深圳市汉族人群转化生长因子β1基因位点多态性与结核病的相关性研究

目的 检测深圳市汉族人群TGF β1基因rs4803455位点单核苷酸多态性（SNP）的基因类型,探讨其基因多态性与不同临床表现的结核病之间的关系。
方法 采用基于TaqMan探针技术的实时荧光PCR法,检测373例结核病患者（结核组）和350名健康人（对照组）TGF β1基因rs4803455位点的等位基因型并分层分析,然后观察结核组中有病理学或者细菌学证据的肺结核患者（肺结核组）和结核性胸膜炎患者（结核性胸膜炎组）等位基因频率差异。 结果 rs4803455位点等位基因C/A频率在结核组373例A为31.8%（237/746）,C为68.2%（509/746）;对照组350名A为40.6%（284/700）,C为59.4%（416/700）;两组间差异有统计学意义（χ²=12.139,OR=1.466,95%CI=1.182～1.819,P=0.000）。年龄≤25岁的结核组121例A为33.5%（81/242）,C为66.5%（161/242）;对照组111名A为41.0%（91/222）,C为59.0%（131/222）;两组间差异无统计学意义（χ²=2.807, OR=1.381,95% CI=0.946～2.015, P=0.094）。年龄＞25岁的结核组252例,A为31.0%（156/504）, C为69.0%（348/504）;对照组239名,A为40.4%（193/478）,C为59.6%(285/478);两组间差异有统计学意义（χ²=9.511,OR=1.511,95%CI=1.162～1.965, P=0.002）。有病理学或者细菌学证据的肺结核组111例,A为32.4%（72/222）,C为67.6%（150/222）;结核性胸膜炎组57例,A为21.1%（24/114）,C为78.9%（90/114）;对照组350名A为40.6%（284/700）,C为59.4%（416/700）;前两组分别与对照组比较,差异均有统计学意义（χ²值分别为4.710、15.879,OR值分别为1.422、2.560,95%CI分别为1.034～1.957、1.592～4.116,P值均<0.05）。等位基因C在肺结核组中的频率［78.9%（90/114）］比在结核性胸膜炎组中的频率［67.6%（150/222）］高。 结论 TGF β1基因rs4803455位点的基因多态性和结核病特别是结核性胸膜炎有关,等位基因C可作为预测结核病特别是结核性胸膜炎的危险因素,其中在年龄＞25岁的患者中预测作用更大。     

汉族人群乙型肝炎病毒感染者外周血IL-28B基因多态性研究*

目的 分析乙型肝炎病毒（HBV）感染者外周血IL-28B基因型和等位基因频率分布,并探讨其与疾病病程和进展的关系。方法 本研究纳入江苏籍汉族健康人群145例和453例HBV感染者,后者包括无症状HBV携带者（ASC）45例,慢性乙型肝炎患者（CHB）181例,肝硬化（LC）患者69例,肝细胞癌（HCC）患者79例,乙型肝炎肝衰竭（LF）患者79例,采用PCR法和直接测序法检测外周血IL-28B基因rs12979860和rs8099917多态性位点。采用Pearson x²检验对IL-28B rs8099917与rs12979860位点进行Hardy-Weinberg平衡检验,计量资料以（x±s）表示,计数资料采用例数表示。应用SPSS 17.0软件进行方差分析、x²检验和Binary Logistic回归分析。结果 IL-28B基因rs12979860位点有CC、CT和TT 3个基因型,LF患者CC型和C等位基因频率分别为96.2%和98.1%,显著高于健康人群的87.6%和93.1%（OR=0.257,95%CI=0.068~0.973,P=0.045;OR=0.255,95%CI=0.070~0.928,P=0.038）;IL-28B基因rs8099917位点有TT 、TG和GG 3个基因型,LC患者TT型和T等位基因频率分别为92.8%和96.4%,显著高于健康人群的86.2%和92.4%（OR=0.288,95%CI=0.087~0.948,P=0.041;OR=0.299,95%CI=0.096~0.926,P=0.036）。结论 江苏地区汉族人群IL-28B基因多态性与HBV感染后不同疾病表型相关,IL-28B基因rs12979860的C等位基因和IL-28B基因rs8099917的T等位基因可能是HBV感染后病情进展的影响因素。     

皖南地区HLA-Brs34933313基因多态性与肾综合征出血热的相关性分析

目的 探讨皖南地区汉族人群HLA-B基因单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)rs34933313与肾综合征出血热(Hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)的相关性。方法 采集HFRS患者14例(病例组)和健康组50例(对照组)新鲜血样,提取基因组DNA,通过等位基因特异引物-聚合酶链反应(ASP-PCR)对HLA-B基因位点分型,应用SPSS22.0统计分析其等位基因及基因型两组间的差异。结果 HLA-B基因rs34933313位点受试人群分布符合哈迪-温伯格(Hardy-Weinberg,H-W)遗传平衡,两组等位基因G、C(χ²=4.38,OR=2.45,P=0.04)和基因型GG、GC、CC(χ²=6.47,P=0.04)频率分布差异均有统计学意义;病例组中C等位基因的分布频率高于G等位基因,且携带C等位基因罹患HFRS的概率是G等位基因的2.45倍;亚组分析发现 HLA-B基因rs34933313位点在显性遗传模型下(χ²=6.45,P=0.01,OR=10.21,95%CI=1.24~84.18)与HFRS发病风险具有相关。结论 皖南地区汉族人群HLA-B基因rs34933313位点与HFRS发病风险存在相关性,且携带C等位基因者会提高HFRS的发生风险。     

环氧化酶2基因多态性与大动脉粥样硬化型脑梗死患者预后的相关研究

目的探讨环氧化酶2(COX-2)基因rs20417和rs5275 2个位点多态性与服用阿司匹林治疗的大动脉粥样硬化型脑梗死患者临床预后的相关性。方法入选南京卒中注册系统中2009年12月²012年10月确诊为大动脉粥样硬化型脑梗死、并长期服用阿司匹林的患者962例。应用改进的多重连接酶检测反应技术分析COX-2基因2个位点的基因型。平均随访(15.13±7.42)个月,记录主要终点事件。结果 rs20417和rs5275最小等位基因频率分别为5.1%、19.1%。随访期间,有89例(9.25%)发生主要终点事件。rs20417位点CC+CG型与GG型主要终点事件发生率比较,差异无统计学意义(HR=0.92,95%CI:0.442012年10月确诊为大动脉粥样硬化型脑梗死、并长期服用阿司匹林的患者962例。应用改进的多重连接酶检测反应技术分析COX-2基因2个位点的基因型。平均随访(15.13±7.42)个月,记录主要终点事件。结果 rs20417和rs5275最小等位基因频率分别为5.1%、19.1%。随访期间,有89例(9.25%)发生主要终点事件。rs20417位点CC+CG型与GG型主要终点事件发生率比较,差异无统计学意义(HR=0.92,95%CI:0.44¹.89,P=0.81)。rs5275位点AA型与AG+GG型主要终点事件发生率比较,差异无统计学意义(HR=1.17,95%CI:0.761.89,P=0.81)。rs5275位点AA型与AG+GG型主要终点事件发生率比较,差异无统计学意义(HR=1.17,95%CI:0.76¹.79,P=0.48)。多因素Cox风险比例模型分析,男性患者预后较好,rs20417C等位基因和rs5275G等位基因携带者与预后不相关(P>0.05)。结论 COX-2基因rs20417和rs5275位点多态性可能与大动脉粥样硬化型脑梗死患者临床预后无关。     

缺血性脑卒中患者与健康人群临床特征及基因多态性比较分析

目的研究缺血性脑卒中患者与健康人群临床特征以及血小板内皮细胞黏附分子1(PECAM1)基因rs1867624位点、平滑肌蛋白1(LMOD1)基因rs2820315位点、蛋白C受体(PROCR)基因rs867186位点多态性差异。方法纳入2014年5月至2017年10月首都医科大学附属北京天坛医院收治的缺血性脑卒中患者326例,正常体检对照者432例,收集基本资料及临床信息。利用Real-time PCR方法,使用TaqMan探针对两组人群目标单核苷酸多态性(SNP)位点进行基因分型。结果观察组与对照组年龄、体质量指数、收缩压、舒张压、甘油三酯、总胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇、高密度脂蛋白胆固醇、空腹血糖、糖化血红蛋白比较差异均有统计学意义(t/Z/χ²=-9.738、-6.006、12.144、-6.691、-10.451、8.303、3.879、17.967、-9.328、-7.675,P<0.05)对缺血性脑卒中患者及对照组基因型频率及等位基因频率分析显示,两组人群中PECAM1基因rs1867624位点、LMOD1基因rs2820315位点、PROCR基因rs867186位点多态性分布差异均无统计学意义(χ²=0.184、0.132、2.353、2.342、0.694、0.052,P>0.05)。结论缺血性脑卒中人群与健康人群rs1867624、rs2820315、rs867186三个SNP位点的基因多态性无显著差异。     

Toll样受体基因多态性与福建籍非人类免疫缺陷病毒相关隐球菌性脑膜炎易感性的关联分析

目的:探讨Toll样受体(Toll-like receptor,TLR)基因多态性与福建籍非人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)相关隐球菌性脑膜炎易感性的关联。方法:纳入2016年10月至2019年4月在上海市复旦大学附属华山医院和福建省福州市联勤保障部队第九〇〇医院仓山院区住院治疗的101例福建籍非HIV相关隐球菌性脑膜炎患者为病例组,270名福建籍门诊健康体格检查者为健康对照组。提取患者基因组DNA,采用多重SNaPshot单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)分型技术,对既往文献报道的与疾病相关但未得到充分验证的8个TLR SNP位点进行基因分型。分别比较病例组和健康对照组、无易感因素患者组和健康对照组TLR基因多态性的分布差异。统计学分析采用χ²检验或Fisher确切概率法。结果:除TLR1 rs5743563外,TLR1 rs5743604、TLR2 rs3804099、TLR4 rs1927907、TLR6 rs3796508、TLR6 rs5743794、TLR9 rs164637、TLR9 rs3521407个TLR SNP检测位点的等位基因频率分布均符合哈迪-温伯格平衡。病例组与健康对照组比较发现,TLR2 rs3804099位点的T/T基因型[52.5%(53/101)比40.4%(109/270),比值比(odds ratio,OR)=1.63,χ²=4.378,P=0.036]和TLR6 rs5743794位点的G/G基因型[44.6%(45/101)比32.2%(87/270),OR=1.69,χ²=4.877,P=0.027]为隐球菌性脑膜炎的风险基因型;而TLR6 rs3796508的G/G基因型[83.2%(84/101)比92.6%(250/270),OR=0.40,χ²=7.271,P=0.007]和TLR9 rs164637的C/C基因型[96.0%(97/101)比100.0%(270/270),Fisher确切概率法,P=0.005]为隐球菌性脑膜炎的保护性因素。101例患者中有70例无易感因素。无易感因素患者组与健康对照组比较发现,TLR6 rs5743794位点的G/G基因型[52.9%(37/70)比32.2%(87/270),OR=2.36,χ²=10.216,P=0.001]为隐球菌性脑膜炎的风险基因型,TLR6 rs3796508的G/G基因型[81.4%(57/70)比92.6%(250/270),OR=0.35,χ²=7.906,P=0.005]和TLR9 rs164637的C/C基因型[97.1%(68/70)比100.0%(270/270),Fisher确切概率法,P=0.042]为隐球菌性脑膜炎的保护性因素。结论:TLR基因多态性与福建籍非HIV相关隐球菌性脑膜炎的易感性密切关联,提示TLR在隐球菌性脑膜炎的发病过程中可能起到重要作用。     

新疆哈萨克族人群结核病易感基因的病例对照研究

目的研究自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(NRAMPl)基因3′端非编码区(3′UTR)和维生素D受体(VDR)基因FokI、TaqI位点多态性与新疆哈萨克族人群结核病易感性的关联;分析NRAMPl基因和VDR基因交互作用对新疆哈萨克族人群结核病易感性的影响。方法采用病例对照研究方法,选取新疆哈萨克族活动性肺结核病患者213例,同地区同种族健康者211例。用聚合酶链反应 限制性片断长度多态性(PCR RFLP)分析方法对NRAMP1基因3′UTR、VDR基因FokI和TaqI多态性位点基因分型,采用χ2检验分析3个位点多态性与新疆哈萨克族结核病易感性的关系,相乘模型分析NRAMPl基因和VDR基因交互作用。结果1. NRAMPl基因3′UTR位点在病例组和对照组中TGTG/TGTG、TGTG/del和TGTGdel/del基因型频率分别为64.8%、29.6%、5.6%和79.1%、19.5%、1.4%。TGTGdel等位基因组间分布差异有统计学意义(χ2=13.737,P<0.01)。2. VDR基因FokI位点在病例组和在对照组中FF、Ff和ff基因型频率分别为33.8%、45.1%、21.1%和47.9%、41.7%、10.4%。f等位基因频率组间分布差异有统计学意义(χ2=13.868,P<0.01);TaqI位点TT、Tt和tt基因型组间分布差异无统计学意义;等位基因T和t组间分布差异无统计学意义(χ2=1.267,P>0.05);D'=0.477,r2=0.01,两位点不存在连锁不平衡。3. NRAMP1基因和VDR基因存在正交互作用,ORint=1.62。结论1. TGTG/del和TGTGdel/del基因型、TGTG缺失等位基因可能是新疆哈萨克族人群结核病易感基因。2. VDR基因中FokI多态性与新疆哈萨克族结核病易感性有关联,等位基因f可能是新疆哈萨克族结核病易感基因。3. NRAMP1和VDR基因间交互作用可能增加新疆哈萨克族人群结核病的发病风险。     

VDR-Taq Ⅰ、Fok Ⅰ位点多态性与宁夏人群结核易感性研究

目的 探讨维生素D受体（VDR）基因TaqⅠ、FokⅠ位点基因多态性与宁夏回族自治区人群肺结核易患性之间的关系。 方法 搜集宁夏南部8个地区2010年7-11月确诊的肺结核患者993例（简称“病例组”）,其中男550例,女443例;同期选择来源地区,与病例组性别相同、民族相同、年龄相当、居住环境相匹配的确认无肺结核的健康人880名（简称“对照组”）,其中男485名,女395名。将聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）检测VDR基因多态性的方法,应用于人群结核病易感性的病例-对照研究。用SPSS 16.0 软件对检测结果进行数据统计,各基因型与结核易感性关系用单因素分析和多因素logistic回归分析,以P<0.05为差异有统计学意义。 结果 VDR-TT、Tt、tt基因型在病例组和对照组中分布频率分别为83.0%（815/982）、15.2%（149/982）、1.8%（18/982）和84.7%（739/872）、14.7%（128/872）、0.6%（5/872）,病例组与对照组差异有统计学意义（χ²=6.15,P=0.046）。VDR-FF、Ff、ff基因型病例组和对照组分布频率分别为32.4%（316/976）、47.9%（468/976）、19.7%（192/976）和28.5%（245/861）、53.3%（459/861）、18.2%（157/861）,病例组和对照组分布差异无统计学意义（χ²=5.41,P=0.067）。在显性基因模型中,VDR-（TT+Tt）、tt基因型病例组和对照组中分布频率分别为98.2%（964/982）、1.8%（18/982）和99.4%（867/872）、0.6%（5/872）,病例组和对照组中分布差异有统计学意义（χ²=5.98,P=0.014;OR=0.98、3.19,95%CI＝0.978~0.997、1.193~8.574）;在纯合基因模型中VDR-（FF+ff）、Ff基因型在病例组和对照组中频率分别为52.0%（508/976）、48.0%（468/976）和46.7%（402/861）、53.3%（459/861）,病例组和对照组分布差异有统计学意义（χ²=5.27,P=0.022;OR=1.12、0.89,95%CI＝1.023~1.298、0.822~0.985）。 结论 在宁夏人群中,肺结核易患性可能与VDR-TaqⅠ、FokⅠ位点多态性有关联,VDR-（FF+ff）、tt基因型可能是罹患肺结核的危险因素,而VDR-（TT+Tt）、Ff基因型可能是保护因素。     

载脂蛋白M基因rs707921位点多态性与冠心病易感性的关系

目的检测载脂蛋白M(ApoM)基因rs707921位点的基因多态性,探讨其与冠心病(CHD)的相关性。方法采用单荧光标记探针技术检测111例CHD患者及248例对照组的ApoM rs707921位点单核苷酸多态性,分析其基因型和等位基因频率的分布情况。结果 ApoM rs707921位点3种基因型(AA型、AC型和CC型)在CHD组中分布频率为1.8%、13.5%和84.7%,在对照组中分布频率为2.0%、25.4%和72.6%,两组差异有统计学意义(P=0.039);ApoM rs707921位点A、C等位基因的频率在CHD组和对照组中分布频率分别为8.6%、91.4%和14.7%、85.3%,两组比较差异有统计学意义(P=0.023)。CHD组中AC+AA基因型者甘油三酯水平显著低于CC基因型者(P=0.043)。CHD组rs707921位点多态性不同基因型间冠状动脉病变严重程度差异无统计学意义(P0.05)。结论ApoM基因rs707921位点A等位基因可能降低CHD的发病风险,但与CHD的严重程度无关。     

Pitx3基因多态性与帕金森病易感性的相关性研究

目的探讨Pitx3基因多态性与帕金森病(PD)易感性的关系。方法选择江苏地区汉族的215例PD患者作为PD组,同期选择健康体检者250例作为对照组,利用多重连接酶链反应方法,检测2组Pitx3 2个单核苷酸多态性(SNP)位点rs2281983和rs3758549基因分布,分析各基因型、等位基因频率、单倍型与PD易感性的关系。结果 PD组与对照组Pitx3基因SNP位点rs2281983的CC、CT和TT基因型(6.5%vs 7.2%,42.3%vs 41.2%,51.2%vs 51.6%,χ2=0.274,P=0.717)和等位基因频率(χ2=0.159,P=0.423)分布比较,差异无统计学意义。PD组与对照组rs3758549的CC、CT和TT基因型(57.8%vs 66.4%,34.4%vs 29.2%,7.9%vs 4.4%,χ2=9.144,P=0.023)和等位基因频率(χ2=10.138,P=0.011)分布比较,差异有统计学意义。2组Pitx3基因C-C、C-T单倍型分布比较,差异无统计学意义(P>0.05);与对照组比较,PD组T-T单倍型增加PD易感性(OR=1.299,95%CI:1.003¹.863,P=0.048)。结论江苏地区汉族人群中,Pitx3基因的rs3758549位点基因型分布和等位基因频率与PD易感性之间有显著关联性,Pitx3基因的单倍型TT可能与PD易感性相关。     

支气管哮喘患者白三烯基因多态性与抗白三烯治疗的相关性研究

目的 检测温州地区汉族人支气管哮喘(简称哮喘)患者白三烯酶基因多态性的分布频率,探讨酶基因多态性与孟鲁司特治疗的相关性.方法 采用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱法,对60例温州汉族哮喘患者(哮喘组)及61名健康者(对照组)的6个白三烯酶基因多态性位点进行检测.依据基因检测结果选取基因白三烯C4合成酶LTC4S(rs730012)CC+AC型11例与从型11例,观察孟鲁司特治疗4周后的肺功能和尿白三烯E4的变化.结果 (1)6个基因位点[5脂氧酶ALOX5(rs2115819、rs4986832、rs4987105)、白三烯A4水解酶LTA4H(rs2660845)、5脂氧酶结合蛋白ALOX5AP(rs10507391)和LTC4S(rs730012)]的变异频率均＜50%,单体型组间分布差异均无统计学意义(均P＞0.05).(2)基因ALOX5(rs2115819、rs4986832、rs4987105)和LTA4H(rs2660845)等位点变异等位基因频率组间比较差异均无统计学意义(OR值分别为1.1 12、0.964、0.964、0.673,均P＞0.05),变异等位基因OR值95%可信区间(95%CI)均包括无效值(OR=1.0).上述位点基因型组间比较差异均无统计学意义(χ2值分别为0.792、2.684、2.683、2.524,均P＞0.05).(3)基因ALOX5AP(rs10507391)位点在两组间存在差异,哮喘组变异等位基因A频率为23.3%(OR=2.016,95%CI为1.027～3.959,P＜0.05).基因LTC4S(rs730012)位点在两组间存在差异,哮喘组变异等位基因C频率为25.0%(OR=1.926,95%CI为1.007～3.685,P＜0.05).(4)孟鲁司特治疗4周后,基因LTC4S(rs730012)CC+AC型者的FEVl提高(t=6.185,P＜0.01),晨尿LTE4下降(t=2.925,P＜0.05).AA型者治疗前后的FEV,和LTE4无明显变化.结论 温州地区汉族人群中基因ALOX5AP(rs10507391)、LTC4S(rs730012)位点的变异与哮喘相关,而另外4个位点的变异与哮喘无关.携带LTC4S(rs730012)变异等位基因C型可影响孟鲁司特的治疗效应.

Abstract：

Objective To investigate the frequencies of leukotriene gene single nucleotide polymorphisms(SNPs)in the asthmatic subiects of Han population in Wenzhou district,and the association between SNPs and response to montelukast treatment. Methods Sequenom matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight(MALDI-TOF)was used to genotype six polymorphisms in 60 asthmatic patients and 61 controls.According to the SNPs results,11 cases with the LTC4S(rs730012)CC+AC genotype and 11subjects with the AA genotype were given montelukast treatment,and evaluated by the response of pulmonary function and urinary leukotriene E4.Results The frequencies of mutant SNPs in ALOX5(rs2115819,rs4986832,r94987105),LTA4H(rs2660845),ALOX5AP(rsl0507391)and LTC4S (rs730012)were less than 50%.There were no statistical differences of the haplotype distribution (P values were 0.914,0.609.0.609,0.315.0.752 and 0.636 respectively).No statistical difireFences of the mutant allele frequencies were observed in the genes ALOX5(rs2115819,rs4986832,rs4987105)and LTA4H(rs2660845)(OR values were 1.112,0.964,0.964 and 0.673 respectively,all P＞0.05).The invalid value(OR=1.0)was included in the 95%CI of odds ratios.There were no differences of genotype distribution in the above loci(χ2 values were 0.792,2.684,2.683 and 2.524 respectively,all P＞0.05).There was a statistical difierence in the ALOX5 AP(rs10507391)mutant allele between the 2 groups,and the frequency of mutant alllele A in the asthma group was 23.3%(OR=2.016,95%CI=1.027-3.959,P<0.05).There was a statistical difference in the LTC4S(rs730012)mutant allele between the 2 groups, and the frequency of the mutant allele C in the asthma group was 25.0%(OR=1.926.95%CI=1.007-3.685,P＜0.05).Compared with the AA genotype,the LTC4S(rs730012)CC+AC genotype showed a significant improvement of FEV1(t=6.185,P＜0.01)and urinary LTE4 level(t=2.925,P<0.05)after receiving montelukast treatment. Conclusions These results suggest that the SNPs of ALOX5 AP (rs10507391)and LTC4S(rs730012)are associated with asthma in our patients.The LTC4S(rs730012)locus genetic polymorphism contributes to improvement in montelukast response.     

Association analysis of the LTA4H gene polymorphisms and pulmonary tuberculosis in 9115 subjects

Immunoregulatory eicosanoids have been implicated in protection from mycobacterial infection in cell and animal models. Recently, a study of the zebrafish embryo demonstrated that mutants of the lta4h gene, which encodes the leukotriene A4 hydrolase (LTA4H) enzyme of the eicosanoid pathway, have hypersusceptibility to Mycobacterium marinum infection. It also reported that heterozygosity at the two single nucleotide polymorphisms rs1978331 and rs2660898 located in introns of the LTA4H gene, a human homologue of lta4h, is associated with protection from pulmonary tuberculosis. To replicate this association we genotyped six LTA4H gene polymorphisms in samples from 3703 pulmonary tuberculosis patients and 5412 healthy controls collected in Russia. We found no evidence of the protective effect of heterozygosity at the polymorphisms rs1978331 and rs2660898 (P = 0.29 and 0.49) and no association of the alleles of any of the six polymorphisms (P = 0.13-0.81). These results suggest that common polymorphisms in the LTA4H gene do not play any major role in susceptibility to clinical pulmonary tuberculosis.     

Fcγ受体ⅢB基因多态性与系统性红斑狼疮易感性及临床表型的相关性研究

目的研究Fcγ受体ⅢB基因多态性在黄河三角洲汉族人群中的分布,探讨其多个位点的基因多态性与SLE易感性及临床表型的相关性。方法选择2017年1月至12月于山东省滨州医学院附属医院就诊的144例SLE患者作为试验组,同期健康志愿者150名作为对照组,收集全血标本和临床资料、试验室检查资料,采用单碱基延伸法PCR技术提取基因组脱氧核糖核酸(DNA),采用质谱法进行单核苷酸多态性(SNP)分型检测,应用SPSS 25.0软件进行χ^2检验,分析Fcγ受体ⅢB基因各位点基因多态性与SLE易感性及临床表型的关系。结果①在试验组和对照组中,rs115878669 CT、TT基因型频率分别为50.7%、64.0%,23.6%、10.0%,差异有统计学意义(χ^2=5.3,P=0.021;χ^2=9.8,P=0.002);rs147574249 TT基因型频率分别为17.4%、8.0%,差异有统计学意义(χ^2=5.9,P=0.016);rs199705513 GG、GA基因型频率分别为20.8%、10.0%,59.0%、70.0%,差异有统计学意义(χ^2=6.7,P=0.010;χ^2=3.9,P=0.049);rs77717968 CA基因型频率分别为30.6%、46.0%,差异有统计学意义(χ^2=7.4,P=0.007)。②在试验组中,rs115878669位点杂合子CT基因型频率在血液系统受累和不受累组分别为37.2%、56.4%,差异有统计学意义(χ^2=4.5,P=0.035);在血小板减少组与血小板正常组中,rs114531649位点AG基因型频率分别为79.2%、50.0%,差异有统计学意义(χ^2=6.8,P=0.009),GG基因型频率分别为4.2%、25.8%,差异有统计学意义(χ^2=4.3,P=0.039),rs147574249位点CC基因型频率分别为4.2%、25.8%,差异有统计学意义(χ^2=5.4,P=0.020),CT基因型频率分别为79.2%、56.7%,差异有统计学意义(χ^2=4.2,P=0.040),rs115878669位点CT基因型频率分别为70.8%、46.7%,差异有统计学意义(χ^2=4.7,P=0.031),rs199705513位点AA基因型频率分别为4.2%、23.3%,差异有统计学意义(χ^2=4.6,P=0.033),rs77717968位点AA基因型频率分别为4.2%、26.7%,差异有统计学意义(χ^2=4.5,P=0.033),TT基因型频率分别为25.0%、9.2%,差异有统计学意义(χ^2=4.8,P=0.028),其他比较无统计学意义(P>0.05)。在关节受累组与关节未受累组中,rs114531649位点纯合子GG基因型频率分别为31.2%、15.7%,差异有统计学意义(χ^2=4.9,P=0.027),rs147574249位点纯合子CC基因型频率分别为31.2%、15.7%,差异有统计学意义(χ^2=4.9,P=0.027),rs199705513位点纯合子AA基因型频率分别为29.5%、13.2%,差异有统计学意义(χ^2=5.8,P=0.016),rs61803007位点纯合子CC基因型频率分别为32.8%、16.9%,差异有统计学意义(χ^2=4.9,P=0.026),杂合子TC基因型频率分别为67.2%、83.1%,差异有统计学意义(χ^2=4.9,P=0.026),rs77717968位点纯合子AA基因型频率分别为31.2%、16.9%,差异有统计学意义(χ^2=4.1,P=0.044),其他比较差异无统计学意义(P>0.05)。rs146653557位点杂合子TC基因型基因型频率在有浆膜炎组和无浆膜炎组分别为39.4%、75.0%,差异有统计学意义(χ^2=4.3,P=0.037),其他比较差异无统计学意义(P>0.05)。在RF升高组与RF未升高组中,rs428194位点CG基因型频率分别为53.8%、22.9%,差异有统计学意义(χ^2=12.7,P=0.0004),GG基因型频率分别为46.2%、77.1%,差异有统计学意义(χ^2=12.7,P=0.0004),rs61803004位点GG基因型频率分别为46.2%、78.1%,差异有统计学意义(χ^2=13.7,P=0.0002),GT基因型频率分别为46.2%、21.0%,差异有统计学意义(χ^2=9.0,P=0.0027),TT基因型频率分别为7.7%、1.0%,差异有统计学意义(χ^2=4.8,P=0.029),rs61803008位点CT基因型频率分别为46.2%、23.8%,差异有统计学意义(χ^2=6.8,P=0.0092),TT基因型频率分别为46.2%、74.3%,差异有统计学意义(χ^2=10.1,P=0.0015)。结论Fcγ受体ⅢB基因相关位点可能与SLE的疾病易感性及临床表型有关。     

TGF-β1rs1800469基因多态性与HBV感染及肝癌家族聚集的相关性

目的:探讨TGF-β1rs1800469基因多态性与HBV感染及肝癌家族聚集性的相关性.方法:以广西肝癌高发区肝癌高发家族成员114名为实验组,采取年龄±5岁、性别、民族及HBsAg配对法选取无癌家族成员114名为对照组,提取外周血DNA,应用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,对TGF-β1rs1800469位点上的基因型CC、TC、TT,等位基因T、C进行分析.结果:TGF-β1rs1800469等位基因T、C的频率和基因型CC、TC、TT在肝癌高发家族成员和无癌家族成员间的分布无统计学差异(P>0.05).TGF-β1rs1800469等位基因T、C的频率和基因型TC、TT在乙肝表面抗原阳性和阴性组间分布无统计学差异(P>0.05),而基因型CC在两组间的分布存在差别(P<0.05).结论:TGF-β1rs1800469等位基因T、C和基因型CC、TC、TT与广西肝癌家族聚集危险性似无明显相关性;TGF-β1r s1800469基因型CC可能会增加HBV感染危险性,而TGF-β1rs1800469等位基因T、C的频率和基因型TC、TT无明显作用.     

江苏地区汉族人群白细胞介素28B基因多态性与丙型肝炎易感性的关系

目的探讨江苏地区汉族人群白细胞介素(IL)28B基因多态性分布及其与丙型肝炎易感性的关系。方法选取2011年南京市第二医院就诊的丙型肝炎患者88名,体检中心健康体检的健康人群100例。应用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序法检测丙型肝炎患者和健康人群IL-28B rs8099917、rs12979860、rs12980275、rs8113007和rs12972991位点的单核苷酸多态性(SNP),并统计分析这些位点的基因型和等位基因在两种不同人群中分布的差异。采用Pearsonχ2检验进行分析,计算Hardy-Weinberg遗传平衡以判断样本的代表性。结果两者间性别和年龄差异均无统计学意义(P=0.92、0.28),在检测人群中IL-28B基因5个位点的主要基因型分别是TT、CC、AA、AA、AA;丙型肝炎患者IL-28B基因SNP位点与健康人群在基因型(χ2=0.31、0.50、0.60、0.15、0.07,P均0.05)和等位基因(χ2=0.29、0.48、0.56、0.14、0.07,P均0.05)分布上差异均无统计学意义。结论 IL-28B的SNPs位点(rs8099917、rs12979860、rs12980275、rs8113007、rs12972991)可能与江苏省汉族人群丙型肝炎易感性无关。     

NLRP2基因多态性与中国汉族人群1型糖尿病的关联研究

目的探讨在中国汉族人群中核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白2(NLRP2)基因的单核苷酸多态性(SNP)与经典1型糖尿病(T1DM)的相关性。方法选取就诊于中南大学湘雅二医院代谢内分泌科的510例经典T1DM患者及本地区531名无血缘关系的健康志愿者为研究对象。利用质谱法对其NLRP2基因的rs1043673位点进行基因分型。两组间一般资料的比较采用Mann-Whitney U检验和χ2检验,T1DM患者组与对照组之间基因型及等位基因频率分布的比较采用χ2检验和logistic回归分析。NLRP2多态性与各项临床特征的分析采用Kruskal-Wallis H检验。结果NLRP2基因rs1043673位点的等位基因及基因型在两组之间的分布无明显差异。在T1DM患者中,rs1043673多态性与空腹C肽(P=0.029)、餐后2 h C肽(P=0.017)以及GADA的抗体滴度(P=0.043)均有关。结论NLRP2基因的rs1043673多态性与中国汉族T1DM患者的临床特征有关。     

中国藏族PSCA基因rs2294008多态性与胃癌遗传易感性的关系

目的:研究前列腺干细胞抗原基因(prostatestem cell antigen gene,PSCA)rs2294008位点多态性与中国藏族胃癌患者遗传易感性的关系.方法:收集185例藏族胃癌患者与200例健康人群的外周血样本,提取基因组DNA,采用dHPLC方法进行PSCA基因rs2294008位点分型.结果:PSCA基因rs2294008位点3种基因型C C、C T、T T在胃癌病例组中频率分别为:40.00%、48.65%和11.35%,而在对照组中分别为54.00%、39.50%和6.50%.与CC型比较,携带CT,TT型基因型者胃癌发生的危险性增加,OR值分别为1.66(95%CI 1.09-2.54)和2.36(95%CI 1.11-5.00).结论:PSCA基因rs2294008位点CT,TT基因型增加中国藏族人群的胃癌易感性.     

MD-1基因单核苷酸多态性与华南汉族成人支气管哮喘发病的相关性研究

目的 探讨MD-1基因的单核苷酸多态性与华南汉族成人支气管哮喘(简称哮喘)发病及肺功能的相关性.方法 选取2006年2月至2010年2月南方医院确诊的华南汉族成人哮喘患者332例[男169例,女 163例,平均年龄(44±16)岁]作为病例组,选取同期健康查体者276例[143例,女 133例,平均年龄(45±15)岁]作为对照组,利用MassARRAY-IPLEX技术和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱平台(MALDI-TOF-MS)对MD-1基因的rs2233128和rs7740529位点进行基因分型,并对其中105例初次确诊哮喘患者的肺功能进行检查.结果 在华南汉族人群中MD-1的rs2233128位点检出 AG和GG两种基因型,rs7740529位点检出CC、CT和TT 3种基因型,分型成功率为94.74%.与对照组比较,病例组rs2233128的基因型分布(x2=0.030,P=0.863)和等位基因分布(x2=0.029,P=0.865)差异均无统计学意义,而rs7740529的基因型分布(x2=8.681,P=0.013)和等位基因分布(x2=8.005,P=0.005)差异均有统计学意义.与TT基因型比较,rs7740529的CC和CC+CT基因型均能显著增加哮喘发生的危险性,OR值(95%可信区间)分别为2.451(1.299～4.963)和2.172(1.173～4.020).在初次确诊的105例哮喘患者中,rs7740529的3种不同基因型(CC、CT和TT)患者的FVC占预计值%(F=18.405,P=0.000)和FEV1占预计值%(F=25.700,P=0.000)差异均有统计学意义,与TT基因型[(86±9)%,(88±8)%]相比,CC基因型患者的FVC占预计值%[(65±12)%]和FEV1占预计值%[(64±11)%]下降最明显(均P＜0.05),但在初诊为哮喘且病情严重程度不同分级患者的rs7740529基因型分布比较,差异无统计学意义(x2=5.017,P=0.081).结论 MD-1可能是华南汉族成人哮喘的易感基因,rs7740529位点的基因型分布可能与初诊哮喘患者的肺功能改变有关.

Abstract：

Objective To investigate the correlation between MD-1 gene single nucleotide polymorphism ( SNP ) and bronchial asthma in adults of the Han nationality in Southern China as well as their lung functions. Methods From 2006 to 2010, 332 adult asthmatic patients of the Han nationality diagnosed in Nanfang Hospital, Southern Medical University, and 276 healthy volunteers were recruited for the study. The SNPs of MD-1 gene loci rs2233128 and rs7740529 were genotyped by using MassARRAYIPLEX technology and matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry platform (MALDI-TOF-MS). In addition, the lung function of 105 cases initially diagnosed with asthma was measured. Results There was no significant difference in sex ( x2 = 0. 50, P = 0. 824 ) and age ( t = 0. 930,P =0. 357 ) between the asthma and the healthy groups. Genotypes AG and GG were detected in MD-1 gene at rs2233128 locus and genotypes CC, CT and TT at rs7740529 locus in this Han population at SouthernChina. Genotyping success rate was 94. 74%. The rs2233128 genotype distribution ( x2 = 0. 030, P =0. 863 ) and allele ( x2 = 0. 029, P = 0. 865 ) showed no significant difference between the asthma and the control groups. However, the rs7740529 genotype distribution ( x2 = 8. 681, P = 0. 013 ) and allele ( x2 =8.005,P = 0.005) were significantly different in the asthma group as compared to the control group.Compared with the TT genotype, the rs7740529 of the CC and CC + CT genotypes could dramatically increase the risk of asthma, the odds ratio (95% confidence interval) being 2. 451 (1. 299 -4. 9626) and 2. 172 ( 1. 173 - 4. 020 ), respectively. In the 105 patients initially diagnosed with asthma, FVC% and FEV1 % were significantly different among the 3 different genotypes (CC, CT and TT) of the rs7740529 locus (F= 18.405, P=0.000 and F=25. 700, P=0.000). The percentages of predicted value of FVC and FEV1were decreased [ ( 65 ± 12 ) %, ( 64 ± 11 ) % ] in the CC genotype as compared to the TT genotypes [ ( 86 ±9) %, (88 ± 8) % ], P ＜ 0. 05. There was no significant difference of genotype distribution of rs7740529 in different grades of severity of newly diagnosed asthma ( x2 =5. 017 ,P =0. 081 ). Conclusions MD-1 may be a susceptible gene for adult asthma in a Southern Han population in China. Genotype distribution of rs7740529 locus in newly diagnosed patients with asthma may be related to their lung function changes.     

TCF7L2基因单核苷酸多态性与妊娠期糖尿病的相关性研究

目的 探讨转录因子7类似物2(TCF7L2)基因rs290487、rs11196205、rs11196218位点单核苷酸多态性(SNP)与妊娠期糖尿病(GDM)的关系.方法 采用病例对照研究方法,选取中国北方地区无血缘关系的糖耐量受损(IGT)孕妇158例、GDM孕妇335例作为病例组,正常妊娠妇女647例作为对照组.提取所有受试者基因组DNA,用连接酶检测反应(LDR)分析TCF7L2基因rs290487、rs11196205、rs11196218位点基因型,并进行相关分析.结果 在rs290487位点,C等位基因频率在病例组为41.6%,明显高于对照组的36.3%(P=0.012).病例组中CC基因型频率为18.7%,明显高于对照组的14.0%(P=0.033).CC基因型GDM发病风险与CT+TT基因型相比,比数比(OR)为1.418(95%CI 1.028～1.955),经logistic回归校正混杂因素后,OR值为1.518(95%CI 1.064～2.166).结论 TCF7L2基因rs290487位点SNP可能在GDM遗传易感性中起重要作用,CC基因型可能是其发生的危险因素.

Abstract：

Objective To investigate the relationship between gene polymorphism of transcripion factor 7-like 2 (TCF7L2) at positions rs290487, rs11196205, rs11196218 and gestational diabetes mellitus (GDM) in Chinese women.Methods In 1140 unrelated pregnant Northern Chinese women (335 women with GDM, 158 gestational cases with impaired glucose tolerance and 647 pregnant non-diabetic controls) ,three single nucleotide polymorphisms (rs290487, rs11196205, and rs11196218) in the TCF7L2 gene were genotyped using ligase detection reaction (LDR).In the present study, cases with GDM and impaired glucose tolerance (IGT) were indistinguishable clinically and biochemically, and were combined into case group.Results The frequency of C allele of rs290487 was 41.6% in case group, being significantly higher than that in control group (36.3%, P=0.012).There was significant difference in the frequency of CC genotype between case group and control group (18.7% vs 14.0%, P=0.033).Compared with T allele carriers, CC genotype carriers had a 1.418-fold increased risk of GDM (95% CI 1.028-1.955).After adjusting for age, body mass index, family history of diabetes,systolic blood pressure,and diastolic blood pressure, pregnant women with CC genotype carriers of rs290487 were more prone to hyperglycemia compared with the T allele carriers (OR 1.518, 95% CI 1.064-2.166).Conclusions The TCF7L2 rs290487 variant may contribute to the genetic predisposition to GDM.CC genotype is likely to be associated with an increased risk of GDM in the pregnant Chinese women.