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目的 通过对miR-146b进行系统的生物信息学分析,预测miR-146b的靶基因及其功能.方法 应用miRBase获取并分析miR-146b的序列特征;应用TargetScan、PicTar及miRanda预测miR-146b的靶基因,进行功能注释和信号转导通路分析;应用PubMed、Google等信息搜索工具综述miR-146b已有功能研究.结果 miR-146b在各物种之间具有高度保守性.功能注释显示预测靶基因主要富集于促细胞增殖、转录调控、调控细胞分化等生物学过程.信号转导通路分析显示预测靶基因显著富集于白血病、ErbB信号通路、促分裂原活化的蛋白激酶通路等.结论 生物信息学分析提示,miR-146b可能与细胞分化、代谢密切相关. 相似文献
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目的 对hsa-miR-100进行靶基因、功能预测等生物信息学分析,为深入研究hsa-miR-100功能提供理论和试验基础.方法 利用Pubmed检索miRNA-100相关文章,通过miRBase、NCBI、UCSC Browser等在线工具分析hsa-miR-100序列,应用miRanda、TargetScan及PicTar预测hsa-miR-100靶基因,结合已证实的靶基因进行功能富集分析和信号通路富集分析.结果 hsa-miR-100与多种肿瘤发生、发展有关,其序列在各物种间具有高度保守性.hsa-miR-100靶基因功能富集于基因沉默、染色质沉默、细胞生物合成负性调节等(P<0.01),涉及肿瘤信号通路、溶酶体信号通路、凋亡信号通路等信号转导通路(P<0.05).结论 hsa-miR-100可能参与肿瘤发生相关的生物学过程. 相似文献
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目的 构建人miR-146b慢病毒表达载体,包被病毒并检测其在人脂肪细胞中过表达效果。方法 以人基因组DNA为模板,PCR高保真扩增包含miR-146b区域上下游各100bp左右的基因组DNA,亚克隆入慢病毒表达载体,与包装质粒共转染HEK-293T细胞,包装病毒,收取病毒上清,纯化后感染人脂肪前体细胞,36 h开始观察荧光标记,72 h收取细胞,抽提RNA,Realtime PCR检测慢病毒感染下miR-146b的相应表达量。结果 成功构建人miR-146b慢病毒表达载体,包装获得的病毒感染人脂肪细胞的效率可达到85%以上,miR-146b过表达水平可接近4倍。结论 本研究成功构建了人miR-146b慢病毒表达载体,包被的慢病毒可以在人脂肪细胞中实现过表达效果,为后续功能研究奠定了基础。 相似文献
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目的 观察miR-143在遗传性ob/ob肥胖小鼠与正常对照组C57/BL6J小鼠肝脏、骨骼肌中的差异表达,初步探讨miR-143在肥胖及相关脂代谢紊乱发生中的作用.方法 选择16周龄的ob/ob小鼠与C57/BL6J小鼠各12只,采用实时荧光定量聚合酶链反应技术检测两组小鼠肝脏、骨骼肌中miR-143的表达水平.结果 miR - 143在ob/ob小鼠肝脏中的表达水平明显高于C57/BL6J小鼠(P<0.05),但在骨骼肌中的表达水平两组无显著性差异(P>0.05).结论 miR-143可能参与了ob/ob小鼠肝脏脂质代谢紊乱的发生. 相似文献
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目的:探讨苏北某三甲医院骨科腰椎间盘突出症手术患者住院费用的影响因素,为有效控制腰椎间盘突出症手术患者住院费用提供参考。方法选取2011—2015年腰椎间盘突出症手术患者2090例,根据疾病诊断相关组(DRGs)方法,按伴发症数目将患者分为5组,按年龄将患者分为2组,探讨不同分组住院费用的差异。结果腰椎间盘突出症手术患者按不同伴发症分组,各组间住院费用有统计学意义,F=2.958,P=0.045;腰椎间盘突出症手术患者按年龄分组,两组间住院费用没有统计学意义,t=-0.908,P=0.39。结论以伴发症为截点对腰椎间盘突出症手术患者住院费用进行分类具有可行性,有利于腰椎间盘突出症手术患者住院费用的控制和诊疗规范的监控。 相似文献
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目的对hsa-miR-335进行系统的生物信息学分析,预测hsa-miR-335可能参与的生物学过程,为本研究小组深入研究其在脂肪细胞分化中的功能和机制奠定基础。方法通过miRbase获取并分析hsa-miR-335序列特征;应用TargetScan,PicTar及miRanda预测hsa-miR-335的靶基因,并结合已证实的靶标基因,进行功能注释(Gene Ontol-ogy)和Pathway富集分析(Pathway Enrichment)。应用NCBI Mapviewer、UCSC Genome Browser等工具对hsa-miR-335进行启动子相关预测。结果 miR-335在各物种之间具有高度保守性,其靶基因功能富集于胰腺外分泌、脂质激酶活性调控、wnt受体信号的调控、细胞周期等生物学过程(P〉0.01),其靶基因信号通路富集于促性腺激素释放激素信号通路、MAPK信号通路、胰岛素信号通路、细胞周期等信号转导通路(P〈0.05)。启动子预测提示hsa-miR-335为基因内miRNA,在基因组上下游10kb以内存在CpG岛,转录起始位置(TSS)、Poly A信号、转录因子结合位置(TFBS)。结论 hsa-miR-335预测的靶基因集合富集于多个生物学过程,与肥胖密切相关,并可能存在其独立的转录调控机制。为后续miR-335在肥胖人脂肪细胞中生物学功能研究奠定基础。 相似文献