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杭州市肠道病毒71型的分离与VP1区域序列分析
引用本文:邱晓枫,祝水芬,濮小英,叶榕,张国忠,李钧,缪凡,黄志成.杭州市肠道病毒71型的分离与VP1区域序列分析[J].中国预防医学杂志,2011(12):1014-1018.
作者姓名:邱晓枫  祝水芬  濮小英  叶榕  张国忠  李钧  缪凡  黄志成
作者单位:杭州市疾病预防控制中心;
摘    要:目的了解杭州市2008年和2011年肠道病毒71型(EV71)流行株VP1基因特征。方法手足口病患者咽拭子、粪便等样本先通过荧光RT-PCR方法初筛,然后选部分肠道病毒71型阳性样本进行病毒分离、培养;通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定上述培养物,并扩增VP1区全长基因和序列测定,利用生物信息学软件对序列进行分析,构建基因进化树。结果从2008年和2011年手足口样本中分离到EV71阳性毒株各4株,VP1基因全序列测定结果显示其与C4亚型代表株核苷酸和氨基酸的相似性最高,分别为93.8%~95.2%、99.0%~99.7%。结论杭州市手足口病患者感染EV71病毒的流行株属C基因型的C4亚型。

关 键 词:手足口病  肠道病毒71型  VP1基因  基因型

Isolation and sequencing of VP1 region of Enterovirus 71 srains in Hangzhou,Zhejiang,China
QIU Xiao-feng,ZHU Shui-fen,PU Xiao-ying,YE Rong,ZHANG Guo-zhong,LI Jun,MIU Fan,HUANG Zhi-cheng.Hangzhou Center for Disease Control , Prevention,Hangzhou,Zhejiang ,China.Isolation and sequencing of VP1 region of Enterovirus 71 srains in Hangzhou,Zhejiang,China[J].China Preventive Medicine,2011(12):1014-1018.
Authors:QIU Xiao-feng  ZHU Shui-fen  PU Xiao-ying  YE Rong  ZHANG Guo-zhong  LI Jun  MIU Fan  HUANG Zhi-chengHangzhou Center for Disease Control  Prevention  Hangzhou  Zhejiang  China
Institution:QIU Xiao-feng,ZHU Shui-fen,PU Xiao-ying,YE Rong,ZHANG Guo-zhong,LI Jun,MIU Fan,HUANG Zhi-cheng.Hangzhou Center for Disease Control and Prevention,Hangzhou,Zhejiang 310021,China
Abstract:
Keywords:Hand-foot-mouth disease  Enterovirus 71  VP1 gene  Genotype  
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
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