肝细胞癌血浆LINE-1启动子区甲基化水平的研究

目的 探讨肝细胞癌（HCC）患者血浆中长散布核元件-1（LINE-1）基因启动子区CpG位点甲基化水平变化的临床意义。方法 应用亚硫酸氢盐测序 PCR（BSP）检测33例HCC患者（HCC组）、18例肝硬化患者（肝硬化组）及16例健康志愿者（正常组）的外周血血浆中LINE 1启动子区的CpG位点甲基化程度。结果 HCC组的LINE-1启动子区多个CpG位点甲基化水平及整体甲基化水平下降;进一步通过ROC曲线分析发现CpG位点1、位点7、位点8的甲基化水平对诊断HCC的能力较优,其敏感度和特异度分别为80.0％和78.8％、81.8％和71.4％、82.9％和75.8％。结论 LINE-1基因启动子区甲基化水平在HCC中明显下降,其中CpG位点1、位点7、位点8的甲基化水平可能对HCC诊断有意义。     

肝细胞肝癌上皮型钙黏素基因表达和启动子甲基化研究

目的 探讨上皮型钙黏素(E-cad)基因表达和启动子CpG岛甲基化与肝细胞肝癌(HCC)的关系.方法 用甲基化特异性PCR技术检测36例HCC肿瘤组织及其癌旁非肿瘤组织中,E-cad基因启动子CpG岛甲基化状况,E-cad mRNA表达用RT-PCR技术检测.结果 癌旁组织中E-cad mRNA表达水平显著高于肿瘤组织(P<0.001),Ⅲ～Ⅳ期肿瘤组织中的表达水平显著低于Ⅰ～Ⅱ期肿瘤(P=0.025),较大肿瘤(>5 cm)组织中的表达水平显著低于较小肿瘤(P=0.035),包膜完整的肿瘤组织中E-cad mRNA表达水平显著高于包膜不完整的肿瘤(P=0.001);E-cad基因在HCC肿瘤组织中的甲基化率显著高于癌旁组织(P=0.035),在包膜完整的肿瘤中的甲基化率显著低于包膜不完整的肿瘤(P=0.015);E-cad甲基化阳性的肿瘤组织中,其mRNA表达水平显著低于E-cad非甲基化阳性的肿瘤(P<0.000).结论 E-cad基因表达下降可能与HCC进展相关,其启动子甲基化是该基因表达下降的重要原因之一.     

肝癌患者血清p16甲基化检测

肝细胞癌(hepatocellular carcinoma，HCC)是原发性肝癌的主要病理类型，其发病的分子机制尚不清楚。近年来发现，p16基因5’-启动子区CpG岛异常甲基化在许多肿瘤组织及患者血清或血浆循环核酸(ciI℃ulatingnucleicacid，CNA)中有较高检出率。我们用甲基化特异性PCR(methvlationspecific PCR，MSP)检测HCC患者血清p16基因启动子区CpG岛甲基化状态，分析p16甲基化与HBV感染、AFP等的关系，并探讨其临床意义。     

肝癌患者血清p16、Runx3基因甲基化及其与临床病理参数的相关性

目的:探讨血清p16和Runx3基因启动子区CpG岛异常甲基化与原发性肝癌(hepatocellular carcino-ma,HCC)关系。方法:采用甲基化特异性PCR(MSP)法对56例HCC患者、40名健康体检者、40例乙肝患者和40例肝硬化患者血清p16和Runx3基因甲基化状况进行检测。结果:HCC患者血清p16和Runx3基因甲基化检出率分别为69.6%(39/56)和66.1%(37/56),而肝硬化患者、乙肝患者和健康体检者均未检出基因甲基化,与HCC组比较差异均有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归分析结果均未发现以α=0.05为显著性水准进入回归模型的变量。结论:HCC患者血清中可检测到p16和Runx3基因的甲基化,有助于肝癌的诊断、治疗和预后评估。     

乳腺癌BRCA1基因甲基化改变的研究

目的研究BRCA1基因启动子CpG区甲基化的改变与乳腺癌临床病理特征的关系.方法采用甲基化特异PCR技术(MSP法)对60例乳腺浸润性导管癌标本进行了BRCA1启动子CpG区基因甲基化研究,并分析与其临床病理特征的关系.结果 60例乳腺癌患者标本中有13例(21.7%)呈BRCA1 CpG区甲基化阳性.Ⅲ级病人BRCA1 CpG区甲基化发生率(80.0%)明显高于Ⅱ级病人(12.5%)和Ⅰ级病人(5.5%).淋巴结转移患者BRCA1甲基化发生率(37.0%)明显高于无转移的患者(9.1%).结论 BRCA1启动子区甲基化导致BRCA1抑癌基因失活,参与乳腺癌的发生和发展.乳腺癌患者BRCA1 CpC区甲基化与分级、淋巴结转移有关.BRCA1甲基化可能可以作为估计乳腺癌患者预后的一个指标.     

胃癌E-cadherin基因启动子CpG岛甲基化的研究

背景与目的:目前认为CpG岛甲基化导致转录抑制是恶性肿瘤发生的重要机制之一。E-cadherin能抑制肿瘤细胞的浸润和转移,被公认为是浸润、转移抑制基因。低分化胃癌常表现有E-cadherin基因失活。我们通过检测胃癌及癌旁组织中E-cadherin基因启动子CpG岛甲基化水平,初步探讨胃癌的发病机制。方法:采用特异性甲基化PCR(MSP)法检测51例胃癌组织及37例癌旁组织中的E-cadherin基因启动子CpG岛甲基化水平,采用免疫组织化学染色法检测E-cadherin表达。结果:健康对照组织中未检测到CpG岛甲基化,4例(10.8%)癌旁组织检测到CpG岛甲基化,32例(62.7%)胃癌组织中检测到CpG岛甲基化。低分化腺癌(72.2%,26/36)CpG岛甲基化显著高于高分化腺癌(33.3%,6/15)(P<0.01),T1/T2期(55.6%,10/18)与T3/T4期胃癌(66.7%,22/33)的CpG岛甲基化率无显著性差异(P>0.05)。32例CpG岛甲基化胃癌中27例(84.5%)E-cadherin表达下调,19例非甲基化胃癌中5例(26.3%)E-cadherin表达下调。未发现E-cadherin基因CpG岛甲基化与幽门螺杆菌感染有关。结论:胃癌、尤其是低分化腺癌广泛存在E-cadherin基因启动子CpG岛甲基化,启动子CpG岛甲基化可能参与胃癌的早期过程,E-cadherin基因CpG岛甲基化与幽门螺杆菌感染无相关关系。     

DNA修复酶基因MGMT启动子区异常甲基化与食管癌的关系

背景与目的： 分析食管癌组织中MGMT启动子区CpG岛甲基化状态和食管癌发病风险的关系,探讨MGMT基因启动子的异常甲基化在食管癌筛查及早期诊断中的意义。 材料与方法： 对江苏淮安的91例新发食管癌病例的癌组织、癌旁组织及外周血血浆样本提取DNA,应用甲基化特异性PCR(MSP)分析MGMT启动子区CpG岛的甲基化状态;对食管癌组织和癌旁组织提取总RNA,采用SYBR GREEN I 实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)测定MGMT的mRNA水平。 结果： MGMT启动子区CpG岛异常甲基化与食管癌发病风险增高有关联 (OR=7.750, 95％CI=2.736～21.955);MGMT启动子区CpG岛甲基化状态与MGMT mRNA水平无显著相关;血浆循环DNA中MGMT启动子区CpG岛甲基化与癌组织中MGMT启动子区CpG岛甲基化相关(P<0.01),血浆循环DNA中MGMT启动子区CpG岛甲基化检出率与癌组织中MGMT启动子区CpG岛甲基化检出率中度相关(Kappa=0.603, P<0.01)。 结论： MGMT基因的启动子区CpG岛的异常甲基化与食管癌发病风险增加有关;检测血浆循环DNA中MGMT基因启动子的异常甲基化,可为食管癌的筛查、早期诊断提供有价值的信息。     

甲基化特异性PCR检测肝癌复发转移患者血清DLC-1甲基化的价值研究

目的 研究血清DLC-1基因甲基化检测与肝细胞癌复发转移的关系.方法 收集73例HCC及正常健康体检者血清标本,HCC患者均经过病理证实.依据临床以及病理学特征分为高侵袭组和低侵袭组;采用甲基化特异性PCR对不同侵袭组HCC之间血清DLC-1基因甲基化表达进行分析.结果 DLC-1甲基化表达率高侵袭组明显高于低侵袭组,二者之间差异有统计学意义(X2=4.4652,P<0.05).研究HCC患者与对照组肝硬化患者(B组)和健康体检者(C组)血清标本中DLC-1甲基化关系发现:HCC患者与正常人和良性肝部疾病患者血清DLC-1基因甲基化检出率比较差异有统计学意义;研究血清DLC-1甲基化与HCC TNM分期的关系发现分期越晚,DLC-1甲基化程度越高;短期随访发现DLC-1甲基化的HCC患者中位生存期低于非甲基化患者(P<0.05).结论 DLC-1基因甲基化检测可作为肝细胞癌复发转移监测指标.     

DNA甲基化与肿瘤

 在真核细胞中 ,DNA甲基化使得胞嘧啶环 5碳的位置添加一个甲基 ,这个发生在 5′ CG 3′序列(也称作CpG二核苷酸 )中的反应受DNA(5 胞嘧啶 )甲基转移酶 [DNA (Cytosine 5 ) methyltransfer ase,DNAMTase]的催化。这是最常见的真核性DNA修饰。这种现象在植物和动物中都广泛存在 ,它在正常发育和组织特异的基因表达中起重要作用。1　甲基化胞嘧啶的分布和CpG岛真核性染色体组并非均一地被甲基化 ,而是在非甲基化区域中散在甲基化的区域。二核苷酸CpG在染色体组中的出现频率为 5 %～ 10 %。在包括人在内的大多数脊椎动物中 ,大约 70 %～ 80 %CpG位点中包含甲基化的胞嘧啶[1] 。这些甲基化区域为典型的大块型染色质 ,提示它们为含有组蛋白成分、核小体构型及相关转录因子的新近复制的DNA。与此相反 ,染色体组中有一些称作CpG岛的小区域 :这些区域未被甲基化 ,GC丰富 (6 0 %～70 %) ,CpG/GpC至少为0 .6 ,区域跨度为 0 .5～ 5Kb不等 ,出现频率为 1/ 10 0Kb。含有CpG岛的染色质通常被高度乙酰化...     

CpG甲基化与癌变原理研究

CpG位点甲基化促进终致癌物损伤DNA。细胞全基因组水平的低甲基化(hypomethylation)和某些CpG岛的高甲基化(hypermethylation)是肿瘤细胞的基本特征之一。本文将对这种高低甲基化变异并行现象的形成机制和意义进行探讨。     

利用数据库资料分析DNA甲基化调控AC004540.4表达水平与肝细胞癌预后相关性

目的通过挖掘癌症基因组图谱数据库(TCGA),探讨在肝细胞癌(HCC)中DNA甲基化与AC004540.4表达及与预后的关系。方法从TCGA数据库获取374例HCC组织和50例癌旁组织的基因表达谱数据,380例HCC组织和50例癌旁组织的甲基化数据。edgeR包筛选差异表达基因,limma包筛选差异甲基化基因,Spearman秩次相关判断两者的相关性。在基因表达综合数据库(GEO)中,GSE101728表达谱芯片、GSE54503甲基化芯片作为外部验证数据集。HCC预后影响因素分析采用Cox回归模型。使用R软件计算AC004540.4与全基因组mRNA的相关系数,对共表达的mRNA进行功能富集分析。结果在TCGA数据库中,HCC和癌旁组织的AC004540.4表达水平中位数(四分位间距)分别为2.322(2.700)和6.129(1.858),差异有统计学意义,Z=-9.287,P<0.001。同时,在HCC和癌旁组织中,AC004540.4启动子甲基化水平中位数(四分位间距)分别为0.412(0.405)和0.195(0.165),差异有统计学意义,Z=-5.651,P<0.001。在GEO数据库中,HCC和癌旁组织的AC004540.4表达水平中位数(四分位间距)分别为3.313(2.410)和10.063(0.818),差异有统计学意义,Z=-3.003,P=0.003。同时,HCC和癌旁组织的AC004540.4启动子甲基化水平中位数(四分位间距)分别为0.346(0.358)和0.113(0.044),差异有统计学意义,Z=-6.549,P<0.001。甲基化位点(cg12492504、cg13268603、cg14592933、cg24755163、cg17035412和cg26526379)的甲基化水平与AC004540.4表达呈中度负相关,rs分别为-0.465、-0.492、-0.447、-0.539、-0.451和-0.456,均P<0.001。Cox多因素分析结果发现,AC004540.4低表达是HCC患者预后的独立危险因素,HR=1.720,95%CI为1.116~2.652,P=0.014。富集分析提示,与AC004540.4共表达基因集主要富集于Wnt蛋白结合、向上调节端粒酶活性等生物学功能,以及调控细胞周期、胆汁分泌等信号通路。结论AC004540.4表达受其甲基化调控,启动子区域高甲基化可能导致转录沉默,并且与HCC患者预后相关,可成为HCC患者诊断和预后判断标志物。     

SCTR hypermethylation is a diagnostic biomarker in colorectal cancer

Diagnostic markers for both colorectal cancer (CRC) and its precursor lesions are lacking. Although aberrant methylation of the secretin receptor (SCTR) gene was observed in CRC, the diagnostic performance has not been evaluated. Therefore, this study aimed to assess and verify the diagnostic value of SCTR methylation of CRC and its precursor lesions through integrating the largest methylation data. The diagnostic performance of SCTR methylation was analyzed in the discovery set from The Cancer Genome Atlas (TCGA) CRC methylation data (N = 440), and verified in a large‐scale test set (N = 938) from the Gene Expression Omnibus (GEO). Targeted bisulfite sequencing analysis was developed and applied to detect the methylation status of SCTR in our independent validation set (N = 374). Our findings revealed that the SCTR gene was frequently hypermethylated at its CpG islands in CRC. In the TCGA discovery set, the diagnostic score was constructed using 4 CpG sites (cg01013590, cg20505223, cg07176264, and cg26009192) and achieved high diagnostic performance (area under the ROC curve [AUC] = 0.964). In the GEO test set, the diagnostic score had robust diagnostic ability to distinguish CRC (AUC = 0.948) and its precursor lesions (AUC = 0.954) from normal samples. Moreover, hypermethylation of the SCTR gene was also found in cell‐free DNA samples collected from CRC patients, but not in those from healthy controls. In the validation set, consistent results were observed using the targeted bisulfite sequencing array. Our study highlights that hypermethylation at CpG islands of the SCTR gene is a potential diagnostic biomarker in CRCs and its precursor lesions.     

Identification of specific DNA methylation sites on the Y-chromosome as biomarker in prostate cancer

As a diagnostic biomarker, prostate special antigen (PSA) tests always generate false positive results and lead to unnecessary and/or repeat biopsies. Therefore, there is an urgent need for developing more sensitive, specific diagnostic biomarkers. We epigenotyped methylated sites in cancer tissues and adjacent normal tissues from 66 patients. In comparation with normal adjacent tissues, we observed that there were 6 aberrant methylation sites in prostate cancer tissues on the Y-chromosome. We further performed pyrosequencing using urine of PCa patients and we identified one methylated site (cg05163709) as a potential biomarker. We evaluated the predictive capacity of the aberrant methylated sites using the area under receiver operating characteristic (ROC) curve (AUC). The ROC analysis showed a higher AUC for cg05163709 (0.915) than prostate-specific antigen (PSA, 0.769). These results indicated that aberrant DNA methylation of cg05163709 on the Y-chromosome could serve as a potential diagnostic biomarker with high sensitivity and specificity.     

血浆外泌体中的CD48蛋白作为潜在的肝细胞癌诊断标志物的研究

背景与目的：约60%的肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）患者在晚期才被确诊,因而无法得到及时有效的治疗,目前临床上常用于HCC诊断的血清标志物的灵敏度均偏低。本研究通过分析血浆外泌体蛋白质组的表达差异,鉴定可能用于HCC诊断的候选外泌体蛋白质标志物。方法：首先,采用鸟枪法蛋白质组质谱分析方法,对发掘人群[包括4名健康对照者（healthy control,HC）组和4例HCC患者组]的血浆外泌体进行全蛋白质组的定性和定量分析,并筛选差异表达蛋白质。然后,采用酶联免疫吸附试验（enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA）在独立的验证人群[包括56例HCC患者组、20例肝硬化（liver cirrhosis,LC）患者组和48名HC组]中进行验证实验,并评估候选蛋白质分子在HCC诊断中的潜在价值。结果：在发掘人群中,共鉴定到1 434种血浆外泌体蛋白质,其中的CD48蛋白在HCC患者中的表达水平显著高于HC组个体。进一步采用ELISA在独立验证人群中证实CD48蛋白在HCC患者中的表达水平显著高于LC和HC个体,受试者工作特征（receiver operating characteristic,ROC）曲线的曲线下面积（area under curve,AUC）为0.886。当联合检测血浆外泌体中的CD48蛋白和血浆中的甲胎蛋白（alpha-fetoprotein,AFP）时,AUC可提升至0.970。结论：血浆外泌体中的CD48蛋白可能作为HCC的候选诊断标志物,当其与AFP联合应用时可能进一步提高HCC的临床诊断能力。     

肝细胞癌中ChREBP基因CpG岛甲基化与mRNA表达的相关性

目的 检测肝细胞癌中ChREBP基因CpG岛甲基化水平及mRNA表达水平,并探讨两者的相关性。方法 收集肝细胞癌及癌旁冰冻组织90例,采用亚硫酸氢钠处理结合克隆测序检测ChREBP基因CpG岛内29个CpG位点的甲基化水平;采用荧光定量PCR检测其中31对新鲜冰冻组织中ChREBP基因mRNA表达水平,分析甲基化水平与mRNA表达之间的关系。结果 ChREBP基因的5、6、7、14号CpG位点甲基化水平在肝细胞癌中显著低于其配对的癌旁组织（P<0.05）。其余CpG位点及整体甲基化在肝细胞癌与癌旁组织中差异无统计学意义（均P>0.05）。15、18、20、23、26、29号CpG位点在≥50岁年龄组的甲基化水平均高于<50岁年龄组（均P<0.05）。肝细胞癌中ChREBP基因mRNA表达水平低于癌旁组织（P=0.003）,但与甲基化无显著相关性（P>0.05）。结论 肝细胞癌中ChREBP基因mRNA表达水平低于癌旁组织,但这一改变可能不是通过影响DNA的甲基化水平实现的。     

肺腺癌CASZ1表达临床意义GEO及TCGA数据库资料分析

目的 CASZ1在多种肿瘤中异常表达,并参与肿瘤的发生发展,但其在肺腺癌中的表达及临床意义罕见报道。本研究旨在探讨CASZ1表达水平与肺腺癌临床病理特征和预后的关系。方法通过基因表达谱动态分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库探讨CASZ1在33种肿瘤中的表达情况。通过基因表达综合(Gene Expressi on Omnibus,GEO)数据库及癌症和肿瘤基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获得CASZ1在肺腺癌中的表达数据及相关病理参数,分析CASZ1表达水平与肺腺癌患者临床病理特征和总生存期(overall survival,OS)的关系,并通过免疫组化验证CASZ1蛋白在肺腺癌中的表达。通过TCGA数据库获得CASZ1在肺腺癌中的甲基化水平,分析肺腺癌中CASZ1表达失调的可能机制。采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)预测CASZ1相关的基因通路。结果 GEPIA数据库分析结果显示,与正常组织相比,在11种肿瘤中CASZ1表达水平下调,在2种肿瘤中表达上调。在TCGA及GSE43458、GSE118370和GSE10072既往吸烟、吸烟及从未吸烟数据集中,CASZ1表达水平在肺腺癌组织中均下调,差异有统计学意义,均P<0.001。免疫组化结果提示,CASZ1蛋白在肺腺癌组织中表达也下调,t=5.969,P<0.001。TCGA及GSE68465数据集结果提示,CASZ1基因低表达组预后差于高表达组(χ^2=6.923,P=0.009;χ^2=11.175,P=0.001)。在肺腺癌组织中,CASZ1表达水平与6个甲基化位点(cg01551133、cg08885197、cg20288000、cg14170597、cg22728186和cg20329303)关联(P<0.001),其中cg01551133、cg14170597和cg22728186高甲基化组生存期短于低甲基化水平组(χ^2=11.290,P=0.001;χ^2=12.901,P<0.001;χ^2=7.083,P=0.008)。GSEA结果提示,CASZ1低表达样本富集在G2M检查点(P<0.001,FDR<0.001)、E2F信号通路(P<0.001,FDR<0.001)等基因集。结论肺腺癌中CASZ1表达水平下调,其甲基化水平升高可能是CASZ1失调的潜在机制,CASZ1低表达提示肺腺癌患者的预后差,可作为肺腺癌患者治疗的潜在靶点。     

Identification of novel aberrant methylation of BASP1 and SRD5A2 for early diagnosis of hepatocellular carcinoma by genome-wide search

A genome-wide study using expression profiles of 12,600 genes was conducted to identify methylated genes that could be used for early diagnosis of hepatocellular carcinoma (HCC). Of the 12,600 genes examined, we identified 23 genes with significantly lower expression levels in HCC tissues than in non-HCC liver tissues by our statistical and CpG mapping tests. Of these 23 genes, methylation analysis by direct sequencing with bisulfite treatment determined 4 genes that were aberrantly methylated in 20 HCC samples of TNM stages I and II. Further methylation analysis of the 4 genes by quantitative sequencing with 20 HCCs and the corresponding non-tumor liver tissues from an independent cohort of HCC patients revealed that 2 genes, BASP1 and SRD5A2, were aberrantly methylated in only HCC tissues, though not in any corresponding non-tumor liver tissues. Notably, in the cohort we found that BASP1 or SRD5A2 were aberrantly methylated when a cut-off value of 30% in the methylation rate was used, in all cases of 11 HCCs of TNM stages I and II, of 10 well-differentiated HCCs and of 4 small HCCs <2 cm in maximum diameter, but in none of the 20 corresponding non-HCC livers. Methylation-specific PCR for BASP1 and SRD5A2 reproduced the same results observed by direct sequencing. These results indicate that BASP1 and SRD5A2 might serve as useful biomarkers for early diagnosis of HCC.     

Elevated methylation of HPV16 DNA is associated with the development of high grade cervical intraepithelial neoplasia

We explored the association of human papillomavirus type 16 (HPV16) DNA methylation with age, viral load, viral persistence and risk of incident and prevalent high grade CIN (CIN2+) in serially collected specimens from the Guanacaste, Costa Rica cohort. 273 exfoliated cervical cell specimens (diagnostic and pre‐diagnostic) were selected: (1) 92 with HPV16 DNA clearance (controls), (2) 72 with HPV16 DNA persistence (without CIN2+) and (3) 109 with CIN2+. DNA was extracted, bisulfite converted and methylation was quantified using pyrosequencing assays at 66 CpGs across the HPV genome. The Kruskal‐Wallis test was used to determine significant differences among groups, and receiver operating characteristic curve analyses were used to evaluate how well methylation identified women with CIN2+. In diagnostic specimens, 88% of CpG sites had significantly higher methylation levels in CIN2+ after correction for multiple tests compared with controls. The highest area under the ROC curve (AUC) was 0.82 for CpG site 6457 in L1, and a diagnostic sensitivity of 91% corresponded to a specificity of 60% for CIN2+. Prospectively, 17% of CpG sites had significantly higher methylation in pre‐diagnostic CIN2+ specimens (median time of 3 years before diagnosis) versus controls. The strongest pre‐diagnostic CpG site was 6367 in L1 with an AUC of 0.76. Age‐stratified analyses suggested that women older than the median age of 28 years have an increased risk of precancer associated with high methylation. Higher methylation in CIN2+ cases was not explained by higher viral load. We conclude that elevated levels of HPV16 DNA methylation may be useful to predict concurrently diagnosed as well as future CIN2+.     

DNA甲基化调控miRNA-328的表达水平与乳腺癌预后的关系分析

目的 探讨DNA甲基化与微小RNA-328（miR-328）表达的关系及miR-328与浸润性乳腺癌临床病理特征和预后的关系。方法 回顾性分析1998年1月至2013年12月从TCGA乳腺癌芯片数据提取的1090例浸润性乳腺癌组织和104例癌旁组织的miR-328表达水平,分析从TCGA_BRCA_hMethyl450芯片数据中获取的775例浸润性乳腺癌组织和98例癌旁组织的miR-328启动子区CpG位点（cg16421621、cg04650403）甲基化率并计算启动子区甲基化与miR-328水平的相关性,从UCSC Genome Browser中的clinical_data_dictionary芯片数据中获取854例有完整临床病理资料及随访数据的乳腺癌标本,分析miR-328表达与临床病理特征及预后的关系,采用Cox回归模型分析影响预后的因素。结果 TCGA数据库1998年1月至2013年12月有miR-328表达量的1194例乳腺癌及癌旁组织中,1090例浸润性乳腺癌组织的miR-328水平为5.224±1.155,低于104例癌旁组织的6.246±0.923,差异有统计学意义（P＜0.01）;775例浸润性乳腺癌组织的miR-328基因启动子区域cg16421621和cg04650403的甲基化率分别为（0.415±0.201）%和（0.193±0.068）%,高于98例癌旁组织的（0.407±0.222）%和（0.094±0.079）%,差异有统计学意义(P＜0.01）;浸润性乳腺癌标本中miR-328的表达量与其启动子区域CG位点（cg16421621、cg04650403）甲基化率呈负相关（r=-0.127, P=0.005）。854例有完整信息的浸润性乳腺癌患者中,miR 328表达水平与淋巴结转移和肿瘤大小有关（P＜0.05）;miR-328低表达组（＜5.462）的中位总生存时间（OS）为7.25年,低于高表达组（≥5.462）的8.75年,差异有统计学意义（P<0.01）。Cox多因素回归分析显示,年龄、淋巴结转移与miR-328表达水平为影响OS的独立因素（P＜0.05）,miR-328高表达组的危险程度低于低表达组（P＜0.01）。结论 浸润性乳腺癌中miR-328表达受其基因启动子区甲基化调控;miRNA-328与浸润性乳腺癌的临床病理特征有关,并能作为影响浸润性乳腺癌预后的危险因素。     

外周血GPC3在肝细胞癌临床诊断中的价值

目的 探讨血清磷脂酰肌醇蛋白聚糖3(glypican?3,GPC3)蛋白和外周血GPC3 mRNA及其联合检测在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的诊断价值.方法 采用免疫组化法检测1例肝癌组织标本中GPC3的表达情况.检索PubMed、Web of Science、Embase和C...