应用Protégé构建临床检验诊断学领域本体的探索

通过对临床检验诊断学领域大量概念的分析,提出若干类和属性,并以这些类和属性初步构建临床检验诊断学领域本体,由此了解临床检验诊断学领域本体的构建特点,为临床检验诊断学领域本体具体应用完善专家系统,指导临床医师和检验医师进行临床检验诊断提供必要的决策支持.     

糖尿病医案本体库的构建及应用研究

当前中医医案缺少规范统一的形式化描述方法,难以实现有效分析和检索,利用本体技术针对中医糖尿病医案进行分析和描述,通过改进的七步法构建糖尿病医案本体库,在protégé系统中完成了对本体中类实例、属性和关系的定义和实现。糖尿病医案本体库的构建步骤包括:确定本体的专业领域和范畴;复用现有的本体;收集医案书籍,获取糖尿病领域知识;定义糖尿病医案的类、属性及其关系,建立糖尿医案本体;本体的检验;本体的存储。     

中医厥证领域本体构建研究

目的 利用本体技术实现中医厥证领域知识的共建、共享及推理。方法 提取中医文献中的厥证相关知识,使用斯坦福大学提出的本体构建“七步法”,基于Protégé工具构建中医厥证领域本体,实现厥证相关知识的领域建模,并进行内部一致性检验,实现本体的推理功能。结果 构建的中医厥证领域本体共有27类,585个实例,25个对象属性,其中反向属性6个,数值属性1个,均通过了一致性检验,实现厥证领域知识的语义化表达,完成厥证知识的共建、共享和推理。结论 本研究采用本体技术,促使中医厥证领域知识的融合重组与推理,为将来中医急危重症诊疗知识库的构建、中医急危重症应急决策和辅助诊疗等系统的建立,奠定基础并提供参考。     

基于本体的孕产知识库构建及应用

将本体、知识库与孕产疾病知识结合构建基于本体的孕产知识库,阐述具体构建步骤,包括明确本体领域范围,列举概念术语,定义类、属性及类之间的关系,创建本体实例等方面,促进孕产知识复用与共享。     

基于本体的疾病知识库设计

疾病知识库是一个面向医学专业人员,同时兼顾大众的知识仓库;其目标是满足初、中级临床医师的具体需求,即在临床工作中快速查找、全面掌握繁杂的疾病、药物、辅助检查信息的需求。探讨了构建疾病知识库系统中一些相关概念,如知识库、疾病知识库、本体等,介绍了疾病知识库疾病本体结构的设计和疾病本体属性的设计。     

糖尿病领域本体构建与语义推理实现

目的：构建糖尿病领域本体库与糖尿病诊疗规则库,在此基础上实现语义推理,糖尿病领域知识的重用、潜在知识的揭示及共享,为后续糖尿病管理系统研究奠定基础,进而为基层全科医生诊疗糖尿病提供决策支持。方法：以国内糖尿病领域相关临床指南和领域专家知识为依据,抽取其中的概念以及概念之间的关系,借鉴七步法和骨架法,在斯坦福大学Protégé平台构建糖尿病领域本体,编写SWRL诊疗规则库,继而使用JESS推理机实现语义推理。结果：构建了较为完整的糖尿病领域本体库与糖尿病诊疗规则库,包含概念233条、实例205条、实例间关系16条、数值属性18条、SWRL规则28条,并在此基础上实现了语义推理。结论：构建的糖尿病领域本体能够实现语义推理任务,是将本体技术应用于慢病诊疗领域的有益探索。     

基于本体的军事活动事件知识建模研究

目的：适应军事领域知识信息化建设的需求,构建军事活动事件、军事人员、武器装备、战法等知识模型。方法：利用本体建模工具Protégé构建军事活动事件本体模型,梳理概念、属性及其关系,并给出该模型构建案例及其有效性验证。结果：提出了一种具有一般性的军事事件本体模型结构,建立了事件与事件要素之间的语义联系,并复用已建立的领域本体应用于事件本体的构建,形成统一的事件知识表示单元。结论：通过本体建模结构化表示军事活动信息,可完善及扩展军事本体模型。     

面向医学科技评价的本体模型构建研究

目的：构建面向医学科技评价的本体模型,为完善医学科技评价本体奠定基础,为医学科技评价研究数据管理系统提供支持。方法：通过分析医学科技评价需求、调研医学科技评价维度及现有科研本体研究现状,以现有医学科技评价维度和科研本体为依据,构建本体模型,并抽取其中概念及属性。借鉴骨架法和七步法,利用Protégé构建本体并进行检索及可视化展示。结果：建立了包含8类顶层模块、303条概念及21种语义关系的医学科技评价工作的本体模型,并借助Protégé进行检索及可视化展示。结论：构建医学科技评价本体能够更好地管理和组织指标数据,揭示科研网络关系,为医学科技评价研究提供新的研究角度,便于科研数据或信息资源的共享。     

随机对照试验评价的语义模型研究

目的：将随机对照试验评价的基本理论和知识整合为计算机可识别的语义模型、属性和元数据,为语义网计算机推理提供知识本体.方法：知识本体的建立以国际上公认的随机对照试验评价规范为依据,采用本体编辑工具Protégé构建语义模型的层级结构,定义类、属性及其关系和其他元数据的规范描述.结果：构建了包含一般信息、分类与分级信息和具体评价项目的语义模型,创建了51个语义属性和元数据,13个随机对照研究的评价实例.结论：构建计算机可识别和处理的随机对照试验评价本体,是网络医学文献信息逻辑推理操作的基础,也为医学研究过程提供了随机对照试验文献质量评价的形式化表达和结果推论的参考.     

基于本体的药学领域知识管理

本体作为领域知识的规范化形式语言,已成为领域知识管理的强有力工具。运用"七步法"构建思路,探讨了基于本体的药学领域知识构建和管理。     

本体在糖尿病临床决策支持系统中的应用

基于电子健康系统的临床决策支持系统（clinical decision support system, CDSS）可以辅助基层医生进行临床决策，提高诊疗效率。其中利用本体构建CDSS的医学知识库和患者数据使CDSS的推理过程和决策结果具有可解释性。本文就糖尿病治疗领域的相关本体及基于本体的CDSS的进展与挑战进行综述。首先，阐明我国糖尿病诊疗的现状与挑战为亟需提高医疗服务效率与质量；在介绍本体的相关知识后，概述使用本体构建CDSS的框架、方法及特点；然后综述国内外糖尿病治疗领域的本体及基于本体的CDSS的案例，总结其构建方法及特点；最后提出该领域的展望:将循证医学与本体相融合，构建可信的临床推荐体系是目前CDSS的发展重点。     

面向临床决策支持的中医脾胃病本体知识库构建研究

本文将本体技术、知识库、Agent技术有机地组织成一个整体,用中间表达集合对知识链进行概念化,中间表达用类对领域知识的知识实体、属性进行描述和定义,实现本体的结构化,用于规范研发中医脾胃病本体知识库与情景式临床决策探索。可以帮助临床医生从知识库中获取规律性认识,筛选出支持临床决策的直接参考证据,使之拟定更有针对性的治疗方案,提高临床疗效,并将中医脾胃病文献资源集成转化为信息知识产品,实现对中医古今脾胃病知识发现与拓展,资源共享。     

指南本体构建中的临床数据标准化问题探讨

目的：研究临床指南计算机本体的构建方法,从医学信息标准化的角度,发现临床决策支持系统（CDSS）设计和实施中可能存在的问题,并提出应对措施和建议。方法：以高血压防治指南为例,参照SAGE指南本体开发方法和路线,利用prot6g6构建高血压防治指南本体,提取决策所需的数据元素,并遵照HL7vMR模型进行规范化表达。结果：建立了高血压防治指南本体,将指南规则表示为32张流程图;提取了决策所需的139个数据元素,采用简化的HL7数据类型,分别用vMR模型规定的目标、观察、健康问题、用药等四个类的属性做规范化描述,其中目标血压的属性包括测量项目标识和目标值,分别用标准化的代码、字符串、数值等形式表示。结论：上述方法能够初步实现指南文本的结构化和标准化表示。针对文本表达不够准确、HL7等国际标准本地化等方面存在的问题,建议临床指南开发要考虑计算机识别的需要,并提出适宜的国家、国际医学信息标准的采纳建议和计划。     

中医药领域本体研究现状

对近10年来中医药领域本体研究进行文献调研、筛选和统计,梳理中医药领域现有本体相关研究进展、本体主题分布情况,总结当下中医药本体研究存在的不足,并提出建议,以期为我国中医药领域本体构建与应用提供借鉴。     

经穴治疗领域本体构建实验性研究

本体构建是语义网背景下知识组织的新方法。介绍了经络、穴位治疗领域本体构建的基本方法、流程,借助本体构建软件的检索、推理及可视化展示,检测了本体在语义关系建立、知识组织增值方面的作用,发现本体构建方法在知识组织方面具有范围广、层次深、语义丰富、关联度强等特点,便于知识重组,为科学研究提供新的角度,创造新的价值。     

临床指南模型构建中医学知识的规范化表达方法

目的：探索和研究计算机化临床指南模型构建中医学知识规范化表达的方法,为基于疾病防治指南的计算机决策支持（CDS）系统及其在个人健康管理中的应用提供借鉴。方法：以高血压为例,分析防治指南文本,构建规则、提炼出节点和医学概念;形成类的层次结构;利用protege进行本体建模,参考openEHR原型表达医学概念。结果：建立了高血压评估诊疗管理全过程的流程图。以“测量血压”为例,描述了“行为”节点类的属性;以“医学概念”中的“血压”类为例,定义其描述结构和内容：通过“行为”类的属性将实例“测量血压”关联至概念类中定义的“血压”。结论：疾病防治过程中涉及的医学概念能以结构化的形式嵌入指南模型,在此基础上构建CDS有助于减少理解分歧导致的诊疗行为变异,促进慢性病管理中各参与方的知识共享。     

“开眼界”式的检验参观在实验诊断教学中的应用

针对我校实验诊断学见习存在的弊端,在我院2005级学生的临床见习中,探讨由检验医师参与带教,开展检验参观的教学效果差异。结果显示：实验组学生的病历成绩、平时成绩、体检成绩、理论成绩和总成绩与对照组学生成绩比较,均无显著统计学差异,而标本考试成绩则优于对照组（P〈0．05）。提示检验医师参与实验诊断学带教,开展“开眼界”式的检验参观,既增加学生对现代临床实验室的感性认识,也有利于检验医师的带教能力的培养。     

基于本体的医学知识库构建方法综述

围绕基于本体构建医学知识库流程中的本体构建、诊断规则构建、本体推理机推理实现几方面,分别阐述各个环节中所涉及的关键技术和方法,列举用相关技术构建领域知识库的实例,探索构建医学领域知识库的最佳方法。     

浅谈实验诊断学教学改革

实验诊断学不完全等同于临床检验 ,也不完全等同于系统内科学 ,是基础医学与临床医学之间的一门桥梁学科 ,在临床医学中占重要地位[1] 。实验诊断学的教学对象主要为医学系学生 ,培养的是临床医师 ,而不是检验医师 ,实验诊断学教学应以临床思维能力的培养为核心 ,教会学生通过对各种实验结果的综合分析进行临床思维[2 ] 。但目前我院在这方面做得还很不够 ,学生进入临床实习前的临床思维能力仍较差。为此 ,我们认为我院实验诊断学的教学改革势在必行。现就此谈谈我们的一些想法 ,与同行们商榷。1　实验诊断学教学存在的问题1.1　从实验教学…     

基于本体的神经信息学概念及其关系研究

目的：通过构建神经信息学本体,为神经信息学研究提供良好的信息整合、知识表示、文本挖掘、智能教育和数据共享服务。方法：分析生物医学领域已有的统一医学语言系统、基因本体、癌症本体、解剖学本体、疾病本体和药物本体的结构和内容,对神经信息学领域专业概念及其关系进行了探讨,提出了神经信息学本体的设计原则、标准和规范、构建方式和基本流程,并利用Protégé工具编制本体。结果：构建了基于多层次概念语义网络的、符合网络本体语言（web ontology language,OWL）规范的神经信息学本体。结论：神经信息学本体可以从不同层次的形式化模式上给出神经信息学领域概念和概念之间相互关系的明确定义,形成清晰的神经信息学理论框架,实现对相关领域知识的共同理解。