胃癌发生与XPC基因单倍型的关系

目的 探讨XPC基因多态性位点rs2228000和rs2228001位点与胃癌发生风险的关系.方法 采用聚合酶链反应.限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,对203例胃癌患者和210例对照者进行XPC基因rs2228000位点和rs2228001位点多态性检测;并采用PHASE 2.0软件构建这两个多态性位点的单倍型,以非条件Logistic回归校正混杂因素,进行多态性与胃癌风险相关性的统计学分析.结果 XPC基因多态性位点rs2228000与rs2228001在胃癌与正常对照组之间差异无统计学意义(P>0.05).该两个SNPs构建的单倍型AT与CT与胃癌的易感关联的差异有统计学意义(P<0.01),OR值分别为2.62,10.51;分层分析显示AT与cT单倍型在性别、吸烟、饮酒、年龄分层中的差异均有统计学意义(P<0.05),且在AT单倍型中随年龄的增大,OR值逐渐增高,在<50岁、50～60岁、>60岁3个年龄层中OR值分别为1.91(95%CI:1.08～3.38)、3.49(95%CI:1.50～8.15)、5.43(95%CI:1.58～18.67).结论 XPC基因rs2228000与rs2228001多态性位点的单倍型与胃癌的发生明显相关.     

胃癌发生与XPC基因单倍型的关系

目的 探讨XPC基因多态性位点rs2228000和rs2228001位点与胃癌发生风险的关系.方法 采用聚合酶链反应.限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,对203例胃癌患者和210例对照者进行XPC基因rs2228000位点和rs2228001位点多态性检测;并采用PHASE 2.0软件构建这两个多态性位点的单倍型,以非条件Logistic回归校正混杂因素,进行多态性与胃癌风险相关性的统计学分析.结果 XPC基因多态性位点rs2228000与rs2228001在胃癌与正常对照组之间差异无统计学意义(P>0.05).该两个SNPs构建的单倍型AT与CT与胃癌的易感关联的差异有统计学意义(P<0.01),OR值分别为2.62,10.51;分层分析显示AT与cT单倍型在性别、吸烟、饮酒、年龄分层中的差异均有统计学意义(P<0.05),且在AT单倍型中随年龄的增大,OR值逐渐增高,在<50岁、50～60岁、>60岁3个年龄层中OR值分别为1.91(95%CI:1.08～3.38)、3.49(95%CI:1.50～8.15)、5.43(95%CI:1.58～18.67).结论 XPC基因rs2228000与rs2228001多态性位点的单倍型与胃癌的发生明显相关.     

骨桥蛋白基因多态性与弱精子症的相关性分析

目的:探究骨桥蛋白(OPN)基因单核苷酸多态性(rs1126772、rs117291487、rs11730582、rs142608941、rs6813526)与男性弱精子症的关系。方法:选取135例弱精子症不育男性为病例组,239例有生育史的健康男性作为对照组,运用多重单碱基延伸PCR技术(SNaPshot)对OPN基因rs1126772、rs117291487、rs11730582、rs142608941、rs6813526位点进行基因分型检测,分析这5个位点多态性与男性弱精子症的相关性。结果:OPN基因rs1126772位点GA基因型和A等位基因与弱精子症发病风险存在相关性(GA vs AA:OR=0.55, 95%CI, 0.35～0.86,P=0.009;A vs G:OR=0.64, 95%CI, 0.46～0.89,P=0.007);rs11730582位点CT基因型和T等位基因与弱精子症发病风险相关(CT vs TT:OR=0.526, 95%CI, 0.34～0.82,P=0.009; T vs C:OR=0.60, 95%CI, 0.44-0.83,P=0.002),单倍型分析发现,AATCT单倍型可能具有降低弱精子症的发病风险(AATCT:OR=0.61, 95%CI, 0.42～0.88,P=0.008)。结论:OPN基因rs1126772和rs11730582位点多态性可能与降低弱精子症的发生相关。     

胃癌患者中hTERT启动子及外显子区域基因多态性的研究

目的:探讨端粒酶逆转录酶(hTERT)基因rs2853676和rs2853677位点单核苷酸多态性与胃癌遗传易感性的关系。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法对297例胃癌患者、105例萎缩性胃炎患者及402例非萎缩性胃炎患者进行基因多态性分析,采用病理学诊断和13C尿素酶呼气试验(13C-UBT)检测幽门螺杆菌(Hp)感染情况。结果:rs2853676位点胃癌组AA基因型频率显著高于对照组(15.2%vs 6.5%),AA基因型携带者患胃癌风险增加2.47倍(95%CI 1.46-4.16);对照组、萎缩性胃炎组、胃癌组HP感染率分别为40.3%、64.8%、56.9%,与对照组相比,萎缩性胃炎组及胃癌组Hp感染率明显增加,差异有统计学意义(P均0.01),OR值分别为2.73(95%CI 1.74-4.26)、1.96(95%CI 1.44-2.67),经Logistic回归分析发现,Hp感染与基因突变无明显交互作用;rs2853677位点CC、TC、TT基因型频率在对照组、萎缩性胃炎组及胃癌组分布差异无统计学意义(P0.05)。结论:hTERT基因rs2853676基因多态性与胃癌遗传易感性有关,其增加胃癌风险与Hp感染可能无关。     

eNOS基因单核苷酸多态性与习惯性流产患者的相关性研究

目的探讨内皮型一氧化氮合酶(eNOS)基因21个单核苷酸多态性位点(SNP)与习惯性流产(RSA)的相关性。方法选择eNOS基因21个位点,通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术对227例RSA患者和232例健康对照进行了基因分型及数据统计分析。结果 RSA组及对照组eNOS基因8个位点基因频率分布符合H-W平衡。3个Block处于强连锁不平衡(D’0.9)。RSA组rs11771443位点CC基因型[χ2=5.107,P=0.004,OR(95%CI)=1.710(1.071,2.731)]及C等位基因频率[χ2=7.076,P=0.008,OR(95%CI)=0.682(0.514,0.905)]显著高于对照组;RSA组rs1799983位点GG基因型[χ2=10.587,P=0.001,OR(95%CI)=0.487(0.314,0.754)]及G等位基因频率(χ2=6.250,P=0.012,OR(95%CI)=0.615(0.420,0.902)]显著高于对照组;对照组中T-T-G单倍型频率显著高于RSA组(P=0.015)。结论eNOS基因rs11771443(Promoter)和rs1799983(Exon 7)位点多态性可能与RSA有关,携带有rs11771443多态性位点C等位基因与rs1799983多态性位点G等位基因的个体可能更容易患RSA;携带有T-T-G单倍型可能是RSA的保护因素。     

白介素-16基因多态性与膝关节原发骨性关节炎易感性韵关联研究

[目的]探讨白介素-16(IL-16)基因多态性与膝关节原发性骨性关节炎(OA)的易感关联.[方法]采用病例-对照研究,纳入95例中国汉族膝OA患者和95例年龄、性别匹配的健康对照者.用聚合酶链反应和限制性片段长度多态性等方法筛查IL-16基因的三个单核苷酸多态性(SNP)位点,并测序验证酶切结果.进行拟和优度x2检验、H-W平衡检验、连锁不平衡分析、单个位点和单倍型的非条件Logistic回归,分析IL-16基因多态性与膝OA的易感关联.[结果]三个SNP位点均符合H-W平衡.显性遗传模式非条件Logistic回归显示,rs11556218位点中,T/G基因型对膝OA可能有保护作用(OR=0.40,95%CI=0.21-0.73,P=0.008);rs4072111中,C/T可能增加发病风险(OR=1.98,95%CI=1.08-3.65,P=0.036).连锁不平衡分析提示rs11556218与rs4778889存在连锁不平衡(D'=0.625,r2=0.217),单倍型TTT可能增加发病风险(OR=2.42,95%CI=1.15-5.10,P=0.021),GCC可能减低发病风险(OR=0.43,95%CI=0.19-0.98,P=0.045).[结论]中国汉族人群中,IL-16基因的rs11556218、rs4072111、rs4778889位点的多态性可能与膝OA易感性相关.     

HES7基因多态性与先天性脊柱侧凸的关联分析

目的:探讨我国汉族人群HAITRY-AND-ENHANCER-OF-SPLIT-7(HES7)基因多态性与先天性脊柱侧凸(congenital scoliosis,CS)的关联性.方法:2005年9月～2007年5月在我院住院治疗的性别与年龄完全匹配的CS患者和非发育性畸形疾病患者(对照组)各123例,均为汉族,从外周血中提取基因组DNA.从美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库选取HES7基因rs3027279和rs1442849两个单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphisms,SNPs)位点,采用超高通量SNP分型系统对这两个位点进行基因分型,对检测的结果进行Hardy-Weinberg(H-W)平衡检验、卡方(X2:)检验、连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析、单位点非条件Logistic回归分析和多位点单倍型非条件Logistic回归分析,判断HES7多态性与CS易感性是否存在关联性.结果:两个SNP位点都具有多态性,且均符合H-W平衡.rs3027279位点中,C和A两种等位基因的频率在对照组和CS组间的差异具有显著性(X2=4.651,P<0.05);C/C和C/A两种基因型在两组间的差异具有显著性(X2=5.857,P<0.05).rs1442849位点中,A和G两种等位基凶在两组间的差异具有显著性(X2=7.963,P<0.05);G/G、G/A和MA 三种基因型在两组问的差异有统计学意义(X2=7.919,P<0.05).非条件logistic回归分析表明m1442849位点的A/A基因型对CS可能具有保护作用(P=0.018<0.05,OR=0.35.95%CI=0.17～0.74),而rs3027279位点的C/A基因型可能会增加CS的发病风险(P=0.015<0.05,OR=1.93,95%CI=1.13～3.30).LD分析示该两位点存在连锁不平衡关系(D'=0.923,r2=0.3812),单倍型非条件Logistic回归分析表明单倍型Hap3-GA可能会增加CS的发病风险(P=0.008<0.01,OR=2.14,95%CI=1.23～3.74).结论:中国汉族人群HES7的rs3027279和rs1442849两个位点存在多态性,该两个位点的多态性可能与CS的易感性有一定关联性.     

骨保护素基因多态性与椎间盘退变的相关性研究

目的探讨骨保护素基因3种常见位点多态性950T/C(rs2073617)、1181G/C(rs2073618)和163A/G(rs3102735)及骨保护素蛋白表达水平与椎间盘退变的相关性。方法选择2013年1月至2014年5月于南华大学附属第一医院就诊的200例椎间盘退变患者作为病例组,同期体检的200例健康志愿者作为对照组。采用PCR-RFLP法检测研究对象骨保护素基因rs2073617、rs2073618和rs3102735位点基因型和单倍型频率分布情况,运用ELISA法检测血清骨保护素水平。采用SPSS 22.0统计学软件进行数据分析。结果病例组和对照组骨保护素基因rs2073617多态性的等位基因和基因型频率比较,差异有统计学意义(P0.05),携带C等位基因可能会增加椎间盘退变风险[OR=1.79(1.33~2.41),P0.001],但两组rs2073618和rs3102735多态性等位基因和基因型频率差异均无统计学意义(均P0.05)。携带骨保护素基因rs2073617多态性3种不同基因型(TT、TC和CC)椎间盘退变患者的血清骨保护素水平均明显高于健康对照组(均P0.05);而携带rs3102735和rs2073618多态性不同基因型患者的血清骨保护素水平与对照组比较,差异均无统计学意义(均P0.05)。单倍型分析结果显示,骨保护素基因T-G-A单倍型可能是椎间盘退变的保护性因素(OR=0.62,95%CI=0.41~0.94,P=0.020),而C-G-G单倍型可能为椎间盘退变的危险因素(OR=2.24,95%CI=1.09~4.60,P=0.020)。Logistic回归分析结果表明,低血清骨保护素水平与椎间盘退变发生风险呈正相关,而T-C-A、T-G-A和T-G-G单倍型与椎间盘退变发生风险呈负相关(均P0.05)。结论骨保护素基因rs2073617多态性可能与椎间盘退变有关,但rs2073618和rs3102735多态性可能不是增加椎间盘退变易感性的主要危险因素;骨保护素基因T-C-A、T-G-A和T-G-G单倍型可能是椎间盘退变的保护性因素,低血清骨保护素水平则可能是椎间盘退变的危险因素。     

miR-143/145侧翼序列多态性与膀胱癌遗传易感性研究

目的 探讨miR-143/145侧翼序列rs4705342和rs4705343多态性与膀胱癌遗传易感性的关系。方法 采用基于医院的病例对照研究,收集106例膀胱癌患者和162例对照人群外周静脉血样本,TaqMan探针法和聚合酶链反应-限制性长度片段多态性分析rs4705342和rs4705343多态性。结果 rs4705342位点CC基因型和C等位基因显著降低了膀胱癌的发病风险（CC与TT相比,调整OR=0.30,95%CI:0.10～0.88,P=0.018;C与T相比,调整OR=0.60,95%CI:0.40～0.89,P=0.01）。 单倍型分析显示,rs4705342C-rs4705343T单倍型显著降低了膀胱癌的发病风险（OR=0.33,95%CI:0.15～0.74）。结论 miR-143/145侧翼序列rs4705342CC基因型可能是膀胱癌发病的保护因素。     

COX-2基因启动子区单核苷酸多态与肝癌遗传易感性的关系

目的 探讨COX-2基因启动子区的单核苷酸多态与肝癌发生风险的关系.方法 研究对象包括270例肝癌病人和540例正常对照.采用PCR-限制性片段长度多态方法 进行COX-2基因启动子区-1290A＞G,-1195G＞A和-765G＞C多态的基因型分析,不同基因型与单体型携带者发生肝癌的相对风险度的评估使用比值比(OR)及95%可信区间(CI).结果 多变量logistic回归分析显示-1195AA和-765GC基因型与肝癌风险增高相关,OR值分别为1.57(95%CI=1.01～2.44)和2.89(95%CI=1.65～5.08).单体型分析显示:与A_1290-G-1195-G_765相比较,含有-1195A等位基因的A-1290-A-1195-G-765和A-1290-A-1195-C-765两种单体型发生肝癌的相对风险增高,OR值分别为1.27(95%CI=1.01～1.60)和7.95(95%CI=1.76～36.02).同时包含-1195A等位基因和-765C等位基因的单体型发生肝癌的OR值较高.结论 COX-2基因启动子区的-1195G＞A和-765G＞C单核苷酸多态与肝癌遗传易感性相关.     

XPC gene polymorphisms and risk of idiopathic azoospermia or oligozoospermia in a Chinese population

A retrospective case–control study was carried out in the Han-Chinese population to determine the polymorphisms of xeroderma pigmentosum complementation group C ( XPC ) gene on the risk of idiopathic azoospermia or oligozoospermia. The Ala499Val (C>T) and Lys939Gln (A>C) polymorphism of XPC gene were genotyped by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism in three groups of infertile men (172 patients of azoospermia, 25 patients of severe oligozoospermia, 55 patients of oligozoospermia) and 228 fertile men. Increased risk of idiopathic azoospermia, but not oligozoospermia was associated with the XPC variant genotypes of Ala499Val (C>T) [adjusted odds ratio (OR) = 1.67, 95% confidence interval (CI) = 1.04–2.68 for CT heterozygote and adjusted OR = 2.03, 95% CI = 1.10–3.75 for TT homozygote] compared with CC homozygous wide-type. The Lys939Gln (A>C) polymorphism was not related to spermatogenic failure. The combined risk alleles analysis and haplotype analysis showed that ORs increased as the number of the risk alleles increased and the 499T-939C haplotype had a significantly increased risk of idiopathic azoospermia (OR = 7.97; 95% CI = 3.51–18.07) compared with other haplotypes. The results suggest that XPC Ala499Val (C>T) polymorphism is correlated with high risk of idiopathic azoospermia in the Han-Chinese population.     

膝骨关节炎与相关金属蛋白酶的基因多态性关联研究

目的探讨带有血小板凝血酶敏感蛋白样模体的解整链蛋白金属蛋白酶5(ADAMTS-5)基因单核苷酸多态性(SNP)与膝骨关节炎的关联性。 方法连续收集洛阳正骨医院188例膝骨关节炎患者作为病例组，对照组收集排除疾病诊断的100人。应用基因组变异服务器(GVS)网站选择ADAMTS-5基因共计15个SNP位点，采用基质辅助激光解析飞行时间质谱分析技术(MALDI-TOF-MS)进行SNP分型，先行哈迪温伯格(HW)平衡检测，对符合HW平衡的SNP位点等位基因进行卡方检验及单体型分析，对基因型进行logistic回归分析。 结果病例组rs2249350位点C等位基因显著多于对照组[比值比(OR)＝1.176，95%置信区间(CI)(1.025，1.351)，P＝0.016]，A等位基因显著少于对照组[OR＝0.761，95%CI(0.612，0.947)，P＝0.016]；rs2249350位点AA基因型[OR＝0.288，95%CI(0.124，0.669)，P＝0.004]及隐性基因模型[OR＝0.348，95%CI(0.162，0.749)，P＝0.007]均与膝关节骨关节炎负相关；rs229054、rs2249350两位点存在连锁不平衡，构成GC、GA、AC共3个单体型区块，其中病例组单体型GC显著多于对照组[OR＝1.259，95%CI(1.032，1.537)，P＝0.019]，而GA则显著少于对照组[OR＝0.763，95%CI(0.614，0.949)，P＝0.017]。 结论ADAMTS-5基因rs2249350位点C等位基因可能是膝关节骨关节炎的致病性因素，A等位基因则可能是保护性因素；rs2249350位点AA基因型可能是膝关节骨关节炎的保护性基因型，降低患病风险，且A等位基因可能为隐性基因，隐性遗传；rs229054、rs2249350位点GC单体型可能是膝关节骨关节炎的致病性因素，而GA单体型则可能是保护性因素。该位点等位基因、基因型及单体型与膝关节骨关节炎的关系仍需进一步深入研究和验证。     

白介素-1β基因多态性与晚期膝骨关节炎易感性的关联性研究

目的探讨IL-1β基因的单核苷酸多态性和单体型与中国汉族人晚期膝骨关节炎（KOA）的易感性相关。方法采用病例对照研究,纳入120例中国汉族膝OA患者和130例年龄、性别匹配的健康对照者,用酶联免疫吸附测定法（ELISA）测定血清中IL-1β的水平,用聚合酶链反应和限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）方法对IL-1β基因的-511C／T（rs16944）、＋3954C／T（rs114363）和-31C／T（rs1143627）位点进行单核苷酸多态性进行分析,并测序验证酶切结果。结果膝骨性关节炎患者组血清中白细胞介素1β水平明显高于健康对照组（t=-8．26,P〈0．01）,单核苷酸多态性分析显示：在膝OA患者组和健康对照组之间IL-1β-31C／T位点基因型分布和等位基因频率没有明显差异,该研究中没有发现IL-1β＋3954Tr基因型。膝OA患中的IL-1β-511TC、IL-1β＋3954CT基因型频率较健康对照组增加（P〈0．05,P〈0．05）,通过Logistic回归分析,IL-1β-511TC、IL-1β＋3954CT基因型与膝OA高风险发病率具有相关性（IL-1β-511TC,OR=1．842,95％CI=1．021—3．327,P〈0．05;IL-1β＋3954CT,OR=2．372,95％CI=1．022—5．509,P〈0．05）。此外,单体型分析显示与单体型TCC相比,单体型TCT和CCC与膝OA高风险发病率具有更强的相关性（TCT．OR=3．24,95％CI：1．50—7．00,P〈0．01;CCC．OR=6．07,95％CI：2．20—16．07,P〈0．01）。结论白细胞介素-1β基因的-511C／T（rs16944）和＋3954C／T（rs114363）位点多态性与中国汉族人膝OA的易感性相关。     

New polymorphism of ENPP1 (PC-1) is associated with increased risk of type 2 diabetes among obese individuals

The K121Q polymorphism in ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1 (ENPP1) is associated with type 2 diabetes and obesity. The possibility of other ENPP1 polymorphisms influencing these phenotypes has received little attention. Our aim was to examine the associations of tagging single nucleotide polymorphisms (SNPs) and haplotypes of the linkage disequilibrium (LD) block containing K121Q polymorphism with type 2 diabetes in a Polish population, controlling for any effect of obesity. We genotyped 426 type 2 diabetic case and 370 control subjects for seven SNPs in ENPP1. In the total group, neither type 2 diabetes nor obesity was significantly associated with any SNP. However, in obese subjects, two SNPs were significantly associated with type 2 diabetes: the Q allele of K121Q (odds ratio 1.6 [95% CI 1.003-2.6]) and T allele of rs997509 (4.7 [1.6-13.9]). In the LD block, four SNPs plus the K121Q polymorphism distinguished six haplotypes, three of which carried the Q allele. Interestingly, the T allele of rs997509 sufficed to distinguish a 121Q-carrying haplotype that was significantly more associated with type 2 diabetes than the other two (4.2 [1.3-13.5]). These other two 121Q-carrying haplotypes were not associated with type 2 diabetes. In conclusion, we found a new SNP, rs997509, in intron 1 that is strongly associated with risk of type 2 diabetes in obese individuals. The molecular mechanisms underlying this association are unknown.     

白介素-18基因多态性与结直肠癌易感性的关系

目的探讨白介素-18（m-18）基因单核苷酸多态性及其单倍型与结直肠癌易感性之间的关系。方法以170例结直肠癌患者和160名健康对照者为研究对象,应用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）的方法对IL．18基因-137G／C、-607C／A单核苷酸多态性进行基因分型,同时用SHEsis软件分析IL-18基因的连锁不平衡及单倍型频率。结果IL-18基因-607C／A多态性在结直肠癌患者和健康人群中的分布差异无统计学意义（P〉0．05）．而IL-18基因-137G／C多态性在两组人群中的分布差异有统计学意义（P〈0．05）。等位基因频率的相对风险分析显示．C等位基因携带者患结直肠癌的风险是G等位基因的1．814倍（OR=1．814,95％CI：1．246～2．642）。联合基因型分析显示,IL-18基因-137G／C、-607C／A单核苷酸多态性存在着强烈的连锁不平衡（ID＇｜=0．945）,-137C／-607A单倍型频率在结直肠癌患者中显著高于健康人群（P〈0．05）。-137C／-607A单倍型携带者显著增加了结直肠癌的发病风险（OR=1．637,95％CI：1．100～2．437）。结论IL—18基因-137G／C多态性和-137C／-607A单倍型与结直肠癌的发病具有相关性．其中-137C等位基因可能是结直肠癌的遗传易感基因。     

DNA修复基因多态性与非肌层浸润性膀胱癌易感性的相关性

目的 探讨上海地区汉族人群中DNA修复基因多态性与非肌层浸润性膀胱癌遗传易感性的关系. 方法 采用Taqman探针实时荧光定量PCR技术、病例对照研究方法,采集研究对象外周静脉血,检测94例病理证实原发非肌层浸润性膀胱癌患者和304例非肿瘤对照者的3个DNA修复基因(XPC,XPG,XRCC1)中的3个单核苷酸多态性位点.应用非条件Logistic回归模型,调整混杂因素后,分析各基因型与非肌层浸润性膀胱癌发生的关系以及与肿瘤临床病理特征之间的关系. 结果 膀胱癌组的XPC 939 Lys/Gln和XPC 939Gln/Gln基因型频率(70.0%,63/90)显著高于对照组(60.9%,185/304),XPG 1104 Asp/His和XPG 1104 His/His基因型频率(79.2%,57/72)亦高于对照组(73.0%,203/278).调整性别、年龄、吸烟等因素后,XPC 939 Lys/Gln和XPC939Gln/Gln基因型频率在膀胱癌患者中明显增高(校正OR为1.89,95%CI 1.14～3.23,P=0.02);XPG 1104 Asp/His和XPG 1104 His/His基因型频率在膀胱癌患者中轻度增高(校正OR为1.07,95%CI 0.86～1.87,P=0.048).XRCC1 Arg399Gln多态性与膀胱癌无关性(校正OR为1.15,95%CI 0.55～2.40,p=0.27).XPC和XPG多态性与肿瘤临床病理特征之间均无相关性(P>0.05).结论 XPC Lys939Gln和XPG Asp1104His基因多态性与上海地区汉族人群非肌层浸润性膀胱癌易感性有关.     

Megsin 2093T-2180C haplotype at the 3' untranslated region is associated with poor renal survival in Korean IgA nephropathy patients

AIMS: Megsin is a mesangial cell-predominant gene which belongs to the serpin superfamily. The expression of megsin was upregulated and coincided with mesangial proliferation and extracellular matrix expansion in IgA nephropathy (IgAN). In the present study, we evaluated the influence of the C2093T and C2180T polymorphism within the 3' untranslated region (3'UTR) of megsin gene and its haplotypes on the development and progression of Korean IgAN patients. METHODS: Korean IgAN patients (n = 260) with a minimal follow-up of 4 years were recruited. Healthy subjects with normal renal function, normal urinalysis and normotension (n = 315) were included as controls. The polymorphisms were determined by the 5' nuclease allelic discrimination assay, and the haplotypes were constructed using the Phase program. RESULTS: The C2093T and C2180T genotype and allele frequencies were not different significantly between IgAN patients and controls. In C2093T polymorphism, patients with CC genotype showed a better renal survival than those with CT or TT genotypes by Kaplan-Meier analysis (p = 0.027). The megsin C2093T polymorphism remained an independent risk factor for progression (Cox regression model, HR for TT genotype: 3.52, 95% CI 1.69 - 7.34; HR for CT genotype: 2.15, 95% CI 1.30 - 3.57). In C2180T polymorphism, patients with TT genotype showed a better outcome than those with CC or CT genotypes (p = 0.025). The C2180T polymorphism was also an independent risk factor for progression (HR for CC genotype: 4.05, 95% CI 1.93 - 8.51; HR for CT genotype: 2.35, 95% CI 1.40 - 3.94). The two alleles showed linkage disequilibrium in phased haplotype. The patients with 2093T-2180C haplotype showed a poor renal survival compared to those with 2093C-2180T haplotype (p = 0.028). The haplotype remained an independent risk factor for progression (HR for 2093T-2180C haplotype: 2.01, 95% CI 1.44 - 2.81). CONCLUSIONS: Our results suggest that the 2093T-2180C haplotype at the 3'UTR of megsin gene is associated with rapid disease progression in Korean IgAN patients. This is the reverse of the results from the Chinese IgAN patients. Further studies are strongly needed to elucidate the reasons of disparity.