检测蛋白质相互作用方法的进展

生物体的生命活动受蛋白质的控制和调节,而绝大部分蛋白质都是通过与其他蛋白相互作用来实现其功能。文章系统总结基于生物化学与分子生物学、生物物理学以及生物信息学等原理检测蛋白相互作用的研究方法,并对这些方法的特点进行了系统性评述。     

蛋白质组学技术及其临床应用研究

蛋白质组学（proteomics）是指根据蛋白质种类、数量、局部存在的时间、空间上的变化来研究表达于细胞、组织及个体中的全部蛋白质,并从其结构和功能的角度应用各种技术手段综合分析生命活动的一门科学。运用蛋白质分离技术、蛋白质鉴定技术,结合生物信息学对蛋白质组进行研究,可以从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成、表达水平与修饰状态,了解蛋白质之间的相互作用与联系,揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律。将其应用于临床,为从整体水平研究临床疾病开辟了更广阔的前景,有助于各种疾病的早期发现和治疗。     

生物信息学在生命科学研究中的应用

生物信息学是当今生命科学的重要组成部分,它也已经成为生命科学研究的前沿领域之一.它可以方便快捷地处理在生命科学研究中产生的海量数据并利用各种数据库来分析这些数据的意义.所以生物信息学被广泛地应用于生命科学的各个领域.它可以用来对基因信息进行分析处理,破译遗传密码,对蛋白质的结构和功能进行预测,并在此基础上可以筛选、鉴定、发现和预测免疫基因以及新的药物靶点,为免疫产品和药物研发提供了一个快捷有效的方法.本文就生物信息学在基因组、蛋白质研究、免疫学、药物研发等生命科学研究领域的应用予以综述.     

通过生物信息学技术预测铜绿假单胞菌噬菌体内溶素的作用机制

目的对20种铜绿假单胞菌噬菌体基因组中可能的内溶素基因进行生物信息学分析，探讨其可能的作用机制。方法采用开放阅读框预测、同源检索、多重序列比对、蛋白质模型自动匹配等方法预测可能的内溶素及其内溶素相关基因。结果通过铜绿假单胞菌噬菌体基因组进行分析，新发现8种内溶素基因和2种穴蛋白基因，对新发现基因的类型做了相关推定。结论利用生物信息学手段分析已知序列，可以迅速、方便、有效地确定未知基因的功能及作用方式。     

分子生物学方法在受体研究中的作用

受体的研究方法包括经典的放射配体结合法、药理学方法、蛋白质化学和生物化学方法、免疫学技术和分子生物学方法。受体的分子生物学研究方法对受体的分子结构及基因序列研究起到了极大的推动作用 ,并能阐明受体的结构与功能的关系 ,此外 ,分子生物学方法还能在基因水平上研究受体生理调节和病理变化的分子机制、受体病的分子基础以及细胞内受体与DNA相互作用的机制等。以下简要介绍受体研究中常用的分子生物学方法。1　受体研究中常用的分子生物学方法1.1　 RT- PCR　分离纯化具有生物活性的完整受体分子总 RNA,逆转录为 c DNA,利用 …     

对当前我国医学分子生物学研究的几点看法

生物化学与分子生物学是在分子水平上研究生命现象的科学,它以核酸、蛋白质、多糖等生物大分子结构、功能与生物分子间相互作用为研究核心,其理论与技术已渗透到生命科学诸多领域,尤其是遗传、进化、发育、神经及免疫等。医学分子生物学即用分子生物学的理论与技术研究...     

翻译后修饰与子宫内膜异位症研究进展

蛋白质是生命活动的承担者,需要经过不同程度的翻译后修饰才能发挥其功能。常见的蛋白质翻译后修饰过程有磷酸化、乙酰化、泛素化、糖基化和甲基化等,这些修饰可以改变蛋白质的功能,在多种疾病中发挥重要作用。子宫内膜异位症是育龄期妇女的常见疾病,其具体发病机制目前尚不清楚。近年研究表明,蛋白质翻译后修饰可能参与子宫内膜异位症发生发展。本文对蛋白质翻译后修饰在子宫内膜异位症发病机制、药物治疗等方面的研究进行综述,为子宫内膜异位症治疗及研究方向提供新思路。     

人CD14基因克隆及基因结构分析

目的扩增人CD14基因序列,对克隆基因进行结构及生物信息学分析。方法利用反转录PCR技术从U937细胞总RNA中,扩增编码人CD14的基因序列,对基因结构及其编码的CD14成熟蛋白质进行了限制性酶切位点、蛋白质组成、相对分子质量及等电点、蛋白质稳定性、信号肽定位、蛋白质Prosite和2级结构等生物信息学分析。结果序列分析结果表明扩增的基因序列与文献报道完全一致,在此基础上获得了人CD14基因结构和生物信息学参数。结论成功获得人CD14基因综合参数,为进一步重组CD14表达、鉴定和结构功能研究提供了理论依据。     

蛋白质相互作用及互作网络的生物信息学分析

后基因组时代的最终目标是认识真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和生物学功能,即蛋白质组学研究。关键的挑战之一就是对蛋白质相互作用网络的研究,将有助于从系统角度加深对细胞结构和功能的认识,并且为新药靶位点的发现和药物设计提供理论基础。目前,用生物信息学的手段来研究蛋白质相互作用网络显示出巨大的优势,主要包括蛋白质相互作用网络的绘制与显示、网络的拓扑结构分析、网络结构模块的研究及网络的比对等。文章试图从生物信息学的角度认识蛋白质相互作用,并总结蛋白质相互作用网络的生物信息学分析方法。     

中医专业《生物化学》教学体会

生物化学是从分子水平和化学变化的角度阐明生命活动机理的科学,即研究生物体的分子结构与功能、物质代谢与调节及其在生命活动中的作用。近年来,生物化学及分子生物学领域新的理论和技术层出不穷,极大地推动了生命科学的发展。当今,生物化学与分子生物学已经成为生命科学领域的前沿学科,是生命科学的领先学科和中心支柱。但是生物化学是研究微观的、看不到的世界,是一个常变常新的动态世界,它的理论性强,内容抽象,代谢途径错综复杂且相互联系,知识更新快,使学生感到既枯燥乏味又难以理解和记忆,普遍反映生物化学是一门较难学习的课程[1]。…     

蛋白质组学技术研究

蛋白质组学是在后基因组时代出现的一个新的研究领域,它是对机体、组织或细胞的全部蛋白质的表达和功能模式进行研究。对蛋白质组的研究可以使我们更容易接近对生命过程的认识。本文对蛋白质组学研究所使用的主要技术和生物信息学等简要综述。     

蛋白质相互作用及互作网络的生物信息学分析

后基因组时代的最终目标是认识真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和生物学功能,即蛋白质组学研究.关键的挑战之一就是对蛋白质相互作用网络的研究,将有助于从系统角度加深对细胞结构和功能的认识,并且为新药靶位点的发现和药物设计提供理论基础.目前,用生物信息学的手段来研究蛋白质相互作用网络显示出巨大的优势,主要包括蛋白质相互作用网络的绘制与显示、网络的拓扑结构分析、网络结构模块的研究及网络的比对等.文章试图从生物信息学的角度认识蛋白质相互作用,并总结蛋白质相互作用网络的生物信息学分析方法.     

蛋白质组学——一门正在崛起的蛋白质分子生物学

人类基因组计划(HGP)全部基因测定的完成,标志着分子生物学已跨入后基因时代。由于基因组学不能阐明蛋白质表达的水平与时间、翻译后修饰、蛋白质与蛋白质相互作用等众多问题,人们于是提出了蛋白质组学概念,并以此来探讨细胞的结构与功能以及生命活动的本质和规律。本文以蛋白质组学的形成背景、分类、蛋白质的分离和鉴定方法、空间结构的预测及蛋白质组学在疾病的诊治、药物开发及对其它生物科学的贡献作一综述。     

磷酸化蛋白质组学研究现状

蛋白质磷酸化是生命活动最重要的一项翻译后修饰，与信号转导、细胞周期、生长发育以及癌变机制等许多生物学问题有着密切的关系。蛋白质磷酸化和去磷酸化作为原核和真核细胞表达调控的关键环节，了解其对功能的影响可以深入理解生命系统在分子水平的调控状况。目前磷酸化蛋白质组研究仍是功能基因组面临的重大课题，本文对此作一综述。     

电离辐照损伤小鼠睾丸组织的比较蛋白质组学分析

目的：运用生物信息学方法分析电离辐照损伤小鼠的睾丸组织,提取出小鼠辐照组与正常组睾丸组织比较后的差异表达蛋白质,分析其功能和生物学过程。方法：建立小鼠电离辐照损伤模型。运用比较蛋白质组学方法、iTRAQ联合LC-MS/MS检测技术筛选出差异表达蛋白质,进一步利用David、Uniport数据库对差异蛋白进行GO、KEGG富集分析。结果：通过比较小鼠辐照组与正常组睾丸组织共鉴定出蛋白质1633个,包含差异蛋白128个,其中28个表达上调,100个表达下调。GO分析显示差异蛋白主要涉及氧化还原过程、精子发生、ATP代谢等生物学过程。KEGG分析显示主要分布在帕金森氏病、氧化磷酸化、代谢途径等21条信号通路中。结论：利用生物信息学方法对电离辐照损伤小鼠睾丸组织的蛋白质信息进行挖掘,为进一步研究电离辐照对睾丸组织的辐射损伤机制及寻找生物标志物提供参考。     

生物化学中“物质代谢”相关章节的教学方法探索

生物化学是一门研究生命化学的科学,它在分子水平上探讨生命的本质,即研究机体的分子结构与功能、物质代谢与调节及在生命活动中的作用。同时,生物化学又是一门重要的医学基础课程,它与生理学、药理学、病理学、免疫学等学科有着广泛的联系与交叉,并与临床医学关系密切。许多疾病的病因、发病机制都需要用生物化学的知识从分子水     

生物化学教学改革体会

生物化学是在医学类、农学类、理学类院校以不同的生物为对象展开的一门必修基础课程,与各个学科都有着密切的关系,它应用化学的原理和方法研究生命现象及生命物质的组成、结构和生命过程中的各种化学变化。医学类院校中的医学生物化学是通过从生物大分子的结构与功能、物质代谢及调节以及遗传信息的传递和调控机制等方面阐述了生命现象和疾病的本质,这有利于学生掌握生命物质、生命活动和疾病的关系。随着生物化学的不断发展,它涵盖的范围越来越广泛,现已包括了基因工程、蛋白质工程、克隆等高端科技,这些理论和技术已渗透到了基础医学和临床医学各个领域,在探讨疾病的发生、发展以及预防和治疗中有越来越多的应用。     

生物信息学概述

生物信息学是一门新兴的学科,它是应用计算机和信息技术搜集、储存、分析、整理各种生物医学信息,并予以管理和利用的一门科学.随着分子生物学研究的进展,当前生物信息学主要是研究和分析基因和蛋白质的遗传结构和功能的生物信息,以解释和认识生命的起源、进化、发育、遗传的本质,破译隐藏在DNA序列中的遗传语言及其意义,这亦称为经典的或狭义的生物信息.此外,它亦研究和分析人体所有细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程的各种生物信息,为人类疾病的预测、诊断、预防和治疗提供最合理和有效的途径.这亦称为广义的生物信息学或医学生物信息学.经典生物学是医学生物信息学的基础和核心,医学生物信息学是经典生物信息的发展和应用,两者是密不可分的,都是以计算机为工具,对生物信息进行储存、检索、分析的科学.     

生物大分子构象研究的一些新进展

近年来，由于理化技术的影响和渗透，生物学的发展非常迅速，逐渐由观察生命活动的现象深入到认识生命活动的本质，从而形成了一门全新的学科——分子生物学，它的核心内容是通过对生物体的主要物质基础，特别是蛋白质、核酸、酶等生物大分子的结构和运动规律的研究，来探讨生命的本质。自50年代以来，分子生物学发展很快，取得了一批重大成果：遗传物质核酸双螺旋结构的发现，蛋白质和核酸的人工合成，蛋白质、酶化学结构和空间结构的测定和它们的人工合成，以及这些大分子物质在结构和功能上的关系，其中特别是核酸及酶作用原理的深入了解…     

生物化学与分子生物学课程建设和教学改革的经验和体会

课程建设是高等学校教学基本建设,是提高教学质量的中心环节。通过系统的课程建设,达到有利于加强学生的自学能力,分析解决问题的能力,有利于培养学生的创新能力,这越来越成为社会迫切的需求。生物化学和分子生物学是自然科学中最重要的基础学科之一。现代生物化学发展于19世纪和20世纪初的生理化学,主要阐述活细胞中发生的各项化学过程;分子生物学主要研究具有重要生物活性的大分子物质———蛋白质和核酸的三维结构及其功能。随着生物和医学领域的探讨越来越走向分子化水平,生物化学和分子生物学日益成为现代生物和医学的语言,其实践与应用构成现代生物医学研究的核心。可以这样认为:最基本的生物学过程最终都可以通过物理和化学规则得以解释。因此它业已成为各高校医学、药学、生命科学、农林、环境科学等一门重要的专业基础课,众多学者都在积极探索如何完善该课程的课程建设。本人在多年生物化学与分子生物学专业的学习以及后来的执教中很遗撼地发现:对于这门课程学生可以很容易地记住一些文字上的东西,但是却难以真正将其理解并整合到一定深度,加以分析利用,而且即便是那些当时记住的知识又常常在不到一个学期就被遗忘。例如一个学期的生物化学与分子生物学学习之后,很少有学生...