分子流行病学进展——机遇和挑战

分子流行病学是流行病学的分支,是流行病学和分子生物学的交叉学科。分子流行病学主要通过对生物标志的研究,在分子水平阐明疾病的分布、发生、发展规律及其影响因素。随着人类基因组学、精准医学、大数据等领域的快速发展,给分子流行病学提供了新的发展机遇和挑战。     

中国幽门螺杆菌cagA基因敲除突变株生物学特性分析

细胞毒素相关基因A蛋白（cytotoxin-associatedgeneA，CagA）是幽门螺杆菌（Hp）最重要的毒力因子之一。流行病学研究认为，CagA阳性肋感染与消化性溃疡和胃癌发生的关系比CagA阴性菌株更为密切，提示CagA可能是一种重要的疾病相关蛋白，在坳致病过程中发挥作用。由于却菌株自身的变异，CagA阳性株与CagA阴性株间除CagA基因外存在许多差异之处，因此，在自然状态下很难对CagA基因功能做出真实判断。     

幽门螺杆菌的分子分型及其分子流行病学研究

目的：在基因分型基础上探讨不同基因型别的幽门螺杆菌（Hp）与疾病之间的关系。方法：采用随机扩增的多态性DNA(RAPD)和PCR-RFLP法对50株来自不同病人的Hp进行分析，在此基础上运用聚类分析进行基因分型，并用病例对照研究探讨不同基因型别的Hp与疾病之间的关系。结果：RAPD结果显示，不同基因型别的Hp与不同的疾病结局有关。PCR-RFLP结果显示，单个基因的分析结果均未能说明不同基因型别的Hp与不同的疾病结局有关，而多个基因的综合分析结果则说明不同基因型别的Hp确实与不同的疾病结局有关。将RAPD和PCR-RFLP的分析结果进行综合分析，也从多方法水平说明不同基因型别的Hp确实与不同的疾病结局有关。结论：对于Hp来说，多基因性状数值分类法的分型效率高于单基因数值分类法，这为建立Hp的多基因、多方法的数值分类系统打下了基础。     

幽门螺杆菌疫苗保护性抗原研究现状及展望

幽门螺杆菌 (Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒｐｙｌｏｒｉ,简称Ｈｐｙｌｏｒｉ)是目前发现的唯一能在人胃内定植、生存的细菌。Ｈｐｙｌｏｒｉ感染在世界范围内广泛流行 ,尤其在发展中国家 ,成年人Ｈｐｙｌｏｒｉ感染率高达 80～ 90 %。已证实Ｈｐｙｌｏｒｉ感染是慢性胃炎和消化性溃疡的重要病因[1- 4] ,与胃癌和胃ＭＡＬＴ淋巴瘤的发病也有密切关系[5,6 ] 。目前 ,主要应用抗生素和质子泵抑制剂来治疗Ｈｐｙｌｏｒｉ,但广泛应用抗生素会导致耐药菌的不断增多[7,8] ,且价格昂贵 ,复发的机会也较大 ,不易被病人接受。因此 ,要在世界范围内完全根…     

志贺菌耐多药相关基因水平转移研究

目的 验证志贺菌耐多药相关基因水平转移及对该基因的位置进行初步判定.方法 培养已筛选出的包含耐多药差异基因片段阳性克隆,提取其质粒,PCR扩增其耐多药差异基因片段、纯化、制备探针,与志贺菌敏感株Z23、耐多药大肠埃希菌E.667、转移株的基因组DNA、质粒进行斑点杂交.结果 该耐多药差异基因片段制备的探针与耐多药大肠埃希菌、敏感株、转移株的基因组DNA、质粒进行杂交后,转移株、耐多药大肠埃希菌的全基因组及质粒均有杂交信号,与Z23的全基因组、质粒均没有杂交信号.结论 此耐多药相关基因片段在液体结合实验中由耐多药大肠埃希菌水平转移给志贺菌敏感株,根据斑点杂交结果可判断其存在于耐多药大肠埃希菌和转移株的质粒中.     

志贺菌耐多药外排泵emrE基因作用分析

目的 对临床耐多药志贺菌株H24的1种小多重耐药性家族(SMR)外排泵emrE基因进行定向分子进化,研究基因突变增强emrE外排泵耐药性的潜力,调查志贺菌外排泵基因emrE基因垂直进化对临床耐药发展的影响.方法 通过用体外易错PCR(EP-PCR)方法对emrE基因进行随机突变实验,用微量稀释生长曲线法进行菌株的耐药性筛选,用荧光实时定量RT-PCR测定基因表达情况,应用DNA分析软件DNAStar进行生物信息学分析.结果 在31个突变子中筛选到了突变子ep2-emrE(DH5α),它的emrE基因有6个氨基酸突变,分别为Thr-28→Ala,Cys-39→Ser,Tyr-40→终止子,Ser-72→Arg,Leu-93→Phe,lie-101→Phe.它不但增强四环素和红霉素的耐药能力,还产生新的氯霉素耐药能力.结论 尽管emrE基因较易获得新增耐药性,但在志贺菌对四环素、红霉素等抗生素耐药性发展中,emrE基因的进化突变没有被筛选,表明有其他能力更强的耐药基因在突变进化中起作用.     

IL-1B基因多态性及幽门螺旋杆菌感染与胃癌的关系研究

目的:探讨IL-1B基因多态性与胃癌易感性的关系。方法:以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析法检测65例胃癌患者和130例非胃癌患者的IL-1B基因位点多态性。结果:IL-1B-31及IL-1B-511均有3种基因型,分别是C/C、C/T和T/T;病例组Hp阳性感染率(70.8%)高于对照组(55.4%),差异有统计学意义(字2=5.6,P0.05)。Hp感染时,IL-1B-511和IL-1B-31的T/T均能增加胃癌发病的风险,OR分别为8.1(95%CI:2.4-10.1)和11.5(95%CI:1.9-13.1)。结论:IL-lB-31和-511 TT基因多态性与河南地区胃癌的发生有关。     

埃博拉病毒病流行病学特征

埃博拉病毒病(EVD)是由埃博拉病毒引起的一种人畜共患烈性传染病。2014年初至9月,EVD已在非洲6个国家流行,且在美国本土已确诊首例EVD病例。爆炸性的疾病过程、高病死率、无特异治疗方法和特效疫苗使EVD已成为非洲地区乃至全球重要的公共卫生问题。自1976年埃博拉病毒首次被发现以来,在其分子生物及发病机制等方面已取得巨大进展,但仍有许多问题亟待解决。本文从流行病学角度对EVD的流行特征作一综述,以期为EVD疫情的预防和控制提供科学依据。     

埃博拉病毒及其致病性

埃博拉病毒病是一种人畜共患烈性传染病。2014年初至9月,埃博拉病毒病已在非洲6个国家流行。埃博拉病毒是埃博拉病毒病的病原体,人群对该病毒无免疫力,普遍易感,且该病毒致死率高、无特异治疗方法和特效疫苗。对埃博拉病毒的深入了解和研究,将对今后防治埃博拉病毒病提供科学依据,本文就埃博拉病毒及其致病性作一综述。     

志贺菌中成簇规律间隔短回文重复序列的分子分布特征

目的 探索志贺菌中成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)的分布。方法 共选择志贺菌分离株52株, 其中河南41株, 江西6株, 北京5株。利用PCR扩增志贺菌的4个CRISPR位点(S1、S2、S3、S4), 产物送测序, 分析CRISPR的重复序列和间隔序列。结果 志贺菌的4个CRISPR位点阳性率分别为33. 69%(S1)、50.00%(S2)、82.69%(S3)和73.08%(S4);S1和S3包括2种亚型, S2有3种亚型, S4包括4种亚型。2004年前分离的河南分离株中检出S1位点, 2004年后分离的菌株中均未检出该位点;S2、S3和S4在两组的分布没有差异。结论 志贺菌各CRISPR位点含有不同亚型, 河南分离株S1的分布与细菌分离时间有关, 而S2、S3 及S4和分离时间无关。