2020年贵州省新型冠状病毒肺炎疫情特征分析

  目的  分析2020年贵州省新型冠状病毒肺炎（COVID-19）病例流行病学特征,为制定防控措施和策略提供依据。  方法  收集2020年贵州省报告的COVID-19病例信息,采用描述性流行病学方法,对病例的三间分布、感染来源及疫情特征等进行分析。  结果  2020年1月22日至12月31日,全省累计报告COVID-19病例173例,死亡2例,病死率为1.16%。 其中确诊病例147例（84.97%）,无症状感染者26例（15.03%）;重症病例31例（21.09%）;本地病例84例（48.55%）、境内输入病例87例（50.29%）、境外输入病例2例（1.16%）。 疫情曲线呈双峰型,两个高峰间隔7 d,第1个发病高峰以境内输入病例为主,第2个发病高峰以本地病例为主。 全省9个（100%）市/州44个（50%）县（区）均有病例报告,主要分布在贵阳市、毕节市及遵义市（占全省总病例的70.70%）。 男、女性别比为1.06∶1;各年龄组均有病例报告,年龄中位数为37岁。 82例（47.40%）病例是通过密切接触者主动筛查发现,55例（31.79%）是通过主动就诊发现,36例（20.81%）是通过对湖北省武汉市来黔等重点人员主动筛查发现。 暴露因素以密切接触者（42.77%）和武汉市旅居史人员（38.73%）为主。 29起聚集性疫情均为家庭聚集病例。  结论  贵州省COVID-19病例以境内输入及密切接触感染为主。 对疫情重点地区人员及密切接触者等重点人员的早期排查、集中隔离管理及对发热病例的监测是早发现和防止疫情传播的关键。     

2021年宁夏回族自治区聚集性新型冠状病毒肺炎疫情分子流行病学分析

  目的  分析2021年10月宁夏回族自治区（宁夏）新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情的分子流行病学特征,为完善防控措施提供科学依据。  方法  收集2021年10月17日至11月6日宁夏COVID-19确诊病例的发病时间、病例分布、人群特征、基因测序结果等信息,进行描述性分析。  结果  宁夏2021年10月聚集性疫情共确诊COVID-19病例 44例,本轮疫情有2个独立的传播链,平均代间距约4 d,潜伏期中位数为5.3 d（1.1～8.0 d）,最多已传代至3代;获得43例COVID-19病例的全基因组序列,结果表明本起疫情是由VOC/Delta变异株（B.1.617.2进化分支）感染,同武汉参考株（NC_045512）序列相比,43例病例新型冠状病毒（SARS-CoV-2 ）基因组序列存在45～50个核苷酸突变位点;SARS-CoV-2 刺突（S）蛋白存在12个氨基酸突变位点。  结论  Delta毒株导致的疫情呈现出病毒载量高,潜伏期短,传播能力强的特点,境外输入的 SARS-CoV-2 变异株存在引起本地暴发与流行的风险,需持续对境外输入的 SARS-CoV-2毒株进行分子监测。     

2019－2020年浙江省杭州市流感病例时空聚集性分析

  目的  探讨浙江省杭州市流行性感冒（流感）疫情的时空分布规律，为优化流感防控策略提供参考。  方法  2019 — 2020年杭州市的流感发病情况来源于“中国疾病预防控制信息系统”，流感聚集性疫情数据来源于杭州市、区疾病预防控制中心疫情处置报告。 采用ArcGIS 10.2软件进行全局/局部空间自相关分析，用SaTScan软件进行时空聚集性扫描分析。  结果  2019年1月1日至2020年9月30日杭州市共报告流感病例264 410例，发病率为269.98/万，发病高峰为2019年12月至2020年1月，期间病例数占总发病数的66.54%。 全局空间自相关分析显示，2019年第1季度至2020年第1季度的GSA Moran’s I值为正值（P<0.001）。 局部空间自相关分析共探测到71个街道为高–高聚集区，以杭州市主城区及临近地区为主。 时空扫描分析显示Ⅰ类聚集区主要位于主城区及周边临近地区，聚集时间为2019年12月15日至2020年1月25日，相对危险度（RR）值为20.86，对数似然比（LLR）为142 431.21，P<0.001。 局部空间自相关分析和时空扫描分析所得的热点地区与实际监测到的流感聚集性疫情分布情况相近。  结论  杭州市流感发病存在时空聚集性，12月至次年1月为防控重点时段，主城区及临近地区为防控重点区域。     

2019年浙江省学校诺如病毒胃肠炎暴发疫情分析

  目的  了解浙江省学校诺如病毒感染暴发疫情的流行特征,提出当前防控特点。  方法  收集2019年1月1日至12月31日浙江省学校发生的诺如病毒胃肠炎暴发疫情资料,采用描述性流行病学方法。  结果  2019年报告173起学校诺如疫情,涉及170所学校,累计3172例病例,波及161711人,总罹患率为1.96%。 诺如病毒疫情主要发生在小学（53.18%）和托幼机构（27.16%）,病例的年龄集中在7～12岁（47.95%）。 疫情在春季和秋冬季均有发生,传播途径主要为人传人（94.80%）,食源性传播和水源性传播引起的疫情较少。 临床症状以腹泻、呕吐为主,基因型以GⅡ型为主（121起,69.94%）。  结论  浙江省学校诺如病毒胃肠炎暴发疫情主要发生在小学和幼儿园,传播途径多为人传人,学校应重视病例的排泄物/呕吐物及环境消毒处理。     

2015－2019年浙江省发热伴血小板减少综合征流行特征分析

  目的  对浙江省发热伴血小板减少综合征（SFTS）的流行病学特征进行分析,为SFTS的防控工作提供依据。  方法  从国家疾病监测信息报告管理系统中获取2015 — 2019年浙江省SFTS疫情资料,采用描述性流行病学方法分析SFTS病例的时间、人群、地区分布特征。 使用ArcGIS 10.2软件进行空间地图绘制,采用SPSS 16.0软件进行统计学检验。  结果  2015 — 2019年浙江省累计报告SFTS病例337例,年均报告发病率为0.12/10万（0.08/10万～0.15/10万）,其中男性163例,女性174例,男女性别比为0.94∶1;死亡35例,病死率10.39%。 病例集中在4 — 10月,夏季为发病高峰。 45岁以上中老年人为高发人群（94.66%,319/337）,职业以农民为主（59.94%,202/337）。 发病数居前3位的地区分别为台州市（143例）、舟山市（83例）和宁波市（33例）,占病例总数的76.85%。 每年波及县（区）数分别为13、17、19、24和18个。 2018年绍兴市上虞区报告一起家庭聚集性疫情,共报告4例病例,血液、分泌物或排泄物可能是重要传播因子。  结论  SFTS在浙江省的分布范围不断扩大,主要发生在丘陵山区的中老年人,呈现明显的季节分布特征,应着重在高发地区、重点人群中开展宣传教育、监测及培训等防控措施。     

2021年7月全球新型冠状病毒肺炎疫情风险评估

  目的   评估2021年7月新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情全球流行情况及对我国的输入风险。  方法   根据美国约翰斯·霍普金斯大学公开发布的每日COVID-19疫情数据，结合牛津大学发布的政策严格性指数，采用流行病学描述方法，通过总体概述、世界卫生组织（WHO）各区及重点国家疫情趋势综合评估和周边十四国疫情与防控政策综合分析，对全球COVID-19疫情风险进行综合、全面与及时的评估。 对于各国评估结果，用“全球重点关注国家”、“各WHO分区一般关注国家”和“周边特别关注国家”予以表示。  结果   与2021年6月相比，2021年7月全球新增确诊病例增长了36.59%，全球新增死亡病例降低了4.78%。 除美洲区（南）外，其他分区的新增确诊均呈现出增长趋势，其中非洲区的新增确诊和死亡病例持续大幅度增长，应重点关注。 全球每新增1000万确诊病例用时整体呈现缩短趋势，每新增50万死亡病例用时增加。 有多个国家7月新增确诊增长率超过了100%，其中美国、印度尼西亚、英国、俄罗斯、伊朗、西班牙和南非为全球重点关注国家。 俄罗斯、老挝、哈萨克斯坦和塔吉克斯坦是我国陆地接壤十四国中特别关注国家 。   结论   进入7月后，全球COVID-19疫情出现反弹，除非洲疫情持续恶化外，美洲区（北）、欧洲区、东地中海区和西太平洋区均出现大幅度反弹。 全球 COVID-19 疫情发展态势严峻，对于全球重点关注国家要进行持续监测，实时调整入境管控政策，并与相关机构建立沟通机制，及时预警。     

传染病暴发疫情中传播动力学参数计算及疫情规模预测实现——基于R

  目的  以美国新型冠状病毒肺炎（COVID-19）数据为例，利用R软件演示暴发疫情处置中代间隔（SI）、基本再生数（R₀）、有效再生数（Re）、倍增时间和疫情规模的计算，为今后暴发疫情处置提供参考。  方法  收集美国2020年2月27日至2020年11月30日COVID-19逐日发病数据、国内2起疫情170对感染者与被感染者的代间隔（SI）数据。采用“fitdistrplus”包自助法对SI数据拟合“gamma”分布，得到SI均数和标准差。 采用指数增长（EG）、极大似然法（ML）、序贯贝叶斯估计（SB）、时间相关再生数（TD）4种方法，利用获取的SI计算R₀，选择拟合效果最好的作为R₀估计值，评价指标选择R2。 倍增时间基于EG的指数增长率进行换算。 利用“EpiEstim”包计算Re；利用SEIARD模型估计不采取任何干预措施美国未来的病例数，用“deSolve”、“FME”包。  结果  170对感染者与被感染者数据拟合得到SI=4.78（95%CI:4.27～5.31），标准差sd=3.56。 EG、ML、SB、TD拟合R₀依次为2.31（95%CI:2.30～2.31）、1.96（95%CI:1.95～1.97）、3.01（95%CI:2.53～3.55）、3.07（95%CI:2.20～4.22），R2依次为0.95、0.73、0.99、0.96。 倍增时间为3.75 d（3.74～3.77 d）。 利用SEIARD估计理想状态下美国将于2020年5月30日全民感染，至2021年6月7日所有感染者清零，累计死亡5502466人。  结论  利用R软件能对R₀等传播动力学参数、疫情规模快速计算，在暴发处置中值得学习使用。 动力学参数、疫情规模快速计算，在暴发处置中值得学习使用。     

2018－2022年广西壮族自治区流感样病例暴发疫情流行特征

  目的  了解2018—2022年广西壮族自治区（广西）流感样病例暴发疫情流行动态及影响因素,为今后流感防控提供依据。  方法  通过收集2018—2022年“中国流感监测信息系统”和“突发公共卫生事件报告管理信息系统”报告的广西流感样病例暴发疫情监测资料,以及相应的病原学检测结果,描述流感暴发疫情的流行特征。  结果  2018—2022年广西共报告流感样病例暴发疫情474起,累计报告发病数40 996例。 每年11和12月出现疫情报告高峰,呈现明显的季节性特征;场所分布主要以县（市）中小学校为主,占暴发疫情总数的90.51%（429/474）;病例年龄以5～14岁居多,占报告总发病数的84.55%（34 663/40 996）。 2018—2022年各型流感病毒均有检出,每年有2种以上的病原流行,暴发流行的优势毒株总体呈现以甲型流感病毒H1N1型、甲型H3N2型和乙型流感病毒BV型交替流行的趋势。  结论  广西流感样病例暴发常发生在中小学校,具有明显的季节性,流感优势株变换频繁,应通过持续监测及时掌握流感病毒的活动情况,做好常态化防控。     

2020年湖北省荆州市新型冠状病毒肺炎疫情流行特征分析

  目的  探讨湖北省荆州市新型冠状病毒肺炎（COVID-19）确诊病例流行病学特征,为今后类似疫情防控提供科学依据。  方法  通过中国疾病预防控制信息系统收集2020年荆州市COVID-19病例资料,描述病例的流行病学特征。  结果  2020年荆州市累计报告COVID-19病例1 550例,重症病例占22.71%（352/1 550）,病死率为3.29%（51/1 550）。 49.61%（769/1 550）的病例报告发病前14 d内有明确武汉市居住史或旅行史。 首例病例在2020年1月1日发病,发病高峰为1月23 — 28日,末例病例发病时间为2月26日。 50～59岁年龄组病例占比最高（23.23%,360/1 550）。 92.91%（118/127）的乡镇（街道）有病例发病。 ≥60岁组病例的病死风险是<60岁组的10.53倍（95%CI:4.70～23.60）,有既往疾病史病例的病死风险是无既往疾病史病例的1.95倍（95%CI:1.05～3.61）。 第一阶段（1月1 — 31日）的“发病至报告间隔”较第二阶段（2月1 — 26日）长（中位数分别为7.8、3.5 d,P<0.001）。  结论  荆州市多数COVID-19病例有武汉市暴露史,重症病例占比不高,疫情波及全市大部分乡镇。 有基础性疾病、年老者病死率高。 防控中后期较前期应更好地将“早发现”的防控策略落到实处。     

广东省深圳市某区一起水痘暴发疫情调查和基于SEIR模型对疫情防控效果的评估

  目的   采用SEIR模型评估一起水痘暴发疫情处置措施的效果,为今后水痘疫情处置提供科学参考。  方法   回顾性分析广东省深圳市某区一起达到突发公共卫生事件标准的校园水痘暴发疫情资料,使用传播动力学SEIR模型对其防控效果进行评估。  结果   此次疫情共有水痘病例123例,罹患率为3.40%。 其中92人有水痘疫苗接种史。 接种水痘疫苗的总保护率为55.88%,仅接种1剂次的保护率为55.20%,接种2剂次保护率为57.11%,接种1剂次、接种2剂次与未接种人群的发病率差异有统计学意义（P<0.001）,接种1剂次与接种2剂次比较差异无统计学意义（P>0.05）。 SEIR模型模拟学校疫情在无干预下自然发展180 d,可产生434例水痘病例,疫情持续101 d,设定对首发病例发病即隔离、对所有病例隔离、首发病例发生后及时进行应急接种的条件下拟合,可产生10、92和31例水痘,疫情持续时间分别为0 d（病例数均小于1）、87 d、35 d;模型拟合学校开展4次水痘疫苗应急接种后可产生80例病例,疫情持续72 d,比实际发生病例数少43例,疫情发生时间少2 d,比接种率90%情况下多49例,疫情持续时间多41 d。  结论   在水痘疫情的处置中,早期发现首发病例、完全隔离病例、及时全面开展应急接种是控制水痘疫情的关键措施。     

2022年浙江省春季新型冠状病毒感染本土聚集性疫情流行病学特征分析

目的 分析自2022年3月以来浙江省本土新型冠状病毒感染（新冠）聚集性疫情流行病学特征。方法 收集2022年3月3日至5月8日浙江省本土新冠聚集性疫情的流行病学调查资料,采用描述性流行病学方法进行分析。结果 262起疫情波及11个市的71个县（市、区）,累计报告确诊病例668例,无症状感染者866例。局部空间自相关分析显示,嘉善县、平湖市、海宁市、临平区、余杭区、拱墅区、上城区和婺城区存在热点聚集性。本次疫情由上海市输入并导致关联疫情占72.90%;50例以上规模疫情持续时间为7～15 d,10 d左右控制动态基本再生数（Rt）<1。结论 本轮疫情主要发生在嘉兴市和杭州市,大部分是外省输入病例引起的关联疫情;疫情R t控制在1以下的时间越早,规模越小,疫情持续时间越短。     

新型冠状病毒传播模式研究

  目的   以广东省广州市、江苏省南京市、河南省郑州市3次Delta变异株引起的疫情为例,探索新型冠状病毒的不同传播模式,为科学防控提供依据。  方法   研究数据来源于国家及地方卫生健康委员会报告的广州、南京、郑州市相关疫情病例数据。 以行政地级市为单位,根据病例人口流动特点将传播模式分为跳跃传播和社区传播,比较两种传播模式的主要特征。  结果   2021年5月21日至9月3日,3次疫情共报告1 494例感染者,跳跃传播模式感染者83例,社区传播模式感染者1 411例,其中包含由跳跃传播导致的感染者884例。 跳跃传播共波及45个城市,传播时间为22 d,感染人群平均年龄为37.15岁,无症状者占26.51%;社区传播持续时间65 d,感染人群平均年龄为45.21岁,无症状者占8.65%;跳跃传播感染人群年龄低于跳跃传播,无症状者占比高于跳跃传播,差异均有统计学意义（P<0.001）。  结论   人口流动引发的跳跃传播涉及范围广,以年轻人为主,无症状感染者居多,社区传播以中老年人为主。 提示对不同人群可采取差异化管控,如对流动人群和交通枢纽岗位的人群加强核酸检测频次,对社区人群减少聚集性活动,降低接触频率可降低感染概率。     

2020年7－8月辽宁省大连市新型冠状病毒肺炎暴发疫情流行病学调查分析

  目的  通过对2020年辽宁省大连市新型冠状病毒肺炎（COVID-19）暴发疫情的流行病学调查分析,为COVID-19疫情防控工作提供参考。  方法  采用描述性流行病学方法,对本次COVID-19暴发疫情病例的时间分布、地区分布、人群分布、病例发现途径等进行分析。  结果  2020年7月22日至8月5日,大连市累计报告COVID-19疫情相关确诊病例和无症状感染者118例,病例年龄为1月龄至73岁,其中男性58例,女性60例。 确诊病例92例,首例病例的发病时间为7月9日,末例病例的发病时间为8月5日,某食品公司病例发病时间早于该公司以外的病例。 81.36%的病例来源于以某食品公司及大连湾街道为核心的高风险地区,95.76%的病例通过密切接触者排查和社区筛查发现。  结论  此次COVID-19疫情是与冷链海鲜产品加工相关的聚集性暴发疫情,因为控制及时有效未发生广泛社区传播。     

甘肃省新型冠状病毒肺炎疫情时间风险的空间特征分析

目的描述并探讨甘肃省新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情的时间风险特征。方法收集截至2020年2月16日甘肃省各县(区)报告的COVID-19的发病数、相应县(区)人口数等数据,运用空间统计学的方法计算各县(区)的时间风险指数频率指数(α)、持续时间频率(β)和强度指数(γ)。结果全局自相关分析发现,α的Moran’s I系数为0.115,提示未来COVID-19发病频率增加概率较小。γ的Moran’s I系数为0.070,说明COVID-19确诊病例不会集中出现,疫情的发病强度较低。甘肃省COVID-19疫情的α、β存在全局空间自相关性(P<0.05),γ不存在全局空间自相关性(P>0.05)。α局部空间自相关分析发现区域(主要分布于兰州市城关区、七里河区、安宁区、红古区、皋兰县和榆中县)内存在高-高聚集性(P<0.05)。β局部空间自相关分析发现区域(主要分布于兰州市城关区、七里河区、西固区、安宁区、皋兰县和榆中县)内存在高-高聚集性(P<0.05)。结论结果提示兰州市大部分县(区)呈现高风险聚集性,但发病强度较低;全省在疫情期间采取的各项防控措施及时、有效。     

新型冠状病毒肺炎常态化防控措施下疫情发生及演变的模拟研究

  目的  通过构建基于接触网络和个体状态变化的计算模型,探究常态化条件下应对新型冠状病毒肺炎（COVID-19）突发病例的防控措施,以及对不同突发情况模拟相应防控措施下的疫情演进过程,为疾控部门制定方案和进行疫情预测提供理论和方法支撑。  方法  通过基于个体模型评估COVID-19病例直接密切接触者隔离和次级密切接触者隔离对防控的影响;分别模拟零星突发、聚集性突发和连续输入病例在常态化防控措施下的疫情演变动力学过程。  结果  模拟结果表明,对COVID-19病例次级密切接触者追踪隔离的疫情控制措施效果显著,与仅采取对直接密切接触者的隔离措施相比,大大降低了疫情的规模。 根据模型计算提出的常态化防控策略,可以有效控制零星突发、聚集性突发和连续输入病例所引起的疫情发展。  结论  基于模型对不同情况下的疫情演变过程进行计算,评估了常态化条件下疫情防控措施的有效性,表明次级密切接触者隔离措施对于疫情的有效防控是必要的,建议疫情发生后尽早执行密切接触者隔离和限制接触措施。     

2016-2020年浙江省一期与二期梅毒流行时空特征分析

目的 分析2016—2020年浙江省一期与二期梅毒时空分布特征，探索疫情聚集区域，为制定梅毒精准防控策略提供依据。方法 从中国疾病预防控制信息系统导出2016—2020年现住址为浙江省的一期梅毒和二期梅毒病例，利用Arcgis10.8软件建立空间分析数据库，对一期与二期梅毒疫情进行空间自相关分析，利用SaTScan 9.7软件进行时空扫描聚类分析。结果 浙江省2016—2020年共报告一期与二期梅毒33 226例，年报告发病率呈下降趋势（趋势χ2=26.136,P<0.001）；各县（区）年均报告发病率为11.65/10万（2.62/10万～40.40/10万），空间分布总体表现为东部较高、中部较低的态势；全局自相关分析结果提示一期与二期梅毒疫情呈聚集性分布（各年报告发病率Moran’s I指数均>0，均Z>1.96，均P<0.001），局部自相关分析显示存在1个空间相近的高-高聚集区域（台州市椒江区、黄岩区、三门县、临海市）和4个低-低聚集区域（分别为丽水市青田县、温州市鹿城区、瓯海区、瑞安市；金华市磐安县、东阳市；绍兴市柯桥区；衢州市龙游县）。局部G统计量热...     

2022年12月全球新型冠状病毒肺炎疫情风险评估

目的 评估2022年12月新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情全球流行情况及对我国的输入风险。方法 根据美国约翰斯·霍普金斯大学公开发布的每日COVID-19疫情数据，结合牛津大学发布的政策严格性指数，采用流行病学描述方法，通过总体概述、各大洲及重点国家疫情趋势综合评估和周边十四国疫情与防控政策综合分析，对全球COVID-19疫情风险进行综合、全面与及时的评估。对于各国评估结果，用“全球重点关注国家”、“各大洲一般关注国家”和“周边特别关注国家”予以表示。结果 与2022年11月相比，全球月新增确诊和死亡病例分别上升了38.92%和25.95%，亚洲12月每日新增确诊和死亡病例整体持续上涨。全球每新增5 000万确诊病例和50万死亡病例用时明显增加。日本、韩国、美国和法国是全球重点关注国家；巴西、阿根廷、墨西哥、毛里求斯和澳大利亚是各大洲一般关注国家；俄罗斯是周边十四国特别关注国家。结论 全球每日新增确诊病例和死亡病例12月中下旬后整体呈下降趋势，但个别区域和国家疫情仍较为突出。对于重点国家要持续加强疫情监测，同相关机构建立沟通机制，互通有无，及时预警。     

我国早期新型冠状病毒肺炎疫情传染病动力学模型分析

  目的   利用传染病动力学模型模拟我国早期新型冠状病毒肺炎的传播过程,分析和评估相关防控措施对疫情的影响。  方法  以2019年12月2日至2020年4月8日中国疾病预防控制中心传染病报告系统上报新型冠状病毒肺炎疫情数据为依据,建立动力学模型对疫情发展进行模拟分析。  结果  我国实施的交通管制措施,使R₀从疫情发展初期的4.82［95%可信区间（CrI）:4.81～4.83］降低到1.13（95% CrI:1.11～1.16）,新型冠状病毒感染者集中隔离和大规模核酸筛查等措施使R₀进一步降低到0.31（95% CrI:0.30～0.32）,模型估计得到无症状感染者的检出率为54.7%（95% CrI:45.7%～65.3%）。 保持防控措施实施的时间点不变,将无症状感染者检出率提高至75%、95%,分别能够避免新增3.4%、5.6%的感染者。 保持无症状感染者检出率不变,将防控措施实施的时间点整体前移1周、2周,分别能够避免新增78.2%、95.3%的感染者。  结论  交通管控措施显著降低了新型冠状病毒的传播速度。对感染者的集中隔离和大规模核酸筛查消除了病毒在人群中的传播。 我国实施的大规模核酸检测能够发现一半以上隐匿的无症状感染者。 相对于提高无症状感染者的检出率,防控措施的尽早实施能够避免更多的新增感染。