长链非编码RNA与肺癌

长链非编码RNA(1ong noncoding RNA,lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸的非编码RNA分子,其数量众多,但缺少蛋白质编码功能。研究发现,lncRNA能在表观遗传学、转录及转录后等多种水平调控基因表达,在各类生物过程中起重要的调节作用,并与多种肿瘤等疾病相关,已经成为现代遗传学的研究热点。近期研究证据显示,肺癌中有多种lncRNA的表达水平发生了变化,并在肺癌的发生、发展及预后中起着重要的调控作用,本文就lncRNA的定义、分类、功能机制及与肺癌的相关性研究作一综述。     

长链非编码RNA与肿瘤关系研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)是长度在200~10 000 nt之间的不编码蛋白质的RNA分子,具有保守性低、组织特异性表达的特点。它参与细胞内多种过程的调控,对于哺乳动物的基因组和转录组以及转录和转录后基因表达的调控有着重要的影响。许多研究表明,lncRNA在许多不同类型的肿瘤中表达异常,探讨lncRNA与肿瘤发生发展的关系,可以使lncRNA成为肿瘤诊断的新的生物标志物和肿瘤治疗的潜在靶点。本文主要对lncRNA与食管癌关系的研究进行综述。     

长链非编码RNA的研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200 nt(核苷酸单位)的功能性RNA分子,可在表观遗传水平、转录水平和转录后水平调控基因的表达,广泛参与机体的生理和病理过程。目前发现的参与哺乳动物基因活动的lncRNA已有上千个,但有关lncRNA的功能机制及其与疾病的关系尚不完全明了。本文就lncRNA的功能研究进展及lncRNA在临床疾病发生发展中的作用作一综述。     

长链非编码RNA研究现状与趋势的文献计量分析

分析了Web of Science 2003-2012年收录的长链非编码RNA( long non-coding RNA或long noncoding RNA,lncRNA)文献的发表时间、期刊分布、国家/地区分布、机构分布和学科分布,探讨了lncRNA文献的分布规律,评价了其研究阶段并预测了其未来发展,为我国lncRNA的相关研究提供参考.     

长链非编码RNA对创面愈合调控作用的研究进展

非编码RNA (non-coding RNA,ncRNA)是不被翻译为蛋白质,但具有功能的一类RNA分子,其在哺乳动物基因组中占额达98%,参与并调控细胞增殖、分化和凋亡等生物过程[1-4].长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类长度大于200 nt的非编码RNA分子,定位于细胞核或细胞质内,从表观遗传、转录水平和转录后水平等多种层面调控基因表达.目前,人体中已发现大约9 000多种,小鼠体内发现6 000多种,约占ncRNA的80%[5-6].根据lncRNA在基因组上相对于编码基因的位置,将lncRNA分为5类:正义(sense)lncRNA、反义(antisense)lncRNA、双向(bidirectional)lncRNA、内含子(intronic)lncRNA和基因间(intergenic)lncRNA,其功能由所处位置决定.     

基于长链非编码RNA数据构建肺腺癌预后风险评估模型

目的 肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)预后相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)标志物的筛选及预后风险模型的构建.方法 下载癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中LUAD患者的lncRNA表达数据和相关临床数据,随后将肿瘤样本和正常样本的lncRNA表达数据进行差异分析,并将差异lncRNA与临床信息合并,进行单因素和多因素Cox回归分析,筛选出与LUAD预后相关的lncRNA,构建预后风险模型.并运用Kaplan-Meier生存分析和受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估模型的预后价值.结果 肿瘤样本与正常样本相比,差异表达的lncRNA有727个,其中277个上调,450个下调.单因素和多因素Cox回归分析,筛选出的8个lncRNA作为预测LUAD预后的生物标志物,以上特征的预后价值良好且与其他临床因素无关.结论 筛选出的8个lncRNA可以作为预测LUAD患者生存的独立预后生物标志物.     

长链非编码RNA在心脏疾病中的研究进展

大规模的哺乳动物转录分析确定了一类相当数量的不编码蛋白质的RNA分子,称为非编码RNA。长链非编码RNA(lncRNA)是一种核苷酸长度>200 nt的功能性RNA分子,没有蛋白质编码能力。lncRNA参与调控机体的生长发育、细胞凋亡、增殖、分化等,广泛地参与机体的生理与病理过程,与多种疾病密切相关。目前lncRNA的数量、功能和作用机制尚不清楚。最近的研究揭示,lncRNA在心脏发育和心脏疾病中起着潜在作用。     

长链非编码RNA在缺血性脑卒中的研究进展

目前,缺血性脑卒中已成为威胁我国公众健康的主要疾病。近年来,研究发现长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在缺血性脑卒中的发生、发展进程中起着重要的作用。探究lncRNA在缺血性脑卒中发病过程中的作用机制,将为缺血性脑卒中诊疗手段的突破提供新的方向。本文通过对lncRNA在缺血性脑卒中中的作用及调控机制进行总结,为今后进一步研究缺血性脑卒中的病因及发病机制提供参考。     

长链非编码RNA在胃癌发生发展中的作用

通过回顾近年来与胃癌相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)研究进展,进一步了解其在胃癌发生、发展调控过程中的作用,对认识lncRNA在胃癌的生物学行为、胃癌诊断及预后中的价值具有重要的意义.lncRNA有希望成为胃癌重要的生物标记物以及诊断和治疗方面的新靶点.     

长链非编码RNA在肝脏疾病中的研究进展

长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸的非编码RNA分子,无蛋白质编码功能,以RNA形式在表观遗传学、转录及转录后等多种水平调控基因表达,在病理生理过程中起着重要的调节作用。近期研究证据显示,原发性肝癌等肝脏疾病中有多种lncRNA表达水平发生了变化,并在肝癌发生、发展及预后中起着重要的调控作用,本文主要就lncRNA在原发性肝癌等肝脏疾病中的机制研究作一综述。     

长链非编码RNA调节脂肪发育与形成的研究进展

长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)曾一度被认为是基因组转录“噪音”,然而近年来大量研 究证实其能调节基因表达,参与人类众多疾病的发生发展。LncRNA可分别与蛋白、DNA和RNA相互作用,通过表 观修饰水平、转录水平、转录后水平调节以及充当生物媒介等方面参与基因表达的调控。近年来随着肥胖及相关 疾病的发生率越来越高以及其对人类健康和社会发展产生的严重影响,科学家们也试图进一步从非编码RNA领域来 探索肥胖的发病机制。越来越多的lncRNA被证实参与对脂肪组织(白色脂肪和棕色脂肪)成脂、发育以及能量代谢的 调控。     

长链非编码RNA对急性痛风性关节炎相关信号通路的作用探讨

长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)是通过调控邻近基因的表达来发挥作用的一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA,无蛋白质编码功能,但是可以与蛋白质的多个位点结合,通过碱基互补配对原则与DNA、RNA发生特异性作用。近年来,随着基因检测技术的快速发展,lncRNA与多种免疫系统疾病的关系逐渐被人们所认识。痛风属于免疫系统疾病的范畴,因人体嘌呤代谢、尿酸生成与排泄异常,导致尿酸盐晶体沉积于组织或器官引发炎症反应,从而引起受累部位的剧烈疼痛,难以耐受。随着生活水平的提高和饮食结构的变化,痛风的发病率愈来愈高,严重影响患者的生活质量。目前,有研究指出,lncRNA与痛风的发病密切相关,痛风发作所涉及的炎症信号通路主要以Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)信号通路、Nod样受体蛋白3(Nod-like receptor protein 3)炎性小体信号通路及嘌呤受体P2X7(purinergic 2X7 receptor,P2X7R)信号通路为主,lncRNA除了通过调控免疫细胞参与痛风的发作,还通过影响上述信号通路发挥作用,本文主要就lncRNA与急性痛风性关节炎相关的信号通路及上述因子的关系进行探讨,进一步揭示痛风的发病机制,以期为痛风的防治提供新的方向。      

长链非编码RNA PAPPA-AS1在人肺腺癌细胞铂类耐药中的作用

目的: 研究长链非编码RNA（long noncoding RNA,lncRNA）PAPPA-AS1在人肺腺癌细胞铂类耐药中的作用,并初步探讨其可能的调控机制。方法: 采用RNA测序（RNA-seq）技术检测人肺腺癌细胞A549及其铂类耐药细胞中lncRNA和mRNA的差异表达谱;qRT-PCR检测lncRNA PAPPA-AS1在A549/DDP和A549/NDP细胞中的表达水平;利用siRNA技术下调铂类耐药人肺癌细胞中PAPPA-AS1的表达,CCK-8实验检测肺腺癌细胞对铂类药物的敏感性;克隆形成实验检测细胞的增殖能力;流式细胞术检测细胞凋亡分布;蛋白质印迹法检测Cleaved Caspase-3、Cleaved Caspase-9、p-PI3K、p-Akt、p-mTOR蛋白在A549/DDP和A549/NDP细胞中的表达水平。 结果： 与亲代敏感细胞A549相比,lncRNA PAPPA-AS1在A549/DDP和A549/NDP细胞中呈高表达;与对照组比较,si-PAPPA-AS1组的肺腺癌细胞对铂类药物的敏感性增强,细胞增殖活力下降,细胞凋亡率增加（P均<0.05）;与对照组比较,si-PAPPA-AS1组的细胞中Cleaved Caspase-3和Cleaved Caspase-9蛋白表达明显升高,磷酸化PI3K、Akt和mTOR蛋白表达明显降低。结论： 下调PAPPA-AS1可以通过抑制PI3K/Akt信号通路逆转肺腺癌细胞对铂类药物的抵抗性。     

长非编码RNA与其他表观遗传机制在肿瘤中的相互调控

长非编码RNA(lncRNA)是新发现的RNA干扰方式,与其他包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重构等表观遗传形式一样,在恶性肿瘤的发生和发展中起着重要作用。近年分子肿瘤学研究显示,lncRNA与其他表观遗传形式相互作用,如lncRNA可通过多种途径调控DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重构和其他RNA干扰形式,而DNA甲基化、染色质重构等也可调控lncRNA的表达及作用;其错综复杂的网路关系影响肿瘤的发生和发展。     

基于生物信息学的脑胶质瘤预后风险长链非编码RNA筛选

目的：应用生物信息学方法筛选脑胶质瘤的预后风险长链非编码RNA（lncRNA）。方法：从开放的癌症基因图谱（TCGA）和基因型组织表达（GTEx）数据平台下载脑胶质瘤样本转录水平数据,采用R语言比较分析脑胶质瘤和正常脑胶质样本差异表达基因,使用Cox分析构建风险模型,通过DAVID基因功能和KEGG通路数据库对差异表达基因进行功能注释和通路富集分析。利用qPCR评价HOXA-AS2的表达量与脑胶质瘤的临床组织特征之间的关系。结果：通过比较分析脑胶质瘤样本和正常脑组织样本基因组表达数据,获得差异表达的lncRNA 424个（211个上调,213个下调）,mRNA 3 827个（1 618个上调,2 209个下调）。构建了包含9个lncRNA的风险模型,参与介导的信号转导通路主要集中于免疫缺陷病毒感染,神经信号转导等相关通路。qPCR方法验证HOXA-AS2在脑胶质瘤中高表达。结论：筛选出HOXA-AS2可能是脑胶质瘤的预后风险lncRNA,为后续脑胶质瘤的机制研究提供参考依据。     

长链非编码RNA在甲状腺乳头状癌中的表达谱分析

目的 长链非编码RNA (lncRNA)在肿瘤的发生和发展中起重要作用。本研究使用基因芯片技术筛选甲状腺乳头状癌中差异表达的lncRNA,并对这些lncRNA调控的靶基因进行预测和分析。 方法 本研究使用微阵列来研究3例甲状腺乳头状癌(PTC)和配对的邻近非癌性甲状腺组织中lncRNA的表达。基因功能通过GO (Gene Ontology,GO)和通路分析进行评估，并预测lncRNA潜在的靶基因。 结果 与邻近的非癌性甲状腺组织相比，共有855个差异表达lncRNA，上调195个，下调660个(FC>2，P<0.05)；2 370个差异表达mRNA，上调801个，下调1 569个(FC>2，P<0.05)。其中差异较大的lncRNA有23个，mRNA有79个(FC>4)。lncRNA-SLC34A2和它相关的mRNA GRCh38(NM_001177998)差异表达最为显著(FC=23.5)。差异表达的mRNA中显著富集的GO途径显示:一些与肿瘤有关，如“焦粘连”“ECM-受体相互作用”“MAPK信号传导途径”和“PI3K/AKT信号传导途径”。经过通路分析，42条信号通路在差异表达的转录后显著富集，其中“焦粘连”最为显著(P=8.499×10-7)并与47个差异表达基因有关。239个与其相关mRNA的lncRNAs可能与顺式调控有关。lncRNAs和mRNAs的位点之间的相对位置关系在基因的不同位点。 结论 本研究是甲状腺肿瘤相关的LNCRNA谱的补充，发现了一定数量的差异表达的LNCRNA，并预测其功能靶向基因和途径。今后，笔者将选择更多的样本，深化对lncRNA分子机制和生化功能的研究，为甲状腺癌的早期诊断和治疗提供新的准确方法。      

LncRNA SNHG3对宫颈癌细胞SiHa增殖、迁移及侵袭的影响

目的 探究长链非编码RNA（lncRNA）小核仁RNA宿主基因3（SNHG3）对人宫颈癌细胞系SiHa增殖、迁移及侵袭的影响。方法 利用 GEO 数据库芯片分析 lncRNA SNHG3 在正常宫颈组织和宫颈癌样本中的表达;通过实时定量 PCR 检测LncRNA SNHG3、上皮-间质转化标志物 N-cadherin、Snail、Vimentin 和 E-cadherin 基因表达水平;通过 Western blot 检测 N-cadherin、Snail、Vimentin和E-cadherin蛋白表达水平;在SiHa细胞中转染siRNA干扰片段来敲低lncRNA SNHG3,并采用qRT-PCR验证转染效率;通过CCK8实验检测细胞增殖能力,划痕愈合实验检测细胞横向迁移能力,Transwell小室实验检测细胞纵向迁移及侵袭能力。结果 LncRNA SNHG3在宫颈癌组织及细胞系中高表达;敲低lncRNA SNHG3后,明显抑制SiHa细胞的增殖能力（P<0.001）、迁移能力（P<0.01）和侵袭能力（P<0.001）;qRT-PCR和Western blot结果显示敲低lncRNA SNHG3可下调N-cadherin、Snail和Vimentin表达水平（P<0.001）,同时上调E-cadherin表达水平（P<0.001）。结论 LncRNA SNHG3可通过激活EMT通路促进宫颈癌细胞SiHa增殖、迁移及侵袭能力。     

长链非编码RNA在类风湿关节炎中的作用及中药有效成分干预研究进展

类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是以持续性滑膜炎为主要特征的慢性、全身性自身免疫疾病,可造成肌腱、韧带和软骨的损伤,最终导致关节畸形和功能障碍,严重影响患者的生活质量,给社会经济造成巨大负担。RA全球发病率达0.5%~1%[1],但发病机制仍不明确。研究表明,50%RA发病与基因相关[2]。