基于网络药理学研究淫羊藿改善心肌重塑的有效成分和作用机制

目的运用网络药理学方法研究淫羊藿改善心肌重塑的有效成分和作用机制。方法利用中药系统药理学技术平台TCMSP数据库筛选出淫羊藿口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18的主要活性成分及其靶点基因,通过GeneCards、OMIM等数据库获取心肌重塑靶点基因。将成分靶点与疾病靶点上传至String数据库,构建中药成分靶蛋白-疾病靶蛋白互作网络,并根据其度值筛选出关键靶点。借助DAVID分析平台对关键靶标进行基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共获取淫羊藿活性成分23个,与心肌重塑交集的关键靶标78个,包括白介素6(IL-6)、半胱氨酸蛋白酶(CASP)3、血管内皮生长因子A(VEGFA)、表皮生长因子受体(EGFR)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)8等基因,主要富集在恶性肿瘤途径(Pathways in cancer)、肿瘤坏死因子信号通路(TNF signaling pathway)、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)、缺氧诱导因子1信号通路(HIF-1 signaling pathway)、促乳素信号通路(Prolactin signaling pathway)等。结论本研究结果初步验证和预测了淫羊藿改善心肌重塑的作用机制,为进一步深入揭示其分子机制提供了理论基础。     

巴戟天-淫羊藿药对防治老年痴呆作用机制的网络药理学分析

目的基于网络药理学方法探讨巴戟天-淫羊藿药对防治老年痴呆的潜在分子作用机制。方法利用中 药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP 数据库）收集巴戟天、淫羊藿的化学成分,根据口服生物利用度、类 药性、血脑屏障透过率等参数以及结合文献报道筛选其活性成分并预测其作用靶点;通过GeneCard、TTD、 DiGSeE 等数据库筛选出老年痴呆症相关的疾病靶点,并与活性成分作用靶点取交集即为药物与疾病的共同作 用靶点;采用Cytoscape 3.7.1 软件构建巴戟天-淫羊藿药对活性成分-共同作用靶点的可视化网络;基于 STRING 数据库,构建巴戟天-淫羊藿药对防治老年性痴呆靶点（共同作用靶点）的蛋白互作网络,根据拓扑学 参数分析筛选出核心靶点;对共同作用靶点进行GO 功能富集分析和KEGG 信号通路富集分析,构建巴戟天- 淫羊藿药对治疗老年痴呆症的“活性成分-共同作用靶点-信号通路”网络。结果共筛选出活性成分27 个, 获得“巴戟天-淫羊藿”药对与老年痴呆症的共同作用靶点129 个;核心靶点涉及GAPDH、VEGFA、STAT3、 SRC、EGFR、JUN、MAPK8 等;GO 富集分析得到生物学过程相关条目388 条、分子功能相关条目131 条及细 胞组分相关条目117 条（P＜0.01）;KEGG 通路富集分析得到128 条信号通路（P＜0.01）,其中筛选得到与老年 痴呆相关的信号通路9 条。结论巴戟天-淫羊藿药对防治老年痴呆症具有多成分、多靶点、多通路的作用特 点,其作用机制可能与神经活性配体-受体相互作用、内分泌抵抗、5-羟色胺能突触、胆碱能突触、多巴胺能 神经突触等信号通路相关。     

基于网络药理学研究淫羊藿治疗多囊卵巢综合征的作用机制

目的:基于网络药理学探讨淫羊藿治疗多囊卵巢综合征的靶点和机制。方法:中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选淫羊藿活性成分及靶基因,GeneCards数据库获取多囊卵巢综合征相关基因,Venny将淫羊藿靶基因与PCOS相关基因映射,Cytoscape3.2.1软件构建淫羊藿-成分-靶点-疾病网络,STRING10.5软件构建PPI网络互作图和Origin9.1软件对PPI网络中的前30位蛋白绘制条形图,最后使用David v 6.8数据库将淫羊藿治疗多囊卵巢综合征的共同靶点做GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。结果:共得到淫羊藿候选药效成分23个,涉及作用靶点106个,多囊卵巢综合征相关基因3739个,淫羊藿治疗多囊卵巢综合征的关键化合物21个,共同作用靶点67个。GO功能富集主要包含序列特异性DNA结合、转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控等。KEGG富集通路主要有PI3K-AKt信号通路、TNF信号通路等72条。结论:筛选和分析淫羊藿治疗多囊卵巢综合征的作用机制,为后续进行深入研究提供了一定思路和参考。     

基于网络药理学和分子对接研究淫羊藿治疗抑郁症的抗炎作用机制

目的:采用网络药理学方法预测淫羊藿治疗抑郁症的抗炎靶点及相关信号通路,探讨其抗抑郁作用的潜在机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库搜集和筛选淫羊藿的活性成分;利用PharmMapper服务器,TCMSP数据库对蛋白靶点进行预测和筛选;利用OMIM数据库,CTD数据库和GeneCards数据库筛选抑郁症的相关靶点以及抗炎靶点;通过DAVID数据库对关键抗炎靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用Cytoscape 3.6.0软件构建淫羊藿"活性成分-作用靶点-信号通路"网络图,并对网络拓扑结构分析;采用GOLD分子对接软件对活性成分与关键抗炎靶点进行结果验证。结果:筛选得到淫羊藿与抑郁症相关的12个活性成分,30个作用靶点,5个关键抗炎靶点;GO功能富集得到生物过程65个,细胞组成4个,分子功能1个,KEGG通路富集分析得到41条,其中与炎症相关的信号通路9个;分子对接验证淫羊藿苷与关键抗炎靶点能够形成最佳复合体。结论:揭示了淫羊藿通过抗炎靶点及其相关信号通路网络作用于抑郁症的分子机制,为进一步研究淫羊藿抗抑郁作用提供了基础。     

网络药理学探讨淫羊藿-巴戟天药对治疗勃起功能障碍的潜在机制

目的：运用网络药理学的分析方法探讨淫羊藿-巴戟天治疗勃起功能障碍的潜在机制。方法：从中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、生物信息学分析工具BATMAN-TCM数据库筛选出淫羊藿、巴戟天的有效活性成分及作用靶点,运用GeneCards、OMIM、NCBI数据库获取勃起功能障碍的疾病靶点,韦恩图筛选药对、疾病的共同的靶点。采用String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络构建,Cystoscap 372进行拓扑分析,构建药对中药-活性成分-疾病-靶点交集网络,运用R363软件对共同靶点进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析,筛选出潜在信号通路并分析其作用机制。结果：1）巴戟天、淫羊藿筛选出203个靶点。2）勃起功能障碍疾病筛选出1 004个靶点。3）淫羊藿-巴戟天药对与勃起功能障碍的交集靶点共75个。4）通过PPI网络筛选出IL6、VEGFA、CASP3等30个关键靶点。5）GO分析的生物过程主要富集在对脂多糖的反应等过程;细胞组分主要富集在膜筏、膜微区等部位;分子功能主要富集在肾上腺素能受体活性等。6）KEGG分析共富集到PI3K-AKT信号通路等17条信号通路。结论：淫羊藿-巴戟天药对治疗勃起功能障碍,主要通过影响PI3K-AKT等信号通路发挥作用,同时可能与降低精氨酸酶、乙酰胆碱酯酶和腺苷脱氨酶的活性,上调NO水平,抑制PDE-5活性及影响细胞信号转导等机制相关。     

基于网络药理学的淫羊藿增强免疫功能作用机制研究

目的：通过网络药理学探讨淫羊藿增强免疫功能可能的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索淫羊藿的活性成分和靶点。利用Cytoscape 3.7.1软件构建“药物-活性成分-靶点”网络图。通过人类基因数据库（GeneCards）检索免疫抑制的相关靶点,利用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析,利用DAVID平台进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集通路分析。结果：筛选出淫羊藿21个有效活性成分,179个潜在靶点。GO生物过程共562条,包括信号转导、炎症反应、凋亡过程等;KEGG信号通路共120条,主要涉及癌症途径、MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路等。结论：淫羊藿的活性成分通过作用于AKT1、TP53、IL6、VEGFA等靶点,参与信号转导等生物过程,调控癌症途径、TNF信号通路等多个途径发挥增强免疫功能的作用。     

基于网络药理学与分子对接技术研究淫羊藿治疗少弱精症的作用机制

目的 利用网络药理学、分子对接技术探究淫羊藿治疗少弱精症的有效成分及作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选出淫羊藿主要活性成分及对应靶点基因；通过GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）获得少弱精症靶点基因；利用UniProt对所有基因进行校正；利用Cytoscape 3.9.0软件构建药物-活性成分-关键靶点调控网络，根据度值筛选关键活性成分；将活性成分与疾病共同靶点上传至STRING 11.5数据库构建淫羊藿靶蛋白-少弱精症靶蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，根据度值筛选关键蛋白靶点；利用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科（KEGG）通路富集分析；利用Protein Data Bank（PDB）数据库及TCMSP数据库获得靶蛋白和活性成分的分子结构，通过AutoDock Vina 1.1.2软件对活性成分及核心蛋白靶点进行分子对接；最后通过淫羊藿活性成分淫羊藿苷干预少弱精症模型大鼠，验证淫羊藿苷对蛋白靶点表达的影响。结果 从淫羊藿中筛选出23个活性成分，淫羊藿与少弱精症的共同关键靶点50个，核心靶点6个，包括肿瘤蛋白p53（TP53）、表皮生长因子受体（EGFR）、前列腺素G/H合酶2（PTGS2）、胱天蛋白酶（Caspase）-3、受体酪氨酸蛋白激酶erbB-2（ERBB2）、Caspase-9。GO功能富集与KEGG信号通路富集分析淫羊藿活性成分主要参与P53信号通路、癌症途径、细胞增殖和凋亡等。分子对接结果提示淫羊藿苷、槲皮素、8-异戊烯醇三个活性成分与靶蛋白结合能力较强。淫羊藿苷干预实验结果表明，与空白组比较，少弱精模型大鼠睾丸中靶蛋白表达显著下调；与少弱精症模型大鼠组比，淫羊藿苷可显著上调靶蛋白在淫羊藿苷组睾丸中靶蛋白的表达（P<0.05）。结论 淫羊藿主要通过淫羊藿苷、8-（3-甲基丁-2-烯基）-2-苯基色酮、8-异戊烯醇，调节P53信号通路、癌症途径、细胞增殖和凋亡等路径发挥治疗少弱精症的作用。     

基于网络药理学分析淫羊藿-三七配伍治疗前列腺癌的潜在靶点及相关机制

目的:基于网络药理学分析淫羊藿-三七配伍治疗前列腺癌的潜在靶点及相关机制。方法:借助TCMSP及TCMID数据库检索淫羊藿、三七的药物活性成分及靶点信息,GeneCards及OMIM数据库检索前列腺癌的作用靶点。利用Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络图,通过STRING及CentiScape进行PPI蛋白互作分析,同时对药物-疾病关键靶点进行GO和KEGG富集分析。结果:共检索淫羊藿-三七的有效活性成分24个,治疗前列腺癌靶点基因64个,筛选出64个核心靶点。GO富集分析中生物学过程集中在泛素化、核受体功能、转录相关功能、激素受体功能、细胞凋亡等;KEGG富集分析提示淫羊藿-三七治疗前列腺癌主要涉及细胞凋亡、肿瘤抑制信号通路(p53)、内分泌抵抗、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)、肿瘤坏死因子(TNF)等信号通路。结论:该研究初步预测了淫羊藿-三七配伍治疗前列腺癌的关键靶点以及相关信号通路,提示其可能通过促进细胞凋亡、抑制肿瘤细胞增殖、降低内分泌抵抗、杀伤肿瘤细胞以及抑制肿瘤血管生成等途径发挥抗肿瘤作用,为进一步深入研究提供了新思路。     

基于网络药理学与实验验证探讨资木瓜治疗类风湿关节炎的作用机制

运用网络药理学方法探讨资木瓜治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis, RA)的物质基础和作用机制,并通过分子对接和实验验证资木瓜抗RA的潜在靶点。从中药系统药理学数据库与分析平台筛选资木瓜中的活性成分及靶点。利用GeneCards、DisGeNET和OMIM数据库获取RA相关靶点,两者取交集,即资木瓜治疗RA的潜在作用靶点。利用Cytoscape 3.9.0软件,构建“中药-活性成分-共同靶点-疾病”网络。利用STRING建立蛋白相互作用(PPI)网络,运用RStudio 4.1.0软件对核心基因进行可视化。运用DAVID数据库进行基因本体(Gene Ontology, GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路富集分析,预测其富集的信号通路并进行可视化展示。将筛选出来的活性成分作为配体,与筛选得到的RA核心靶点进行分子对接分析,最后通过动物实验进一步验证实验结果。资木瓜的主要活性成分4种、对应靶点137个,药物疾病共同靶点37个;GO富集分析得到239个条目(P<...     

淫羊藿治疗骨质疏松骨折的网络药理学分析

目的 利用网络药理学原理探讨淫羊藿治疗骨质疏松骨折的分子作用机制。方法 利用中药系统药理学分析平台（TCMSP数据库）筛选淫羊藿的主要活性成分和作用靶点,应用GeneCards数据库、OMIM数据库、PharmGkb数据库、TTD数据库、DrugBank数据库预测骨质疏松骨折的相关靶点,制作维恩图获取淫羊藿与骨质疏松骨折的共同靶点,运用Cytoscape软件绘制中药-成分-疾病-靶点调控网络,利用STRING数据库进行蛋白相互作用网络的构建与分析。最后,使用R语言和Bioconductor平台进行基因本体富集分析（GO）和基因相互作用通路分析（KEGG）。结果淫羊藿主要是通过23种活性成分、121个作用靶点及155个生物学通路发挥作用治疗骨质疏松骨折。其中主要活性成分为槲皮素、山奈酚和木犀草素;主要核心靶点有AKT1、TP53、Jun、HSP90AA1和CASP3等;关键通路为脂质和动脉粥样硬化信号通路。结论 通过网络药理学揭示了淫羊藿通过多成分、多靶点、多通路治疗骨质疏松骨折的作用特点,为进一步的研究和实验工作提供了基础。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨巴戟天治疗类风湿性关节炎的作用机制

目的 采用网络药理学方法和分子对接技术，探讨巴戟天治疗类风湿性关节炎（rheumatoid arthritis,RA）的作用机制。方法 通过TCMSP、GeneCards、OMIM、TTD以及String数据库获得巴戟天活性成分、作用靶点以及RA相关疾病靶点，采用Cytoscape 3.7.1软件绘制“化学成分-靶点-RA”网络图，采用String和DAVID数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interaction,PPI）、基因本体（gene ontology,GO）功能及京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路富集分析，使用Chemdraw、PyMOL、AutoDock Tools软件以及RCSB PDB数据库对活性成分与关键靶点进行分子对接。结果 共筛选出11个巴戟天活性成分和37个关键靶点，GO功能和KEGG通路富集分析显示巴戟天可能通过信号转导、RNA聚合酶II启动子的转录起始、蛋白质结合、三磷酸腺苷（adenosine triphosphate,ATP）结合等生物...     

基于网络药理学研究赤芍治疗动脉粥样硬化的作用机制

目的:运用网络药理学的研究方法筛选赤芍治疗动脉粥样硬化的相关信号通路。方法:以赤芍为关键词对中药系统药理学数据库与分析平台进行检索,根据口服生物利用度及类药性筛选出赤芍的主要有效成分及作用靶点,在Gene-Cards和OMIM数据库找到与动脉粥样硬化相关的靶基因。将赤芍作用靶点与疾病靶基因取交集,构建赤芍-有效成分-动脉粥样硬化-靶基因调控网络,通过STRING数据库构建赤芍抗动脉粥样硬化靶基因的蛋白互作网络,最后进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果:共筛选出29个有效活性成分和123个有效作用靶点;将动脉粥样硬化靶基因与赤芍作用靶点取交集后共得到72个靶基因。KEGG通路分析有乙型病毒性肝炎、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、Toll样受体信号通路等。结论:赤芍的有效成分可通过多个靶基因参与多通路治疗动脉粥样硬化。     

基于网络药理学探寻淫羊藿治疗哮喘的关键靶标及作用机制

目的:基于网络药理学与分子对接方法,系统挖掘淫羊藿治疗哮喘的关键靶标及作用机制。方法:利用多种数据库寻找淫羊藿的活性成分与作用靶标,建立预测模型并利用分子对接技术对靶标进行筛选与验证;查找疾病数据库得到哮喘相关靶标;构建靶标互作网络筛选关键靶标;利用数据库进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析;构建生物网络并进行拓扑分析。结果:通过筛选得到白细胞介素(Interleukin,IL)-6、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)等10个关键靶标,富集的通路有IL-17信号通路、TNF信号通路、缺氧诱导因子(Hypoxia-inducible Factor,HIF)-1信号通路等66条,功能信息共得到446条,包括参与炎症反应、调控细胞增殖与细胞凋亡等。结论:淫羊藿中的活性成分靶标及作用通路在对抗炎症反应、逆转气道重塑方面均表现出显著富集,与治疗哮喘的作用机制相符合,在哮喘防治方面具有广阔的发展前景。     

真武汤治疗糖尿病肾病作用机制的网络药理学研究

目的：通过网络药理学方法探讨经方真武汤治疗糖尿病肾病(DKD)的核心作用靶标基因以及潜在通路机制，旨在指导临床用药同时为更深入的实验研究提供依据。方法：通过TCMSP数据库检索真武汤所含药物的有效成分、潜在作用靶点，在Genecards、OMIM、DisGeNET数据库筛选与糖尿病肾病有关的疾病靶点，借助Cytoscape3.7.2绘制并构建“药物-成分-靶点-疾病”可视化交互网络。利用STRING平台绘制关键靶点PPI网络，在David数据库里针对关键靶点蛋白开展GO基因功能、KEGG信号通路富集分析。结果：检索查筛出真武汤中有效活性成分59个、潜在靶点108个，其中涉及DKD的关键靶点47个，从蛋白互作网络中分析发现TNF、ATK1、JUN、RELA、IL6、MAPK8、CASP8、NOS2可能是真武汤治疗糖尿病肾病的核心靶点。GO富集分析得到180个条目，主要涉及细胞增殖、代谢、凋亡及脂肪细胞因子、葡萄糖稳态等。KEGG信号通路富集分析得到94条信号通路，主要涉及TNF信号通路、Toll样受体信号通路、HIF-1信号通路、FoxO信号通路等。结论：本研究初步验证真武汤治疗糖尿病肾病的作用机制涉及多成分、多靶点、多信号通路，给予真武汤的临床应用及更深层次对糖尿病肾病的研究以一定理论依据。     

海风藤治疗类风湿关节炎的网络药理学研究

目的通过网络药理学研究方法,探讨海风藤治疗类风湿关节炎的作用机制。方法使用中药系统药理学数据库与分析平台筛选海风藤的有效成分和靶点,并通过Swiss Target Predicition数据库做相应补充,通过DisGeNET数据库查找与类风湿关节炎相关的靶点。利用Cytoscape软件分析海风藤治疗类风湿关节炎的关键作用靶点,通过DAVID数据库分析海风藤治疗类风湿关节炎的具体机制。结果根据口服利用度和药物相似性原则筛选出海风藤有效成分21个,筛选出的有效成分作用靶点90个。在DisGeNET数据库中筛选出类风湿关节炎靶点1 832个。利用Cytoscape软件筛选出海风藤治疗RA的关键靶点与邻居靶点196个。通过DAVID数据库进行的富集分析产生了涉及炎症、免疫、破骨细胞分化等关键信号通路。结论海风藤通过多靶点、多通路治疗类风湿关节炎,作用机制包括直接参与破骨细胞分化,以及调节免疫、炎症反应等。     

基于网络药理学探讨黄芪治疗肌少——骨质疏松症的作用机制＊

目的 利用网络药理学研究黄芪治疗肌少-骨质疏松症的作用机制。方法 首先借助TCMSP分析平台、GeneCards数据库和OMIM数据库,分别筛选中药活性成分、中药靶标、肌少症疾病靶标和骨质疏松症疾病靶标,将肌少症疾病靶标和骨质疏松症疾病靶标取交集,得到肌少-骨质疏松症疾病靶标。将中药靶标与肌少-骨质疏松症疾病靶标取交集,得到中药-疾病靶标并构建中药-疾病-靶标调控网络。然后通过构建中药-疾病共同靶标的蛋白互作网络,筛选核心靶标基因。最后将中药-疾病共同靶标进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,得出中药-疾病共同靶标相关的信号通路。结果 筛选得到黄芪治疗肌少-骨质疏松症的20个活性成分和10个中药-疾病共同靶标,并推断其作用机制可能与催乳素信号通路、内分泌失调信号通路、雌激素信号通路、乳腺癌信号通路、类风湿性关节炎信号通路、Toll样受体信号通路、胰岛素抵抗信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等有关。结论 基于网络药理学探讨了黄芪治疗肌少-骨质疏松症的作用靶标及信号通路,为中药单体开发提供了理论依据。     

基于网络药理学-分子对接探讨益气养阴通络方抗类风湿关节炎的作用机制

[目的] 采用网络药理学与分子对接探究益气养阴通络方干预类风湿关节炎（RA）的作用机制。[方法] 通过中药系统药理学数据库及分析平台（TCMSP）、本草组鉴（HERB）和文献查阅获得复方活性成分与靶点,采用Genecards、在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）等数据库获得疾病靶点,然后采用数据库计算出益气养阴通络复方成分与疾病的交集靶点。对交集靶点施行功能和通路富集分析,选取益气养阴通络方核心药物靶点与关键化合物施行分子对接。[结果] 网络药理学共筛选出益气养阴通络方的 83种活性成分和779个潜在靶点,RA相关靶点5 393个,交集靶点465个,其中交集核心靶点9个（分别为SRC、STAT3、MAPK3、MAPK1、HSP90AA1、PIK3R1、GRB2、AKT1、PIK3CA）。富集得出PI3K-AKT、癌症相关及神经活性配体-受体相互作用等通路,其中PI3K-AKT信号通路可能是复方干预RA的关键通路之一。对接计算表明,益气养阴通络方的11种主要活性成分与关键靶点SRC、STAT3、PIK3R1、AKT1均有较稳定的结合,其中与AKT的结合可能最大。[结论] 益气养阴通络方通过多成分-靶点-通路的方式干预RA,PI3K-AKT、癌症相关及神经活性配体-受体相互作用通路均为可能的作用通路。     

基于网络药理学探讨桃红四物汤治疗糖尿病周围神经病变作用机制

目的:运用网络药理学方法探讨桃红四物汤治疗糖尿病周围神经病变的作用机制。方法:根据中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)筛选桃红四物汤药物活性成分和靶点。根据Gene Cards、OMIM数据库筛选糖尿病周围神经病变(DPN)靶点基因,构建韦恩图,得到桃红四物汤治疗DPN的作用靶点,应用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点-疾病网络。应用R软件进行基因本体(GO)功能注释和东京基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共筛选出桃红四物汤43种有效成分,212个作用靶点,4662个DPN相关靶点,桃红四物汤干预DPN主要涉及150个靶点基因。富集出生物过程155条、信号通路166条。结论:桃红四物汤可能通过调节AKT1、JUN、MAPK1等靶点,调控AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化、IL-17信号通路等多种途径治疗DPN。     

基于网络药理学和分子对接法探讨虎杖干预类风湿关节炎作用机制

目的探讨虎杖干预类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的分子作用机制。方法通过TCMSP筛选虎杖的有效活性成分并预测相关靶点,通过GeneCards数据库预测RA相关靶点,将虎杖药效靶点与RA相关靶点取交集,得到虎杖干预RA的共同靶点,使用Cytoscape 3.7.2构建药物-活性成分-靶点-疾病网络。将获得的共同靶点导入STRING数据库进行蛋白质相互作用分析,经R语言计算筛选出虎杖干预RA的核心靶点。运用DAVID在线数据库及R语言对共同靶点进行GO分子功能富集分析和KEGG通路富集分析。使用AutoDock Vina软件对活性成分和前5位核心靶点进行分子对接。结果筛选获得10个虎杖有效活性成分和对应的203个药效靶点,检索得到4424个RA相关靶基因,取交集后得到139个虎杖干预RA的共同靶点,蛋白相互作用网络分析提示,v-akt鼠科胸腺瘤病毒癌基因同源物Ⅰ(v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 1,AKT1)基因、肿瘤蛋白p53(tumor protein p53,TP53)基因、JUN、MAPK1、人v-rel禽网状内皮细胞过多症病毒癌基因同源物(AV-Rel Reticuloendotheliosis Viral Oncogene Homolog A,RELA)等为核心靶点。GO富集分析得到虎杖干预RA的分子功能共35个,包括ATP结合、锌离子结合、转录因子活性等。KEGG富集分析得到虎杖干预RA的相关信号通路共117条,包括PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、癌症通路等。分子对接显示,有效成分均与基因AKT1、TP53、JUN、MAPK1、RELA对接良好,其中大黄素甲醚双葡萄糖苷与JUN显示出较好的结合能力。结论基于网络药理学和分子对接法分析虎杖可多靶点、多通路干预RA,为其药品研发提供参考。     

六味调更汤治疗更年期Ⅱ型糖尿病的网络药理学机制研究

目的采用网络药理学的方法对六味调更汤治疗更年期Ⅱ型糖尿病的分子作用机制进行研究。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),收集六味调更汤的活性成分,搜寻潜在靶点,借助STRING平台构建蛋白互作网络(PPI),使用Cytoscape 3.6.0软件筛选出关键靶点。用DAVID平台对关键靶基因进行GO生物过程富集,分析靶点的KEGG信号通路及相关的疾病富集。利用NCBI平台查找疾病靶标,最后使用Cytoscape 3.6.0软件对成分靶标和疾病靶标进行网络拓扑学分析。结果研究得到齐敦果酸、beta-谷甾醇、檞皮素等206个主要活性成分,其中活性成分度值较高的为β-谷甾醇、山奈酚及槲皮素等39个关键靶标,其与733个更年期Ⅱ型糖尿病靶标交集后得23个交集靶标。通过基因功能富集平台DAVID分析信号通路,得到雌激素信号转导通路(Estrogen signaling pathway)、PI3K-Akt信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)等关键通路。结论六味调更汤中的活性成分主要通过CASP8、ESR1、Akt1等靶标作用于PI3K-Akt信号通路和雌激素信号转导通路达到对更年期Ⅱ型糖尿病的治疗作用。