菌株分离个体的临床疾病类型无显著关系,但来源不同民族菌株的HP0519基因存在差异.结论幽门螺杆菌中国菌株cagA 3′端JF/TR特异引物的扩增结果具有东亚菌株特点.中国菌株vacA基因多为s1,其分布与菌株分离个体的临床疾病类型无关.中国菌株vacA基因m区的分布具有多样性.中国菌株HP0519基因具有24 bp和15 bp插入和缺失的多态性特点.     

北京市朝阳区2011年儿童A组溶血性链球菌超抗原基因的分子流行病学研究北大核心CSCD

目的描述2011年北京市朝阳区儿童A组溶血性链球菌（GAS）的超抗原分子流行病学特征,分析超抗原基因与emm型别和GAS相关疾病的关系。方法从猩红热、咽炎及扁桃体炎患儿的咽拭子分离培养获得71株GAS,应用PCR法检测这些GAS是否携带8类超抗原基因（speA、spel、$sa、speC、speJ、speG、spell和SMEZ）;PCR扩增emm基因片段并测序,进行emm型别鉴定;分析超抗原基因、emm型别和GAS所致疾病之间的相互关系,应用,检验进行显著性分析。结果71株GAS的超抗原基因检出率从高到低分别为speC（100．0％）、SMEZ（100．0％）、s50（97．2％）、speG（95．8％）、speH（80．3％）、spel（80．3％）、speA（15．5％）和speJ（12．7％）;71株GAS中检出emml2．0型菌株62株、emml．0型7株、emm22．0型1株、emm75．0型1株;spel和渺H基因与speA和speJ基因在emml2．0型与emml．0型菌株中的分布差异有统计学意义（P均〈0．05）;spel和spetf基因在猩红热患儿和咽炎扁桃体炎患儿中的分布差异有统计学意义（P均〈0．05）;未发现emm型别在不同的疾病中的分布有差异。结论北京市朝阳区儿童携带的GAS超抗原基因的检出率与地域有一定关系;不同emm型别的GAS对超抗原基因的携带有一定的选择性,尤其是针对噬菌体携带的超抗原基因;较emm型别,超抗原基因能更好地建立菌株与疾病之间的关系。     

波利特、达克普隆和Nexium对幽门螺杆菌的体外抑菌效果比较

目的：观察、比较质子泵抑制剂(PPI)波利特(雷贝拉唑肠溶衣片)、达克普隆(兰索拉唑胶囊)和Nexium对幽门螺杆菌(Hp)的抑制作用，初步解释近期临床流行病学资料所显示的不同PPI用于Hp根除治疗所表现的明显效果差异现象。方法：使用Hp国际标准株NCTC11637、NCTC11639和国内分离菌株CAPMN62，应用平板掺入法测定三种PPI对Hp的体外抑菌作用。结果：波利特在体外对Hp具有明显的抑制作用(MIC99为2．25mg／L)，其次为达克普隆(MIC99为42.5mg／L)，而Nexium抑菌作用不明显(MIC99为360mg／L)。结论：不同PPI对Hp的直接抑菌作用存在明显差异，其作用除本身化学结构的差异因素外，制剂中的其他复合成分的影响也不容忽视；亟待对体外抑菌效果与用于Hp感染治疗效果的相关性进行分析，以便更好地指导临床用药和相关幽门螺杆菌病的防治。     

空肠弯曲菌的双向电泳系统可重复性评价

目的:对空肠弯曲菌(Cj)的双向电泳(2DE)系统可重复性和稳定性进行评价,为空肠弯曲菌的蛋白质组学研究奠定基础。方法:选取一株空肠弯曲菌,培养48小时后制备全菌蛋白,进行双向电泳。比较不同上样量和不同批次对实验结果的影响。结果:不同批次和不同上样量的胶进行比较,蛋白质的匹配率均可达到90.89%;未匹配蛋白主要是一些低丰度蛋白;增加上样量可增加低丰度蛋白的检出,但可产生蛋白质的共迁移,因此选择合适的上样量很重要;不同批次蛋白质点在等电点方向的位置偏移为0.62±0.37mm,在SDS-PAGE方向的位置偏差为0.72±0.51mm,相对含量的相关系数为0.973。结论:表明空肠弯曲菌2DE的系统具有很好的稳定性及很高的可重复性,符合蛋白质组学的要求,实验结果具有可比性。     

吉兰-巴雷综合征相关空肠弯曲菌WLAX基因序列分析

目的了解吉兰-巴雷综合征(GBS)相关空肠弯曲菌的WLAX基因序列特征,为进一步研究GBS相关空肠弯曲菌的分子致病机制打下基础。方法通过PCR方法对该基因进行扩增,将PCR产物克隆到质粒载体上,然后进行测序,将测序结果通过DNAstar软件进行比较和聚类分析。结果与非GBS相关空肠弯曲菌比较,GBS相关空肠弯曲菌的WLAX核苷酸序列发生变异的频率增大;菌株的核苷酸序列与全基因测序空肠弯曲菌NCTC11168比较存在差异;聚类关系反映了空肠弯曲菌具有一定的区域特征。结论GBS相关空肠弯曲菌中WLAX基因发生突变的概率明显增大,这些突变与GBS致病性的关系有待于进一步确定。     

新视角--质子泵抑制剂及其体外抑制幽门螺杆菌作用研究进展

胃质子泵H^ -K^ ATP酶的发现，为抗胃酸分泌新药的研究提供了新的可能。从1988年第一个质子泵抑制剂——奥美拉唑问世，经10多年来的临床应用，已成为一类疗效高、耐受性好、副作用少的抗酸药物和联合治疗幽门螺杆菌感染的药物。由于奥美拉唑的巨大成功，推动了其衍生物的研究开发，新的质子泵抑制剂药品陆续上市。本文对质子泵、质子泵抑制剂及其作用特点以及质子泵抑制剂对幽门螺杆菌的抑制机制研究进展进行简要综述：