基于生物信息学分析SLC44A4基因在乳腺癌中的表达及其临床意义

目的 通过分析生物信息数据库,探讨胆碱转运蛋白样蛋白SLC44A4基因在乳腺癌中的表达及其临床意义.方法 检索Oncomine数据库,分析SLC44A4基因在不同类型肿瘤中的表达情况;检索基因表达谱动态分析(gene expression profiling interactive analysis,GEPIA)数据库,对比乳腺癌组织与正常乳腺组织之间SLC44A4基因的表达差异,分析该基因的表达水平与乳腺癌临床病理分期的关系.利用Kaplan-Meier Plotter在线分析SLC44A4基因表达水平与乳腺癌患者预后的关系.检索肿瘤单细胞(CancerSEA)数据库分析SLC44A4基因与乳腺癌单个细胞功能状态的相关性.结果 SLC44A4在多种肿瘤组织中高表达.与正常乳腺组织相比,乳腺癌组织中SLC44A4基因的表达明显升高(P＜0.05),且不同临床病理分期和分型的乳腺癌患者SLC44A4基因表达水平比较差异有统计学意义(P＜0.05).从总体来看,SLC44A4基因高表达组总生存(overall survival,OS)期高于低表达组(P＜0.05).此外,SLC44A4基因的表达与乳腺癌细胞的侵袭、细胞周期、DNA修复呈正相关性.结论 SLC44A4基因在乳腺癌组织中高表达,与患者预后相关,并与乳腺癌细胞功能存在一定相关性.     

低级胶质瘤候选靶标及预后标志物SLC4A家族的生物信息学分析

目的采用生物信息学分析,筛选SLC4A基因家族中可作为低级胶质瘤(LGG)的候选靶标及预后标志物的基因。 方法利用TCGA、GTEx、UCSCXENA、GEPIA、cBioPortal、GeneMANIA、String等数据库,分析LGG患者SLC4A的差异表达、预后价值、遗传改变和蛋白互作等,根据数据筛选SLC4A基因家族中可作为LGG候选靶标及预后标志物的基因。 结果LGG组织中SLC4A2、SLC4A4、SLC4A7、SLC4A8表达升高,而SLC4A1、SLC4A3、SLC4A9、SLC4A10表达降低。SLC4A2、SLC4A3、SLC4A4、SLC4A7、SLC4A10在LGG肿瘤分级中表达存在显著差异。预后价值总生存率的分析发现,高表达SLC4A2、SLC4A3、SLC4A7、SLC4A8和低表达SLC4A5、SLC4A10的患者预后较差；无病生存率的分析发现,高表达SLC4A2、SLC4A3、SLC4A8和低表达SLC4A10的患者预后较差。 结论SLC4A2、SLC4A3、SLC4A7、SLC4A8、SLC4A10可能是LGG潜在候选靶标及预后标志物。     

错配修复（MMR）蛋白（MLH1、PMS2、MSH2和MSH6）表达与子宫内膜癌临床病理特征和预后相关性分析

目的 分析错配修复(MMR)蛋白表达与子宫内膜癌临床病理特征和预后相关性。方法 选取我院2018年2月至2020年5月收治的70例子宫内膜癌(UCEC)患者,采用免疫组化法对4种蛋白(MLH1、PMS2、MSH2和MSH6)表达情况进行检测,并将4种MMR蛋白中1种及以上表达缺失判定为错配修复基因缺陷(d MMR),全部阳性则判定为错配修复基因完整(p MMR)。检测UCEC患者MMR蛋白缺失情况并对其与病理特征的关系进行分析。结果 4种MMR蛋白表达均定位于肿瘤细胞核,可作为内对照;d MMR组与p MMR组年龄、病理组织学类型、临床分期及淋巴结转移等比较,差异有统计学意义(P0.05),表现为dMMR组发病年龄低、肿瘤分期低、淋巴结转移少见。结论 dMMR子宫内膜癌比例较低,且MLH1和PM52蛋白表达缺失与MSH2和MSH6相比较为多见。MLH1和PMS2、MSH2和MSH6常协同表达或缺失。MMR蛋白与UCEC临床病理特征关系密切。MMR蛋白对预测UCEC的恶性程度、临床预后及UCEC发病机制方面有指导意义。     

铜死亡相关基因SLC31A1在肾细胞癌中的功能及预后价值

目的:探讨铜死亡相关基因SLC31A1在肾细胞癌的表达水平、肿瘤浸润免疫细胞相关性及其对预后的影响，并在体外实验中验证SLC31A1在肾细胞癌中的功能。方法:采用TCGA数据库收集肾细胞癌的临床数据及铜死亡相关基因转录组数据；采用HPA数据库收集蛋白表达数据；采用ssGSEA和Spearman分析计算免疫细胞浸润水平及其与铜死亡相关基因的关系；采用R语言比较肾细胞癌患者不同临床分期中SLC31A1的mRNA表达水平差异；采用Kaplan-Meier(KM)分析探索SLC31A1对肾细胞癌预后的影响；采用COX分析判断SLC31A1是否是独立预后因素；采用RT-qPCR检测SLC31A1 mRNA的表达水平。过表达质粒调控SLC31A1在细胞中的表达后采用克隆形成及划痕实验检测调控SLC31A1后对细胞增殖侵袭能力的影响。结果:铜死亡相关基因FDX1、DLD、DBT、SLC31A1、ATP7A、GCSH、DLST、DLAT、PDHA1、PDHB在肾细胞癌中的mRNA和蛋白水平均低于正常组织(P<0.05)。SLC31A1与17种瘤内免疫浸润细胞正相关(P<0.05)。SLC3...     

转录因子SREBP1通过促进SLC16A8表达调控肿瘤酸性微环境参与结直肠癌发生发展

目的:探讨转录因子SREBP1通过促进SLC16A8表达调控肿瘤酸性微环境参与结直肠癌(CRC)发生发展的机制。方法:通过生物信息学数据库分析SLC16A8在CRC中的表达情况及其与患者预后的关系。使用RT-qPCR法检测并比较各CRC细胞系中SLC16A8的表达水平；过表达SLC16A8后使用CCK-8法检测细胞增殖活性；使用Transwell法检测细胞侵袭能力；使用Metascape数据库对SLC16A8的功能富集进行分析；使用乳酸试剂盒检测细胞上清液中乳酸水平。通过生物信息学数据库分析SLC16A8的转录因子及潜在结合位点；通过双荧光素酶实验检测SREBP1蛋白与SLC16A8相关性；通过UALCAN portal分析SREBP1 mRNA表达水平；通过Kaplan-Meier Plotter分析CRC中SREBP1表达水平与预后的关系；通过GEPIA2分析SREBP1表达水平与SLC16A8的相关性；使用Western blot分析过表达SREBP1对SLC16A8蛋白表达的影响。通过拯救实验分析SREBP1是否通过正调控SLC16A8促进乳酸转运。结果:SLC16A8高表达的...     

SLC7A11蛋白在小儿肾母细胞瘤中的表达及临床意义

目的 探讨溶质载体家族7成员11(SLC7A11)蛋白在小儿肾母细胞瘤(WT)中的表达情况及其临床意义。方法 选取103例WT患儿作为研究对象。取手术切除的癌组织及癌旁组织，采用免疫组织化学法检测组织中SLC7A11蛋白的表达情况。随访5年并记录WT患儿存活情况。比较癌组织与癌旁组织中SLC7A11蛋白的表达情况，以及不同临床病理特征WT患儿癌组织中SLC7A11蛋白的表达情况。分析癌组织中不同SLC7A11蛋白表达情况的WT患儿的预后差异，以及WT患儿预后的危险因素。结果 WT患儿癌组织中的SLC7A11蛋白阳性表达率高于癌旁组织(P<0.05)。肿瘤直径≥5 cm、肿瘤分期为Ⅲ/Ⅳ期的WT患儿癌组织中SLC7A11蛋白阳性表达率均分别高于肿瘤直径<5 cm、肿瘤分期为Ⅰ/Ⅱ期的WT患儿(均P<0.05)。癌组织中SLC7A11蛋白阳性表达的WT患儿5年生存率低于阴性表达的WT患儿(分别为45.95%、72.41%,P<0.05)。单因素COX回归分析显示，肿瘤直径、肿瘤分期、癌组织中SLC7A11蛋白表达情况均是影响WT患儿预后的因素(均P<0.05)...     

基于数据挖掘探讨GLYATL1因子对前列腺癌的影响

目的探讨Glycine-N-Acyltransferase Like 1(GLYATL1)因子对前列腺癌(prostate cancer,PCa)的影响。方法从The Human Protein Atlas中获取GLYATL1的PCa免疫组化结果。TCGA、GEPIA分析GLYATL1与PCa临床参数的意义以及预后关系。利用STRING绘制GLYATL1相关蛋白-蛋白相互作用网络(PPI),进一步与关联基因进行相关性分析。应用SPSS 25.0进行数据统计分析,Graphpad prism 5.0进行绘图。结果免疫组化显示GLYATL1高表达于癌组织且定位于细胞质。TCGA数据表明GLYATL1的表达在PCa组织、病理T分期和格林森评分有显著差异(P0.001)。GEPIA显示低表达的GLYATL1无瘤生存率显著高于高表达的GLYATL1PCa患者(Logrank p=0.016)。关联基因相关分析GLYATL1与PAOX呈正相关(r=0.2746,P 0.0001),同样的正相关性在pT分期(P0.0005)和格林森评分参数(P0.005)中也被观察到。结论 GLYATL1在PCa中高表达,可能与PAOX通过互相调控基因mRNA或蛋白表达参与PCa的发展。GLYATL1具有潜在疾病预测和生存预后判断作用。     

PDS5A在胰腺癌中的表达及预后的生物信息学分析

目的 探讨早期姐妹染色单体解离蛋白A(the percocious dissociation of sisters 5A,PDS5A)在胰腺癌中的表达及预后意义.方法 应用GEPIA在线工具分析来自TCGA数据库和GTEx项目各种恶性肿瘤及正常组织PDS5A表达情况,筛选具有统计学意义差异表达的恶性肿瘤.同时分析了PDS5A与各恶性肿瘤预后的相关性,筛选有统计学意义预后相关性的癌种.分析PDS5A的表达与胰腺癌分期及预后的关系.从TCGA数据库下载胰腺癌(RNA-seq)基因表达数据,进一步分析与PDS5A基因表达相关的差异基因,进行GO富集及KEGG富集分析.采用Western blot法检测PCNA-1(人胰腺癌细胞)、BON-1(人胰腺神经内分泌瘤细胞)、HPDE6-C7(胰腺导管上皮细胞)中PDS5A表达.结果 GEPIA分析显示PDS5A基因在胰腺癌中高表达,差异具有统计学意义,P<0.05.并且PDS5A高表达与胰腺癌患者的OS具有负相关性,P<0.05.富集分析表明PDS5A的高表达与AQP5、SPINK1、MUC6、TFF2等基因负表达有显著相关性,P<0.05.Western blot初步证实胰腺癌细胞中PDS5A表达高于正常胰腺癌细胞.结论 PDS5A基因在胰腺癌中高表达,且与患者预后显著相关,可能有望成为胰腺癌判断预后的标志物,同时可能成为治疗靶点.     

基于数据库分析COL1A2在肝细胞癌组织中的表达及对预后的影响

目的探讨Ⅰ型胶原蛋白α2(COL1A2)在肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)组织中的表达变化及其对肝癌预后的影响。方法采用生物信息学方法,通过GEPIA 2.0网络平台,利用TCGA数据分析COL1A2在正常肝组织与HCC组织中的差异表达;通过Kaplan-Meier分析COL1A2表达变化对HCC患者生存率的影响;通过UALCAN在线分析COL1A2与肿瘤分级,肿瘤分期和TP53基因突变的相关性;通过TIMER数据库分析COL1A2表达对肝癌组织免疫细胞浸润的影响;通过GEPIA 2.0网络平台在线分析HCC组织中COL1A2的表达与T淋巴细胞免疫抑制检查点PD-1、CTLA4的相关性。进一步利用GEO数据库综合分析验证COL1A2在肝癌组织的差异表达。结果 COL1A2的表达与HCC的肿瘤分级、肿瘤分期及TP53基因突变呈正相关;COL1A2在HCC组织表达明显上调;生存分析显示癌组织COL1A2的表达量与HCC患者无进展生存率(PFS)和无复发生存率(RFS)相关;COL1A2的表达虽与HCC组织CD8+T细胞浸润呈正相关,但也同时与免疫抑制检...     

Copines蛋白家族在肾透明细胞癌中的潜在预后价值

目的 探讨Copines蛋白家族(CPNEs)在肾透明细胞癌(KIRC)中的潜在预后价值。方法 在GEPIA、HPA、Kapian-Meier Plotter、cBioPortal GeneMANIA、STRING、TIMER2.0等数据库中对KIRC患者的CPNEs表达差异、生存预后、临床分期、基因突变、蛋白互作、免疫浸润等数据进行生物信息学分析和整理。结果 CPNE1、CPNE2、CPNE5、CPNE7、CPNE8在KIRC组织中表达水平均显著升高(P<0.05),CPNE3、CPNE4、CPNE6在KIRC组织中表达水平均显著降低(P<0.05),CPNE1、CPNE3、CPNE7的mRNA的表达水平与KIRC的临床分期明显相关(P<0.05)。高表达CPNE1、CPNE7的KIRC患者的总体生存率(OS)明显低于低表达的患者(P<0.05),低表达CPNE3、CPNE6的KIRC患者的OS明显低于高表达的患者(P<0.05)。此外,差异表达的CPNEs的功能主要依赖于钙依赖性磷脂结合蛋白参与的信号通路的跨膜运输和与蛋白质的相互作用。CPNEs在KI...     

SLC9A3-AS1调控miR-148a-3p/ROCK1信号轴影响肾癌细胞生物学功能

目的 检测lncRNA SLC9A3-AS1在肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma, ccRCC)组织与肾癌细胞中的表达水平,探讨其促进肾癌细胞恶性生物学行为的机制。方法 应用GEPIA2在线软件(http://gepia2.cancer-pku.cn/)分析TCGA数据库中SLC9A3-AS1在ccRCC组织中的表达水平;采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测SLC9A3-AS1在不同肾癌细胞系、24例ccRCC组织与癌旁正常肾脏组织中的表达水平;应用细胞增殖/毒性检测试剂盒(cell counting kit-8,CCK-8)和Transwell小室迁移实验检测敲低SLC9A3-AS1表达对肾癌细胞增殖与迁移的影响;应用蛋白质免疫印迹法检测增殖与迁移相关信号通路蛋白的表达水平;采用双荧光素酶报告基因实验验证SLC9A3-AS1与miR-148a-3p/ROCK1轴的靶向调控关系。结果 GEPIA2软件分析结果显示,相较正常肾脏组织,SLC9A3-AS1在肾透明细胞癌组织中表达显著上调(P<0.01)。qRT-PCR结果显示,...     

结肠癌组织中THBS2、SLC11A1基因表达及与TANs浸润的关系

目的 分析结肠癌组织中血小板反应蛋白2(THBS2)、溶质载体家族11成员1(SLC11A1)表达及与肿瘤相关性中性粒细胞（TANs）浸润的关系。方法 选取2020年1月—2022年4月在泉州市第一医院进行手术切除的120例结肠癌患者的肿瘤组织及癌旁组织,用免疫组化法检测结肠癌组织及癌旁组织中THBS2、SLC11A1表达,收集患者临床病理特征,分析THBS2、SLC11A1表达与结肠癌患者临床病理特征的关系,分析THBS2、SLC11A1与TANs浸润密度的相关性。结果 THBS2在结肠癌组织中主要表达于细胞质,SLC11A1在结肠癌组织中主要表达于细胞膜中,染色均呈现棕黄色;相较于癌旁正常组织,结肠癌组织中THBS2表达明显降低,SLC11A1表达明显升高。结肠癌组织THBS2表达与分化程度、淋巴结转移、TNM分期、血管浸润具有明显相关性（P<0.05）;结肠癌组织SLC11A1表达与淋巴结转移、肿瘤浸润深度、病理分型、TNM分期、血管浸润具有明显相关性（P<0.05）。结肠癌组织中THBS2表达与TANs浸润密度呈负相关（r=-0.444,P<0.05）,SLC...     

基于数据库挖掘分析BUB1基因在卵巢癌中的表达及意义

目的探讨BUB1在卵巢癌(Ovarian cancer, OV)中的表达及与预后的关系。方法利用Oncomine数据库挖掘BUB1在各种肿瘤中的表达;通过GEPIA数据库分析BUB1在卵巢癌组织中的表达,采用Kaplan-Meier数据库分析BUB1在卵巢癌中的预后价值;通过Coexpedia数据库构建BUB1在卵巢癌中的共表达基因网络,并用FunRich软件对score>13的共表达基因注释。利用WebGestalt对其进行KEGG通路富集分析。按score高低筛选出关键基因,GEPIA进一步分析BUB1与关键基因的相关性。结果 (1)从Oncomine数据库检索出BUB1基因相关研究424项,其中高表达85项,低表达15项。(2)GEPIA分析表明,BUB1在卵巢癌组织中的表达高于正常组织(P<0.05)。(3)Kaplan-Meier数据库分析结果显示,BUB1基因低表达的卵巢癌患者总生存期(HR=1.2,P<0.05)增加。(4)BUB1的共表达基因主要有AURKA、DLGAP5、KIF2C、TPX2、BUB1B、DEPDC1、KIF23、CDCA3、TTK、...     

蛋白激酶CI的表达与胰腺癌的相关性分析

目的 研究蛋白激酶CI(PRKCI)在胰腺癌组织中的表达,阐明其对胰腺癌的诊断及预后的作用,并进一步分析PRKCI与肿瘤微环境中免疫细胞浸润的相关性。方法 利用Oncomine、GEPIA、HPA和CCLE数据库分别分析PRKCI在胰腺癌组织和细胞系中的表达,利用GEPIA分析PRKCI的表达与胰腺癌患者预后的关系,利用String数据库分析与PRKCI相互作用的蛋白,利用TIMER研究PRKCI的表达与肿瘤纯度和免疫细胞浸润的相关性。结果 胰腺癌组织中PRKCI mRNA和蛋白的表达水平均高于癌旁正常胰腺组织,且PRKCI在胰腺癌细胞系中呈高表达。PRKCI高表达的胰腺癌患者的总生存期和无病生存期明显低于低表达患者(P<0.01),且与胰腺癌患者的分期显著相关。与PRKCI相互作用的蛋白有CDC42、NUMB、SQSTM1等,主要参与炎症反应、蛋白质磷酸化等过程。胰腺癌中PRKCI的表达与CD4⁺T细胞数目、PD-L1基因和CTLA-4基因的表达呈负相关性。结论 PRKCI在胰腺癌中呈高表达,PRKCI mRNA的表达水平与患者的预后和免疫细胞浸润显著相关,其可能成为治疗胰腺癌的潜在靶点。     

基于生物信息学分析FAM83H-AS1在乳腺癌中的表达及临床意义

目的 通过生物信息学分析FAM83H-AS1在乳腺癌中的表达及其对临床治疗和预后评估的意义。方法 下载癌症基因组图谱（the Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库中多种肿瘤表达资料,采用R语言分析FAM83H-AS1在多种癌症中的表达情况。单独分析FAM83H-AS1在乳腺癌中的表达情况,并通过基于基因表达水平值的交互式分析平台（Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA）在线数据库验证表达情况。利用TCGA数据库下载并分析生存资料,明确FAM83H-AS1表达水平与乳腺癌患者预后的关系,并利用GEPIA及Kaplan-Meier Plotter进行双重验证。同时利用TCGA临床信息分析FAM83H-AS1与临床病理分期的关系,运用R语言分析FAM83H-AS1与肿瘤微环境、免疫检测点相关基因及肿瘤突变负荷（tumor mutation burden,TMB）的相关性,并进行基因集富集分析（gene set enrichment analysis,GSEA）。结果 FAM83H-AS1在多种癌症中表达异常,其中在乳腺癌中的表达显著升高,且高表达FAM83H-AS1的乳腺癌患者总生存率显著降低。此外,不同临床分期的乳腺癌患者FAM83H-AS1的表达水平不同。FAM83H-AS1与乳腺癌样本中的基质细胞评分及免疫细胞评分均呈负相关,与一些免疫检测点相关基因表达具有相关性,TMB雷达图结果提示FAM83H-AS1在乳腺癌中的表达与TMB存在正相关性,GSEA结果提示FAM83H-AS1的表达与错配修复功能呈正相关性。结论 FAM83H-AS1基因在乳腺癌中高表达,与患者的不良预后、临床病理分期、肿瘤微环境及TMB均有相关性。同时FAM83H-AS1与免疫检测点相关的一些基因及错配修复基因存在相关性,以上可能为临床乳腺癌的治疗、预测预后及基因靶向药物的研制提供理论依据。     

MAD2L1/CAMK2A/PTTG1基因簇失调维持子宫内膜癌干性特征

目的 研究子宫内膜癌(UCEC)的干性特征及潜在调控机制。方法 从癌症基因组图谱数据库中获取UCEC转录组测序数据。在R3.5.1环境下,采用edgeR包对基因表达谱进行标准化。基于一类逻辑回归机器学习算法计算各UCEC样本的mRNA干性指数(mRNAsi)。采用survival包和survminer包计算mRNAsi和候选基因的预后意义。基于高频子通路挖掘算法(HiFreSP)对差异基因进行子通路预后识别。通过WGCNA包构建基因共表达网络,分析关键基因模块。利用clusterProfiler包进行功能注释及通路富集分析。利用人类蛋白图谱数据库进行免疫组织化学验证。结果 UCEC样本mRNAsi显著高于正常组织(t=25.095,P<0.001),分化程度越低,mRNAsi越高,mRNAsi随肿瘤分期逐渐上调。预后分析表明,mRNAsi评分越高,UCEC患者总生存期越短(χ²=6.864,P=0.0088),mRNAsi高低组别之间存在570个特异变化差异基因。通过HiFreSP算法富集并识别出卵母细胞减数分裂的子通路及细胞周期子通路具有显著预后意义。这些通路共包含MAD2L1、CAMK2A、PTTG1、PLK1、CCNE1、CCNE2、ESPL1、CDC20、CCNB1、CCNB2、SMC1B等11个差异基因,均与患者预后显著相关。基因共表达网络分析结果显示,mRNAsi与3个基因模块密切相关,MAD2L1、CAMK2A、PTTG1也分别与上述模块高度相关。免疫组织化学结果表明,MAD2L1及PTTG1在UCEC组织中高表达,而CAMK2A在UCEC中下调,该趋势与转录组测序结果一致。结论 本研究基于机器学习刻画了UCEC的干性特征,识别预后相关子通路,并发现MAD2L1、CAMK2A、PTTG1等基因簇与UCEC的干性特征密切相关,为揭示UCEC干性特征调控机制及发现潜在治疗靶点提供线索。     

PCNA在子宫内膜癌组织中的表达及临床意义

目的 探讨增殖细胞核抗原(PCNA)基因在子宫内膜癌(UCEC)组织中的表达及与临床病理特征及潜在的生物学功能的关系。方法 通过肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库获取PCNA mRNA在UCEC中的表达数据及相关病理参数。收集2020年1月至2022年12月通过术后病理确诊的UCEC组织标本20例和正常内膜组织标本20例。免疫组化技术检测PCNA蛋白在上述组织中的表达。采用单因素Cox回归、多因素Cox回归分析PCNA基因在UCEC患者中的预后价值。利用TIMER数据库分析PCNA基因与免疫细胞浸润的关系。利用基因集富集分析(GSEA)预测PCNA表达的相关通路。利用STRING在线分析以PCNA为中心相关蛋白之间的相互作用。结果 PCNA基因mRNA和编码蛋白在UCEC组织中表达水平上调(P<0.001),且具有诊断价值。免疫组化染色显示,PCNA蛋白在UCEC细胞核中高表达。Cox回归分析结果显示年龄、临床分期、主要治疗结果、病理分级、残留组织、组织学分级、肿瘤侵袭度、放射治疗可作为UCEC潜在的预后因素。PCNA表达水平与免疫浸润细胞的丰度相关。GSEA预测结果显示PCNA高...     

长链非编码RNA SLC7A11-AS1在胃癌组织中表达及临床意义

【摘要】 目的 探讨长链非编码RNA SLC7AU-AS1在人胃癌中的表达及临床意义。方法 收集2016年1月? 2018年6月手术治疗78例胃癌患者胃癌组织标本。采用实时荧光定量聚合酶链反应法(RT-qPCR)检测3株胃癌细胞 系和1株正常胃粘膜细胞细胞系SLC7A11-AS1的表达水平。结果 胃癌组织中SLC7A11-AS1的相对表达量低于癌 旁组织；SLC7AU-AS1表达量与大体分型、TNM分期相关；多因素Logistic回归分析，胃癌侵袭与T分期、N分期、 SLC7A11-AS1表达水平相关；低表达SLC7A11-AS1组患者OS为(21. 78±3. 16)个月低于高表达SLC7A11-AS1组患 者平均OS为(34.23 ±3. 48)个月；SLC7AU-AS1组织表达水平对胃癌诊断的特异性为82.10%,敏感性为53.80% (AUC=0. 69,P=0.042)。结论 SLC7A11-AS1可能作为抑癌基因参与胃癌的发生、发展，特别是参与胃癌的侵袭、迁 移过程，低表达SLC7A11-AS1可作为不良预后指标，为胃癌诊断、预后判断提供重要参考依据。     

基于生物信息学分析人TXNDC12基因在肝细胞癌的预后价值和作用机制

目的 探讨人硫氧还原蛋白结构域蛋白12(thioredoxin domain-containing 12,TXNDC12)基因在肝细胞癌中的表达情况、临床价值以及TXNDC12参与肝细胞癌发生、发展的机制。方法 基于TIMER2.0和GEPIA数据库分析TXNDC12在肝细胞癌组织和正常组织的表达差异;选用GEPIA数据库、TCGA数据库分析TXNDC12表达与肝细胞癌患者病理分期和生存预后的关系;选用Linked Omics数据库分析TXNDC12在TCGA-LIHC中共表达基因;进一步探究TXNDC12在肝细胞癌中发生、发展的上游调控机制,分析TCGA-LIHC中TXNDC12的甲基化探针与基因表达水平和患者临床预后的相关性。再选用TCGA-LIHC分析TXNDC12与免疫细胞的相关性。结果 生物信息学分析表明TXNDC12在肝细胞癌组织中的表达显著高于正常组织。随着肿瘤分期的进展,TXNDC12的表达量明显升高,在肝细胞癌患者中TXNDC12高表达患者总体生存期明显低于低表达患者,且预后模型具有显著的预测效果。与TXNDC12正相关的差异性表达基因有PPIH、MAGOH和BTF3...     

SLC22A1低表达与肝癌患者的不良预后相关：303例报告

目的评估SLC22A1在肝癌患者中的表达及其对预后的影响。方法使用303例肝癌（HCC）和匹配的癌旁肝组织（ANLTs）
标本构建组织芯片并进行免疫组化染色（IHC）,两名病理医生对SLC22A1的表达进行评分。评分范围为1到12分,总分>6为
高表达组,总分≤6为低表达组。分析SLC22A1表达量与患者的临床病理特征的关系。结果所有ANLTs的IHC评分均为12分,
肝癌中仅29例（9.6%）为12分。根据患者HCC的IHC评分将其分为两组：59%（180/303）为低表达组（评分≤6）;41%（123/303）
为高表达组（评分>6）。低表达组的无瘤生存率（DFS）和总体生存期率（OS）均显著低于高表达组。低表达组的1、3、5年DFS分
别为43%,31%和27%,高表达组为58%,47%和43%。低表达组的1、3、5年OS分别为66%,38%和32%,高表达组为80%,57%
和50%。SLC22A1的低表达与肿瘤直径,BCLC分期,肿瘤分化和AFP水平相关（P<0.05）。SLC22A1低表达是影响总体生存
的独立预后因子（HR,1.454;95% CI,1.050~2.013）。结论SLC22A1低表达是肝细胞癌的恶性特征和潜在不良预后的标志。