应用SELDI-TOF-MS技术分析SEB染毒小鼠血清蛋白质组学变化

目的:把蛋白质芯片和SELDI质谱技术应用于金黄色葡萄球菌肠毒素B(staphylococcal enterotoxin B,SEB)染毒小鼠血清蛋白质组研究,分析染毒小鼠血清蛋白质组的变化．方法:采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术和弱阳离子交换蛋白质芯片检测染毒小鼠血清蛋白质的变化,使用PBSⅡ-C 型蛋白质芯片阅读机读取数据,获得的结果采用Ciphergen公司的Biomarker wizard和 Biomarker Patterns System软件进行分析．结果:实验组与对照组血清蛋白质谱相比有 11个蛋白质有显著差异,其中8个蛋白质表达上调,3个表达下调．结论:SEB染毒小鼠血清蛋白质组发生显著变化,可能与SEB的毒理学与病理学作用有密切关系．     

食管癌淋巴结转移的蛋白质组学

目的:对河南省林州地区食管癌高发区食管鳞癌患者(食管癌组)和健康人血清(对照组)蛋白质组进行比较研究,确立食管癌的蛋白质指纹诊断模型,并筛选与食管癌淋巴结转移相关的蛋白质.方法:采用IMAC3芯片及表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)检测61例食管癌患者和50例健康人血清,用Bio-Marker Wizard软件对芯片检测得到的蛋白质相对含量进行处理及方差分析.并对25例发生淋巴结转移的食管癌患者(转移组),36例无淋巴结转移患者(未转移组)与对照组进行了对比分析.结果:以相对分子质量(Mr)为9 439.58、6 627.21、2 867.65、4 494.08、7 762.68、6 835.32、4 095.94 7种蛋白质组建立的决策树模型,对食管癌测试的准确率、敏感度和特异度分别为85.6%、88.5%和82.0%.转移组、未转移组与对照组3组相比,有15种蛋白差异有统计学意义.其中转移组和未转移组相比有2种蛋白差异有统计学意义(Mr分别为11 742.48、9 294.44).结论:以上述7种蛋白质建立的诊断模型用于食管癌的诊断,具有较高灵敏度和特异度;筛选出2种与食管癌转移密切相关蛋白质,后者为进一步建立食管癌转移相关肿瘤标志物提供了重要线索.     

血清蛋白质谱模型对肝癌诊断的应用

目的应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)从肝癌患者血清中筛选标志蛋白,找出最佳的标志蛋白组合模式作为临床诊断指标。方法蛋白组学图谱通过表面增强激光解吸电离飞行时间质谱产生。对20例肝癌患者和60例健康志愿者、20例肝硬化的血清蛋白质谱进行反复分析寻找合理运算规则以确定能区分肝癌和健康志愿者与肝硬化患者的蛋白组学图谱。结果发现肝癌患者和肝硬化患者、健康对照组血清蛋白质指纹图谱之间有5个标志蛋白在肝癌患者血清中高表达,1个标志蛋白在肝癌患者血清中低表达。分析系统筛选出4477Da、8943Da、13761Da、4097Da标志蛋白建立起一个肝癌的诊断模型。结论SELDI-TOF-MS技术的特异性及敏感度远远高于目前所采用的某一单独的标志物的血清学诊断,其结果对进一步研究肝癌的蛋白质组学改变及其临床应用可能具有重要意义。     

卵巢癌患者血清蛋白指纹图谱检测及其临床意义

目的 运用SELDI-TOF-MS技术（表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术）检测卵巢癌患者、良性卵巢囊肿和正常健康妇女的血清蛋白质指纹图谱，初步探讨筛选出的肿瘤标志物建立的诊断模型在卵巢癌诊断中的临床意义。方法 用SELDI-TOF-MS技术及WCX2芯片检测55例卵巢癌患者和60例对照纽的血清蛋白指纹图谱，并运用SPSS10.0软件判别分析处理数据和筛选标志物，以建立诊断模型。结果 6个蛋白质峰（11500、11650、11800、15800、16000、16250m／z）组合构建的诊断模型1鉴别卵巢癌和对照组的敏感性为94、5％（52／55），特异性为93．3％（56160）。6个蛋白质峰（11590、11700、12000、14800、15500、15900m／z）组合构建的诊断模型Ⅱ鉴别Ⅰ期卵巢癌和对照组的敏感性为82．45％（14／17），特异性为90．0％（54／60）。5个蛋白质峰（11600、11750、16100、16150、16200m／z）组合构建的诊断模型Ⅲ鉴别Ⅰ期卵巢癌患者和Ⅱ～Ⅳ期卵巢癌患者的敏感性为92．1％（35／38），特异性为94．1％（16／17）。结论 SELDI-TOF-MS技术是一种快速、准确、高通量、高灵敏度的蛋白质分析方法，能够直接检测出卵巢癌患者血清中相对特异的肿瘤标志物，其对于卵巢癌的早期诊断具有一定的临床意义。     

构建腰椎间盘突出症血瘀证的血清蛋白指纹图谱模型

背景：腰椎间盘突出症血瘀证与非血瘀证的相互关系尚不明确。〈br〉 目的：构建腰椎间盘突出症血瘀证的血清蛋白指纹图谱模型。〈br〉 方法：按照病例对照研究方法,遵循组间民族、性别及年龄等相匹配原则筛选180例研究对象,其中120例分为腰椎间盘突出症血瘀证组及腰椎间盘突出症非血瘀证组,每组60例;健康对照组60例。抽取受试者外周血的血清样本,应用表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱及蛋白质芯片技术检测并绘制蛋白质质谱图,随后用Biomarker Wizard软件识别蛋白峰信息,建立腰椎间盘突出症血瘀证的血清诊断模型,并通过双盲验证法对模型进行验证及通过ExPASy数据库对相关差异蛋白进行蛋白检索。结果与结论：在腰椎间盘突出症血瘀证、腰椎间盘突出症非血瘀证及健康者各组之间找到11个蛋白质峰有统计学意义（P＜0.05）,其中2个蛋白质呈高表达、9个蛋白质呈低表达;用Biomarker Patterns Software构建腰椎间盘突出症血瘀证血清学诊断模型并验证,其敏感性为86.667%,特异性为94.167%,阳性预测值为88.136%。表明腰椎间盘突出症血瘀证患者的血清中存在多种异常表达的蛋白质;由11个差异蛋白组成的血清蛋白质指纹图谱模型可作为腰椎间盘突出症血瘀证的血清标志物诊断模型。     

飞行时间质谱技术在乳腺癌诊断中的应用

 目的 采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术检测乳腺癌患者血清蛋白质指纹图谱，分析健康人与乳腺癌患者以及乳腺癌患者手术前后特异性标志蛋白变化，探讨血清蛋白质指纹图谱在乳腺癌疗效评价及复发监测中的临床意义。方法 用SELDI-TOF-MS技术检测30例乳腺癌患者（术前和术后第7天）及20名健康人的血清蛋白质指纹图谱，筛选乳腺癌特异性蛋白标志物，结合支持向量机软件建立诊断模型。比较乳腺癌手术前后特异性蛋白的变化。结果 与健康人血清蛋白质谱相比，术前乳腺癌血清中有3个差异蛋白，质荷比为2043、3938的标志分子低表达，质荷比为 5639的标志分子高表达。术后质荷比为2043、3938的标志分子稳定上调，质荷比为 5639的标志分子稳定下调，差异具有统计学意义。以筛选3个特异性蛋白质峰的数据构建的诊断模型经交叉验证，灵敏性和特异性均为100 %。结论 SELDI-TOF-MS检测血清蛋白质组学图谱在乳腺癌的早期诊断、术后病情转归及监测复发等方面具有一定的临床指导意义     

飞行质谱技术筛选有家族史食管癌患者的血清标志蛋白

目的探讨有家族史食管癌患者血清蛋白的表达差异及其与食管癌遗传易患性之间的关系。方法应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术结合铜离子蛋白芯片获得20例有家族史和26例无家族史食管癌患者的血清蛋白质谱。将获得的蛋白质谱采用Ciphergen公司的Biomarker Wizard和Biomarker Pattern软件分析。结果共找到10个表达差异蛋白,且此10个蛋白的含量在家族史阳性组均显著上调。其中,以质荷比为5344.77和7571.19建立的分类树模型能有效区别家族史阳性者和阴性者。在学习模式下分组正确率达到100%,在测试模式下分组正确率分别为100%(20/20)和96.2%(25/26)。结论质荷比为5344.77和7571.19的两个蛋白可能是影响食管癌遗传易患性的重要血清相关蛋白。     

SELDI-TOF-MS技术在检测乳腺癌肿瘤标志物中的应用

蛋白质组学是21世纪生命科学研究领域的热点。基于蛋白芯片技术与质谱技术结合发展而成的表面增强激光解析电离飞行时间质谱SELDI），已经成为当前临床研究筛选肿瘤标志物的主要技术平台之一。文章就SELDI系统的基本原理以及在乳腺癌肿瘤标志物筛选方面的应用做一综述。     

应用SELDI-TOF-MS技术分析慢性乙肝患者血清差异表达蛋白

【目的】应用表面加强激光解析离子化飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption-ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术分析慢性乙肝患者血清差异表达蛋白。【方法】选择临床明确诊断的慢性乙肝患者和正常健康体检者各12名,利用弱阳离子芯片CM10经质谱分析血清中差异表达蛋白。【结果】样品血清中共获得与芯片结合的67个有效蛋白质峰。其中相对分子质量4107、4980、5650、5923道尔顿的4个蛋白峰有差异,相对分子质量为4980道尔顿的蛋白峰在慢性乙肝组高表达。经检索,发现相对分子质量为4980道尔顿的蛋白与细胞色素B相对分子质量相符。【结论】利用SELDI-TOF-MS技术寻找慢性乙肝患者无创性血清学指标是一种可行的方法,细胞色素B可能在慢性乙肝形成中起一定作用。     

应用SELDI-TOF-MS技术筛选肺腺癌患者血清诊断标志物

目的 探讨肺腺癌患者及正常人血清中蛋白质质谱的不同,筛选出肺腺癌血清诊断标志物.方法 用WCX2蛋白芯片结合表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,检测24例肺腺癌和10例正常人血清蛋白质谱,筛选出差异表达蛋白质.结果 本实验共检测到86个有效的蛋白质波峰,其中m/z位于分子质量2000～10 000的波峰有78个.筛选出m/z分子质量为8129.55,2022.18,3271.91,3933.44,3504.49,3811.71的6个血清肿瘤标志物.结论 SELDI-TOF-MS技术是寻找肺腺癌血清诊断标志物的有效工具.利用蛋白组学和生物信息学及相关技术,将有利于建立新的疾病诊断模式--蛋白质指纹图谱.