基于网络药理学与分子对接技术对白术-半夏-茯苓配伍治疗胰腺癌作用机制的研究

目的 采用网络药理学和分子对接技术预测白术-半夏-茯苓配伍治疗胰腺癌的作用靶点，探讨其治疗胰腺癌的潜在分子作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）、PharmMapper、OMIM、GeneCards、STRING、DAVID等在线数据库与Cytoscape软件构建一系列网络图、筛选核心靶点并对靶基因进行GO分析和KEGG通路富集分析，最后通过AutoDock软件对关键活性成分与潜在作用靶点进行分子对接验证。结果 共筛选得到药组活性成分35个，相关靶点190个，胰腺癌靶点1 566个以及白术-半夏-茯苓治疗胰腺癌的交集靶点76个。这些交集靶点主要参与基因表达的正调控，细胞因子介导的信号通路以及细胞凋亡调控等生物学过程，并与癌症通路、乙型肝炎、大肠癌、化学致癌受体激活、胰腺癌以及MAPK信号通路等相关。分子对接结果显示，白术-半夏-茯苓的主要活性成分与胰腺癌的潜在作用靶点间具有一定的结合活性。结论 白术-半夏-茯苓主要通过多成分、多靶点、多通路发挥对胰腺癌的治疗作用，为临床应用白术-半夏-茯苓配伍治疗胰腺癌提供一定的理论依据。     

基于网络药理学及分子对接技术的复方丹参滴丸治疗心绞痛潜在分子机制探讨

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨复方丹参滴丸治疗心绞痛的潜在分子机制。方法 通过中药系统网络药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索复方丹参滴丸的活性成分,利用GeneCards、Disgnet和TTD数据库检索心绞痛疾病相关靶点,通过String数据库和Metascape开放平台对复方丹参滴丸与心绞痛的交集靶点进行京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路富集分析及基因本体论（gene ontology,GO）注释。采用SYBYL2.1软件的Surflex-Dock模块对筛选的核心成分和核心靶点进行分子对接。结果 从复方丹参滴丸中筛选出76种活性化合物,涉及500个潜在靶点。复方丹参滴丸成分靶点与心绞痛疾病靶点取交集,共获得457个交集靶点;复方丹参滴丸治疗心绞痛作用靶标的蛋白相互作用（PPI）网络中共包含158个节点,其中重要的靶点有STAT3、TP53、AKT1、JUN、MAPK1、HSP90AA1等。复方丹参滴丸通过调控炎症反应、凋亡信号通路、积极调节细胞迁移等GO生物过程,参与流体剪切应力与动脉粥样硬化、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路、IL17信号通路等信号通路,发挥治疗心绞痛的作用。分子对接结果表明筛选得到的活性成分与靶点有较强的结合。结论 运用网络药理学研究方法推测出复方丹参滴丸治疗心绞痛的潜在分子机制及作用靶点,分子对接验证了筛选的关键活性成分与重要靶点具有较强的结合活性。     

整合UPLC-QTOF-MS分子网络与网络药理学探究龙葵化学成分及抗肺癌作用机制

目的 采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间串联质谱(UPLC-QTOF-MS)整合分子网络技术对龙葵全草的化学成分进行快速分析与鉴定,利用网络药理学技术初步探究其治疗肺癌的作用机制。方法 运用UPLC-QTOF-MS,分别在正负离子模式下进行质谱检测与分析,定性龙葵全草中化学成分。同时将二级质谱图转换格式后上传到GNPS网站构建分子网络,对其化学成分进行分析。综合2种方法的定性分析结果结合网络药理学和分子对接,分析龙葵治疗肺癌过程中起主要作用的靶点及通路。结果 质谱分析和GNPS分别鉴定和匹配出41个和54个化合物,其中相交11个化合物,共鉴定出84个化合物。综合上述结果筛选出有效活性成分7个,对应不重复靶点298个,疾病靶点1 294个,相交靶点66个,富集分析得到28条信号通路、20个生物学过程、16个细胞组分、17个分子功能。分子对接结果显示核心靶点与核心成分均有较强的亲和力。结论 运用UPLC-QTOF-MS/MS整合分子网络技术可快速、全面、系统地分析鉴定龙葵全草中的化学成分;网络药理学及分子对接结果为龙葵临床用药和药理研究提供了科学依据。     

Radical Scavenging Activity of Methanol Leaf Extracts of Orthosiphon stamineus.

Abstract

The antioxidant activity of methanol extracts of Orthosiphon stamineus. Benth (Lamiaceae), cultivated in different regions of Malaysia, was determined by measuring the scavenging effect on 1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl (DPPH) radical and on superoxide anion. The results showed a variation in free-radical and superoxide-anion scavenging activities of the methanol extracts ranging from 62.82 to 92.34% and 53.29 to 75.88%, respectively. Methanol extract was active, and its antioxidative potency was comparable to that of pure quercetin and higher than that of the widely used synthetic antioxidant butylated hydroxylanisole (BHA). The UV and HPLC chromatographic fingerprints of the major phenolics were qualitatively similar for all the methanol leaf extracts of Orthosiphon stamineus. from various locations.     

基于网络药理学和分子对接技术探究清热药治疗COVID-19的活性成分及作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接技术挖掘《新型冠状病毒肺炎诊疗方案（试行第七版）》中具有清热功效的中药治疗COVID-19的共有活性成分及作用机制。方法：通过TCMSP数据库及BATMAN-TCM数据库检索清热药的化学成分和作用靶点;通过UniProt数据库检索靶点对应基因,运用Cytoscape Version 3.7.2软件绘制药物-化合物-靶点网络;利用STRING数据库绘制靶点间作用关系网络;通过DAVID数据库进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析;利用Autodock软件对筛选出的活性成分及抗病毒化药和SARS-CoV-2 3CL水解酶及ACE2进行分子对接。结果：药物-化合物-靶点网络共有401个节点（15个药物节点,120个化合物节点,266个靶点节点）;GO条目1 422个（P<0.05）;KEGG通路富集筛选共得到61条通路（P<0.05）;分子对接结果显示脱水淫羊藿素、木犀草素、槲皮素等关键化合物具有与抗病毒化药相近或更好的亲和力。结论：清热药通过与ACE2结合调控多条通路、与病毒特定部位的结合阻断病毒入侵及抑制炎症因子风暴等方面达到治疗COVID-19的作用。     

Orthosiphon stamineus, een geneeskruid met een diuretische werking

Samenvatting In dit artikel wordt een overzicht gegeven van het tot dusver bekende fytochemisch en farmacologisch onderzoek naar de werkzame bestanddelen van de bladeren vanOrthosiphon stamineus Benth., dat als geneeskruid wordt toegepast bij nier- en blaasziekten en als diureticum. Hoewel een hoog kaliumgehalte en de aanwezigheid van inositol in het kruid wel verantwoordelijk worden gesteld voor de werking, is er nog geen duidelijke relatie tussen deze bestanddelen en de farmacologische effecten. Mogelijk zouden ook andere stoffen een rol kunnen spelen, zoals nog niet volledig ge?dentificeerde saponinen, terwijl flavono?den en hun omzettingsprodukten verantwoordelijk zouden kunnen zijn voor de bacteriostatische werking van Orthosiphon. In ons laboratorium is een onderzoek begonnen teneinde hierover opheldering te verschaffen.

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Orthosiphon stamineus — Phytochemical and pharmacological research

In this paper a survey is given of the phytochemical and pharmacological research, known until now, into the active principles of the leaf drugOrthosiphon stamineus Benth., which is used therapeutically for diseases of the kidneys and the bladder and as a diuretic. Although a high potassium content and the presence of inositol have been claimed for the activity no clear relationship exists between these constituents and the pharmacological effects. Other constituents as for instance not fully identified saponins may possibly play a role and flavonoids and their metabolites would be responsible for the bacteriostatic activity of Orthosiphon. An investigation is in progress in our laboratory to elucidate these problems.

     

Exploring the multi-gene regulatory molecular mechanism of Saudi Arabian flora against epilepsy based on data mining,network pharmacology and docking analysis

Epilepsy is a chronic neurological disorder marked by recurrent seizures, significantly affecting the population in Saudi Arabia across all age demographics. The global prevalence of active epilepsy is around 6.38/1,000 persons and in the Arabian region, the median prevalence of active epilepsy is 4.4/1,000 persons. However, over 75% of individuals are untreated. Consequently, the development of therapeutic strategies with increased efficacy and safety profiles is essential to improve the survival rate among epilepsy patients. The current study integrates network pharmacology along with Bioinformatics approaches to explore the potential molecular mechanisms of local flora of Saudi Arabia including Solanum incanum, Abrus precatorius, Withania somnifera, and Azadirachta indica in epilepsy treatment. In the preliminary phase, data related to the bioactive components of the local plants and the associated target genes of both these plants and epilepsy were gathered from scientific literature and open-source databases. This data was then analyzed to identify common targets between the plants and ovarian cancer. Based on these common targets, a protein–protein interaction (PPI) network was constructed utilizing the STRING database, which was subsequently incorporated into the Cytoscape software for identification of hub genes based on their degree of connectivity. Lastly, an interplay network depicting the associations between the compounds and the overlapping genes was formulated via Cytoscape, to study the potential network pharmacology implications of these active compounds in relation to ovarian cancer. Following that, a compound-target protein-pathway network was constructed which uncovered that namely abrectorin, genistin, (+)-catechin, precatorine, (+)-ascorbic acid, licoflavanone, skrofulein, stigmasterone, 5,7-Dihydroxy-4′-methoxy-8,3′-di-C-prenylflavanone could potentially be used as antagonists for the therapeutic management of epilepsy by targeting TNF and TP53 proteins. Furthermore, the implementation of molecular docking reinforces the binding affinity of the compound, indicating a robust stability of the forecasted compounds at the docked site. This research lays both a theoretical and experimental groundwork for more profound investigations and establishes a practical method for the strategic employment of active compounds in the development of anti-epileptic therapeutics.     

Therapeutic potential of traditional Chinese medicine for the treatment of NAFLD: A promising drug Potentilla discolor Bunge

Nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) is characterized by excessive accumulation of hepatic lipids and metabolic stress-induced liver injury. There are currently no approved effective pharmacological treatments for NAFLD. Traditional Chinese medicine (TCM) has been used for centuries to treat patients with chronic liver diseases without clear disease types and mechanisms. More recently, TCM has been shown to have unique advantages in the treatment of NAFLD. We performed a systematic review of the medical literature published over the last two decades and found that many TCM formulas have been reported to be beneficial for the treatment of metabolic dysfunctions, including Potentilla discolor Bunge (PDB). PDB has a variety of active compounds, including flavonoids, terpenoids, organic acids, steroids and tannins. Many compounds have been shown to exhibit a series of beneficial effects for the treatment of NAFLD, including anti-oxidative and anti-inflammatory functions, improvement of lipid metabolism and reversal of insulin resistance. In this review, we summarize potential therapeutic effects of TCM formulas for the treatment of NAFLD, focusing on the medicinal properties of natural active compounds from PDB and their underlying mechanisms. We point out that PDB can be classified as a novel candidate for the treatment and prevention of NAFLD.     

基于网络药理学、定量构效关系、分子对接探讨甘草黄酮抗痤疮的分子机制

目的 基于网络药理学、定量构效关系、分子对接探讨甘草黄酮抗痤疮可能的分子机制，为该成分透皮制剂的开发提供依据。方法 通过网络药理学筛选出甘草黄酮抗痤疮的关键活性成分与靶点，然后通过HipHop方法构建了甘草黄酮化合物活性的最佳QSAR药效团模型，并推测出该药效团可能起决定性治疗作用的药效基团，最后通过分子对接对该药效基团进行验证。结果 网络药理学研究表明7-羟基黄酮、甘草内酯、9S,13R-12-oxophytodienoic acid、柚皮素、4’-甲氧基黄酮等化合物是甘草黄酮中抗痤疮的关键活性成分，CYP19A1、ALOX5和ESR1是其抗痤疮的关键靶点。QSAR药效团模型研究表明，甘草黄酮的最优药效团由1个疏水基团，2个氢键受体基团组成。分子对接研究表明，通过网络药理学筛选的活性化合物和靶蛋白具有较好的亲和力，同时也发现通过QSAR构建的最优药效团模型可能是甘草黄酮抗痤疮中起决定性治疗作用的药效基团。结论 本研究成功建立了甘草黄酮的结构特性与其抗痤疮活性之间的构效关系，为中药透皮制剂的开发和临床应用提供了理论指导。     

基于UHPLC-LTQ-Orbitrap-MS/MS技术和网络药理学探讨蒲公英改善高脂血症的活性成分及其作用机制

目的 基于超高效液相色谱-线性离子阱串联静电场轨道高分辨质谱（UHPLC-LTQ-Orbitrap-MS/MS）技术、网络药理学和分子对接探究蒲公英改善高脂血症的有效成分及其作用机制。方法 根据质谱信息结合对照品裂解规律并参考文献指认蒲公英中化学成分；利用STITCH、SwissTargetPredection、TCMSP数据库构建蒲公英的潜在药效成分靶点数据库，通过GeneCards、DrugBank、OMIM、TherapeuticTargetDatabase、PharmGKB获取血脂异常潜在靶点；使用STRING数据库构建关键靶点蛋白相互作用（PPI）网络；通过Metascape数据库对关键靶点进行基因本体论（GO）功能与京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析；借助Cytoscape软件构建"活性成分-靶点-通路"网络；采用分子对接技术进行虚拟验证。结果 从蒲公英中共鉴别出126个化合物，包括黄酮类58个，有机酸类29个，萜类23个，苯丙素8个，核苷类3个和其他类5个。网络药理学研究表明，蒲公英可能通过槲皮素、异鼠李素、香叶木素、白杨素、芹菜素等成分作用于碳酸酐酶2（CA2）、碳酸酐酶7（CA7）、醛糖还原酶（AKR1B1）、基质金属蛋白酶2（MMP-2）、蛋白激酶1（Akt1）等核心靶点，来调节脂质和动脉粥样硬化、磷脂酰肌醇-3-激酶（PI3K）/Akt、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）、流体剪切应力和动脉粥样硬化和晚期糖基化终末产物（AGE）/AGEs受体（RAGE）等信号通路，从而发挥调血脂作用；分子对接验证结果表明，蒲公英改善高脂血症有效成分与疾病靶点蛋白具有较强的结合活性。结论 蒲公英可能通过调控脂质代谢、炎症反应、内质网应激、氧化应激和免疫调节等多方面发挥改善高脂血症的作用。     

A review on extraction techniques and therapeutic value of polar bioactives from Asian medicinal herbs: Case study on Orthosiphon aristatus,Eurycoma longifolia and Andrographis paniculata

Medicinal plants have gained much interest in the prevention and treatment of common human disease such as cold and fever, hypertension and postpartum. Bioactive compounds from medicinal plants were synthesised using effective extraction methods which have important roles in the pharmaceutical product development. Orthosiphon aristatus (OA), Eurycoma longifolia (EL) and Andrographis paniculata (AP) are among popular medicinal herbs in Southeast Asia. The major compounds for these medicinal plants are polar bioactive compounds (rosmarinic acid, eurycomanone and andrographolide) which have multiple benefits to human health. The bioactive compounds are used as a drug to function against a variety of diseases with the support of scientific evidence. This paper was intended to prepare a complete review about the extraction techniques (e.g. OA, EL and AP) of these medicinal plants based on existing studies and scientific works. Suitable solvents and techniques to obtain their major bioactive compounds and their therapeutic potentials were discussed.     

基于网络药理学与分子对接技术探讨健骨注射液治疗骨质增生及类风湿性关节炎的作用机制

目的 利用网络药理学方法研究健骨注射液治疗骨质增生及风湿性关节炎的作用机制。方法 采用超快速高效液相色谱串联三重四级杆飞行时间质谱（UFLC-Triple TOF-MS/MS）对健骨注射液的化学成分进行分析,通过中药系统药理数据库与分析平台（TCMSP）、Swiss Target Prediction数据库检索并预测健骨注射液有效成分对应靶点。通过Genecards数据库检索疾病相关靶点。利用cytoscape软件进行网络构建,将潜在作用靶点录入STRING平台构建靶点间的蛋白相互作用（PPI） 网络。采用DAVID数据库对潜在作用靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果 通过筛选得到15种活性成分,检索并预测得到261个对应靶点。利用在线网站Venny 2.1.0筛选出53个成分和疾病的交集靶点,涉及信号通路包括癌症通路、美洲锥虫病、TNF信号通路、T细胞受体信号通路等。分子对接结果显示,健骨注射液关键成分与核心靶蛋白均能较好结合。结论 本研究发现健骨注射液通过多成分多靶点对疾病进行调控,为后续研究提供了指导意义。     

基于网络药理学和分子对接技术分析川楝子致肝毒性机制

目的 通过网络药理学及分子对接技术探究川楝子肝毒性机制。方法 通过TCMSP、PubChem、SwissADME数据库及文献检索筛选川楝子的潜在毒性成分,利用SwissTargetPrediction数据库预测潜在毒性成分的作用靶点,再通过GeneCards数据库搜索与肝脏损伤相关的靶点,将毒性成分预测靶点与肝脏损伤靶点取交集靶点,获得毒性成分肝脏潜在作用靶点,再利用软件Cytoscape 3.8.2版进行毒性成分–预测靶点、毒性成分–潜在作用靶点、蛋白相互作用（PPI）网络、毒性成分–潜在作用靶点–核心通路网络的构建,采用AutoDock 1.5.6版进行分子对接,并应用PyMOL软件对对接结果进行可视化示例。结果 筛选得到6个川楝子潜在毒性化合物,分别是toosandanin、meliasenin B、trichilinin D、1-O-tigloy-1-O-debenzoylohchinal、butenolide、5-hydxoymethylfurfural,与肝脏损伤共同作用靶点103个。GO和KEGG结果显示,川楝子通过蛋白质磷酸化、凋亡过程的负调控、对异种生物刺激的反应、酶激活的正向调控等过程引起肝脏毒性。分子对接结果显示,川楝子中toosandanin、trichilinin D、1-O-tigloy-1-O-debenzoylohchinal与关键靶点具有较好的结合能力。结论 应用网络药理学及分子对接技术对川楝子致肝毒成分、机制、靶点、通路进行了初步探索,为进一步对川楝子的临床应用研究和效应机制提供数据支持。     

双丹颗粒联合瑞舒伐他汀治疗冠心病心绞痛的临床研究

目的 采用网络药理学和分子对接法分析款冬花在清肺排毒汤治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）中发挥的作用。方法 基于课题组前期研究,确定款冬花中的主要成分。采用Swiss Target Prediction和BATMAN-TCM数据库对款冬花主要化学成分的潜在靶点进行整理;在GenCLiP 3和GeneCard数据库搜索COVID-19相关靶点,运用Cytoscape 3.7.1软件绘制款冬花成分-靶点-疾病网络图;使用String数据库构建靶点PPI网络;通过DAVID数据库进行GO富集分析和KEGG通路富集分析;将各成分与新型冠状病毒（SARS-CoV-2）3CL水解酶和血管紧张素转化酶II（ACE2）进行分子对接。结果 款冬花治疗COVID-19的化合物-靶点-疾病网络包含化合物14个、靶点104个、疾病4个。GO功能富集分析得到GO条目444个（P<0.05）,其中包括生物过程（BP）条目325个、细胞组成（CC）条目44个、分子功能（MF）条目75个。KEGG通路富集筛选得到94条信号通路（P<0.05）。分子对接结果显示异绿原酸B（3,4-dicaffeoylquinic acid）和异绿原酸C（4,5-dicaffeoylquinic acid）与蛋白的亲和力要优于瑞德西韦。结论 款冬花中主要化合物能通过与SARS-CoV-2 3CL水解酶和ACE2结合,作用于多靶点调节多条信号通路,从而发挥对COVID-19的防治作用。     

网络药理学联合生物信息学及分子对接探索黄芪甲苷抗肝癌的作用机制

目的 利用网络药理学结合TCGA和GEO数据集以及分子对接系统性探索黄芪甲苷抗肝癌的分子机制。方法 通过CTD、OMIM及PharmMapper数据库预测黄芪甲苷靶点。计算TCGA和GEO数据集差异基因作为肝癌预测靶点并检索CTD和GeneCards数据库作为补充。用STRING数据库和Cytoscape软件构建靶点蛋白相互作用（PPI）网络，并筛选核心靶点。“clusterProfiler”R包用来对靶点富集分析。运用AutoDuck和PyMOL软件进行分子对接。结果 共预测到201个黄芪甲苷抗肝癌靶点，主要与老化、氧化应激及脂质代谢有关，且京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集通路与肝癌密切相关。201个靶点中有9个关键靶点，分子对接发现白细胞介素-6（IL-6）、丝裂原活化蛋白激酶3（MAPK3）、白蛋白（ALB）与黄芪甲苷有良好结合力。结论 黄芪甲苷通过多靶点和多通路实现抗肝癌作用。     

基于系统虚拟药理学与归经理论研究归大肠经中药 抗结直肠癌药效物质基础

目的:基于系统虚拟药理学与归经理论研究归大肠经中药抗结直肠癌(CRC)药效物质基础,对该类中药在分子网络层面上进行探析.方法:选择了10个CRC相关靶点,构建归大肠经中药化学成分分子数据库,探讨数据库分子与CRC靶点间相互作用关系,并应用Western blot对部分数据进行了验证.结果:共筛选出30个归大肠经中药活性分子与10个CRC靶点有一定的潜在协同效应.结论:本实验从分子层次上阐释了归大肠经中药抗CRC药效物质基础,为该类中药的临床应用提供了科学依据,同时也为寻找抗CRC药物提供一定的参考和借鉴.     

基于网络药理学和分子对接方法研究羚珠散抗小儿易感病毒的作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术研究羚珠散抗小儿易感病毒的有效成分和作用机制。方法 利用TCMID数据库查找羚珠散的化学成分,利用TCMSP、Pubchem、Swiss Target Prediction、SEA和STITCH数据获得羚珠散活性化合物的作用靶点;通过GeneCards数据库获得相关病毒性疾病靶点,取交集后得到共有靶点,即为羚珠散抗小儿易感病毒的潜在作用靶点。通过STRING数据库构建交集靶点的蛋白质相互作用（PPI）网络,基于degree值筛选重要靶点。利用DAVID平台对重要靶点进行基因本体论（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。使用Cytoscape软件进行化合物–靶点网络拓扑分析,获得羚珠散抗小儿易感病毒的关键化合物和核心靶点。采用AutoDock Vina软件对筛选出的关键靶点和核心化合物进行分子对接验证。结果 共获得91个活性化合物以及184个药物–疾病交集靶点,经筛选获得羚珠散抗小儿易感病毒15个核心化合物（桉油烯醇、桉脂素、丁香烯、乙酸龙脑酯等）以及3个核心靶点[C反应蛋白（CRP）、趋化因子2（CCL2）、血红素加氧酶1（HMOX1）]。KEGG通路富集分析结果显示,羚珠散抗小儿易感病毒可能主要通过调控肿瘤坏死因子（TNF）、Toll样受体、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）、叉头框蛋白O（FoxO）及T细胞受体等多种信号通路发挥治疗作用。分子对接结果表明,羚珠散抗易感病毒中10个核心化合物和核心靶点均有良好的结合能力,证明了网络药理学筛选结果的可靠性。结论 羚珠散可通过桉油烯醇、桉脂素、丁香烯、乙酸龙脑酯等主要活性成分,结合CRP、CCL2、HMOX1等核心靶点来调控机体多种炎症反应、免疫反应相关信号通路,从而发挥抗小儿易感病毒作用。     

Protective effects of Re-yan-ning mixture on Streptococcus pneumonia in rats based on network pharmacology

ContextRe-yan-ning mixture (RYNM) is a new national drug approved by China''s State Food and Drug Administration for the treatment of colds, simple pneumonia and acute bronchitis.ObjectiveTo determine the mechanism of action of RYNM in the treatment of bacterial pneumonia.Materials and methodsUsing the network pharmacology approach, the multiple components, component candidate targets and multiple therapeutic targets of RYNM were screened and functionally enriched. Also, we established a rat Streptococcus pneumonia model to verify the results of network pharmacology enrichment analysis. Forty male SPF Sprague Dawley rats were divided into four groups of 10 rats: control (normal saline), model (normal saline), levofloxacin-intervened and RYNM-intervened groups. IL-10, NOS2, COX-1, IL-6, TNF-α and NF-κB in serum and BALF were detected by ELISA. Western blot detected IL-17, IL-6, TNF-α, COX-2 and Bcl-2.ResultsThe network pharmacology approach successfully identified 48 bioactive components in RYNM, and 65 potential targets and 138 signal pathways involved in the treatment of Streptococcus pneumonia with RYNM. The in vivo experiments indicated that model group has visible inflammation and lesions while RYNM and levofloxacin groups have not. The RYNM exhibited its therapeutic effects on Streptococcus pneumonia mainly via the regulation of cell proliferation and survival through the IL-6/IL-10/IL-17, Bax/Bcl-2, COX-1/COX-2, NF-κB and TNF-α signalling pathways.Discussion and conclusionsThe present study demonstrated the protective effects of RYNM on Streptococcus pneumonia, providing a potential mechanism for the treatment of bacterial pneumonia with RYNM.     

藏药三果汤治疗糖尿病作用机制的网络药理学与分子对接技术分析

目的 基于网络药理学及分子对接对三果汤治疗糖尿病靶点及通路进行分析，并通过分子对接进行验证，为基础研究及临床用药提供科学依据。方法 通过中药系统药理学数据库与分子平台（TCMSP）、有机小分子生物活性数据库（PubChem）及文献查阅筛选三果汤中诃子、毛诃子、余甘子的活性成分及作用靶点，使用Genecard数据库、DRUGBANK数据库筛选糖尿病相关靶点，构建“药物-成分-靶点-疾病”网络，取药物疾病靶点交集，使用STRING构建蛋白PPI网络，运用Matescape数据库对交集靶点基因进行GO、KEGG富集分析。将筛选出的有效成分与靶点进行分子对接验证。结果 通过网络药理学收集三果汤及糖尿病靶点信息，采用GO富集分析和KEGG通路分析发现，三果汤和糖尿病共同作用靶点共269个，靶点作用最为突出的为AKT1、HAS2、MAP2、CDH1、PRKCG、PLAT，三果汤作用于糖尿病的通路主要在癌症通路、脂质和动脉粥样硬化、MAPK信号通路。分子对接结果显示，鞣花酸和没食子酸对AKT1、HAS2、MAP2存在亲和力，鞣花酸对HAS2亲和力最好。结论 通过本研究中网络药理学分析及分子对接分析，三果汤中鞣花酸、没食子酸对AKT1、HAS2、MAP2通路靶点具有亲和力，为后续实验提供研究思路。     

基于网络药理学和分子对接探讨石榴皮治疗腹泻的作用机制

目的 基于网络药理学结合分子对接技术探究石榴皮治疗腹泻的作用机制。方法 通过TCMSP数据库获取石榴皮的活性成分和潜在作用靶点；GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库进行检索获得腹泻的潜在作用靶点，筛选两者交集靶点；应用Cytoscape软件构建蛋白相互作用（PPI）图并筛选核心靶点。通过DAVID数据库进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，最后采用AutoDock软件进行分子对接验证。结果 获得7个石榴皮主要化学成分，石榴皮与腹泻共同靶点114个。PPI分析显示，肿瘤抗原p53（TP53）、蛋白激酶B1（Akt1）、肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-6（IL-6）、胱天蛋白酶33（CASP）等可能为治疗关键靶点。通过KEGG分析表明，石榴皮可能通过癌症通路、磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）/Akt信号通路等起到治疗腹泻的作用。分子对接表明关键活性成分与核心靶点均可自发结合。结论 通过网络药理学和分子对接技术揭示石榴皮可以通过多成分、多靶点、多途径治疗腹泻，为后续研究提供理论依据。