剪接蛋白U2AF65 基因多态性和吸烟交互作用与胰腺癌风险的关联

目的 探讨U2 小核糖核蛋白体辅助分子U2AF35 和U2AF65 功能基因多态性及其与吸烟交互作用与胰腺癌风险关联。方法 采用两阶段病例对照研究,筛查阶段采用Openarray中通量分型技术对筛选出的U2AF35 和U2AF65 基因4 个潜在功能标签单核苷酸多态性（SNP）位点在研究对象（武汉地区298 例原发胰腺癌病例和525 例非肿瘤对照）中进行基因分型;对筛查阶段的阳性位点进一步在验证人群（北京地区413 例原发胰腺癌病例和557 例非肿瘤对照人群）中采用TaqMan基因分型技术进行验证。并采用加法交互模型分析基因和吸烟交互作用对胰腺癌发生风险的影响。结果 筛查阶段U2AF65 基因的rs310441 和rs310445 与胰腺癌发病风险均存在显著关联。对rs310445 进行验证后发现,以携带TT基因型者为参照,携带C等位基因者的胰腺癌发病风险增加,合并两阶段人群的OR值为1.31（95%CI：1.07～1.60,P＝0.010）。合并人群观察到吸烟和rs310445 C 等位基因之间的协同作用可增加胰腺癌的发生风险,协同指数为2.08（95%CI：1.37～2.78）。未发现U2AF35 位点多态与胰腺癌发生风险相关。结论 U2AF65 rs310445 C等位基因与吸烟协同作用可能增加胰腺癌发生风险,但仍需大样本研究验证。     

TNFRSF11A和TNFRSF11B基因多态性与HCV感染转归的关系

目的 探索肿瘤坏死因子受体超家族成员11A（TNFRSF11A）和11B（TNFRSF11B）基因多态性与丙型肝炎病毒（HCV）感染转归的关系。方法 以2008－2016年纳入的749例持续感染者、494例自限清除者和1 486例对照者作为研究对象开展病例对照研究,利用TaqMan-MGB探针法检测TNFRSF11A rs1805034和TNFRSF11B rs2073617两个位点的基因型,分析它们在不同人群中的分布情况。结果 共显性模型结果显示,与携带TNFRSF11B rs2073617 TT基因型的个体相比,携带CC基因的个体易发生HCV感染慢性化（OR=1.517,95% CI：1.055～2.181,P=0.024）。隐性模型结果显示,与携带rs2073617 TT或TC基因型的个体相比,携带CC基因的个体易发生HCV感染慢性化（OR=1.435,95% CI：1.033～1.996,P=0.032）;相加模型显示,随着携带C等位基因个数的增加,个体发生HCV感染慢性化的风险亦可增加（OR=1.204,95% CI：1.013～1.431,P=0.035）。结论 TNFRSF11B rs2073617的基因多态性与HCV感染慢性化可能存在关联。     

细胞色素氧化酶基因CYP1A1多态性与新疆维吾尔族人群冠心病相关性研究

目的 探讨新疆地区维吾尔(维)族人群细胞色素氧化酶基因CYP1A1多态性与冠心病的关联性。方法 使用实时PCR对293例冠心病患者(病例组)和408名健康体检者(对照组)CYP1A1基因单核苷酸多态性(SNPs:rs4886605, rs12441817, rs4646422, rs1048943)进行基因型鉴定。结果 维族人群病例组和对照组rs4886605的基因型及等位基因分布的差异均有统计学意义(均P<0.05)。病例组rs4886605显性模型(CC vs. CT+TT)基因型频率明显低于对照组。调整混杂因素后logistic回归分析表明, 维族人群rs4886605的CC基因型者患冠心病风险明显低于CT+TT基因型者(总体:OR=0.368, 95%CI:0.185～0.530, P=0.018;男性:OR=0.350, 95%CI:0.235～0.568, P=0.015)。病例组和对照组rs12441817的基因型及等位基因分布差异均有统计学意义(均P<0.05)。病例组的rs12441817显性模型(TT vs. CT+CC)基因型频率明显低于对照组。调整混杂因素后logistic回归分析表明, 维族人群rs12441817的TT基因型者患冠心病风险明显低于CT+CC基因型者(总体:OR=0.253, 95%CI:0.231～0.546, P=0.016;男性:OR=0.241, 95%CI:0.132～0.478, P=0.002)。结论 新疆维族人群CYP1A1基因多态性rs4886605、rs12441817的2个位点与发生冠心病相关。rs4886605的CC基因型、rs12441817的TT基因型可能是该人群发生冠心病的保护因素。     

肥胖相关基因多态性与妊娠期糖尿病发病风险的关系

目的 探讨肥胖相关（FTO）基因及多态性位点与妊娠期糖尿病（GDM）发病风险的关系,为GDM机制研究提供线索与依据。方法 以2012年3月1日至2014年7月30日在山西医科大学第一医院产科分娩的孕妇为研究对象,将诊断为GDM的孕妇作为病例组,并按年龄、妊娠时间及居住地1：1频数匹配非GDM孕妇作为对照组,最终纳入324例病例和318例对照,提取孕妇外周血DNA并进行基因分型,应用min P检验和非条件logistic回归分析FTO基因及多态性位点与GDM发病风险的关系。结果 min P法结果显示,FTO基因与GDM发病风险无关（P>0.05）。在调整糖尿病家族史、孕前BMI且调整多重比较后,非条件logistic回归分析结果显示,在FTO基因的多态性位点中,携带rs11075995位点TT基因型与AA基因型孕妇相比（OR=0.59,95% CI：0.35～0.89）,携带rs3826169位点GG基因型与携带AA基因型孕妇相比（OR=0.59, 95% CI：0.35～0.88）,携带rs74245270位点GA基因型（OR=0.69,95% CI：0.49～0.98）、GA或AA基因型（OR=0.70,95% CI：0.50～0.97）与GG基因型孕妇相比,均是GDM的保护因素;相反,携带rs74018601位点GA基因型（OR=1.51,95% CI：1.07～2.12）、GA或AA基因型（OR=1.46,95% CI：1.06～2.02）与GG基因型孕妇相比,携带rs7205009位点AA基因型（OR=1.83,95% CI：1.18～2.86）、GA或AA基因型（OR=1.53,95% CI：1.08～2.19）与携带GG基因型孕妇相比,携带rs9888758位点AG基因型与携带AA基因型孕妇相比（OR=1.43,95% CI：1.02～2.00）,均是GDM的危险因素。结论 FTO基因rs11075995、rs3826169、rs74245270、rs74018601、rs7205009与rs9888758位点多态性与GDM的发病风险有关。     

干扰素治疗慢性乙型肝炎预后与降钙素基因相关肽及受体活性蛋白1基因多态性的关联研究

目的 探讨降钙素基因相关肽（CGRP） rs155209和受体活性蛋白1（RAMP1）rs3754701两个基因位点突变是否与干扰素治疗慢性乙型肝炎（乙肝）预后有关。方法 采用调查问卷的方法收集317例研究对象的一般资料,收集其抗凝血,提取DNA,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱实验平台进行SNPs分型,使用单因素及多因素logistic回归方法分析CGRP及RAMP1基因多态性与干扰素治疗慢性乙肝预后的关系。结果 携带RAMP1基因rs3754701T者更容易出现DNA应答和ALT应答（OR=2.277,95% CI：1.386～3.741,P=0.001;OR=1.694,95% CI：1.073～2.675,P=0.024）,而携带CGRP基因rs155209C者更不易出现DNA应答和ALT应答（OR=0.150,95% CI：0.083～0.271,P<0.001;OR=0.583,95% CI：0.367～0.925,P=0.022）。结论 在中国北方汉族人群中,CGRP基因的rs155209和RAMP1基因的rs3754701位点与干扰素治疗慢性乙肝预后有关,rs3754701T在干扰素治疗后的DNA应答和ALT应答中起保护作用,而rs155209C携带者不易出现DNA应答和ALT应答。     

CYP24A1基因多态性与绝经后女性乳腺癌的易感性研究

目的 探究CYP24A1基因多态性与绝经后女性乳腺癌风险关联。方法 采用以人群为基础的病例对照研究方法,在江苏省无锡市选取绝经后女性1 134人（589例乳腺癌患者和545例非乳腺癌患者）。采取Sequenom MassARRAY平台对CYP24A1单核苷酸多态性位点（rs2209314、rs2585428、rs2762941、rs3787555、rs4909959、rs912505和rs927650）进行分型,通过logistic回归分析CYP24A1多态性与乳腺癌的易感性,并采用广义多因子降维方法分析位点-位点之间的交互作用。结果 CYP24A1基因的rs2209314、rs2585428、rs2762941、rs3787555、rs4909959、rs912505和rs927650在共显性、显性、隐性和相加模型下均未发现与乳腺癌存在统计学关联。在腰围<80 cm的人群中,rs2585428能降低乳腺癌风险（OR=0.64,95% CI：0.42～0.96）,rs3787555也表现出相似关联（OR=0.58,95% CI：0.38～0.87）。同时rs2585428、rs3787555和rs4909959与腰围在乳腺癌发病风险存在交互作用。rs2209314、rs3787555和rs912505之间可能存在位点-位点之间的交互作用（P=0.054 7）。结论 在绝经后人群中,rs2585428和rs3787555与乳腺癌的易感性存在关联。     

PNPLA3、TM6SF2基因多态性及其与吸烟、饮酒交互作用对HBV相关肝癌的影响

目的 探讨PNPLA3、TM6SF2基因多态性及其与吸烟、饮酒交互作用对HBV相关肝癌（hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma,HBV-HCC）的影响。方法 收集2010年1月至2014年3月HBV-HCC患者、慢性乙型肝炎（乙肝）患者（CHB）、肝硬化患者（LC）以及健康体检者的血液标本,应用飞行质谱技术检测patatin样磷脂酶域3（PNPLA3）基因位点rs738409和6号跨膜超家族成员2（TM6SF2）基因位点rs58542926的单核苷酸多态性（SNP）。利用在线SNP stats寻找基因多态性的最优赋值方法;检验SNP是否符合哈-温（H-W）遗传平衡定律;采用多分类logistic回归分析PNPLA3和TM6SF2多态性及吸烟、饮酒因素对HBV-HCC的影响,采用叉生分析和二分类logistic回归分析探讨基因-基因、基因-吸烟、饮酒交互作用对HBV-HCC的影响。结果 H-W遗传平衡检验结果显示,CHB组rs738409位点的基因型频率分布不符合H-W遗传平衡定律（χ²=11.980,P<0.005）,CHB组rs58542926位点、HBV-HCC组和LC组rs738409和rs58542926位点均符合H-W遗传平衡定律;调整年龄、性别的影响后,与健康体检者相比,HBV-HCC组rs58542926突变的OR=1.659,95% CI：1.026~2.684,P=0.039。与CHB组相比,HBV-HCC组饮酒的OR=1.680,95% CI：1.121~2.519,P=0.012。与LC组相比,HBV-HCC组饮酒与吸烟的OR值（95% CI）分别为1.539（1.071~2.213）和1.453（1.005~2.099）。交互作用分析显示,HBV-HCC组与CHB+LC组相比,rs738409与rs58542926交互作用的叉生分析相加模型OR=1.548（U=1.885,P=0.029）,logistic回归相乘模型OR=1.658（P=0.024）;饮酒与rs738409的交互作用叉生分析,饮酒且rs738409突变相加模型OR=1.811（U=1.965,P=0.024）,相乘模型无统计学意义;logistic回归相乘模型吸烟与饮酒的交互作用OR=1.756（P<0.001）。结论 TM6SF2基因突变、吸烟、饮酒是HBV-HCC的危险因素,PNPLA3与TM6SF2基因都突变、饮酒并且吸烟是HBV-HCC的危险因素。PNPLA3的单基因突变可以减弱饮酒对HBV-HCC的危害。     

维生素D受体基因多态性与妊娠期糖尿病关系的病例对照研究

目的 探讨维生素D受体（VDR）基因多态性与妊娠期糖尿病（GDM）之间的关系,为GDM的机制研究提供线索与依据。方法 采用病例对照研究设计,以2012年3月1日至2014年7月30日在山西医科大学第一医院产科分娩的孕妇为研究对象,其中334例被诊断为GDM,按年龄、妊娠时间及居住地1∶1匹配相应健康对照。对研究对象进行DNA基因分型,剔除基因分型缺失率>10%者,最终323例病例和320例对照纳入研究。在共显性、显性、隐性和等位基因遗传模型下,通过非条件logistic回归分析VDR基因位点多态性和GDM之间的关系,并采用Haploview软件分析单倍型与GDM之间的关系。结果 在基因水平上,VDR基因与GDM发病风险有关（P<0.05）。在调整孕前BMI、糖尿病家族史后,rs7967152位点在共显性（AC vs. AA,OR=1.58,95%CI：1.13~2.21）、显性（AC+CC vs. AA,OR=1.58,95%CI：1.15~2.18）和等位基因（C vs. A,OR=1.41,95%CI：1.10~1.82）遗传模型下与GDM风险升高有关;rs2238140位点在共显性（AA vs. GG,OR=2.24,95%CI：1.19~4.20）、显性（GA+AA vs. GG,OR=1.48,95%CI：1.07~2.03）和等位基因（A vs. G,OR=1.43,95%CI：1.11~1.83）遗传模型下与GDM风险升高有关。在共显性和显性遗传模型下,孕妇携带rs2853564位点AG基因型、AG+GG基因型（OR=1.46,95%CI：1.04~2.05;OR=1.45,95%CI：1.05~2.00）与携带AA基因型相比,是GDM的危险因素;孕妇携带rs2853566位点AG基因型、AG+GG基因型（OR=1.43,95%CI：1.03~2.00;OR=1.41,95%CI：1.02~1.94）与携带AA基因型相比,是GDM的危险因素。在VDR基因内由rs1544410、rs7967152组成的单倍型区块,其GC单倍型与是GDM的危险因素（OR=1.50,95%CI：1.15~1.97）。结论 VDR基因rs7967152、rs2238140、rs2853564、rs2853566位点多态性和区块（rs1544410、rs7967152）GC单倍型与GDM的发病风险升高有关。     

一种新的调控型遗传变异与中国人群肺癌发病风险的关系：两阶段病例-对照研究

目的 调控型数量性状位点（regQTL）理论可以帮助研究者从三维角度评估单核苷酸多态性（SNPs）对重要生物信号的调控作用。本研究拟探讨regQTL-SNPs对肺癌易感性的影响。方法 基于regQTL理论，利用已知的肺癌regQTL-SNPs数据库，筛选出全基因组关联研究（GWAS）报道的肺癌易感区域中发挥regQTL功能的SNPs。并通过两阶段病例-对照研究（初筛阶段：2 331例肺癌病例和3 077例健康对照；验证阶段：626例肺癌病例和667例健康对照），进一步明确上述regQTL-SNPs与肺癌易感性的关联。结果 在肺癌GWAS已报道的易感区域中，共筛选出8个regQTL-SNPs。人群易感性分析的初筛阶段，研究结果显示3个regQTL-SNPs与肺癌的发病风险存在统计学关联（P<0.05），验证阶段结果显示，位于ADRA1A基因上的rs6998591突变等位基因T可以显著增加肺癌的发病风险（相加模型：OR=1.33，95%CI：1.01~1.74，P=0.040），而位于ACTA2基因上的rs11202916突变等位基因G可以明显降低肺癌的发病风险（隐性模型：OR=0.71，95%CI：0.52~0.96，P=0.026）。分层分析结果显示，rs6998591的突变等位基因T显著增加肺鳞癌的发病风险（相加模型：OR=1.53，95%CI：1.01~2.32，P=0.043），而rs11202916的突变等位基因G显著降低肺腺癌的发病风险（相加模型：OR=0.83，95%CI：0.69~0.98，P=0.031）。基因环境交互作用分析显示携带rs6998591突变等位基因T且吸烟的个体与不携带rs6998591突变等位基因T且不吸烟的个体相比，肺癌的发病风险增加235%（OR=3.35，95%CI：2.10~5.34，P<0.001）。结论 肺癌GWAS已报道的易感区域中存在2个发挥regQTL功能的SNPs，并且可以显著影响肺癌的易感性。     

间质金属蛋白酶基因多态性与中心性肥胖在非酒精性脂肪肝病中交互作用研究

目的 探讨间质金属蛋白酶-9(MMP-9)-1562C/T(rs3918242)以及MMP-2-1306C/T(rs243865)位点单核苷酸多态性(SNP)与非酒精性脂肪肝(NAFLD)遗传易感性以及与中心性肥胖交互作用。方法 对545例NAFLD患者和636例正常对照,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析rs24386以及rs3918242基因型、非条件logistic分析各基因型与脂肪肝发病易感性关系,利用非条件logistic分析和广义多因子降维(GMDR)法分析rs3918242、rs243865与中心性肥胖的交互作用。结果 MMP-9 rs3918242位点T基因携带者(TT/CT)与非T基因携带者(CC)的NAFLD罹患风险明显增加(OR=1.67,95%CI:1.32～2.12,P=0.001;调整OR=1.65,95%CI:1.31～2.01,P=0.008);而MMP-2 rs243865位点T基因携带者(TT/CT)与非T基因携带者(CC)的NAFLD罹患风险明显降低(OR=0.68,95%CI:0.53～0.86,P=0.001;调整OR=0.66,95%CI:0.49～0.90,P=0.007)。广义多因子降维法分析结果显示,rs3918242与中心性肥胖在NAFLD发病中存在交互作用(P=0.001)。利用非条件logistic校正年龄、性别、腰围、BMI、LDL-C、HDL-C、FPG、胰岛素抵抗指数后,分析显示,携带rs3918242 TT/CT基因型中心性肥胖个体罹患NAFLD的风险高于携带CC基因非吸烟个体(OR=4.50,95%CI:2.78～7.17,P=0.007)。结论 MMP-9基因的rs3918242以及MMP-2基因的rs243865与NAFLD患病罹患风险紧密相关,rs3918242与中心性肥胖在NAFLD发病中具有协同效应。     

抗结核治疗队列人群药物性肝损害的易感基因多态性研究

目的 探索药物代谢、转运和免疫反应基因多态性与中国人群抗结核药致肝损害的关联。方法 利用“中国结核病防治规划抗结核病药品不良反应研究”的人群资料和样本,构建1：4巢式病例对照研究,选择与抗结核药物所致肝损害相关的三相代谢基因以及相关免疫基因,采用TaqMan分型技术检测基因单核苷酸多态性（SNP）,结合Lasso回归和多因素条件logistic回归筛选易感基因。结果 共检测33个基因的75个SNP位点,Lasso回归和logistic回归的合并分析显示,SLCO1B1 rs4149014、HSPA1L rs2227956、STAT3 rs1053023和IL-6 rs2066992基因多态性与抗结核药致肝损害的关联有统计学意义（P<0.05）。结论 SLCO1B1、HSPA1L、STAT3和IL-6 基因可能是抗结核治疗人群发生药物性肝损害的易感基因。     

叉形头转录因子O亚型相关基因位点多态性与肝细胞癌关系

目的探讨叉形头转录因子O亚家族（forkhead box-containing protein O subfamily,FOXO）基因多态性与肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）遗传易感性的关系。方法采用以医院为基础的病例对照研究方法,选取1 049例HCC患者作为病例组,1 052例无肿瘤患者作为对照组,对照组按年龄、性别、民族与病例组频数匹配。采用高通量TaqMan MGB实时荧光定量聚合酶链式反应（real-time fluorescent guantitative polymerase chain reaction,RT-PCR）技术对FOXO1的rs17592236位点、FOXO3的rs4946936位点和FOXO4的rs4503258位点进行基因分型。应用Logistic回归模型分析上述位点单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与HCC发病风险的关系,并研究基因多态性与环境因素的交互作用。结果 rs17592236、rs4946936和rs4503258位点基因型在病例组和对照组中分布差异均无统计学意义（均有P〉0.05）。多因素Logistic回归分析发现,rs17592236位点CT/TT基因型可能降低HCC发病风险[P=0.010,OR（95%CI）=0.699（0.526~0.927）]。分层分析结果显示rs17592236位点SNP与HCC发病风险存在统计学关联。交互作用分析显示,rs17592236、rs4946936、rs4503258位点多态性与吸烟、饮酒、HBV感染、肝癌家族史4种环境因素均存在交互作用,rs17592236与rs4503258位点SNPs之间存在基因-基因交互作用[P=0.003,OR（95%CI）=0.755（0.628~0.908）]。结论携带FOXO1的rs17592236位点突变等位基因T可能降低HCC发病风险。rs17592236、rs4946936、rs4503258与环境危险因素的交互作用可能与HCC发生有关。     

Sex-specific genetic association of brain and muscle Arnt-like protein-1 (BMAL1) and obesity in Chinese youth

BackgroundThe circadian clock gene brain and muscle Arnt-like protein-1 (BMAL1) regulates energy metabolism, adipocyte proliferation and differentiation, glucose metabolism, and other functions. This study aimed to examine the association of potential polymorphisms in BMAL1 with obesity among Chinese youth.MethodsA total of 2973 participants were included in this study. According to the body mass index obesity standard of China, 208 subjects were defined as experiencing general obesity. According to the waist-to-hip ratio obesity standard, 335 participants were defined as experiencing central obesity. Four single nucleotide polymorphisms (SNPs) (rs9633835, rs6486121, rs7107287, and rs12364562) were genotyped using TaqMan probe techniques.ResultsThere was no significant difference in the either genotypic or allelic frequencies between the non-general and general obesity groups, while a positive association was observed between BMAL1 rs6486121 variant and central obesity risk (CC＋CT vs. TT: OR:2.139, 95% CI:1.164–3.930; P = 0.014) after adjusting for covariates. Stratification analyses revealed significant associations with central obesity risk for rs6486121 polymorphism in women according to the additive model (CC vs. CT vs. TT: OR：1.409; 95 % CI: 1.029–1.930; P = 0.032). Haplotype analysis showed that only paired haplotypes, including rs9633835G with rs6486121T, had a significant effect on central obesity with OR (95%CI) was 1.035 (1.011–1.060) and P = 0.004.Conclusionour findings suggest that BMAL1 polymorphisms are significantly associated with central obesity and sex-specific genetic effects on BMAL1-mediated genetic susceptibility to obesity.     

母亲、子代血管紧张素原基因单核苷酸多态性与先兆子痫/子痫的关联研究

目的 探讨母亲、子代血管紧张素原（AGT）基因单核苷酸多态性（SNP）与先兆子痫/子痫的关联。方法 2008年1月至2015年10月，采用病例-父母/对照-母亲混合研究设计，调查347组病例和700组对照的基本人口学特征，并检测AGT相关SNP的基因型，运用对数线性模型及非条件logistic回归的方法分析母亲、子代AGT各SNP与先兆子痫/子痫的关联。结果 当子代rs3789679基因型为GA和AA时，其母亲发生先兆子痫/子痫的风险降低（OR=0.73，95% CI：0.55~0.96；OR=0.62，95% CI：0.39~0.98）；当子代rs2493132为TT基因型时，其母亲发生先兆子痫/子痫的风险增加（OR=1.60，95% CI：1.08~2.37），此结果经多重检验校正后无统计学意义。遗传模型分析显示，子代rs3789679在显性模型下（GA+AA/GG）降低了其母亲发生先兆子痫/子痫的风险（OR=0.73，95% CI：0.55~0.96）；子代rs2493132在隐性模型（TT/CT+CC）下增加了其母亲发生先兆子痫/子痫的风险（OR=1.66，95% CI：1.13~2.44）；母亲rs5051在显性模型下（TC+CC/TT）增加了自身发生先兆子痫/子痫的风险（OR=1.33，95% CI：1.01~1.76）。结论 在显性遗传模型下，子代rs3789679 GA和AA基因型降低了其母亲发生先兆子痫/子痫的风险，母亲rs5051 TC和CC基因型增加了自身发生先兆子痫/子痫的风险。在隐性遗传模型下，子代rs2493132 TT基因型增加了其母亲发生疾病的风险。     

Genetic variants in IL33 and IL1RL1 genes confer susceptibility to HBV-related liver cirrhosis in Chinese Han population

IntroductionPrevious studies indicate that the IL-33/ST2 pathway is involved in hepatitis B virus (HBV) -related liver diseases. This study aimed to determine the relationship between genetic variants in IL-33/ST2 pathway with susceptibility to liver cirrhosis.Materials and methodsA total of 2632 Han Chinese samples met the inclusion and exclusion criteria, including 840 negative controls (NeC), 691 chronic hepatitis B (CHB), 680 HBV-related liver cirrhosis (LC) and 421 HBV-related hepatocellular carcinoma (HCC) (without LC) patients. Four polymorphisms (IL33-rs4742170, rs1048274, rs10975519 and IL1RL1-rs1041973) were selected and genotyping was performed. All statistical analyses were performed by SPSS21.0, mainly using the Hardy-Weinberg equilibrium test, Pearson chi-square, unconditional Logistic regression and haplotype analysis.ResultsAfter adjusting for age, sex, smoking and drinking, significant associations were observed between IL33-rs4742170, rs1048274 and rs10975519 polymorphisms with LC risk. NeC with IL33-rs4742170 CC genotype was 1.80 times more likely to develop LC compared with TT genotype, while NeC with rs10975519(TC + CC) genotype was 1.32 times more likely to develop LC when compared with the TT genotype. CHB cases with rs4742170(CC + TC) genotype had 1.30 times higher susceptibility to develop LC compared with the TT genotype. The IL33-rs1048274G allele occurred more frequently in the LC group compared with the HCC group in codominant model (AG/AA: P = 0.001, OR = 1.66, 95%CI = 1.22–2.25; GG/AA: P = 0.018, OR = 1.54, 95%CI = 1.08–2.20). The IL33 haplotype CG conformed by rs10975519C and rs1048274G was more frequent in the LC group than in the NeC group and CHB group. Moreover, the IL33 haplotype CCG conformed by rs4742170C, rs10975519C and rs1048274G was found to be more frequent in the LC group than the HCC group. However, there was no association between IL1RL1-rs1041973 and LC risk.ConclusionOur findings demonstrate the association between genetic variants in IL33 with susceptibility to liver cirrhosis. IL33-rs4742170C, rs1048274G and rs10975519C could serve as biomarkers of LC.     

Replication of genome wide association studies on hepatocellular carcinoma susceptibility loci of STAT4 and HLA-DQ in a Korean population

A recent genome-wide association study (GWAS) for hepatitis B virus (HBV)-related hepatocellular carcinoma (HCC) identified two loci (rs7574865 in STAT4 and rs9275319 in HLA-DQ) in a Chinese population. We attempted to replicate the associations between the two SNP loci and the risk of HCC in a Korean population. The rs7574865 in STAT4 and rs9275319 in HLA-DQ were genotyped in a total of 3838 Korean subjects composed of 287 HBV-related hepatocellular carcinoma patients, 671 chronic hepatitis B virus (CHB) patients, and 2880 population controls using TaqMan genotyping assay. Gene expression was measured by microarray. A logistic regression analysis revealed that rs7574865 in STAT4 and rs9275319 in HLA-DQ were associated with the risk of CHB (OR = 1.25, P = 0.0002 and OR = 1.57, P = 1.44 × 10⁻¹⁰, respectively). However, these loci were no association with the risk of HBV-related HCC among CHB patients. In the gene expression analyses, although no significant differences in mRNA expression of nearby genes according to genotypes were detected, a significantly decreased mRNA expression in HCC subjects was observed in STAT4, HLA-DQA1, and HLA-DQB1. Although the genetic effects of two HCC susceptibility loci were not replicated, the two loci were found to exert susceptibility effects on the risk of CHB in a Korean population. In addition, the decreased mRNA expression of STAT4, HLA-DQA1, and HLA-DQB1 in HCC tissue might provide a clue to understanding their role in the progression to HCC.     

基因-基因间交互作用对学龄儿童腹型肥胖的影响

目的 探讨我国学龄儿童6个肥胖相关基因多态性位点（SNPs）及其交互作用与腹型肥胖的关联。方法 以"北京市儿童青少年代谢综合征（BCAMS）研究"中1 196名肥胖儿童和2 306名非肥胖儿童为研究对象。采用盐析法从外周血白细胞中提取DNA。使用ABI Prisms^TM-7900实时荧光定量PCR仪对6个SNPs（FTO rs9939609、MC4R rs17782313、BDNF rs6265、PCSK1 rs6235、SH2B1 rs4788102和CSK rs1378942）进行分型检测。采用BCAMS基线总人群腰围的性别年龄别第90百分位值判定腹型肥胖。运用logistic回归模型分析6个SNPs与腹型肥胖的关联。采用广义多因子降维法（GMDR）模型检测6个SNPs之间的基因-基因交互作用,并使用多因素logistic回归模型验证。结果 在加性遗传模型下,调整性别、年龄、Tanner分期、体力活动和肥胖家族史后,FTO rs9939609-A、MC4R rs17782313-C和BDNF rs6265-G等位基因增加儿童腹型肥胖罹患风险（OR=1.24,95%CI：1.06~1.45,P=0.008;OR=1.26,95%CI：1.11~1.43,P=2.98×10^-4;OR=1.18,95%CI：1.06~1.32,P=0.003）。GMDR模型分析显示,在调整同样的影响因素后,MC4R rs17782313和BDNF rs6265之间交互作用的差异有统计学意义（P=0.001）,交叉验证一致性为10/10,平均检验准确度为0.539,为最优模型;logistic回归分析显示,MC4R rs17782313-C和BDNF rs6265-G可能存在正交互作用。结论 FTO rs9939609-A、MC4R rs17782313-C和BDNF rs6265-G增加儿童腹型肥胖罹患风险;MC4R rs17782313与BDNF rs6265可能存在交互作用,对学龄儿童腹型肥胖的罹患风险存在影响。     

survivin基因易感性及其单倍型与原发性肝细胞癌关系

目的探讨汉族人群中存活素(survivin)基因rs8073069及rs1042489位点与原发性肝细胞癌(HCC)的相关性,为采取干预措施提供参考依据。方法采用病例对照研究方法对在江苏省海门市10个社区收集的176例汉族HCC病例和随机匹配的196名健康汉族人群进行一般情况问卷调查以及survivin基因rs8073069和rs1042489位点基因分型。结果 rs8073069位点CC、CG、GG基因型和C、G 2个等位基因在HCC病例组的频率分别为8.52%、35.22%、56.25%2、6.14%7、3.86%,在对照组的频率分别为6.12%3、9.80%、54.08%、26.02%7、3.98%,不同遗传模式下rs8073069位点基因型和等位基因分布在HCC病例组与对照组间分布差异均无统计学意义(P>0.05);rs1042489位点CC、CT、TT基因型和C、T 2个等位基因在HCC病例组的频率分别为17.61%、55.68%、26.70%、45.45%、54.55%,在对照组的频率频率为13.78%、52.04%、34.18%、39.80%、60.20%,不同遗传模式下rs1042489位点基因型及等位基因在HCC病例组与对照组间分布差异均无统计学意义(P>0.05);多因素Logistic回归分析结果表明,在相加遗传模式下,HBsAg+和有乙肝史是HCC的危险因素r,s8073069G-rs1042489T单倍型是HCC的保护因素;不同遗传模式下环境因素与单倍型交互作用分析结果表明,显性、隐性和相加遗传模式均未发现单倍型与环境因素的交互作用(P>0.05)。结论汉族人群survivin基因rs8073069和rs10424892位点多态性与HCC的易感性无关;rs8073069G-rs1042489T单倍型是HCC的保护单倍型。