德阳市2010年手足口病监测结果分析

[目的]了解2010年德阳市手足口病患者中肠道病毒的主要血清型及EV71毒株的基因型别,为德阳市手足口病的预防控制提供科学依据。[方法]采用实时荧光PCR方法对四川省德阳市手足口病疑似病例的68份咽拭子或疱疹液标本进行肠道病毒通用型(EV)、肠道病毒71型(EV71)型和柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)的病毒核酸检测。并对2份EV71阳性标本进行VP1区核苷酸序列测序和进化树分析。[结果]68份标本中,CoxA16阳性率41.18%(28/68),EV71阳性率17.65%(12/68),其他肠道病毒阳性率为7.35%(5/68)。2份EV71毒株VP1区的核苷酸序列进化树分析,证实均属C4基因亚型。[结论]2010年德阳市手足口病以CoxA16感染为主,EV71及其他非CoxA16、非EV71肠道病毒并存。2份德阳EV71毒株经VP1区测序证实为C4基因亚型,与中国内地流行株基因亚型一致。     

2016-2017年盐城市手足口病CVA9型肠道病毒VP1基因分子进化特征

目的研究2016—2017年盐城市手足口病病原CVA9型肠道病毒VP1基因分子进化特征。方法对2016—2017年盐城市疑似手足口病例标本进行病原体分子分型分析;以RT-PCR法扩增CVA9型肠道病毒VP1基因全长编码区并测序,采用生物信息学软件进行核苷酸及氨基酸序列比对及基因种系进化特征分析。结果2016—2017年盐城市共检测1 002例疑似病例标本,肠道病毒核酸阳性率38.32%,主要型别为EV71型112例(占29.17%),CVA16型94例(占24.48%),其他肠道病毒共178例(占46.35%)。检出2株CVA9型,其核苷酸、氨基酸同源性分别为94.7%、99.3%,与原型株Griggs(D00627)核苷酸、氨基酸同源性分别为80.4%～81.3%、92.7%;与引起其他症状各代表株(包括无症状健康儿童携带者)的核苷酸、氨基酸同源性为81.1%～97.2%、94.0%～99.3%。遗传进化树分析显示2毒株在C4分支中构成2条明显的传播链:CVA9/JS-yancheng/122/2016位于单独的小分支,CVA9/JS-yancheng/419/2016与2016年无症状健康儿童携带者四川株(LC361283)聚集成簇构成另一传播链。共检测31例重症病例,13例肠道病毒通用核酸阳性,阳性率41.93%,其中EV71型11例、CVA型2例。结论 2016—2017年盐城市引起手足口病的CVA9病毒属于散在流行,非手足口病流行的主要基因型别,与国内部分省市引起手足口病的毒株共进化共循环,与引起其他症状类型的CVA9毒株存在差异。     

2011年-2013年湖州市儿童手足口病病原学监测分析

目的分析湖州市儿童手足口病病原学构成情况,为制定有效的防控策略提供依据。方法收集2011年-2013年湖州市手足口病疑似患者的咽拭子、疱疹液等标本926份,采用荧光定量RT-PCR方法进行肠道病毒(EV)、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(COA16)核酸检测,并对部分EV71和COA16核酸阳性标本进行VP1区的序列测定和分析。结果 926份疑似感染者的咽拭子、疱疹液中肠道病毒阳性率为71.1%(658/926),其中肠道病毒71型阳性率为21.0%(194/926),柯萨奇病毒A组16型阳性率为16.2%(150/926),其他肠道病毒阳性率为33.9%(314/926)。VP1区的序列分析和系统进化结果表明湖州地区检出的EV71为C4a基因型,COA16为B1基因型。结论湖州市儿童手足口病2011年-2012年主要以EV71、COA16肠道病毒感染为主,2013年以其他肠道病毒感染为主,加强EV71、COA16肠道病毒的监测,同时要关注其他肠道病毒的型别,更好地预防和控制儿童手足口病。     

柳州市重症手足口病病原谱及肠道病毒71型VP1基因分析

目的分析柳州市重症手足口病病原谱构成,了解引起重症手足口病的肠道病毒71型(EV71)VP1的基因特征。方法收集柳州市2015年临床诊断重症手足口病病例标本,使用逆转录聚合酶链反应技术(RT-PCR)和DNA测序技术对病例标本进行肠道病毒核酸检测,并用MEGA 5.0对EV71 VP1基因进行分析。结果 67例临床诊断重症手足口病病例标本中,肠道病毒核酸阳性49例,其中EV71阳性11例、Cox A16阳性3例、Cox A2阳性17例、Cox A4阳性2例、Cox A6阳性9例、Cox A10阳性3例及其它肠道病毒4例;11株EV71毒株VP1核苷酸同源性为94.3%~100.0%,氨基酸同源性为98.3%~100.0%;通过与各亚型代表株进行同源性比较及构建系统进化树发现,11株EV71毒株均属于C4a亚型,在VP1区存在共变异现象的6个氨基酸位点上模式为KADSTV,在3个中和抗原决定簇上,除毒株15LZ-58在163位存在差异外,其余10株毒株均高度保守。结论柳州市重症手足口病病原谱复杂,主要病原体为Cox A2及EV71,其次为Cox A6;病原体EV71均属于C4a亚型,VP1基因片段较保守,没有发生较大的有意突变。     

2014-2019年琼山区儿童重症手足口病病原学与流行病学特征

目的探讨2014-2019年海南省海口市琼山区重症手足口病儿童的流行病学、病原学分布及VP1基因特征。方法收集海南省海口市琼山区2014-2019年手足口病、重症手足口病病例一般资料,采用实时荧光逆转录-聚合酶链反应检测通用肠道病毒、柯萨奇病毒A组16型(CVA16)及肠道病毒71型(EV71)核酸,扩增VP1基因编码区并进行测序。结果 2014-2019年海南省海口市琼山区共报告手足口病11 248例,重症病例75例,死亡病例4例,2014-2019年海南省海口市琼山区手足口病总体发病率呈现先升高后下降趋势,其中2016年发病率最高;手足口病及重症病例在各个月份均有分布,其中5～8月发病率最高。随时间推移,EV71型病毒比例降低,其他肠道病毒比例升高。经培养、分离得到EV71毒株7株,毒株序列之间核甘酸、氨基酸同源性为97.1%～100.0%、99.1%～100.0%;7株毒株序列与C4a亚型同源性最高,核苷酸、氨基酸同源性为93.8%～96.0%、99.4%～99.8%。经培养、分离得到CVA16毒株6株,毒株序列之间核甘酸、氨基酸同源性分别为97.7%～100.0%、99.2%～100.0%;6株毒株序列与B1b亚型同源性最高,核苷酸、氨基酸同源性分别为92.7%～97.2%、96.5%～99.9%。结论 2014-2019年海南省海口市琼山区手足口病发病呈现先升高后降低趋势,其病原菌谱随时间推移也发生改变,在临床预防中应加强对病原菌的监测,密切观察,更好的开展手足口病防控工作。     

2011年郴州市手足口病病原学及EV71型分离株基因特性研究

目的了解2011年郴州市手足口病病原学特征及EV71型分离株基因特性,为郴州地区手足口病防治工作提供依据。方法收集郴州市手足口病临床诊断病例的咽拭子或肛拭子、粪便标本,采用实时荧光PCR法检测EV71、CA16和其他肠道病毒核酸。随机挑选55份EV71阳性的标本进行RD细胞分离,10株分离株用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增EV71的VP1片段,并作基因测序和序列分子系统发生树分析。结果 2011年郴州市共报告手足口病例5 128例,发病有两个高峰,分别是5-7月和11-12月。病原学检测提示,2011年检测手足口病标本574例,发病年龄以1～3岁儿童为主,男性是女性的2.04倍,检出阳性标本461份,其中EV71占30.15%,CA16占31.89%,EV71和CA16同时阳性占0.65%,其他肠道病毒占37.31%;三种型别病毒分布在病例发病时间、发病年龄和地域上有所不同(P<0.001);重症病例25例,18例检出EV71病毒核酸,死亡病例6例均为EV71病毒感染;采用实时荧光PCR法随机检测68份其他肠道病毒,其中23份CA6、8份CA10,CA6和CA10占其他EV的45.59%。10株EV71分离株基因测序均为C4a亚型,重症和普通病例EV71的VP1基因序列差异较小。结论手足口病的发病存在明显季节、地区、性别、年龄差异,EV71是2011年郴州市引起手足口病重症和死亡病例的主要毒株类型,要开展对EV71型病毒的深入研究,同时也要关注非EV71和非CA16病毒的流行趋势,以防范其快速传播。     

杭州市肠道病毒71型的分离与VP1区域序列分析

目的了解杭州市2008年和2011年肠道病毒71型(EV71)流行株VP1基因特征。方法手足口病患者咽拭子、粪便等样本先通过荧光RT-PCR方法初筛,然后选部分肠道病毒71型阳性样本进行病毒分离、培养;通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定上述培养物,并扩增VP1区全长基因和序列测定,利用生物信息学软件对序列进行分析,构建基因进化树。结果从2008年和2011年手足口样本中分离到EV71阳性毒株各4株,VP1基因全序列测定结果显示其与C4亚型代表株核苷酸和氨基酸的相似性最高,分别为93.8%～95.2%、99.0%～99.7%。结论杭州市手足口病患者感染EV71病毒的流行株属C基因型的C4亚型。     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

2016～2018年梅州市手足口病病原学监测分析

目的了解梅州市手足口病肠道病毒类型和手足口病流行特征,为预防和控制手足口病暴发提供科学依据。方法采集2016～2018年梅州市哨点医院临床诊断的手足口病病例标本(咽拭子或肛拭子或粪便),采用荧光PCR法进行EV、EV71、CVA16、CVA6病毒的核酸检测,分析感染病毒类型及流行趋势。结果共检测1 022例病例标本,EV阳性786例,男女比例为2∶1。2016和2018年以CVA16型流行为主,阳性率分别为56.62%和43.30%;2017年以CVA6型流行为主,阳性率为44.33%。2016～2018年检测手足口病肠道病毒阳性高峰分别集中在7月(30.77%)、9月(15.27%)和6月(23.02%)。阳性检出年龄集中在5岁以下儿童(占阳性总数的95.67%),EV、EV71、CVA16及CVA6型均以1～2岁为阳性检出最高峰年龄,分别占34.48%、38.85%、21.97%、50.42%。3年EV71型、CVA16型、CVA6型阳性率差异均有统计学意义(P0.01)。结论 2016～2017年梅州市手足口病病例以5岁以下儿童为主,每年流行病毒类型不同,总体以CVA16型为引起手足口病的优势流行毒株。     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

手足口病EV71病毒株的分离鉴定及其生物学特性研究

目的:为了获得肠道病毒71型病毒株,同时验证Vero细胞分离肠道病毒的效果。方法:采集手足口病例疱疹液、咽拭子标本,接种单层Vero细胞,观察细胞病变(CPE);CPE阳性的培养物用荧光定量RT-PCR方法进行鉴定及分型,选取毒株进一步做EV71 VP1全序列测定、电子显微镜形态学观察、间接免疫荧光染色、病毒CCID50测定。结果:从23例手足口病例33份标本中,分离到22株肠道病毒,分离阳性率为66.7%;其中肠道病毒71型17株占阳性数的77.3%,CoxA16型4株占18.2%,未分型1株占4.5%,经基因序列分析表明本次分离的肠道病毒71型毒株均为C基因型。结论:Vero细胞分离肠道病毒阳性率高,获得了17株EV71型毒株。     

宁夏地区2008年肠道病毒7 1型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.