结核分枝杆菌链霉素耐药临床分离株rpsL基因突变特征分析

目的了解我国结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis,MTB）rpsL基因突变特征及其与链霉素耐药的相关性,并评价其应用价值。方法对302株结核分枝杆菌临床分离株的rpsL基因采用聚合酶链反应-直接测序（PCR-DS）进行检测。结果 59株对INH、RFP、SM、EMB和PAS全部敏感,rpsL基因没有突变,61株对SM敏感的耐药株有6株突变,SM敏感菌株突变率为5.00%（6/120）。182株SM耐药MTB,rpsL基因突变率为70.33%,其中43位密码子赖氨酸转变为精氨酸（Lys43Arg）突变率为52.20%;88位密码子有4种突变类型,突变率为17.58%;86位密码子精氨酸转变为谷氨酰胺（Arg86Gln）突变率为0.55%。SM耐药株的rpsL基因突变率明显高于SM敏感株的基因突变率,两者之间的差异有统计学意义,χ2=125.05,P〈0.05。结论 rpsL基因突变与结核分枝杆菌链霉素耐药高度相关,其中Lys43Arg突变是主要突变类型,PCR-DS检测rpsL基因突变可以用于临床结核菌链霉素耐药的快速检测。     

荧光PCR熔解曲线法检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼耐药性的价值北大核心CSCD

目的分析南京市结核分枝杆菌(MTB)感染患者的耐药情况,评价荧光PCR熔解曲线法检测结核分枝杆菌对利福平(RFP)和异烟肼(INH)耐药性的临床价值,探究RFP和INH耐药相关基因突变的特征。方法对鉴定为MTB的780株菌株同时进行绝对浓度法药物敏感性试验和荧光PCR熔解曲线法检测对RFP和INH的耐药性。以绝对浓度法药物敏感性试验结果为标准,分析熔解曲线法检测RFP和INH的灵敏度、特异度、符合率和一致性(Kappa检验)。结果780株MTB中,22株(2.82%)为RFP单耐药,62株(7.95%)为INH单耐药,143株(18.33%)为耐多药。以绝对浓度法药敏试验结果为标准,荧光PCR熔解曲线法检测MTB对RFP和INH耐药性的灵敏度分别为98.18%和85.85%,特异度分别为95.28%和97.39%,符合率分别为95.90%和94.36%,Kappa值分别为0.88和0.85。RFP分子耐药菌株中全部检测出rpoB基因位点突变,其中以rpoB 529~533位点为最常见的突变(63.87%,122/191),突变位点为rpoB 507~512的20株菌株中只有7株表型耐药,rpoB基因双位点突变的18株菌株全部表型耐药;INH分子耐药菌株中最常见的突变为katG 315位点(66.49%,127/191),其次是inhA启动子区(17.80%,34/191),90%以上的INH分子耐药菌株为表型耐药。结论南京市结核耐药情况严重,以耐多药结核病为主。荧光PCR熔解曲线法与药敏试验结果高度一致,且弥补了药敏试验对于低度耐药突变株菌检测的局限性。耐药相关基因突变位点的检测有利于结核病的及时诊断和个体化治疗的实施。     

耐多药结核分枝杆菌基因突变分析

目的对临床分离的耐多药结核分枝杆菌株进行基因突变分析。方法对耐多药结核分枝杆菌临床分离菌株进行耐药基因的PCR检测,利用基因序列测定方法分析耐药基因突变情况。结果从耐多药结核病（MDR-TB）患者临床分离菌株中快速检测到rpoB、katG、rpsL、embB基因及其突变。耐多药菌株、全耐及单耐利福平分离菌株均检测rpoB基因点突变,突变位点主要为第516、526和531常见密码子,1例MDR-TB出现第479位和第531位密码子同时突变。耐多药菌、全耐菌及单耐异烟肼的菌株均检测有katG基因点突变,突变位点均为第2066位碱基C突变为Go全耐菌和对乙胺丁醇（EMB）耐药的耐多药菌株均检测有embB基因点突变,突变位点均为第306位密码子ATG突变为ACG。全耐菌和对链霉素（SM）耐药的MDR-TB菌株均检测有rpsL基因点突变,突变密码子为CCT突变为CTT,其中从1株对SM敏感的MDR-TB中也检测到突变。全敏感株、标准株及利福平（RIF）、异烟肼（INH）或EMB敏感的耐药株均无rpoB、katG或embB基因突变。结论PCR及基因序列测定可快速检测耐多药结核基因,结核分枝杆菌耐多药性与多个基因突变相关。     

徐州市耐多药结核耐药分析及分枝杆菌基因突变特征研究

目的 研究徐州市耐多药结核(MDR-TB)耐药表型、耐INH或RFP相关基因突变情况,分析耐药表型与基因突变间关系,为耐多药结核疾病的诊断提供科学依据。方法 采取随机方法抽取徐州市115例MDR-TB菌株和66株全敏感菌株进行耐药情况分析,使用基因芯片检测技术对耐INH相关基因katG、 inhA和aphC以及耐RFP相关基因rpoB突变位点进行检测,对结果进行t检验分析。结果 徐州市MDR-TB菌株耐药表型有9种组合,主要是以耐INH+RFP组合为主,比例为47.83%,其次为耐INH+RFP+SM组合,比例为20.00%。与耐INH的相关基因突变率87.83%,基因突变类型分别为单基因katG(64.35%)和inhA(3.48%),双基因katG+inhA(12.17%)和katG+aphC(12.17%)。耐多药株(115例)和敏感株(66例)总体变异率均数比较(t=107.56,P<0.05), 其中katG基因突变率比较(P<0.05),二者差异均有统计学意义。与耐RFP相关rpoB基因总突变率86.09%,耐RFP相关rpoB基因突变类型分别为单531(45.22%)、516(8.70%) 和526位点,双(531+516)(13.91%)、(531+513)(12.17%)和516+533突变位点, 531+516+513(3.48%)三位点突变。耐多药株和敏感株总体和单个位点突变率均数比较(t=94.92,P<0.05), 531(P<0.05)、516(P<0.05)、533(P<0.05),二者差异均有统计学意义。结论 研究发现了徐州市MDR-TB耐药表型特征。徐州市MDR-TB菌株与耐INH和RFP相关基因突变客观存在,并表现出多态性和地区性。与耐INH相关katG基因、与耐RFP的相关rpoB基因531、516、533位点突变相对稳定,有临床应用价值,可作为徐州市耐药结核菌株快速诊断的指标。     

388例患者结核分枝杆菌耐药情况分析

目的回顾性分析陕西省结核病防治院肺结核病人中结核分枝杆菌耐药状况并分析耐药形成原因。方法分析2008年分离培养388株结核分枝杆菌药物敏感试验结果,包括异烟肼（H）,利福平（R）,盐酸乙胺丁醇（E）,硫酸链霉素（S）。结果 388株结核分枝杆菌中,至少耐一种药物耐药率为64.43%,同时对4种药物耐药率为4.12%,耐多药率为10.31%。结论结核病人耐药情况比较严重,需要更严格执行结核病控制策略,防止耐药病人及耐药菌株的产生和传播。     

南京地区结核分枝杆菌耐药监测疫情趋势分析

目的了解南京地区胸科医院结核病患者结核分枝杆菌对临床常用9种药物的耐药情况。方法对我院分离的结核分枝杆菌采用绝对浓度法对9种抗结核药物:链霉素、异烟肼、乙胺丁醇、利福平、对氨基水杨酸、丁胺卡那霉素、卷曲霉素、左氧氟沙星、对氨基水杨酸异烟肼进行药敏试验,同时用PNB、TCH进行菌种初步鉴定。结果 10014株结核分枝杆菌中,总耐药率38.42%(3847/10014),单耐药率最高为利福平(27.35%),最低为卷曲霉素(0.50%);2017株耐多药结核分枝杆菌对另外7种药物单耐药率最高为链霉素(56.22%),最低为卷曲霉素(1.69%),对9种药物全耐者有3株。结论结核分枝杆菌对多种药物耐药率高,应加强抗结核药物耐药性监测,根据药敏试验结果选择科学有效的化疗方案。     

重庆地区结核分枝杆菌异烟肼和丙硫异烟胺耐药及其交叉耐药相关基因突变研究

目的 研究结核分枝杆菌(MTB)对异烟肼(INH)和丙硫异烟胺(Pto)的耐药情况,分析INH耐药相关基因(katG、inhA、ahpC、kasA)及与Pto交叉耐药相关基因的突变特点。方法 对233株INH耐药MTB临床分离株(37株对Pto同时耐药)的katG、inhA、ahpC、kasA基因进行扩增及序列分析。结果 耐异烟肼菌株中未发现katG完全缺失,223株 (96.5%)耐药株katG存在点突变、插入,其中 2个突变位点未见报道。195株 (83.6%)耐药株的第 315位点突变;189株 (81.1%)耐药株第463位点突变(R463L),其中166株 (71.2%)与第 315位点联合突变;在其他位点发生突变的菌株4株,包括D448G 1株、D419H 1株和2株同义突变。 11株(4.72%) INH耐药菌株中inhA点突变,包括S94A 1株、I194T 1株,C-15T 9株。37株Pto耐药的菌株中,8株点突变且均为inhA C-15T(4株为inhA单基因点突变C-15T,4株发生katG S315T和inhA C-15T的双基因联合突变)。全部耐药菌中有1株为ahpC基因突变,未发现有kasA基因突变。结论 进一步证实katG315和inhA-15基因位点突变与MTB对INH耐药密切相关;INH与Pto存在着交叉耐药,但耐药率较低,Pto耐药的发生与inhA-15位点突变密切相关。     

比例法测试结核分支杆菌药物敏感性的探讨

探讨在我国应用比例法测试结构分支杆菌药物敏感性的可行性以及与以往资料的可行性。方法用比例法和绝对浓度法测试了３６０株结核分支杆菌对四种抗结核药物的敏感性,对１９株结果有判别的菌株进行了ＭＩＣ测试,用国产和Ｓｉｇｍａ公司结核药对３０株分支杆菌分别进行了耐药性测定。     

Prevalence of katG Ser315 substitution and rpoB mutations in isoniazid-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from Brazil.

SETTING: Four hundred and sixty-eight isoniazid (INH) resistant Mycobacterium tuberculosis isolates recovered from a selected Brazilian population. OBJECTIVE: To check for susceptibility to other chemotherapeutic drugs used in TB treatment, and to ascertain mutations involved in INH and rifampicin (RMP) resistance. DESIGN: Antimicrobial susceptibility to RMP, streptomycin and ethambutol (EMB) was evaluated by the resistance ratio method and pyrazinamide (PZA) by activity assay. Single strand conformation polymorphism (SSCP) and sequence analysis were performed in samples from this panel to confirm mutations in codon 315 of the katG and in a 69-bp region of the rpoB gene. RESULTS: Combined resistance to INH+RMP, INH+ PZA, INH+EMB, and INH+RMP+PZA was shown in respectively 272 (58.1%), 126 (26.9%), 47 (10%), 116 (24.8%) isolates. No katG mutation was found in 19 (39.6%) of 48 strains tested. Ser315Thr substitution was found in 29 (60.4%). All RMP-resistant strains tested (n = 25) showed rpoB mutations. S531L substitution was found in 15 (60%). CONCLUSION: INH-resistant strains isolated from selected Brazilian populations frequently show resistance to other first-line anti-tuberculosis drugs. rpoB mutation was responsible for RMP resistance in all strains. Among INHr strains, katG mutations were shown in only 60.4%. Genetic approaches targeting the rpoB gene but not the katG gene have a high sensitivity to detect resistance among Brazilian M. tuberculosis strains.     

聚合酶链反应-单链构象多态性技术检测耐多药结核分支杆菌rpoB、KatG、rpsL突变的研究

目的　应用PCRSSCP技术快速检测耐INH,RFP,SM结核分支杆菌分离株KatG、rpoB、rpsL基因突变,评价其在检测结核分支杆菌耐药性方面的价值。方法 32株耐INH、RFP、SM结核分支杆菌临床分离株及25株结核分支杆菌敏感分离株用PCRSSCP方法分别检测,rpoB、KatG、rpsL基因突变。结果 32株耐多药结核分支杆菌分离株中,rpoB、KatG、rpsL PCR扩增产物PCR-SSCP分别有28株(87.5%)rpoB基因,19株(59.3%)KatG基因和23株(71.9%)rpsL基因电泳条带与结核分支杆菌标准株H₃₇Rv电泳条带相比有明显差异,而25株结核分支杆菌敏感株的PCR-SSCP条带与结核分支杆菌H₃₇Rv相似,特异性为100%。结论 PCR-SSCP方法敏感、特异,可快速检测结核分支杆菌rpoB、KatG、rpsL耐药基因突变,有利于耐多药结核分支杆菌耐药性的快速检测。     

基因芯片技术检测贵州省结核分枝杆菌耐药基因KatG和inhA

目的 了解本地区结核分枝杆菌(MTB)异烟肼(INH)相关耐药基因katG和inhA的突变特征,评价基因芯片法对MTB INH耐药性检测的临床应用价值。方法 应用基因芯片法对经PCR-荧光探针法鉴定为MTB阳性的2 738例病人标本进行INH耐药性检测,分析其相关耐药基因katG和inhA的突变特征,同时应用比例法检测上述同期送检的相同病人的同类型标本经罗氏培养MTB阳性菌株的INH耐药性,比较两种方法的检测结果。结果 2 738例MTB核酸阳性标本经基因芯片法检测,INH耐药465例,耐药率16.98%,其中以katG 315(AGC→ACC)突变为主,基因突变率为78.06%,其次为inhA -15(C→T),katG 315(AGC→AAC),突变率分别为16.13%和5.59%。上述病人同期送检的同类型标本有1 493例经罗氏培养MTB阳性,比例法检测,INH耐药255例,耐药率17.08%,对应的基因芯片法检测结果为INH耐药249例,耐药率16.68%。以比例法结果为判断标准,基因芯片法测定INH耐药性的敏感性、特异性、阳性预测值(PPV)、阴性预测值(NPV)及准确性分别为85.49%、97.50%、87.55%、97.03%和95.45%。结论 本地区INH耐药以katG 315(AGC→ACC)和inhA -15(C→T)突变类型为主;基因芯片对MTB INH耐药性检测具有高敏感性、特异性、准确性和快速性,可用于本地区MTB INH耐药性的快速检测。     

Molecular analysis of isoniazid, rifampin and streptomycin resistance in Mycobacterium tuberculosis isolates from patients with tuberculosis in Düzce, Turkey

The aim of this study was to use DNA sequencing analysis to analyze the mutations in the most commonly targeted genes (katG, inhA, rpoB, rpsL) in isoniazid (INH)-, rifampin (RIF)- and streptomycin (SM)-resistant Mycobacterium tuberculosis strains obtained from subjects in Duzce, Turkey. Four isolates were found to be INH-resistant, 3 were RIF-resistant and 5 were SM-resistant, out of a total of 52 M. tuberculosis strains. In 3 of the 4 INH-resistant strains, a mutation in the katG gene in codon 315 appeared as AGC-->ACC (Ser-->Thr), and the other INH-resistant strain showed a mutation in the katG gene in codon 314 as ACC-->CCC (Thr-->Pro). There were no mutations in the inhA gene in INH-resistant isolates. Two of the 3 RIF-resistant strains were found to have mutations in the rpoB gene in codon 516 appearing as GAC-->GTC (Asp-->Val), and the other RIF-resistant strain has a mutation in the rpoB gene in codon 531 as TCG-->TTG (Ser-->Leu). These 3 RIF-resistant strains are also INH-resistant. All 5 SM-resistant strains have mutations in the rpsL gene in codon 43 appearing as AAG-->AGG (Lys-->Arg). Thus, we found common gene mutations that bring about the resistance of M. tuberculosis to antituberculosis drugs in all of our isolates from Duzce. To the best of our knowledge, the ACC-->CCC (Thr-->Pro) mutation in the katG gene in codon 314 has not been previously defined.     

GenoType MTBDRplus快速检测耐多药结核分枝杆菌复合群临床分离株效果评价

目的评价GenoType MTBDRplus快速检测耐多药结核分枝杆菌复合群(multi-drug resistant Mycobacterium tuberculosis Complex,MDR-MTBC)临床分离株的应用效能。方法随机抽取福建省30个耐药监测点的129株MTBC包括全敏感菌株50株和79株MDR菌株,应用MTBDRplus 检测,同时扩增MDR菌株的rpoB, katG, inhA基因进行测序比对,并将检测结果与比例法药敏结果比较分析。结果129株MTBC经MTBDRplus检测,Tub条带均阳性(100%),50株全敏感株的检测结果与比例法药敏结果完全一致。79株MDR菌株经MTBDRplus检出67株(84.81%)MDR,10株(12.66%)单耐RFP,2株(2.53%)单耐INH。经测序,77株MDR菌株的rpoB基因检测出突变,71株的katG 和/或inhA检测出突变。以比例法药敏结果为金标准,MTBDRplus检测RFP、INH耐药性及MDR的敏感度分别为97.47%(77/79), 87.34%(69/79), 84.81%(67/79),MTBDRplus检测RFP、INH耐药性及MDR的特异度均为100%(50/50),一致率分别为98.45%(127/129),92.25%(119/129),90.70%(117/129)。结论MTBDRplus是一种快速、准确、操作简便的技术,具有很好的应用前景,适用于耐多药结核分枝杆菌临床分离株的快速检测,但灵敏度有待进一步提高。     

难治性肺结核分支杆菌耐药性和药物依赖性的实验观察

目的探讨难治性肺结核分支杆菌耐药性和药物依赖性。方法对难冶性肺结核病人痰标本培养分离的分枝杆菌65株（例），进行低浓度、高浓度抗结核药物的耐药性和依赖性实验观察。结果65株分枝杆菌对SM、INH和RFP三种药物均耐药，EMB耐药率也较高（75．4％和69．2％）。分枝杆菌对sM依赖率分别为38．5％，INH为26．2％，RFP为18．5％，EMB为10．8％；同时依赖两种药物者为15．4％，三种药物为12．3％，四种药物为4．6％。结论难治性肺结核具有很高的耐药性和较高的依赖性。     

591株结核分枝杆菌耐药情况分析

目的回顾性分析湖南省结核病医院结核病人中结核分枝杆菌耐药状况并分析耐药形成原因。方法分析2003年5月1日—2007年12月31日间分离培养出并使用噻吩-2羧基肼（TCH）和对硝基苯甲酸（PNB）进行分型确认的591株结核分枝杆菌药物敏感试验结果,包括异烟肼（INH、H）、利福平(RFP、R)、硫酸链霉素（SM、S）、对氨基水杨酸钠(PAS、P)、乙胺丁醇(EMB、E)、卡那霉素(KM、K)、左氧氟沙星（OFLX、O）。7种药物采用绝对浓度法进行药物敏感性检测。结果591株结核分枝杆菌中,至少耐一药为63.6%（376/591）;同时对7种药物耐药率为0.2%（1/591）;耐多药率（MDR）为38.6%(228/591)。结论结核病人耐药情况比较严重,需要更严格的执行结核病控制策略,防止耐药病人及耐药菌株的产生和传播。     

174株结核分枝杆菌耐药情况分析

目的分析我所183株痰培养阳性菌株的耐药情况。方法采用药敏比例法对183株阳性菌株进行菌种鉴定及药物敏感性试验。结果共分离出174株结核分枝杆菌,且4种一线抗结核药物异烟肼(INH)、利福平(RFP)、乙胺丁醇(EMB)、链霉素(SM)的总耐药率为25.3%,耐多药率为8.0%。4种抗结核药物的耐药率由高到低依次为SM、INH、EMB、RFP。结论陕西省结核耐药情况仍较严重。     

六安地区结核分枝杆菌耐药基因katG 和rpoB 的突变特征

目的 分析临床分离的结核分枝杆菌katG 和rpoB 基因的突变情况与耐药之间的关系,了解六安地区耐药结核分枝杆菌的基因突变特征。方法 采用比例法对六安地区65 株结核分枝杆菌临床分离株进行药敏试验;通过特异性引物,对目的基因片段katG 和rpoB 进行扩增、测序后进行分析。结果 60 株结核分枝杆菌中分别有有9 株耐异烟肼和14 株耐利福平,其中同时耐异烟肼和利福平的6株。9 株耐异烟肼菌株中,4 株katG 在315（Ａ GC→ACC 或ACA）位点发生突变,占44.4％;14 株耐利福平菌株中,11 株rpoB 分别在516（GAC→GTC）、526(CAC→CGC 或TAC)和531(TCG→TTG)位点发生突变,占总耐药菌株的78.6％;6 株同时对利福平和异烟肼耐药,其中5 株katG 或rpoB 基因发生突变,占83.3％。结论 六安地区结核分枝杆菌耐异烟肼和耐利福平分别主要是由katG 和rpoB 基因突变引起,其中耐异烟肼主要在315（AGC→ACC 或ACA）位,而耐利福平在516（GAC→GTC）、526(CAC→CGC或TAC)和531(TCG→TTG)位,都发生了突变。     

中国疾病控制体系实验室第1轮结核杆菌药物敏感试验室间质量评估分析

目的评估中国疾病控制体系结核病实验室药物敏感性测试能力。方法国家结核病参比实验室下发30株结核杆菌至受评估的实验室,受评估实验室按照WHO推荐的罗氏培养基药物敏感性试验方法(比例法),进行药物敏感性试验,检测药物包括异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)、乙胺丁醇(EMB),并报告国家参比室,国家参比室将其结果与正确结果比对。结果 4种药物的4个评估指标分别为,符合率:INH 97%,RFP 95%,SM 89%,EMB 93%;重复性:INH 96%,RFP98%,SM 86%,EMB 94%;特异性:INH 97%,RFP 99%,SM 89%,EMB 96%;敏感性:INH 97%,RFP 65%,SM 91%,EMB 47%;各实验室4个评价指标均数比较,除敏感性差异有统计学意义外,其他4个检测值均高于85%,差异无统计学意义。结论除个别实验室在耐药检出能力上需提高外,其他参与实验室的药敏试验水平达到设定要求,INH、RFP药物检测稳定,SM和EMB需要进一步标化。     

Resistance-conferring mutations of Mycobacterium tuberculosis strains with low level resistance to isoniazid

OBJECTIVE: We investigated the prevalence of isoniazid (INH) resistance-conferring mutations in the INH-indeterminate Mycobacterium tuberculosis (MTB) strains. MATERIALS AND METHODS: We initially selected a sample of 47 clinical isolates of MTB from patients, who visited the Osaka Prefectural Medical Center for Respiratory and Allergic Diseases from 2000 to 2005. Strains resistant to the concentration of 1 - 2 microg/ml were defined as "indeterminate". INH resistance-conferring mutations were determined by DNA microarray. RESULTS: Of 47 INH-indeterminate strains, only 13 (27.7%) were found to have no resistance mutations, 23 (48.9%) had mutation within the inhA regulatory region at -15 C to T, and 2 (4.3%) had mutation within the inhA regulatory region at -8 T to A, 6 (12.8%) had mutation within the katG gene at 1778 G to A, and 3 (6.4%) had mutations within the katG gene both at 1778 G to A and at 982 T to G. CONCLUSIONS: We showed that the majority of INH-indeterminate strains have resistance-conferring mutations, which were mainly detected within the inhA regulatory region.     

Drug resistance in newly discovered untreated tuberculosis patients in Poland, 1974-1977.

Between March 1974 and November 1977 altogether 2568 strains from 509 newly discovered, previously untreated tuberculosis patients from many areas of Poland were tested for susceptibility to 4 antituberculosis drugs: isoniazid (INH), streptomycin (SM), ethambutol (EMB) and rifampicin (RMP). Twenty seven patients (5.3 %) were infected with tubercle bacilli resistant to 1 (4.1 %) or 2 drugs (1.2 %). Sixteen patients (3.1 %) were infected with strains resistant to INH alone; t (1.0 %) to SM alone and 6 (1.2 %) to both INH and SM. Twenty two cases (4.3 %) were resistant to INH and 11 cases (2.1 %) to SM. No bacilli resistant to EMB or RMP, alone or in combination, were found. No relationship was found between sex or age and primary resistance rates.