基于网络药理学的降脂脉安颗粒治疗非酒精性脂肪肝作用机制研究(英文)

  目的  采用网络药理学方法筛选降脂脉安颗粒(JZMA)的主要活性成分和作用靶点, 探讨其治疗非酒精性脂肪肝(NAFLD)的潜在作用机制。  方法  借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中的脂水分配系数(ALogP)和药物相似性(DL)参数设置, 收集降脂脉安颗粒中各个药物的化学成分, 通过靶点预测网站服务器(UniProt)与人类基因数据库(Genecard)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)的整合来获取降脂脉安颗粒治疗非酒精性脂肪肝的作用靶点和疾病基因, 运用STRING在线工具构建蛋白互相作用(PPI)网络, 并借助Cytoscape 3.6.0构建"中药-成分-疾病-靶点"网络。利用Cytoscape3.7.2软件进行网络拓扑分析, 运用MCODE插件筛选出关键基因, 并采用STRING数据库与R 3.6.3软件进行基因本体(GO)分类富集和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。  结果  共得到283个潜在活性成分, 包括槲皮素(quercetin)、芹菜素(apigenin)、山柰酚等关键化合物; 经拓扑分析, 获得13个核心靶点、6个基因簇和4个核心基因CASP9、PTGS2、SLC2A4、OPRD1, 它们主要参与PI3K/Akt、AGE-RAGE、FOXO、IL-17、HIF-1信号通路等。  结论  网络药理学分析有助于揭示JZMA治疗NAFLD的主要物质基础, 预测了其多层次、多靶点和多途径的潜在作用机制, 为拓展临床应用提供了科学依据。       

关于跳跃间期与HIS至慢径消融靶点距离的相关性研究

目的:探讨在Carto标测系统指导下,房室结折返性心动过速在射频消融中跳跃间期与HIS至慢径消融靶点距离的相关性。方法:回顾性分析在我科接受射频消融手术的房室结折返性心动过速患者26例,手术成功的标准设定为慢径消失或仅有一个心房回波,分析跳跃间期与HIS至慢径消融靶点距离的相关性。结果:26例患者全部消融成功,跳跃间期与HIS至慢径消融靶点的距离呈正相关(r=0.403,P<0.05)。结论:在接受射频消融手术治疗的房室结折返性心动过速患者中,跳跃间期与HIS至慢径消融靶点距离有正相关性,依据跳跃间期对慢径消融靶点位置的选择有一定的参考价值。     

脂质代谢与肺癌相关性及其潜在治疗靶点

正脂质代谢调节机制在肿瘤发生发展中的重要性已得到广泛关注。通过增加多种脂肪生成酶的表达,肿瘤细胞可以诱导新生脂肪形成,甚至有研究者认为新生脂肪组织生成的增加可作为多种侵袭性肿瘤的新型标志~([1])。肺部肿瘤常存在血管异构,在限制肿瘤细胞营养供应的同时,造成细胞缺氧微环境,最终诱导肿瘤细胞发生包括脂代谢在内的多方面代谢变化~([2])。     

通过ACEⅡ通路治疗男性不育症的中药网络药理学研究

目的 通过收集ACEⅡ通路和男性不育症的交集靶点,运用网络药理学研究方法,挖掘具有潜在价值的中药及相关化合物.方法 通过KEGG、TCMSP数据库检索靶点、相关中药以及活性化合物,运用Cytoscape 3.7.0构建有效中药-活性化合物-靶点网络,通过NetworkAnalyzer功能分析各组分网络维度参数.结果 共有194味中药具有该通路靶点,其中前10位为麻黄、桑叶、柴胡、芫荽、沙棘、桂枝、生姜、桑椹、枇杷叶、牛蒡子.进一步构建有效中药-活性化合物-靶点网络,发现以麻黄Degree最高(Degree=7),桑叶、芫荽次之(Degree=5),活性化合物按Degree排序以acetic acid(Degree=11)、anethole(Degree=4)、Terragon(Degree=4)居前3位.结论 本研究初步分析了针对ACEⅡ通路与少弱精交集靶点对应的有效中药,并通过网络药理学分析,筛选了具有潜在价值的中药及活性化合物.     

转录因子FoxM1与颅内胶质瘤治疗的研究进展

胶质瘤是中枢神经系统最常见的原发性肿瘤,高级别胶质瘤具有高度侵袭性,术后复发快,并对放疗和化疗表现出内在抗性,患者预后不佳[1]。尽管临床医生不断探索和革新手术切除以及化学治疗和放射治疗方案,在一定程度上提高了患者术后生活质量,但一般的抗肿瘤药物,由于难以通过血脑屏障等因素的影响,治疗的效果欠佳,寻找到一个能有效治疗胶质瘤的药物就成为了研究的关键。     

基于网络药理学分析牡丹皮-赤芍治疗银屑病的作用机制

[目的] 通过网络药理学方法分析牡丹皮-赤芍治疗银屑病的有效成分、作用靶点及作用通路,探讨其作用机制。[方法] 通过中药系统药理数据库和分析平台（TCMSP）,检索牡丹皮和赤芍的有效成分以及相应的作用靶点,通过The Human Gene Database（GeneCards）平台检索银屑病的相关靶点,利用ClusterProfiler R软件绘制韦恩图,获得牡丹皮-赤芍与银屑病的共同靶点。利用STRING平台和Cytoscape3.7.2软件,构建靶蛋白相互作用网络和药物-有效成分-靶点-疾病网络。利用ClusterProfiler R软件平台对牡丹皮-赤芍及银屑病的共同作用靶点进行GO功能富集分析和KEGG代谢通路富集分析。[结果] 筛选出牡丹皮-赤芍治疗银屑病的有效成分37个和潜在作用靶点112个,关键靶点为JUN、AKT1、RELA,发现细胞因子受体结合、细胞因子活性、血红素结合等生物学过程和AGE-RAGE信号通路、白介素（IL）-17信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路等在牡丹皮-赤芍治疗银屑病中起到较为关键的作用。[结论] 牡丹皮-赤芍治疗银屑病是通过多种有效成分作用在多种靶点、多种通路的生物学过程实现的,也为进一步研究牡丹皮-赤芍治疗银屑病的作用机制提供了理论基础。     

基于网络药理学和分子对接的乾坤丹Ⅵ号治疗糖尿病肾脏疾病的机制研究

[目的] 运用网络药理学研究方法探讨乾坤丹Ⅵ号防治糖尿病肾脏疾病（DKD）的作用机制。[方法] 基于TCMSP数据库获取乾坤丹Ⅵ号的化学成分及对应靶点,GeneCards、OMIM数据库检索DKD的疾病靶点;对药物与疾病靶点相映射得到乾坤丹Ⅵ号防治DKD的关键作用靶点,利用String数据库构建关键靶点的蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络,运用Cytoscape软件筛选乾坤丹Ⅵ号防治DKD的核心靶点和功能模块,利用autodock软件对乾坤丹Ⅵ号的化学成分和核心蛋白进行分子对接。对关键靶点进行GO和KEGG通路富集分析,分析乾坤丹Ⅵ号对DKD的潜在作用机制。[结果] 得到乾坤丹Ⅵ号有效成分103种,靶点137个,预测靶点较多的成分有槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等,共得到关键靶点128个,分子功能模块6个。分子对接结果显示,乾坤丹Ⅵ号化学成分和靶点蛋白对接的平均结合能为-6.43 kcal/mol,其中槲皮素和PSGT2的结合能最高。GO和KEGG通路富集分析结果显示,乾坤丹Ⅵ号防治DKD与糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、Th17细胞分化、IL-17信号通路、钙信号通路、TNF信号通路、HIF-1信号通路等信号通路有关。[结论] 乾坤丹Ⅵ号通过多成分、多靶点、多信号通路的协同作用实现对DKD的防治作用,为乾坤丹Ⅵ号的进一步临床和实验研究提供了重要的科学依据。     

经典名方当归四逆汤指纹图谱及功效关联物质预测分析

目的基于指纹图谱及网络药理学对当归四逆汤(Danggui Sini Decoction,DSD)进行全过程质量控制和温经散寒、养血通脉功效关联物质预测分析。方法建立DSD物质基准对应实物的指纹图谱,匹配共有峰,进行共有峰的归属分析;基于可测性和可追溯性进行DSD活性成分的筛选,采用网络药理学构建"成分-靶点-通路"网络,预测DSD温经散寒、养血通脉功效关联物质。结果建立了DSD物质基准对应实物的指纹图谱,标定25个共有峰,指认了芍药内酯苷、芍药苷、阿魏酸、甘草苷、肉桂酸、邻甲氧基桂皮醛、甘草酸、藁本内酯、细辛脂素9个色谱峰,相似度均0.90。根据各共有峰的归属分析,主要药效物质群可以从饮片到物质基准对应实物较为完整的传递,归属关系清晰明确;采用网络药理学对筛选出的9个活性成分进行"成分-靶点-通路"网络构建与分析,富集的通路中包括癌症信号通路、磷脂酰肌醇-3-羟激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositol-3-hydroxykinase-proteinkinaseB,PI3K-Akt)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路、瞬时受体电位(transient receptor potential,TRP)通道的炎性介质调节等,DSD的9个活性成分可能通过调节这些信号通路达到温经散寒、养血通脉的作用。结论建立了经典名方DSD的指纹图谱并对其进行归属分析,明确DSD的色谱峰归属,对经典名方DSD进行整体化、过程化的质量控制;并结合网络药理学发现DSD的9个活性成分具有传递性和溯源性,且与DSD温经散寒、养血通脉功效属性密切相关,可作为其潜在的功效关联物质,为DSD的进一步研究提供依据。     

基于网络药理学研究丹栀治疗围绝经期综合征的作用机制

目的:采用网络药理学研究分析牡丹皮-栀子药对治疗围绝经期综合征的多成分、多通路、多靶点的作用机制.方法:运用数据库检索得到牡丹皮-栀子药对的主要活性成分、相应作用靶点及围绝经期综合征的疾病靶点,用Consensus-PathDB数据库进行信号通路及基因本体论(GO)分析,并运用软件Cytoscape 3.7.0绘制关键成分-核心靶点网络图及蛋白互作网络图,软件imageGP绘制通路及GO分析气泡图.结果:得到包括堪非醇在内的关键活性成分17个,血管内皮生长因子(VEGF)A在内的核心靶点39个,GO分析得到包括细胞增殖调控在内的生物学过程970个;激素结合在内的分子功能116个;胰岛素受体复合体在内的细胞组分45个;富集到通路728条,涉及癌症通路和VEGF通路等.结论:牡丹皮-栀子药对可能通过调节激素水平、降低心血管疾病发生风险、改善胰岛素抵抗及调节癌症基因等靶点治疗围绝经期综合征.     

淫羊藿治疗类风湿关节炎作用机制的网络药理学分析

目的运用网络药理学方法探讨淫羊藿治疗类风湿关节炎(RA)的作用机制。方法利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库收集淫羊藿的主要活性成分及其作用靶点;通过GeneCards、OMIM等数据库获取RA相关疾病靶点。取淫羊藿活性成分靶点与RA疾病靶点的交集基因(共同靶点),作为淫羊藿对RA作用的潜在关键靶点基因。将交集基因上传至String数据库,构建淫羊藿活性成分与RA疾病的共同靶点蛋白互作(PPI)网络,并根据其度值筛选出核心靶点。借助DAVID分析平台对共同靶点进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共获得淫羊藿活性成分23个,共同靶蛋白即关键靶标72个。重要活性成分包括槲皮素(Quercetin)、木犀草素(Luteolin)、山萘酚(Kaempferol)等;核心靶点包括白细胞介素6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、表皮生长因子受体(EGFR)、丝裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)等;KEGG主要通路富集在肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、促乳素(Prolactin)信号通路、甲状腺激素(Thyroid hormone)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等。结论淫羊藿可能主要通过多成分、多靶点、多通路,从调节炎症、免疫等多方面发挥对类风湿关节炎的治疗作用。