多重RT-PCR结合反向杂交技术检测多种流感病毒方法的研究

目的 建立一种基于多重RT-PCR结合反向斑点杂交技术的多种流感病毒核酸快速检测方法.方法 对5种亚型流感病毒的HA基因序列进行比对分析,选择合适的保守区域设计引物序列,并在扩增产物序列内部选择高变区设计探针序列.首先,使用生物素标记的引物扩增出同样带标记的PCR产物;然后,产物与膜上的探针杂交,通过生物素-亲和素反应,最后以斑点显色的方式来检测和鉴别不同亚型的流感病毒.实验中还通过摸索不同的引物浓度和探针浓度来优化反应条件.结果 成功建立了一种基于多重RT-PCR结合反向斑点杂交技术的检测方法,该方法能够成功检测和鉴别5种不同亚型的流感病毒,检测灵敏度比传统的RT-PCR方法高100～1000倍.结论 成功建立了一种可高通量快速检测多种流感病毒的多重RT-PCR结合反向斑点杂交技术的检测方法.     

2004-2005年中国B型流感病毒抗原性及基因特性研究

目的 阐明2004-2005年中国流行的B型流感病毒血凝素抗原性及其基因变异情况.方法 对2004-2005年分离的B型毒株先进行单向血凝抑制试验;在此基础上选取不同时间、地点的B型流感毒株进行血凝素基因HA1区核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,然后进行基因进化特性分析.结果 2004-2005年我国人群中同时流行着B型Yamagata系和Victoria系毒株.Yamagata系毒株与B/Shanghai/361/02比较,2004年有3.7%病毒单向血凝抑制效价有4倍以上差异,2005年有4.5%病毒单向血凝抑制效价有4倍以上差异,并且在血凝素基因HA1区发生9个氨基酸替换,在196为增加一个糖基化位点.Victoria系毒株与B/Hong kong/330/01比较,2004年有8.5%病毒单向血凝抑制效价有4倍以上差异,2005年有20.6%病毒单向血凝抑制效价有4倍以上差异,并且在HA1区发生9个氨基酸替换,在197位增加一个糖基化位点.结论 2004-2005年我国人群中流行的B型流感病毒的抗原性与B/Shanghai/361/02、B/Hong kong/330/01相比抗原性已经发生了变化.     

轮状病毒组特异性抗原VP6在重组腺病毒中的表达及其免疫学效果的研究

目的 构建可表达A组轮状病毒组特异性抗原VP6的非复制型重组腺病毒载体，并对其生物学和免疫学性质进行研究。方法 将人轮状病毒VP6基因插入腺病毒载体pShuttle-CMV中，通过细胞内同源重组方法获得重组腺病毒DNA，将其转染293细胞获得重组腺病毒。用聚合酶链反应（PCR）及Southern blot方法，检测目的基因在重组腺病毒中的整合，用Western blot检测VP6的表达。通过灌胃和滴鼻两种途径对小鼠进行免疫，并对免疫后小鼠体液和粘膜免疫进行分析。结果 得到了重组腺病毒rvAd-VP6,VP6基因整合于腺病毒基因且中，在293细胞中可稳定表达。2次免疫后灌胃和滴鼻两组小鼠均产生明显免疫应答，血清IgG抗体滴度分别为1：1000和1：10000－1：100000。除了血清IgG外，小鼠还产生了较强的针对轮状病毒的血清IgA，滴度为1：10－1：100。滴鼻组在肺灌洗液和肠匀浆液中均可检测到分泌型IgA(sIgA)，灌胃组仅在肠道检测到sIgA。滴鼻组的免疫学效果明显优于灌胃组。结论 人轮状病毒VP6基因重组腺病毒载体的成功构建及所取得的良好免疫学效果，为我国具有自主知识产权的新型轮状病毒基因工程疫苗的研制奠定了基础。     

在我国流行的脊髓灰质炎中发现脊灰病毒Ⅰ型自然重组株

消灭脊灰是预防医学的重要课题,1991年时我国仍是世界上脊灰流行区之一,其主要病原为Ⅰ型脊髓灰质炎病毒(PV1),为弄清PV在我国的流行情况,我们组织全国主要省区防疫站协作自选进行“我国PV1野毒株的分子流行病学研究”课题。地方同志负责脊灰病人粪便样品的采集、病毒的分离和部分病毒血清型检定,本实验室负责从各地的PV分离株中用RT—PCR和打点杂交方法区别疫苗相关株或野毒株,选PV1     

猪型(H1N1)流感病毒血凝素和神经氨酸酶基因来源的研究

目的 研究2002年我国内地从猪群中分离的猪型(H1N1)毒株HA和NA基因来源。及其使猪致病的原因。方法 用PCR扩增目的基因，用P^GEM-T Easy Vector，4℃过夜连接，重组质粒转入DH-10B细菌，筛选阳性菌落，酶切鉴定，送六合通公司自动测序，并作进化树分析。结果 3株猪型(H1N1)病毒的HA和NA基因属猪型(H1N1)流感病毒，而不同于其他禽或人的H1N1亚型流感病毒。2002年猪型毒株由1991年猪型毒株演变而来。近来我国内地猪群中猪型毒株活动增强，其对猪能致病是由于病毒粒HA和NA蛋白抗原性发生变异所造成。结论 3株猪型病毒的HA和NA基因来源于猪型(H1N1)毒株。近来猪型毒株对猪具有致病性和活动增强是由于其HA和NA蛋白分子上氨基酸序列发生替换所造成。     

两株京科猪H1N1亚型流感病毒内部基因来源的研究

目的通过内部基因研究了解两株猪(H1N1)亚型流感病毒内部基因是否含有禽流感病毒基因节段及是否与猪群中H9N2亚型毒株发生了基因重配。方法病毒在鸡胚中传代,从收获的尿囊液中提取RNA,通过逆转录合成cDNA,cDNA用PCR扩增。PCR产物用纯化试剂盒纯化,接着进行核苷酸序列测定,然后用MegAlign(Version1.03)和Editseq(Version3.69)软件进行基因进化树分析。结果两株京科猪H1N1病毒内部基因除PB2基因节段有所不同外,其余5个基因节段均相同,但与猪H1N1流感病毒内部基因相近,然而,与古典型猪H1N1毒株有差异。结论两株京科猪H1N1病毒不是基因重配株,它们的内部基因均属猪H1N1流感病毒基因系。     

7型腺病毒疫苗株载体的构建及β—半乳糖苷酶基因 …

目的 构建Ｅ３区缺失的７型腺病毒疫苗株（Ａｄ７ｖ）载体并表达β－半乳糖苷酶基因。方法 从人二倍体细胞的Ｗ１３８培养的Ａｄ７ｖ中分离病毒ＤＮＡ，利用Ａｄ７ｖＤＮＡ天然的酶切位点，经过多步亚克隆，克隆的同时将Ｅ３区７８．８－８７ｍｕ片段缺失，并将多克隆酶切位点带入Ａｄ７ｖ载体。为了验证载体的功能，将带有巨细胞病毒（ＣＭＶ）早期启动子β－半乳糖苷酶基因插入缺失的Ｅ３区。将这一重组质粒和ＥｃｏＲＩ酶切Ａｄ     

用于荧光定量检测流感病毒RNA质控品的制备及质控图的绘制

目的 应用自制流感病毒RNA室内质控品,绘制Levey-Jennings质量控制图.方法 选取近期的流感病毒流行代表株,提取RNA后10倍系列稀释（10-1 ～ 10-8）,取不同稀释度的RNA做RT-PCR荧光定量检测,每个稀释度平行做三孔,根据检测的平均Ct值选取高Ct值和低Ct值对应稀释度的RNA,连续检测20次,计算均值（x）和标准差（s）,应用Excel软件绘制Levey-Jennings质控图.结果 用Excel绘制出三种亚型流感病毒的Levey-Jennings质控图,三种亚型RNA质控品均在警戒线内.结论 三种亚型RNA质控品稳定性较好,制备简单,质控图绘制方便,适用于PCR检测实验室对流感病毒的室内质控.     

中国轮状病毒非结构蛋白NSP4基因变异特征的分析

目的　研究我国轮状病毒流行株NSP4基因的变异特点。方法　对近年来从我国不同地区获得的 2 7份人轮状病毒流行株的NSP4基因用RT PCR进行扩增 ,克隆后进行全长cDNA序列分析 ,并利用Clustal× 1.8,TreeView3 2及DNAStar软件与参比株Wa、KUN、AU 1、EW及来自GenBank的OSU、SA11、Hochi、US2 44、Bristol株的NSP4序列进行分析比较。采用PCR分型方法对VP7血清型进行鉴定 ,确定轮状病毒G型与NSP4基因型的关系。结果　氨基酸同源性比较表明 ,我国轮状病毒不同流行株NSP4之间同源性为 81.7%～ 99.4% ,据此可将 2 7株RVNSP4分为 2组 ,分别以Wa株和KUN株为代表 ,其中以Wa组为主。组内同源性分别为 92 .0 %～ 99.4%和 92 .0 %～ 98.9% ,组内变异率分别为 0～ 8 5 %及 1 2 %～ 8 5 %。两组间变异率达 16 6%～ 2 1 0 %。氨基酸进化树提示在Wa组内包括 3个亚组。轮状病毒G血清型与NSP4基因型之间的联系不确定。结论　我国流行株NSP4基因主要可分为Wa组和KUN组 ,在Wa组内可形成三个亚组 ,并且在高变区有特征性的氨基酸位点。NSP4的变异与年份有关而与地域关系不密切     

PCR方法在肠传病毒检测中的应用

多聚酶链反应(PCR)扩增DNA技术是科学发展的重大突破。近年来在国内外都有越来越广泛的应用。本研究在国家自然科学基金资助下,对我国一些重要肠传病毒,如轮状病毒、脊灰病毒、甲肝病毒、诺瓦克病毒,分别建立了套式PCR方法区分轮状病毒的G型和P型;RT-PCR方法鉴别脊灰病毒为疫苗株或野毒株;抗体捕捉PCR方法检测临床和环境样品中的甲肝病毒;RT-PCR方法结合扩增产物测序分析首次在我国发现有诺瓦克样病毒感染等。