育龄妇女不同HCY水平及叶酸利用能力对胎儿出生缺陷的影响

目的探讨育龄妇女不同同型半胱氨酸(HCY)水平及叶酸利用能力对胎儿出生缺陷的影响。方法选取2019年1月至2020年1月在海南省妇女儿童医学中心妇产科建档的537例孕妇为研究对象,在首次产检时采集其口腔黏膜上皮细胞,采用荧光定量PCR测定甲蛋氨酸合成还原酶(MTRR) A66G和5,10-亚甲基四氢叶还原酶(MTHFR) C677T、A1298C的基因分型判断叶酸利用能力,比较MTRRA66G、MTHFRC677T、A1298C不同基因型血清Hcy水平。并根据叶酸利用能力分为A组(未发现风险+低风险)及B组(中度风险+高度风险),A组给予叶酸400μg/d,B组给予叶酸800μg/d,给药至孕3个月,孕中期及孕晚期根据Hcy值调整叶酸用量,记录两组孕早期、孕中期、孕晚期及产后42 d血清Hcy水平及新生儿出生缺陷情况。结果 MTRR的A66G基因分型主要为AA、AG;MTHFR的C677T基因分型主要为CT、TT;MTHFR的A1298C基因分型主要为AA、AC。A66G中AA分型Hcy水平高于AG+GG;C677T中TT分型Hcy水平高于CT+CC;A1298C中AA分型Hcy水平高... 更多     

基于生物信息学筛选胰腺导管腺癌关键基因

目的:利用生物信息学方法分析胰腺导管腺癌（PDAC）基因表达谱芯片并筛选关键基因。方法:从公共数据库基因表达数据库（GEO）中下载PDAC基因表达谱芯片GSE28735、GSE15471、GSE101448,共纳入108例PDAC样本和97例癌旁组织样本。应用R语言limma包和impute包筛选差异表达基因。利用DAVID数据库和在线分析工具Kobas分别对差异基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。利用STRING数据库和Cytoscape软件构建差异蛋白互作网络并进一步筛选关键基因。结果:3个基因表达谱芯片共有161个差异表达基因（|log2 fold-change(FC)|>2，P<0.05），包括54个上调基因，107个下调基因。GO功能富集分析显示差异基因与extracellular exosome、extracellular space、extracellular matrix organization密切相关。KEGG通路分析显示差异基因主要富集在protein digestion and absorption、ECM-receptor interaction和focal adhesion等通路。蛋白质相互作用网络图中显示节点最多的10个枢纽基因分别是ALB、COL11A1、COL3A1、FN1、EGF、COL1A1、MMP9、COL5A2、ITGA2、COL6A3。结论:筛选所得的10个关键基因可能在PDAC发生发展中发挥重要作用，有望成为PDAC诊断及治疗的生物学靶标，为进一步研究PDAC发生发展的分子机制提供了理论依据。     

SLC4A1 复合杂合突变致遗传性球形红细胞增多症并远端肾小管酸中毒1 例报告并文献复习

目的分析SLC4A1复合杂合突变致遗传性球形红细胞增多症(HS)并远端肾小管酸中毒(dRTA)的临床表型与基因变异的关系。方法回顾分析1例确诊HS合并dRTA患儿的临床资料,以及患儿及父母外周血全外显子测序及Sanger验证结果。结果男性患儿,1岁7个月,主要临床表现为输血依赖性球形红细胞增多、代谢性酸中毒、低钾血症及生长发育迟缓。检测到患儿SLC4A1 基因2个已报道的错义变异c.2102GA p.(Gly701Asp),c.1988TC p.(Met663Thr),分别来源于父母。结论经基因检测确诊由SLC4A1复合杂合变异所致的遗传型HS合并dRTA,符合常染色体隐性遗传。     

2020年ASCO《卵巢上皮性癌胚系和体细胞肿瘤检测指南》解读

        2020年初美国临床肿瘤学会（American Society of Clinical Oncology，ASCO）首次在Journal of Clinical Oncology发布了《卵巢上皮性癌胚系和体细胞肿瘤检测指南》［1］。该指南以2007—2019年间发表的6篇Meta分析、11篇随机对照试验、2篇观察性研究的相关文献为主要参考依据，为卵巢上皮性癌肿瘤基因突变检测相关临床应用和实施提供了指导和建议。该指南的框架架构由背景、方法、结果、推荐、医患沟通、健康差异、成本影响等十几个板块组成，主要阐述了3个主要问题：应在哪些个体中进行胚系和体细胞突变肿瘤风险评估、咨询和基因检测，哪些胚系基因突变已经被证明对卵巢癌临床治疗有指导价值，以及最合适的卵巢癌基因突变检测时机。本文对该指南进行剖析和解读，以期为卵巢癌基因检测的临床应用提供相关依据和指导，为卵巢癌的规范诊治提供借鉴，也为国内同道制定相关指南提供参考。 浏览更多请关注本刊微信公众号及当期杂志。     

梅州地区TLR4基因连锁不平衡与缺血性脑卒中相关性研究

目的 检测梅州地区缺血性脑卒中患者和健康对照人群TLR4基因的（rs10759932、rs11536879、rs11536891、rs1927914）的基因多态性，经连锁不平衡分析其与缺血性脑卒中的相关性。方法 收集2018年1月1日 - 2018年7月31日住院治疗的突发缺血性脑卒中患者作为病例组，同期在体检中心收集健康人群作为对照组。应用Massarray SNP 分型技术检测两组患者TLR4基因的4个位点基因型，进行Hardy - Weinberg（H - W）平衡检测。采用不同模型分析上述位点不同基因型与脑梗死发病风险的相关性，并通过连锁不平衡分析其与缺血性脑卒中的相关性。结果 病例组纳入病例186名，对照组纳入健康人194名；4种SNP位点均符合H - W 平衡。rs1927914位点G/G基因型在对照组出现频率远远高于病例组（χ2 = 9.267，P＜0.05）。rs10759932位点T/T基因型在女性对照组中出现的频率显著高于男性[OR = 0.38 (0.18 - 0.81)，P＜0.05]。4个SNP位点之间均存在连锁不平衡，TGCG基因型组合在缺血性卒中男性患者出现的频率显著高于女性[OR = 3.54 (1.17 - 10.69)，P＜0.05]。结论 梅州地区rs1927914位点A＞G为保护性基因突变，可以降低缺血性脑卒中发生。4个位点的连锁不平衡与缺血性脑卒中发生存在部分性别差异，TGCG组合为男性人群的危险基因，脑卒中发生率显著升高。     

针灸联合活血祛痰膏方对PCOS患者卵巢早衰颗粒细胞STMN1和DENND1A基因表达的影响

目的探讨针灸联合活血祛痰膏方对PCOS患者卵巢早衰颗粒细胞STMN1和DENND1A基因表达的影响。方法选取2017年8月-2018年8月在襄阳市中医医院接受治疗的PCOS患者90例,按奇偶数字表随机分为两组,每组45例。A组予以活血祛痰膏方治疗,B组予以活血祛痰膏方联合针灸治疗。对比两组患者治疗前后STMN1、DENND1A表达情况,性激素水平,中医症候评分。结果治疗前,两组患者STMN1和DENND1A表达水平,血清卵泡刺激素(FSH)、雌二醇(E2)、黄体生成素(LH)、黄体酮(P)水平,中医症候评分比较差异均无统计学意义(均P <0. 05);治疗后,两组患者STMN1和DENND1A表达水平,血清FSH、E2、LH、P水平,中医症候评分比较差异均有统计学意义(均P<0. 05)。在两组中,治疗后患者STMN1和DENND1A表达水平,血清FSH、E2、LH、P水平,中医症候评分均低于治疗前(均P<0. 05)。结论 PCOS患者卵巢早衰颗粒细胞中可见STMN1、DENND1A高表达,活血祛痰膏方联合针灸治疗后,STMN1、DENND1A表达水平下降,患者性激素水平及中医症候评分随之改善。     

中国回族人群CYP4F2和VKORC1的基因多态性

目的考察中国回族人群华法林治疗反应相关基因CYP4F2和VKORC1的基因多态性。方法从159名健康中国回族志愿者的外周血提取DNA,CYP4F2的13个外显子及VKORC1的3个外显子及其外显子-内含子交接处的碱基序列通过多聚酶链反应进行扩增,相应的扩增产物经Sanger测序法进行测序分析。所得基因变异体通过软件HAPLOVIEW进行单体型和连锁不平衡分析。错义突变对蛋白的影响通过3个在线软件Poly Phen-2,SIFT和MutationTaster-2进行预测。结果CYP4F2共有18个基因变异体被发现,内含子和外显子各9个,其中有3个变异体是首次报道,即第1内含子-14G>C,第4外显子5039C>T(p.Ala118Val)和第12外显子18227A>C(p.Glu452Ala)。VKORC1共有9个单核苷酸多态性被发现,其中3个位于外显子区。CYP4F2 Val433Met和VKORC1-1639 G>A的变异体等位基因频率分别是0.370和0.608,与千人基因组人群相比均有显著性差异(P<0.05)。CYP4F2和VKORC1所发现的基因变异体有显著的连锁不平衡。结论中国回族人群CYP4F2和VKORC1的群体遗传学模式具有不同的特征,在使用华法林等药物时应进行药物剂量的相应调整。     

基于TCGA数据初步探查肝内胆管癌预后相关基因

目的 分析tCGA数据库中肝内胆管癌（ICC）高通量测序数据，寻找其预后相关基因，构建风险模型，并研究其在ICC组织中表达及作用通路。方法 下载tCGA数据库中33例ICC组织和8例癌旁组织中的RNA-seq表达矩阵数据和患者临床资料信息，利用edgeR软件包进行基因差异表达分析，通过单因素Cox回归分析筛选出预后相关差异基因，对差异基因绘制生存曲线，筛选出具有临床意义的基因，经多因素Cox回归分析并构建风险模型，通过京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析了解预后相关基因的作用通路。结果 通过edgeR分析后得到6 617个差异基因（筛选标准为|log2 Fold Change|＞1，P＜0.05），其中高表达组4 094个，低表达组2 523个。通过功能富集发现，这些基因主要集中在化学物致癌作用、药物代谢-细胞色素P450系统、细胞色素P450对异生物质的代谢影响以及视黄醇代谢通路。经单因素Cox回归、R软件“survival”包生存曲线分析显示，UCN2、CST1、PROS1、SLC35E4、PEMT五个基因对ICC患者预后存在显著性影响。通过多因素Cox回归分析，CST1、PEMT、PROS1构建的风险模型对ICC患者预后具有判断作用。结论 UCN2、CST1、PROS1、SLC35E4、PEMT基因可能成为ICC预后判断指标，为后续临床试验提供数据支持。     

β-纤维蛋白原-455G/A基因多态性与胆囊癌的相关性研

目的 通过检测胆囊癌患者β-纤维蛋白原（Fgβ）-455G/A基因，探讨Fgβ-455G/A基因多态性与胆囊癌的相关性。方法 采集50 例胆囊癌患者（胆囊癌组）和50 例胆囊结石伴慢性胆囊炎患者（胆囊炎组）的静脉血，应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）方法对Fgβ-455进行基因分型。 结果 Fgβ-455 基因GA杂合型和AA纯合子在胆囊癌中的频率显著高于胆囊炎组，显著增加胆囊癌发生的危险性，OR值（95%CI）分别为2.526（1.052～6.068）和4.306（1.177～15.749）。结论 Fgβ-455G/A位点G/A单个碱基的改变可能在胆囊癌的发病中起着重要的作用。