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1.
目的: 采用血清药理学方法探究甘草干姜汤(LDGD)的体外抗胃癌作用,并基于网络药理学和分子对接法探讨其抗胃癌机制。方法: 以不同配比的甘草干姜汤灌胃大鼠后以腹主动脉取血方式提取含药血清,利用四甲基噻唑蓝(MTT)法观察甘草、干姜不同配比LDGD大鼠含药血清对人胃腺癌细胞AGS以及人脐静脉血管内皮细胞HUVEC活力的影响;基于网络药理学构建LDGD抗胃癌的“成分-靶点”网络,通过构建蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)筛选出关键靶点,通过GO功能和KEGG通路富集分析探究LDGD抗胃癌可能涉及的生物学功能和信号通路;通过分子对接分析LDGD中文献报道的8种主要成分甘草苷、异甘草苷、甘草素、异甘草素、甘草酸、6-姜酚、6-姜烯酚、8-姜酚和抗胃癌关键靶点的结合情况。结果: 血清药理学实验中不同配比LDGD灌胃大鼠后提取的30%含药血清对人胃腺癌细胞AGS的细胞活力均产生了显著的抑制作用,而对HUVEC无明显抑制作用;通过网络药理学分析得到LDGD有效化学成分101个,抗胃癌关键靶点为VEGFA、TNF-α、CASP3、MYC;富集分析结果表明,LDGD抗胃癌可能主要通过对凋亡信号、氧化应激、活性氧反应等途径的调节,以及对TNF、p53等信号通路发挥作用;分子对接结果表明,甘草酸、甘草苷与VEGFA对接良好,6-姜酚与TNF-α对接良好,且这3种成分在LDGD中含量相对较高。结论: 甘草干姜汤具有一定抗胃癌活性,其机制可能是通过调节氧化应激,作用于TNF、p53等信号通路,其中甘草酸、甘草苷、6-姜酚可能为关键药效成分。  相似文献   
2.
目的 运用网络药理学方法及分子对接技术探讨黄芪干预腹膜纤维化的可能机制。方法 利用中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)检索黄芪的主要化学成分及靶点,并补充文献报道相关药理作用的成分作为潜在活性成分。以"peritoneal fibrosis"为关键词分别在OMIM、Genecards获取目前已知的与腹膜纤维化相关的疾病靶点,后取两者的交集靶点;对交集基因通过STRING数据库与Cytoscape 3.7.2软件构建"药物-成分-靶点-疾病"网络及蛋白互作(PPI)网络并筛选核心网络。基于R软件使用Bioconductor生物信息软件对核心靶点进行GO及KEGG富集分析,最终采用AutoDock软件将主要有效成分与核心靶点进行分子对接,得出其结合能力。结果 筛选出20个黄芪活性成分及文献报道有相关药理作用4个, 457药物作用靶点,与674个腹膜纤维化病靶点取交集,得到86个共同靶点。GO功能富集分析提示黄芪拮抗腹膜纤维化主要参与了蛋白激酶B信号转导的调节、细胞对化学的应激反应、炎症反应的调节等通路; KEGG通路富集分析主要涉及调控肿瘤、磷脂酰肌醇-3-羟激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、晚期糖基化终末产物/晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)、人类巨细胞病毒感染、HIF-1信号通路等;分子对接结果显示关键靶点与活性成分具有较好的结合能力。结论 黄芪治疗腹膜纤维化的分子机制,可能与抑制炎症及氧化应激反应、调节多种信号通路等相关。  相似文献   
3.
4.
《Journal of endodontics》2022,48(5):572-596
IntroductionCulture-independent molecular studies have shown a broad spectrum of bacterial taxa that persist after chemomechanical procedures (CMP). Therefore, this study systematically reviewed these reports to explore the prevalence of bacteria in post-instrumentation samples of root canals from permanent teeth, especially of as-yet-uncultivated/difficult-to-culture bacteria.MethodsElectronic databases were searched from 2007 to January 2021. Clinical studies using culture-independent molecular methods to identify species-level taxa before and after CMP were included. Studies were critically appraised using the Joanna Briggs Institute Prevalence Critical Appraisal Checklist and the funnel plot analysis. The meta-analysis was performed on the prevalence of as-yet-uncultivated/difficult-to-culture bacterial taxa using RStudio.ResultsA total of 3781 titles were screened, but only 20 studies were included. The most frequent species in post-instrumentation samples were Streptococcus spp., Leptotrichia buccalis, Fusobacterium nucleatum, and Capnocytophaga ochracea. The detection frequency of some species increased after CMP, including mainly Firmicutes members such as streptococci, Enterococcus faecium, Selenomonas noxia, and Solobacterium moorei. The prevalence (confidence interval) of difficult-to-culture species was as follows: Dialister invisus, 17% (7%–29%); Solobacterium moorei, 14% (8%–23%); Bacteroidaceae [G-1] bacterium HMT 272, 13% (5%–23%); and Filifactor alocis, 11% (3%–23%).ConclusionsThe prevalence of as-yet-uncultivated/difficult-to-culture bacterial taxa in post-instrumentation samples was low. The persistent species belonged mainly to the phylum Firmicutes, and streptococci were the major members. Future larger clinical studies on the composition of the whole bacterial community that persist after CMP are still necessary for a better understanding of bacterial interactions and their clinical significance in the treatment outcome.  相似文献   
5.
6.
目的分析低分子肝素钙抗凝对多囊卵巢综合征(PCOS)所致不孕症患者来曲唑诱导排卵疗效的影响。方法选取2014年1月—2019年1月九江市第三人民医院和彭泽县妇幼保健院收治的156例PCOS所致不孕症患者,采用随机数字表分成两组,每组78例。对照组口服来曲唑治疗,观察组采取口服来曲唑联合低分子肝素钙注射液治疗。比较两组的疗效、子宫内膜容受性、凝血功能指标、促排卵结局及不良反应。结果观察组总有效率[94.87%(74/78)]显著高于对照组[80.77%(63/78)],差异有统计学意义(χ2=7.252,P=0.007)。治疗后,观察组子宫内膜厚度、子宫动脉搏动指数(PI)及阻力指数(RI)分别为(9.75±1.03)mm、(1.30±0.26)及(0.58±0.12),对照组子宫内膜厚度、PI及RI分别为(7.48±0.95)mm、(1.71±0.33)及(0.66±0.11),两组比较差异均有统计学意义(t=14.308,8.619,4.340,均P<0.05)。治疗后,两组凝血功能指标比较差异均有统计学意义(均P<0.05)。观察组妊娠率[52.56%(41/78)]显著高于对照组[32.05%(25/78)],自然流产率[2.44%(1/41)]显著低于对照组[16.00%(4/25)],差异均有统计学意义(均P<0.05)。观察组不良反应发生率[16.67%(13/78)]与对照组[12.82%(10/78)]比较差异无统计学意义(χ2=0.459,P=0.498)。结论PCOS所致不孕症患者在应用来曲唑诱导排卵的同时联合低分子肝素钙抗凝治疗能有效改善患者的凝血-纤溶状态,明显提高患者的子宫内膜容受性,改善促排卵结局。  相似文献   
7.
8.
《Molecular therapy》2022,30(2):963-974
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  相似文献   
9.
目的 基于网络药理学与基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库挖掘初步揭示瘀血痹胶囊发挥抗类风湿性关节炎(RA)的潜在活性成分及作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GeneCards数据库筛选出瘀血痹胶囊活性化学成分、作用靶点及RA靶点,采用STRING 11.0数据库对其交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建,采用Bioconductor数据库进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;通过GEO数据库下载基因芯片数据(GSE55457),经过基因探针富集分析(GSEA)筛选出差异表达基因,联用分子对接对差异基因与排名靠前的活性化合物进行虚拟验证。结果 筛选出瘀血痹胶囊128个有效成分和85个与RA的交集靶点,其中度值排名靠前的化合物有槲皮素、木犀草素和山柰酚等。GO功能富集结果显示,RA靶点参与生物过程、分子功能、细胞组分的多种调控过程。KEGG通路富集结果显示,炎性因子和受体信号通路可能为瘀血痹胶囊对RA发挥作用的主要通路。差异表达基因与交集靶点交集有白细胞介素-6(IL-6)、DNA修复酶1(PARP1)、核转录因子-κB激酶亚基β抑制剂(IKBKB)、雄激素受体(AR)、半胱氨酸蛋白酶-3(CASP3)、表皮生长因子受体(EGFR)、丝裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)、多不饱和脂肪酸5-脂氧合酶(ALOX5)等。分子对接结果显示,β-谷甾醇、鞣花酸、7-O-甲基异鼠李糖醇、木犀草素、槲皮素、异鼠李素、山柰酚、β-胡萝卜素等与差异性基因对接活性较好。结论 瘀血痹胶囊中的β-谷甾醇、木犀草素、槲皮素等核心化合物可能是通过作用于IL-6、PARP1、IKBKB、AR、CASP3等靶点对RA起治疗作用,为瘀血痹胶囊后续深入研究及临床应用提供了数据支持。  相似文献   
10.
目的:探讨丁香抗流感的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和既往文献筛选丁香活性成分。通过数据库SwissTarget Predictiont获得丁香活性成分的相应靶点;采用GeneCards数据库获取流感相关靶点。将二者取交集,获得共同靶点,运用Cytoscape 3.7.2构建“丁香-活性成分-靶点-疾病网络”。运用String数据库构建共同靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)。利用Metascape进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。用Autodock Vina 1.1.2对丁香活性成分与流感关键蛋白和流感病毒蛋白进行分子对接,并构建其作用网络。结果:从丁香-活性成分-流感靶点-流感网络中获得rhamnazin-3-O-β-D-glucopyranoside、isoquercitrin、quercetin-3-O-β-D-glucuronide、rhamnetin-3-O-β-D-glucuronide-6″-methyl、1,2,3,6-tetra-O-galloylglucose等28个丁香活性成分和MAPKs、TNF、AKT1、TP53、EGFR、CASP3、HSP90AA1等209个丁香治疗流感的靶点。GO富集分析和KEGG富集分析结果显示,丁香治疗流感主要与激活免疫反应,调控酶活性、细胞凋亡、细胞因子等生物过程和调控PI3K-AKT、MAPK、细胞凋亡、趋化因子、甲型流感等信号通路有关。分子对接作用网络显示28个活性成分可与HA、NA、M2等多个流感病毒蛋白结合。结论:丁香可能通过多成分与多个流感病毒蛋白结合,并作用于多靶点,调控多通路,进而影响炎症反应、免疫应答、细胞凋亡和流感病毒复制,达到治疗流感的作用。  相似文献   
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