2011年和2013年武汉市病毒性胃肠炎病原监测与分析

目的监测和分析2011年和2013年武汉市婴幼儿和成人病毒性胃肠炎病原。方法用聚丙烯酰胺凝胶电泳及RT-PCR对胃肠炎患者腹泻大便样本进行轮状病毒、诺如病毒、星状病毒以及札幌样病毒检测,部分样本测序并比对同源性。用PCR检测腺病毒。结果轮状病毒、诺如病毒、星状病毒、札幌样病毒检出率分别为21.6%(296/1 368)、35.7%(488/1 368)、10.2%(140/1 368)和7.7%(105/1 368);肠道腺病毒在儿童患者中的检出率为8.2%(70/853)。诺如病毒和轮状病毒易感人群为13~24月龄和7~24月龄儿童,及40~59岁成人。轮状病毒检出高峰在秋冬季。星状病毒、札幌样病毒和腺病毒多发于2岁以下的婴幼儿,无明显季节分布。196人份A组轮状病毒基因型以G9P[8]为主(40.8%),其次为G1P[8](26.5%),G3P[8](16.3%)和G2P[4](11.7%)。经测序比对诺如病毒基因型分别为GⅡ.4型(7/12),GⅡ.3型(5/12);星状病毒为1型(8/13),8型(4/13)和5型(1/13);札幌样病毒为GI.1型(2/6),GI 2型(2/6)和GⅡ.1型(2/6)。结论 2011年和2013年武汉市婴幼儿和成人胃肠炎主要病原是诺如病毒,其次是轮状病毒。     

甘肃省武威市腹泻症候群病例监测分析

目的了解甘肃省武威市腹泻症候群病例的病原构成及其流行特点,为腹泻的预防控制提供科学依据。方法采集2012年1月─2014年12月武威市凉州区2所哨点医院门诊、急诊就诊的腹泻患者粪便标本,用细菌培养法检测肠道细菌(沙门氏菌、志贺氏菌、致泻性大肠埃希菌、霍乱弧菌、副溶血弧菌),用ELISA、PCR和RT-PCR法检测肠道病毒(轮状病毒、诺如病毒、星状病毒、肠道腺病毒、札如病毒)。结果共收集粪便标本212份,检出阳性标本150份、病原体7种,阳性检出率为70.75%;病原谱构成分别为沙门氏菌9份(6.00%)、志贺氏菌7份(4.67%)、A组轮状病毒57份(38.00%)、诺如病毒29份(19.33%)、札如病毒8份(5.33%)、肠道腺病毒26份(17.33%)、星状病毒14份(99.33%);57份A组轮状病毒阳性标本中,病毒毒株G血清分型以G9、G3为主,P基因型分型以P[8]为主;男、女病原检出阳性率差异无统计学意义(χ2=0.01,P0.01);发病年龄以3岁以下组为主,占83.02%(176/212),病原体的阳性检出率为63.68%(135/212),与其他年龄组相比差异有统计学意义(χ2=26.03,P0.05);2─7月、10─12月为病原阳性检出较高的月份。结论2012─2014年甘肃省武威市腹泻症候群病例监测的主要病原体为沙门氏菌和A组轮状病毒,婴幼儿是高发人群,扩大病原监测范围和加强感染性腹泻的防治仍是今后工作的重点。     

2018—2020年焦作市手足口病病原检测结果分析

目的分析2018—2020年河南省焦作市手足口病实验室病原检测结果,了解病原特征,为手足口病防治提供依据。方法采用实时荧光PCR法检测手足口病临床诊断病例标本的肠道病毒通用型(EV),柯萨奇病毒A16型(CoxA16)和肠道病毒71型(EV71)的核酸,同时采集114例临床病例的咽拭子和粪便标本开展检测,结果采用配对卡方检验进行统计学分析。结果2018—2020年焦作市共检测手足口病临床诊断病例1312例,检出肠道病毒通用型核酸阳性1033例、阳性率为78.73%,3年间阳性率呈逐年下降趋势(χ^(2)=94.884,P<0.05);不同年度手足口病流行型别不同,2018年和2020年均以其他EV型为主,分别占84.96%和99.12%,2019年以CoxA16型为主(220例、占63.58%);114例临床病例的咽拭子、粪便标本中仅检出其他EV核酸阳性,阳性率分别为85.09%和92.98%,粪便标本阳性率高于咽拭子(χ^(2)=4.920,P<0.05)。结论2018—2020年焦作市手足口病阳性率呈下降趋势,不同年度主要致病病原不同,其他肠道病毒占比增加;应加强病原分型的实验室检测和监测,对指导疫情防控具有重要意义。     

银川地区儿童急性腹泻病原学及相关影响因素

目的:研究儿童急性腹泻病病原学分布特点及病因相关因素分析,为临床合理治疗提供依据.方法:采集2012-04/2013-04就诊的腹泻患儿的新鲜粪便进行细菌培养,同时采用RTPCR技术进行轮状病毒、诺如病毒、扎如病毒、星状病毒及肠道腺病毒检测.同期针对患儿发病相关因素进行问卷调查及分析.结果:286份粪便样本中共检测细菌和病毒208例,检出率72.73%;病毒阳性172例,阳性率60.14%,其中轮状病毒84例(29.34%)、诺如病毒62例(21.77%),扎如病毒14例(4.90%)、星状病毒27例(9.44%),肠道腺病毒21例(7.34%).细菌培养致病菌36例,检出率为12.58%,分别为沙门氏菌、志贺氏菌、金黄色葡萄球菌、致病性大肠埃希菌及白色念珠菌.未检出细菌和病毒78例(27.28%).急性腹泻病与多种因素(年龄、季节、喂养方式、发病诱因及母亲文化程度)具有相关性.结论:银川地区儿童急性腹泻病以病毒感染为主,轮状病毒、诺如病毒为主要致病菌,目前存在不合理使用抗生素情况.各型腹泻病发病与不同因素有相关性.     

手足口病患儿密切接触家属分泌物肠道病毒检测分析

目的 了解手足口病（HFMD）患儿密切接触家属呼吸道、消化道分泌物肠道病毒检出情况.方法 随机选取HFMD患儿密切接触家属50例,分别于患儿入院（急性期）及出院时（恢复期）采集咽拭子、粪便标本共200份,应用荧光定量RT-PCR方法进行肠道病毒（EV）核酸检测,包括EV、EV71、柯萨奇A组16型（CoxA16）.结果 EV阳性患儿密切接触家属总EV阳性率78％,其中97.3％为隐性感染者.HFMD患儿密切接触家属EV阳性检出率粪便明显高于咽拭子（P≤0.05）,且在患儿疾病恢复期阳性率高于急性期（P≤0.05）,尤其是粪便标本（P≤0.05）.结论 手足口患儿病密切接触家属EV隐性感染率高,应加入防控重点范围.     

多重荧光RT-PCR同时检测GⅠ型和GⅡ型诺如病毒方法的建立

目的建立可同时检测GⅠ型和GⅡ型诺如病毒的双重荧光RT-PCR快速检测方法,并应用于临床标本的检测。方法使用针对GI型和GⅡ型诺如病毒各亚型代表株保守序列设计的特异性引物和TaqMan探针,通过调整引物、探针浓度优化最佳反应条件,建立一步法荧光RT-PCR快速检测反应体系。对该方法的灵敏度、特异性、稳定性进行评估,并对临床粪便标本进行检测,与已有的单重荧光RT-PCR方法进行比较。结果实验结果表明,该检测方法特异性强,对GⅠ型、GⅡ型诺如病毒、轮状病毒、肠道腺病毒、甲型肝炎病毒进行检测,均无交叉反应;对GⅠ型和GⅡ型诺如病毒核酸的最低检出限分别可达1pg/mL和10pg/mL,并且重复性好;对101份临床标本分别用已有的单重荧光RT-PCR和本文建立的多重荧光RT-PCR进行检测,结果显示本文建立的多重荧光RT-PCR方法对GⅠ型诺如病毒的检测能力优于前者。结论本研究建立的多重荧光RT-PCR方法能同时对GⅠ型和GⅡ型诺如病毒进行快速检测,并且灵敏度高,特异性好,可用于感染性腹泻暴发中诺如病毒的快速检测。     

2010年广州地区手足口病病例病原学检测结果分析

目的了解2010年广州地区手足口病病例标本中CoxA16和EV71的感染情况。方法采集临床诊断为手足口病患者的粪便,用Real-time PCR同时检测总肠道病毒、CoxA16和EV71。结果共检测手足口病病例标本1 271例,总肠道病毒阳性率为61.32%;其中,CoxA16阳性率占29.82%,EV71阳性率占70.18%。阳性标本主要分布于0~4岁患者阶段,总肠道病毒、CoxA16和EV71阳性数分别为694、209和485。结论 CoxA16和EV71为广州地区2010年手足口病的主要病原病毒,EV71占多数,0~4岁儿童是感染的主要人群。     

英山县手足口病爆发高峰期病原学及流行病学观察

目的:了解英山县2013-04-2013-05间手足口病爆发高峰期病原学及流行病学特征,为本地区手足口病的防治提供依据。方法:采集109例手足口病患者咽拭子标本,采用实时荧光定量PCR方法进行肠道病毒通用型、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CA16)的核酸检测。结果:肠道病毒通用型阳性81例,阳性率为74.3%;EV71病毒阳性63例,阳性率为57.8%;CA16阳性19例,阳性率为17.4%;其中EV71和CA16双阳性12例,阳性率为11.0%。此次爆发高峰期的发病患者年龄集中在1~4岁儿童,并且男性患儿明显多于女性,以散居儿童和幼托儿童为主,EV71亚型发热患者所占比率要显著高于CA16亚型。结论:英山县2013年手足口病高峰期的主要病原体是EV71亚型,了解患者手足口病感染的病原体亚型及流行病学特征。     

烟台地区病毒性脑炎病毒分离与病原学分析

目的了解烟台地区病毒性脑炎病原谱及其基因特征。方法采集烟台地区病毒性脑炎患者脑脊液46份及粪便标本10份,通过细胞培养分离病毒,RT-PCR扩增肠道病毒VP1区并测序,进行基因序列分析。结果从46例病毒性脑炎患者脑脊液标本中分离到11株病毒,分离率为23.91%,10份粪便标本中分离病毒5株。16株病毒经鉴定7株为肠道病毒,其中EV71型4株。EV71与其他地区流行株VP1区序列差异较小。结论烟台市病毒性脑炎以肠道病毒为主,有EV71型流行,与其他地区流行株相比,EV71型VP1区基因变异较小。     

2008～2010年淄博地区70例手足口病患儿病原学分析

目的为手足口病的疫情控制及治疗提供实验依据。方法对2008～2010年淄博市临淄区人民医院70例手足口病患儿行病原学分析：采集70例手足口病患儿的粪便和咽拭子标本,采用实时荧光RT-PCR法分别检测人肠道病毒（HEV）、肠道病毒71型（EV71）及柯萨奇病毒CA16型（CA16）RNA表达率;分析本地区不同年份的病原学特点。结果 2008、2009年病毒以EV71为主,2010年以CA16为主;粪便标本检测阳性率高于咽拭子标本。结论淄博地区手足口病病原以EV71和CA16为主,且随年份不同有所变化。     

1323例手足口病流行病学特征及EV71检测结果分析

目的 研究2011年深圳市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的流行病学特征和肠道病毒(enterovirus,EV)71的季节分布规律。方法 以2011年我院1323例HFMD住院患者为研究对象,对该病发生的地区、时间、人群分布进行统计。运用反转录聚合酶链反应方法对所有HFMD患者粪便标本进行EV71和柯萨奇病毒A16型(Coxsackievirus A16,CoxA16)检测。结果 HFMD患者多来自原特区外,除2月有零星发病外,全年均有散在流行,1~4岁年龄段多发;1323例患者中EV71阳性175例(13.2%),CoxA16阳性20例(1.5%);EV71阳性患者主要分布在5、6、7月,占总阳性患者的62.9%。结论 HFMD仍然是深圳市重要的公共卫生问题,应对其保持高度警惕。在2011年HFMD高发季节,EV71仍是实验室诊断的主要病原。     

2015年宿州市324例手足口病病原检测结果分析

【摘要】 目的  了解2015年宿州市手足口病病原学流行特征,为制订手足口病防控方案提供依据。 方法  采用Real-time RT-PCR方法检测肠道病毒71型（EV71）、柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)的特异性核酸及其它肠道病毒核酸（非EV71和非CoxA16）。 结果  324份手足口病临床诊断病例标本,肠道病毒核酸总阳性137份,阳性率42.3%。EV71阳性35份,阳性率10.8%（35/324）,阳性构成比为25.5%（35/137）;CoxA16阳性26例,阳性率8.0%（26/324）,阳性构成比为19.0%（26/137）;其他肠道病毒（非EV71和非CoxA16）76份,阳性率23.5%（76/324）,阳性构成比为55.5%（76/137）。男女比为1.6︰1,男性和女性阳性率分别为43.4%(86/198)和39.7%（50/126）,男女阳性检出率差异无统计学意义(χ2=0.445,P>0.05);发病年龄组以0~3岁为主;1月及4~7月为发病高峰,阳性检出率均超过50%。 结论  2015年宿州市手足口病发病高峰在春夏季,3岁以下儿童为高发病人群,其流行型别以其他肠道病毒（非EV71和非CoxA16）为主,同时伴有EV71和CoxA16。     

山东省部分地区肠道病毒71型的RT-PCR检测及基因特征分析

目的采用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）检测2008年山东省部分地区手足口病（HFMD）患者肠道病毒71型（EV71）,对毒株进行诊断及基因特征初步分析。方法以肠道病毒特异引物对EV71进行RT-PCR扩增,经琼脂糖凝胶电泳鉴定阳性标本,纯化后与pGEM-T载体连接,转化大肠埃希菌DH5α,筛选后测序,所得序列与我国阜阳、深圳、台湾株及美国EV71标准流行株的核苷酸序列在线进行BLAST比对,分析其同源性。结果42份标本中检出EV71 33例（78.57%）,所得序列经种系进化分析,与阜阳2008年HFMD暴发分离株同源性为98.7%99.1%,与深圳1998年HFMD散发分离的EV71毒株同源性为93.4%93.8%,与台湾1998年HFMD病例分离毒株同源性为91.2%91.6%,与美国EV71毒株同源性为79.2%79.7%。有9株EV71的563位苏氨酸（T）替代了EU703813的异亮氨酸（I）。结论EV71 C4亚型是2008年山东省部分地区HFMD暴发流行的病原,同源性分析表明山东省部分地区EV71分离株与阜阳、深圳及台湾地区分离株有较高的同源性,提示该病毒在中国大陆有较广泛的传播。     

实时荧光定量RT-PCR法检测安徽宿州市手足口病病原体结果分析

目的  了解宿州市手足口病肠道病毒谱及感染情况,为制订手足口病预防控制策略提供依据。 方法  采用实时荧光定量RT-PCR法对2012~2014年宿州市各县区哨点医院手足口病临床诊断病例进行病原学检测并分析。 结果  在962份样品中,肠道病毒核酸检测阳性384例,阳性率为39.92%;其中EV71、CoxA16分别为154例（占40.10%）、144例（占37.50%）,其他型肠道病毒共86例（占22.40%）。384例阳性病例中,男247例,女137例,阳性检出率在性别间差异无统计学意义（χ2=0.83,P＞0.05）;1岁组和2岁组手足口病毒核酸检测阳性占全部阳性者的73.18%。在3~4月和6~7月的发病高峰期间,病毒主要以CoxA16型和EV71型毒株为主,10~12月以EV71型病毒株为主。在人口密集的萧县和埇桥区,其手足口核酸阳性检出率最高,分别为50.21%和42.18%。 结论  宿州市手足口病病原体主要是EV71和CoxA16,主要发生在3岁以下儿童,发病时间以每年3~4月和6~7月为主,应加强在流行季节的防控工作及3岁以下手足口病患儿的病情监测与治疗。     

2010—2013年常州地区手足口病病原学分析

目的对2010—2013年常州地区手足口病病原体检出情况进行分析。方法选取2010年1月—2013年12月常州地区1945例手足口病患儿的肛拭子和咽拭子标本。用实时荧光定量聚合酶链反应对所有标本进行肠道病毒核酸检测,比较不同年份、不同年龄组、不同性别、不同部位标本检出的病原体型别分布及总阳性率。结果 1945例手足口病患儿中,检出肠道病毒(enterovirus,EV)71型591例(30.39%),柯萨奇病毒A组(coxasckievirus A,Cox A)16型526例(27.04%),其他肠道病毒476例(24.47%)。不同年份病原体型别分布不同(P0.05):2010和2012年以Cox A16型最多,EV71次之;2011年以EV71最多,Cox A16型次之;2013年以非EV71、Cox A16其他的EV型最多,EV71型次之。在总体阳性率方面,除1~岁组高于0~岁组外,其余各组间差异均无统计学意义。不同年龄组3种病原体型别分布差异具有统计学意义,其中0~岁组和1~岁组均以非EV71、Cox A16型最多,EV71次之,Cox A16最少;3~岁组和6~岁组均以EV71最多,Cox A16型次之,非EV71、Cox A16的其他EV型最少。肛拭子组阳性率显著高于咽拭子组。结论 EV71和Cox A16型是2010—2013年常州地区手足口病主要病原体,3~6岁儿童是高发人群,肛拭子总阳性检出率高于咽拭子。     

Prevalence of antibodies against enterovirus 71 in children from Lu'an City in Central China

We performed preepidemic and postepidemic serologic surveys to elucidate the rate of enterovirus 71 (EV71) infection in Lu'an City, Anhui Province, Central China. For the preepidemic study, a total of 472 healthy infants and children (age range, neonates to 15 years) were randomly selected before the 2008 outbreak of EV71 in the region. Blood samples were collected and tested for neutralizing antibodies (NAbs) against EV71 by performing a microneutralization assay. The results of preepidemic serological survey showed that 43.2% (204/472) of the tested samples yielded positive results for NAbs against EV71. The seropositivity rates were 29.6% (93/314) in children who were 0-7 years of age and 74.6% (59/79) in children who were 12-15 years of age. The overall geometric mean titer was 18.1, and the highest antibody titers were detected in children who were 5-7 years of age; this suggests that this group was frequently exposed to EV71 infection. For the postepidemic study, 83 serum samples were collected from healthy children ≤15 years of age in 2010. The seropositivity rate of EV71 NAbs increased in this young population after the 2008 outbreak, especially in 2- to 11-year-old children. This report shows that EV71 was spreading in Lu'an City before the 2008 outbreak, and children under 7 years of age were the main susceptible population.     

2016—2020 年深圳市盐田区流行性感冒流行特征分析

目的 分析深圳市盐田区流行性感冒的流行病学特征,预测其流行趋势,为流感防控提供科学依据。 方法 收集 2016—2020 年盐田区流感样病例(ILI)监测数据、辖区内流感暴发疫情数据和病原学检测结果并进行分析。结果 2016—2020 年深圳市盐田区哨点医院共报告 ILI 1 563 例,其中男性 898 例,女性 665 例;年龄以 0~ 15 岁人群为主,占 67. 31%(1 052 / 1 563)。 2016—2020 年共采集 ILI 样本 1 563 份,检出阳性样本 302 份,总阳性率为19. 32%。 2016—2020 年 ILI 样本阳性率分别为 23. 79%、21. 39%、16. 23%、31. 11%和 2. 42%,各年度阳性率差异有统计学意义( χ2 = 87. 829,P<0. 05)。 2016 年主要流行病毒株为甲型 H1N1 和 B 型 Victoria 系,2017 年为甲型 H1N1和 A(H3N2),2018 年为甲型 H1N1 和 B 型 Victoria 系,2019 年为甲型 HINI、A(H3N2)和 B 型 Victoria 系,2020 年仅 有 A(H3N2)检出。 2016—2020 年深圳市盐田区共报告 ILI 暴发疫情 82 起,采集样本 451 份,阳性 314 份,阳性率为 69. 62%。 暴发疫情全部发生在学校,以小学为主,中学次之。 结论 深圳市盐田区不同监测年份各流感亚型交替流行,0~ 15 岁人群为重点关注人群,学校是盐田区流感防控重点场所。 应提高重点人群流感疫苗接种率,加强学校流感监测工作。     

海南西部地区手足口病流行病学及病原学特征分析

目的了解2012—2015年海南西部地区手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)流行病学及病原学特征,为防控工作提供依据。方法收集2012年1月—2015年12月海南西部地区10 258例HFMD患儿的资料,分析其流行病学特征。对粪便或咽拭子标本采用实时荧光定量PCR扩增基因序列进行肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)、柯萨奇病毒A组(Coxasckie virus A,CA)16型和其他肠道病毒核酸检测。结果 2012—2015年海南西部地区累计报告HFMD患儿10 258例,年发病率为121.34/10万,病死率为0.19%。HFMD患儿发病年龄主要集中在5岁儿童,其中1~3岁组发病率最高,占69.31%。HFMD发病有明显的季节性,发病高峰出现在5—8月,呈单峰分布。实验室诊断率为60.20%(6175/10 258),其中EV71阳性3907例(63.27%),CA16阳性875例(14.17%),其他肠道病毒阳性1393例(22.56%)。EV71和CA16感染构成比随季节变换而发生变化,EV71构成比在5月份高达74.28%(719/968),CA16构成比在8月份高达19.44%(146/751)。重症患儿和死亡患儿均以EV71感染构成比最高,分别占80.00%(20/25),81.82%(9/11)。结论海南西部地区HFMD疫情处于高流行态势,5岁儿童是主要发病人群,EV71和CA16为主要病原,应采取相应措施,更好防控HFMD的发生和流行。