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目的筛选乳腺癌高表达基因,用生物信息学方法预测FAM83A生物学功能。方法使用肿瘤基因组解剖计划数据库的数字基因表达演示工具,在乳腺癌组织和乳腺良性肿瘤组织中筛选差异表达的基因。生物信息学方法预测FAM83A基因及其编码蛋白的序列同源性、理化性质、亚细胞定位、结构和表达谱。RT-PCR方法测定FAM83A在乳腺癌、乳腺纤维瘤和正常乳腺组织中的表达。结果筛选出差异表达基因FAM83A。发现其有3个不同的剪接体,基因进化保守,亚细胞定位于线粒体的可能性大。预测有PK,PKA等磷酸化位点,MAPK作用识别位点,SH2、SH3,RPEL和WH2结合基序。二级结构主要是α螺旋和无规则卷曲。RT-PCR证实FAM83A在乳腺癌组织中高表达,而在乳腺良性肿瘤和正常乳腺组织中均无表达。结论 FAM83A是一个乳腺癌高表达基因,可能作为乳腺癌分子机制研究的靶点。 相似文献
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目的:筛选一组可检测乳腺癌循环癌细胞的标记物基因,分析乳腺癌患者相对循环癌细胞数(Lc)与临床病理特征的关联。方法:收集乳腺癌患者142例(乳腺癌组)和正常女性60人(正常对照组)外周血标本。利用CGAP提供的SAGE Genie数据库中数字基因表达演示工具,筛选一组可用于检测乳腺癌循环癌细胞的标记物基因(FAM83A、NPY1R和KRT19)。应用定量巢式PCR方法检测研究对象外周血中标记物基因的表达水平,并通过公式计算患者Lc值。结果:在乳腺癌组患者外周血中肿瘤标记物基因FAM83A、NPY1R和KRT19的表达水平均明显高于正常对照组(P<0.001)。142例乳腺癌患者中有113例(79.6%)至少表达1个肿瘤标记物基因。乳腺癌患者Lc值与其临床分期和远处转移有关联(P<0.001)。Kaplam-Meier生存曲线,Lc值小于2的患者生存时间明显长于Lc值大于2者(P=0.005)。结论:筛选了一组检测乳腺癌外周血循环癌细胞的标记物基因,联合该组基因计算的Lc值与患者临床分期和远处转移有关联,并可辅助判断乳腺癌预后。 相似文献
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目的观察促性腺激素抑制激素(Gn IH)侧脑室注射后大鼠下丘脑组织中神经肽Y(NPY)mRNA及蛋白表达变化。方法雄性SD大鼠60只,随机分为实验组和对照组各30只,分别给予侧脑室注射Gn IH(1μg/μL,5μL)和生理盐水(5μL),分别于注射1、2、4 h后各处死10只,取下丘脑组织。采用real-time PCR法检测NPY mRNA,免疫印迹法检测NPY蛋白。结果实验组注射后1、2、4 h下丘脑组织中NPY mRNA相对表达量分别为0.759±0.025、1.755±0.219、2.671±0.696,NPY蛋白相对表达量分别为0.225±0.015、0.244±0.015、0.264±0.009;对照组分别为0.633±0.021、0.568±0.006、0.631±0.015和0.113±0.004、0.125±0.007、0.128±0.011。两组注射后2、4 h NPY mRNA表达量相比,P均<0.05;两组注射后各时点NPY蛋白表达量比较,P均<0.05。结论Gn IH侧脑室注射后,大鼠下丘脑组织中NPY mRNA及蛋白表达上调。 相似文献