基于蛋白质组学分析色胺酮抑制小鼠乳腺癌的作用机制

目的:采用非标记定量(Label-free)蛋白质组学技术研究色胺酮抗小鼠体内乳腺癌的作用机制。方法:采用超高效液相色谱-质谱联用技术检测色胺酮抗小鼠乳腺癌的表达蛋白,选择Ionoptics nano UPLC C18色谱柱(0.075 mm×250 mm,1.6μm),流动相0.1%甲酸水溶液-0.1%甲酸乙腈溶液梯度洗脱,正离子模式,扫描范围m/z 100～1 700,使用MaxQuant 1.6.5.0进行数据库检索。采用Label-free高分辨质谱的蛋白质组学技术筛选4T1乳腺癌小鼠模型组与色胺酮(100 mg·kg~(-1))口服给药组之间的差异表达蛋白,进行色胺酮抗乳腺癌的蛋白质组学研究。结果:共鉴定出3 997个蛋白质,其中有2 911个蛋白可定量。模型组与色胺酮组共750个差异表达蛋白,其中286个蛋白上调,464个蛋白下调。基因本体分析表明,这些差异表达蛋白主要参与增殖、细胞迁移、凋亡、免疫、血管生成和炎症调节等生物学过程。京都基因与基因组百科全书通路分析进一步表明,这些蛋白主要集中于T细胞受体,B细胞受体,Toll样受体,核转录因子-κB(NF-κB),Ras蛋白,白细胞介素-17,肿瘤坏死因子,磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)和丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等信号通路。结论:与色胺酮抗4T1乳腺癌作用密切相关的差异表达蛋白包括上调蛋白白细胞分化抗原14(CD14),前列腺素G/H合酶2(PTGS2),泛素蛋白连接酶E3和下调蛋白CD44,70 kDa热休克蛋白1A(HSPA1A),巨噬细胞移动抑制因子(MIF),NF-κB,核糖体蛋白S6激酶α-4(RPS6KA4)和高迁移率族蛋白B1(HMGB1),提示色胺酮主要通过调节肿瘤炎症微环境来达到抑制小鼠乳腺癌的作用。     

抑郁大鼠海马的双向凝胶电泳图谱分析

背景及目的抑郁症发病机制不清。结构影像、遗传、神经生化的研究都从不同角度阐述了抑郁症的发病机制,种种证据也显示抑郁症的发病在脑代谢层面是有其器质性基础的,但至今还无明确、统一的结论。蛋白质组学技术为抑郁症发病机制的研究提供了新的手段。本研究通过建立抑郁症的动物模型,利用双向电泳和质谱鉴定技术,分析海马组织差异蛋白质表达,旨在探索抑郁症新的治疗靶点,为建立客观的诊断、治疗、停药指标提供线索。方法以雄性成年SD大鼠10只,采用慢性不可预见的轻度应激(chronic unpredictablemildstress,CUMS)制作抑郁症模型。将动物…     

蛋白质组学及其在前列腺癌研究中的应用

随着蛋白质组学技术的发展,越来越多的肿瘤标记物被发现,并逐渐应用于临床,这将为肿瘤的早期诊断和预后监测提供可靠的依据。现综述蛋白质组学的研究策略及其在前列腺癌研究中的应用。     

蛋白质组学方法在研究阿片类物质依赖机理中的应用

阿片类物质成瘾（依赖）的机理十分复杂。大脑中有关组织中蛋白质表达改变可能与阿片类物质依赖产生密切相关。海马是一个调节学习记忆功能的重要脑组织，近年来研究表明它在阿片等毒品成瘾机理中也有重要作用。研究海马组织蛋白表达改变与阿片类物质成瘾的关系，对认识阿片类物质成瘾的机理和发现药物作用的靶标的重要意义。应用蛋白质组学方法，我们观察到慢性吗啡处理能引起小鼠海马中与能量代谢密切相关的呼吸链中的NADH脱氢酶的辅基Fe-s蛋白，三羧酸循环中丙酮酸脱氢酶复合物中二氢硫辛酰转乙酰基酶和糖酵解关键酶乳酸脱氢酶表达显著地降低。荧光实时定量PCR（RT-PCR）分析表明编码这三个蛋白质表达的mRNA含量相应地降低。吗啡慢性处理小鼠海马组织中的ATP水平显著地低于正常小鼠海马组织中ATP水平，进一步证实慢性吗啡依赖小鼠海马中三个与能量代谢相关的酶表达降低。     

帕金森病的蛋白质组学研究进展

帕金森病（Parkinson＇s disease，PD）是最常见的老年性神经疾病之一，其主要临床特征是静止性震颤、肌强直、运动减少和姿势平衡障碍等。PD的病因目前仍不十分清楚，可能与老龄化、遗传易感性和环境因素等有关。病理学检查显示中脑黑质多巴胺能神经元进行性变性坏死，残存的多巴胺能神经元胞浆中出现特征性的淀粉样蛋白包涵体（Lewy小体），进一步的研究发现，     

肿瘤干细胞蛋白质组学研究进展

当前，恶性肿瘤的发病率已上升到我国疾病谱的第二位，而且随着环境污染的加剧、人口老龄化等因素的影响，还呈进一步升高的趋势，恶性肿瘤正严重危害着我国人民的身体健康和阻碍了我国社会、经济的发展。但目前人类对恶性肿瘤的研究尚未取得根本性突破，对于恶性肿瘤的本质是什么，如何有效控制它的发生发展等问题还处于探索之中。肿瘤干细胞（cancer stem cell，CSC）是在造血干细胞（hematopoietic stem cell，HSC）、白血病干细胞（1eukemic stem cell，LSC）概念的基础上总结延伸出来的，由Reya等…首次提出并初步阐述。这一概念试图从一个全新的角度诠释癌细胞的起源、癌组织的异质性、部分癌细胞的永生性和转移能力差异等肿瘤生物学行为，一经提出立即引起广大科研工作者的浓厚兴趣，近几年来在Nature等权威刊物上发表的关于CSC的文章明显增多。但CSC研究在日益引起人们重视和取得一些进展的同时也面临许多技术瓶颈和困难。肿瘤的蛋白质组学研究是肿瘤研究中极其重要的一方面，对于阐明肿瘤的发生发展机制，为其诊断、治疗、预后判断提供依据等方面都具有重要意义。因此，如何尽快运用蛋白质组学研究的技术方法剖析CSC，提高我们对肿瘤的认识，并最终提高人类对肿瘤的诊治水平，将是广大肿瘤相关科研工作者努力的方向之一，本文将从这些方面作一综述。     

结直肠癌淋巴结转移研究获进展

中南大学湘雅医院申教授和裴海平教授领衔的课题研究组。综合运用蛋白质组学、组织芯片和Western杂交等最新的医学研究技术，对收集的大量临床标本进行了系列研究，初步揭示结直肠癌发生淋巴结转移的医学之谜。研究成果近日发表在世界该研究领域顶尖的核心刊物《蛋白质组学》杂志上。     

干细胞与蛋白质组学

蛋白质组学具有规模大和高通量的特点，其核心技术双相电泳、质谱分析和蛋白质组信息学的迅速发展，可完成极其复杂的蛋白质功能和细胞因子变化的研究。干细胞可定向分化为各种细胞和组织器官，其定向分化过程中有众多的蛋白质、细胞因子的参与和消失，应用蛋白质组学研究干细胞分化过程中极其复杂的蛋白质变化，对探索干细胞的分化机制和应用有重大意义。     

运用蛋白质组学技术研究EB病毒诱导鼻咽癌细胞CNE2表达变化的蛋白质

【目的】寻找并鉴定CNE2细胞在EB病毒感染后表达发生变化的功能蛋白质，为阐明该病毒诱导鼻咽上皮细胞发生生物学变化的作用机制提供线索。【方法】分别从EB病毒感染后的CNE2细胞和未经感染的CNE2细胞中抽提总蛋白质，通过双向电泳分离。运用软件比较分析上述两组的蛋白质表达图谱，寻找表达有差异的蛋白质点。从凝胶上切下差异蛋白质点，通过基质辅助激光解吸，离子化飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定。【结果】图像分析显示，EB病毒感染后的CNE2细胞和未经感染的CNE2细胞之间存在一些明显差异的蛋白质点。通过MALDI-TOF-MS成功地鉴定了其中4个蛋白质点，EB病毒感染CNE2细胞后蛋白质GRP78和硫氧还蛋白过氧化物酶1表达上调，蛋白质肌动蛋白胞浆组分2和蛋白酶体。链表达下调。【结论】EB病毒感染鼻咽上皮细胞后引起生物学变化的分子机制可能包括：①诱导细胞大量合成蛋白质以促进增生．同时上调蛋白质GRP78的表达而抗凋亡；②提高细胞内氧化状态而诱导蛋白质硫氧还蛋白过氧化物酶1的表达，并可能通过该蛋白质调控NF-κB和AP-1来影响细胞生长。     

肺癌基础研究的几个热点

肺癌是严重危害人类生命健康的疾病,在发达国家和我国大城市肺癌已占恶性肿瘤死亡的首位。以北京为例,10年间肺癌病死率快速增长,男性增长26.85％,女性增长35.96％。虽然30年来手术方法、化疗及放疗不断进步,但肺癌5年生存率仅达到13％,因而人们对肺癌的诊断及生物治疗寄予厚望。目前的研究热点很多,现将我们能有所作为的概述如下。