基于高通量测序和化学轮廓分析研究黄连在连栀矾溶液发酵炮制中的作用

目的探究黄连Coptidis Rhizoma在连栀矾溶液传统发酵炮制中的作用。方法按照连栀矾溶液传统配方比例,将其拆分为3组配方溶液:连栀矾组(黄连+栀子+白矾)、黄连组(黄连+白矾)和栀子组(栀子+白矾),采用HPLC分析比较3组溶液发酵前后的化学成分变化轮廓,采用Illumina Hiseq高通量测序技术测定并比较发酵溶液中微生物的群落特征。结果传统配方连栀矾经发酵后环烯醚萜类成分发生了较显著的变化(P<0.05),生物碱类成分未发生明显变化,拆分后的黄连组中生物碱类成分和栀子组中环烯醚萜类成分均没有发生明显变化。分别对各组发酵溶液进行测序,根据α多样性分析结果,3组发酵液中真菌多样性为连栀矾组<栀子组<黄连组,真菌的丰富度为栀子组<连栀矾组<黄连组;细菌多样性为连栀矾组<黄连组<栀子组,细菌的丰富度为连栀矾组<栀子组<黄连组。根据β多样性分析结果,3组溶液中的真菌和细菌的群落结构均有明显差异。根据微生物相对丰度分析可知,3组的优势真菌均为子囊菌门、担子菌门和罗兹菌门,不同组间丰度无明显差异;真菌优势属中的孢霉属的丰度在连栀矾组最高,显著高于另外2组(P<0.05),栀子组又显著高于黄连组(P<0.05);韦斯特壳属的丰度在连栀矾组中最低,显著低于黄连组和栀子组(P<0.05),后两者间丰度无明显差异。3组的优势细菌均为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门和拟杆菌门,其中连栀矾组中变形菌门的丰度极显著低于黄连组和栀子组(P<0.01),厚壁菌门的丰度在连栀矾组中极显著高于黄连组和栀子组(P<0.01),放线菌门和拟杆菌门的丰度在3组发酵溶液的差异较小;细菌优势菌属中的乳杆菌属在连栀矾组中显著高于黄连组和栀子组(P<0.05),在黄连组中也显著高于栀子组(P<0.05),伯克氏菌属丰度在黄连组和栀子组中无显著差异,都显著高于连栀矾组中的丰度(P<0.05)。结论连栀矾溶液配方中的黄连能提高其中栀子的有效成分的发酵转化,并且是通过对发酵体系中的优势菌属的丰度进行调节而发挥作用的。进一步佐证了传统配方制剂的合理性和科学性。     

羊肚菌属群体遗传学和基因组进化的研究进展

羊肚菌Morchella esculenta是子囊菌亚门的一种大型药食两用真菌,具有重要的经济价值和药用价值。然而近年来全球气候变化,导致羊肚菌属物种的栖息地破碎和片段化,加上消费者对羊肚菌美食的喜爱,过渡采挖造成羊肚菌属野生资源急剧减少,因此,急需对羊肚菌属物种资源进行保护。遗传多样性的时空分布是保护生物学的重要内容,遗传多样性关系到一个物种或类群的进化潜力和未来命运。生物基因组和进化的研究能够辅助挖掘物种深层次的优异基因资源,有利于从本质上对物种进行科学保护。从羊肚菌属的遗传多样性、遗传结构和家系关系以及基因组进化等的研究进展进行综述,以期为羊肚菌属资源的科学保护提供重要依据。     

肝素辅助治疗小儿哮喘30例疗效观察

临床发现具有低抗凝作用活性的肝素及其衍生物在影响黏着力、活化和白细胞转运控制炎症等方面表现有一定程度的生物多样性。作者自2001年以来，用肝素辅助治疗小儿哮喘30例，现报告如下。     

基于ISSR标记的麻花艽遗传多样性分析

目的探讨秦艽基原植物之一麻花艽Gentiana straminea的遗传多样性,并构建DNA指纹谱。方法在其自然分布区广泛取样,共涉及西藏、青海、甘肃及四川等地28个居群83份样本,应用ISSR分子标记技术,POPGEN软件分析遗传信息参数,NTSYS软件构建亲缘关系UPGMA聚类图。结果从100条引物中筛出7条多态性好、条带清晰的引物用于ISSR分析。共检测到95个条带,其中多态性条带88个,多态性条带百分率(PPL)为92.63%;麻花艽居群间的期望杂合度(H_e)为0.288 2,多样性信息指数(I_m)为0.437 1,种群间基因分化系数(G_(st))为0.678 3,基因流(N_m)为0.237 1,遗传距离为0.074 3~0.490 0。UPGMA树将麻花艽居群主要分为2大支。结论麻花艽种群遗传多样性水平较高,居群间遗传多样性水平高于居群内;其遗传变异主要存在于居群间;遗传特性与地理分布具有一定相关性。该工作可为麻花艽品种鉴定、物种就地保护、探讨环境等因素对于遗传分化的影响及药材道地性研究提供基础资料。     

分子标记技术在獐牙菜属植物研究中的应用进展

獐牙菜属植物主产于中国,以其重要的药用价值而被研究者所青睐。分子标记技术近年来发展迅速,作为一种有效的现代手段被广泛用于药用植物的各个研究领域。首次系统综述了随机扩增多态性DNA(RAPD)、扩增片段长度多态性(AFLP)、简单重复序列区间(SSR)、ISSR和DNA条形码在獐牙菜属植物体细胞杂交、遗传多样性、种质资源鉴定和系统发育构建等方面研究的应用现状,以期为獐牙菜属植物及相关属植物的研究提供一定的参考。     

白芍种质资源的DNA分子标记研究

目的:采用DNA条形码技术和随机多态性(RAPD)分子标记技术对12个不同品种(系)的白芍种质资源进行遗传多样性研究。方法:采用CTAB法提取白芍叶片基因组DNA,利用ITS2引物和RAPD随机引物对样品进行PCR扩增,对于ITS2-PCR体系,测序后采用相似性搜索(BLAST法)进行鉴定分析;对于RAPD-PCR体系,根据条带数目,应用NTSYS2.10e软件采用UPGMA法进行聚类分析。结果:12个品种的ITS2序列的BLAST结果高度一致,未见碱基位点的变异。RAPD引物碱基序列共扩增出308条带,其中多态性条带有257条,多态百分率为83.4%,各品种(系)间的相似系数在0.558~0.847之间。结论:白芍的各品种间保存着丰富的遗传多样性。     

60Co-γ辐射对元胡品质及根际菌群的作用

[目的] 研究60Co-γ辐射对元胡品质的直接影响及对根际微生态的间接影响。 [方法] 利用高效液相色谱(high performance liquid chromatography,HPLC)法和高通量测序检测不同剂量射线辐射对元胡品质的影响和辐射后根际细菌群落结构和多样性的变化。[结果] 随着60Co-γ辐射剂量的增加,元胡的鲜重、干重、粒径及膨大率均明显增加,但其主要药效成分的含量并未显著提升。研究元胡根际土壤的菌群发现,与无辐射组比较,辐射组的生物多样性指数更高,表明辐射会改变元胡根际菌群多样性,其中80 Gy辐射组的细菌多样性最高。从菌群组成来看,各组在细菌的门以及优势属的分类水平上差异无统计学意义(P＞0.05),而一些含量低于4%的非优势菌变化明显,其数量随辐射剂量增加而增加,表明元胡经过射线辐射后,根部菌群可能会发生变化,在根部富集一些新的细菌,从而提高细菌多样性。 [结论] 60Co-γ照射会显著影响元胡的产量和大小,但对药效成分的改变不显著。辐射可能会通过提高根际土壤的非优势菌水平,甚至富集一些新的细菌来提高根际土壤细菌多样性。综合来看,60～80 Gy是元胡的最佳诱变剂量。     

Immunity to hepatitis C virus infection： Update 2007——Sequence diversity of hepatitis C virus： Implications for immune control and therapy

With approximately 3% of the world’s population (170 million people) infected with the hepatitis C virus (HCV), the WHO has declared HCV a global health problem. Upon acute infection about 50%-80% of subjects develop chronic hepatitis with viral persistence being at risk to develop liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma. One characteristic of HCV is its enormous sequence diversity, which represents a significant hurdle to the development of both effective vaccines as well as to novel therapeutic interventions. Due to a polymerase that lacks a proofreading function HCV presents with a high rate of evolution, which enables rapid adaptation to a new environment including an activated immune system upon acute infection. Similarly, novel drugs designed to specifically inhibit viral proteins will face the potential problem of rapid selection of drug resistance mutations. This review focuses on the sequence diversity of HCV, the driving forces of evolution and the impact on immune control and treatment response. An important feature of any therapeutic or prophylactic intervention will be an efficient attack of a structurally or functionally important region in the viral protein. The understanding of the driving forces, but also the limits of viral evolution, will be fundamental for the design of novel therapies.     

应用变性高效液相色谱法检测葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症的三种常见基因突变

葡萄糖-6-磷酸脱氢酶（G6PD）缺乏症呈X连锁不完全显性遗传。G6PD具有遗传多态性，其基因定位在染色体Xq28，现已鉴定的G6PD基因突变型有131种，在我国已报道的有20种，其中多为点突变，G6PD缺乏症呈全球性、多种族、多民族分布，其基因突变型具有民族和种族异质性，我国是一个多民族闰家，在G6PD基因上一定存在着多种类型的突变，研究这些突变型对我国群体遗传学、人类学、民族渊源和变迁至关重要，也可填补我国“人类基因组多样性计划”G6PD座位的空白。变性高效液相色谱法（DHPLC）是近年发展起来的检测突变的新技术，我们初步探索了DHPLC在中国人G6PD基因突变检测中的应用。