组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA对食管癌细胞ncRNA/mRNA表达谱的影响

目的:分析组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA处理前后,食管癌细胞株EC109中差异表达的非编码RNA(ncRNA)和mRNA表达谱,初步预测与TSA作用相关的ncRNA和mRNA。方法:采用MTT、细胞周期等方法检测TSA的效应;运用应用芯片技术分别检测TSA处理前后EC109细胞中ncRNA和mRNA表达谱变化,并对差异ncRNA和mRNA表达谱进行整合分析。结果:TSA以剂量时间依赖方式抑制细胞增殖,细胞周期阻滞和凋亡的发生。芯片检测共发现461个ncRNA和758个mRNA显著性差异表达,生物信息学分析显示差异涉及红比霉素、阿霉素代谢过程、氧化还原、核小体的装配、染色质结构组织和端粒的结构组织等。通过数据库分析预测及整合分析,得到了361个ncRNA-mRNA靶基因对。结论:差异表达的ncRNA和mRNA对TSA的生物学效应密切关联,为进一步研究基因功能及其在肿瘤中的生物学意义奠定基础。     

百草枯致小鼠肺泡上皮细胞损伤过程中microRNA表达谱分析

目的 研究百草枯(PQ)致小鼠肺泡上皮细胞损伤过程中microRNA(miRNA)表达谱的变化,并预测差异表达的miRNA靶基因和相关的生物学功能.方法 体外培养小鼠肺泡上皮细胞系MLE12细胞,加入不同浓度的PQ,通过CCK-8方法检测细胞活力以及流式细胞术检测细胞凋亡率,最终选择100μ MPQ作为合适的实验浓度.进一步设立对照组和实验组,对照组加入等量PBS的培养液,实验组加入100μ MPQ的培养液,24h后用基因芯片检测两组microRNA表达谱的改变,分析差异表达的miRNA并用生物信息学方法预测靶基因及相关信号调节通路.结果 100μmol/LPQ处理MLE-12细胞24h后,细胞活性下降约50％,细胞凋亡率约15％.基因芯片共筛选出11个差异表达的miRNA,其中1个被上调,10个被下调.预测这些上下调的miRNA靶基因与细胞的线粒体凋亡途径以及DNA的甲基化相关,参与PI3K-Akt、mTOR、RAS、TNF和MAPK等与氧化应激以及凋亡相关的信号通路的调节.结论 PQ对小鼠肺泡上皮细胞的损伤进程中microRNA表达谱发生了改变,这些差异表达的miRNA可能是细胞氧化应激及凋亡的重要调节因素.     

延安地区成年男性ALDH2基因多态性与酒精性肝病关系探讨

目的探讨乙醛脱氢酶(ALDH)2基因多态性与延安地区成年男性酒精性肝病(ALD)的关系。方法应用基因芯片方法测定健康对照组(76例)、ALD组(36例)和非酒精性脂肪肝病组(NAFLD)(73例)ALDH2基因型及等位基因频率,进行比较。结果两种等位基因ALDH2 504Glu和ALDH2 504Lys在3组之间的分布差异均有统计学意义(P均0.05)。ALDH2的3种基因型在健康对照组、ALD组和NAFLD组之间的分布均存在一定差异(P均0.05),具有统计学意义。结论 ALDH2基因多态性和本地区ALD的发生密切相关,ALDH2 504Lys等位基因可能是ALD的保护因子。     

基因芯片在宫颈癌中的研究进展

基因芯片是分子生物学领域的技术之一,是20世纪90年代以来发展的一种基因筛选技术,具有高通量、快速等优点。近年来,随着相关技术和设备的进步,基因芯片的应用更为广泛,尤其在医学领域有较快发展。应用基因芯片技术,可对肿瘤的发生、发展进行研究,并从基因水平上探究相关机制,给临床治疗等提供帮助。宫颈癌是女性常见的生殖系统肿瘤之一,宫颈癌的发生与人乳头瘤病毒(HPV)的感染密切相关。应用基因芯片技术不仅可以绘制宫颈癌的表达谱,进行HPV感染情况的分析,还可以对宫颈癌的病理分型、浸润及治疗机制进行基因水平的分析,以指导临床决策。