结核分枝杆菌喹诺酮类药物耐药与犵狔狉基因突变的初步研究

摘要：目的　初步了解福建省结核分枝杆菌分离株喹诺酮类药物耐药性与犵狔狉基因突变的关系。方法　对
来源于福建省结核病耐药性监测３０ 个监测点纳入的７５ 株耐多药结核分枝杆菌分离菌株,行包含犵狔狉犃、
犵狔狉犅基因喹诺酮类药物耐药决定区（ＱＲＤＲ）序列测定,以结核分枝杆菌Ｈ３７Ｒｖ标准株ＤＮＡ 序列为参比
序列进行比较分析。结果　７５株耐多药结核分枝杆菌中,５６株氧氟沙星敏感株均未检测到犵狔狉犃基因发生
突变,１９株氧氟沙星耐药株检测到１６株（８４．２１％,１６／１９）犵狔狉犃基因发生突变,其中９株突变发生在第
９１位密码子,４株发生在第９４位密码子,３株发生在第９５位密码子,发现Ｓｅｒ９５Ａｓｎ为新突变类型;所有
菌株均未检测到犵狔狉犅基因发生突变。结论　犵狔狉犃基因突变是耐喹诺酮结核分枝杆菌耐药性的主要分子机
制;犵狔狉犃基因的突变主要发生在第９１位、９４位、９５位密码子上。
关键词：结核分枝杆菌;耐药性;喹诺酮;犵狔狉基因;突变
中图分类号：Ｒ３７８．９１１,Ｒ９７８　　文献标识码：Ａ　　文章编号：１００９ ６６３９ （２０１４）０７ ０６４１ ０３     

结核性脑膜炎临床分离株的耐药性和基因型相关性分析

目的 了解结核性脑膜炎（tuberculous meningitis,TBM）的致病菌在耐药性和基因型方面的相关性.方法 从500例疑似TBM患者脑脊液标本中经MGIT（Mycobacteria growth indicator tube）960培养仪分离培养出25株结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis,Mtb）,对这25株Mtb分别进行间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）法基因分型、14种抗结核药物的药物敏感性试验、10个耐药基因测序.结果 20株为北京基因型,占80.0％（20/25）;耐多药结核性脑膜炎（MDR TBM）有3株（3/25）,都属于北京基因型;测序结果显示inhA、embB、gyrB、eis 基因未发生突变,katG、rpoB、gyrA、rrs-KAN、rpsL、gidB基因发生突变.结论 北京基因型在耐药TBM中所占比例高,尤其是MDR-TBM.耐药TBM临床分离株与相关耐药基因突变有关系.     

福建省结核分枝杆菌多位点可变数目串联重复序列基因分型研究

目的 了解福建省结核分枝杆菌的多位点可变数目串联重复序列基因分型(MLVA)的特征.方法 选择15个可变数目串联重复位点(VNTR),检测福建省30个耐药监测点临床分离的结核菌株,结果使用BioNumerics (Version 4.5)软件进行聚类分析.结果 313株结核菌被分为9个基因群(Ⅰ～Ⅸ),分别包含220、9、48、2、1、3、10、10、10株菌,以Ⅰ群为主(70.3％,220/313);Ⅰ群菌株异烟肼、链霉素、乙胺丁醇和耐多药的耐药率与其他基因群的差异无统计学意义(P＞0.05),但利福平(RFP)耐药率为33.2％(73/220),明显高于其他群菌株RFP的耐药率20.4％(19/93),差异有统计学意义(P＜0.05).结论 福建省结核分枝杆菌菌株存在明显的基因多态性,以Ⅰ群菌株为主,并与RFP耐药性具有相关性,应加强此类菌株流行的监测.     

我国耐药结核病的危险因素——2007年全国结核病耐药基线调查资料分析

目的 探索新登记、复治患者发生耐药、耐多药结核病的危险因素。 方法2007年4-12月中国进行了全国结核病耐药基线调查,调查覆盖全国31个省、自治区和直辖市,以省分层,采用多阶段整群抽样方法从全国结核病防治系统中随机抽取70个调查点,调查期间每个调查点纳入新登记涂阳新患者51例和复治患者17例。临床医师采用信息表收集患者的相关信息,通过当面询问患者填写治疗史信息,如有可能查阅患者医疗记录进行确认,治疗信息的准确性经另一位临床医师再次询问患者进行复核。采用比例法进行药敏试验,检测药物包括异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇、卡那霉素和氧氟沙星。 结果 多因素分析结果表明,对于新登记、治疗时间少于1个月(OR=1.6, 95% CI＝1.1～2.1)发生耐药结核病的风险较高;而女性（OR=1.4, 95% CI＝1.0～2.1）和进行过结核病药物治疗（OR=2.4, 95% CI＝1.5～3.7）是发生耐多药结核病的危险因素。对于复治患者,女性（OR=1.7,95% CI＝1.1～2.7）、既往有过2次及以上治疗且最近1次在结核病专科医院治疗（OR=4.0, 95% CI＝1.2～14.0）发生耐药结核病的风险较高;而女性（OR=2.3, 95% CI=1.5～3.6）、生活在实施DOTS较晚（2000年以后）的地区（OR=1.7, 95% CI＝1.2～2.4）、既往有过2次及以上治疗且最近1次在结核病专科医院外的其他医疗机构治疗（OR=3.3, 95% CI＝2.1～5.2）、既往有过2次及以上治疗且最近1次在结核病专科医院治疗（OR=13.0, 95% CI＝3.9～46.0）是产生耐多药结核病的危险因素。 结论 进行过结核病治疗的新登记产生耐药、耐多药结核病的风险较高;患者为女性、既往有过2次及以上的结核病治疗史是复治患者产生耐药、耐多药结核病的危险因素。     

重庆市结核分枝杆菌临床分离株的基因分型及相关耐药性分析

目的 对重庆市结核分枝杆菌临床分离株进行基因分型,研究不同基因型在重庆的流行情况,并分析基因型与耐药表型的关系。 方法 收集2011年1-12月重庆市结核病防治所分离的113株结核分枝杆菌临床分离株,采用比例法进行药物敏感性检测;应用间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）和PCR方法对113株结核分枝杆菌临床分离株进行基因分型。 结果 在113株结核分枝杆菌临床分离株中,可分为北京家族和非北京家族,分别占77株（68.1%,77/113）和36株（31.9%,36/113）;北京家族菌株中现代型为48株（62.3%,48/77）,古代型为29株（37.7%,29/77）;非北京家族菌株中,T1型高达13株（36.1%,13/36）,发现9种新基因型。北京家族菌株耐药率为24.7%（19/77）,非北京家族菌株耐药率为38.9%（14/36）,差异无统计学意义（χ²=2.40,P>0.05）。现代型北京家族菌株耐药率为27.1%（13/48）,古代型北京家族菌株耐药率为20.7%（6/29）,差异无统计学意义（χ²=0.39,P>0.05）。 结论 重庆地区结核分枝杆菌具有明显的基因多态性,其主要流行基因型为北京家族,其中北京家族中主要为现代型;北京家族菌株、非北京家族菌株均与耐药性无明显相关性。     

结核分枝杆菌环介导恒温扩增（LAMP）快速检测方法的评价

目的 对国内建立的结核分枝杆菌DNA环介导恒温扩增（loop-mediated isothermal amplification, LAMP）快速检测方法进行了介绍和评价。 方法 实验菌株来源于北京结核病胸部肿瘤研究所。以结核分枝杆菌作为研究对象,设计了4 条LAMP 引物特异地识别结核分枝杆菌中 gyr B 基因的6个特殊区域。所有的菌株样本提取DNA作为模板,加入LAMP反应管后,65 ℃恒温反应60 min即可。其结果可以通过肉眼观察到的颜色变化来判断。 结果 实验共验证了79株临床和标准菌株。对于菌株的培养物,LAMP实验的灵敏度为100%,特异度为92%。 结论 结核分枝杆菌LAMP快速检测方法是一种快速、可靠的结核分枝杆菌诊断方法。     

耐异烟肼和链霉素的结核分枝杆菌临床分离株与敏感株差异蛋白表达研究

目的 鉴定结核分枝杆菌对异烟肼和链霉素耐药相关的潜在蛋白。 方法 以药物敏感株（01105）和标准株H37Rv为对照,核素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)结合Nano液相色谱-串联质谱分析仪（LC-MS-MS）技术和生物信息学,鉴定并相对定量结核分枝杆菌对异烟肼与链霉素耐药的临床分离株02166菌体蛋白。 结果02166菌株分别与01105菌株和H37Rv菌株比较差异表达蛋白为153个和130个,02166菌株与01105菌株和H37Rv比较差异表达蛋白均为86个(共同差异表达蛋白)。差异表达蛋白理论相对分子质量和等电点分布广泛,相对分子质量从7.63~326.22,等电点从3.74~12.48,其主要参与中间代谢、呼吸作用和脂类代谢。共同差异表达蛋白：9个核糖体蛋白（Rv0056、Rv0651、Rv0652、Rv0701、Rv0719、Rv1630、Rv2785c、Rv2909c和Rv3458c）在02166菌株中表达下调;5个蛋白（Rv0234c、Rv2466c、Rv2626c、Rv2986c和Rv3118）在02166菌株中呈显著差异表达,其中琥珀酸半醛脱氢酶（Rv0234c）和假定未知蛋白（Rv2466c）在02166菌株中表达上调倍数>1.2,DNA结合蛋白HU同系物hupB（Rv2986c）、假定未知蛋白(Rv2626c和Rv3118)在02166菌株中表达下调倍数<0.5。 结论iTRAQ发现了耐异烟肼和链霉素的结核分枝杆菌临床分离株差异表达蛋白,为进一步探讨结核分枝杆菌异烟肼或链霉素耐药机制奠定了基础。     

结核分枝杆菌γ-干扰素释放试验及临床应用专家意见(2021年版)

γ-干扰素释放试验(IGRA)是世界卫生组织推荐的用于诊断结核分枝杆菌感染的体外免疫学方法,也是我国肺结核诊断标准中用于活动性结核辅助诊断的手段之一。近年,IGRA的方法和技术不断发展和更新,在国内的临床应用中也积累了丰富的经验。本专家意见在中华医学会结核病学分会2014年编写的《γ-干扰素释放试验在中国应用的建议》基础上,根据最新发展和临床经验进行修订和完善,从原理和技术进展、质量控制、结核潜伏感染诊断的应用、活动性肺结核辅助诊断应用、特殊人群中的应用以及常见药物对IGRA结果的影响六个部分提出专家意见,以期为IGRA在中国的临床应用提供指导。     

GSK656与克拉霉素、阿奇霉素体外协同抗脓肿分枝杆菌的活性研究

目的 评价3-氨甲基-4-卤代苯并恶唑类化合物GSK656与大环内酯类药物克拉霉素、阿奇霉素联合用药对脓肿分枝杆菌的体外抗菌活性。方法 收集2016—2018年期间首都医科大学附属北京胸科医院菌株库保存的非结核分枝杆菌共80株,包括脓肿分枝杆菌30株,堪萨斯分枝杆菌7株,胞内分枝杆菌37株,鸟分枝杆菌5株和偶发分枝杆菌1株;将30株脓肿分枝杆菌纳入本研究。用微孔阿尔玛蓝检测法(MABA法)测定GSK656、克拉霉素和阿奇霉素对脓肿分枝杆菌的体外最低抑菌浓度(MIC),并采用棋盘稀释法检测GSK656分别与克拉霉素、阿奇霉素联合用药时的体外抗菌作用。结果 克拉霉素对脓肿分枝杆菌的MIC为0.031~16mg/L, 其耐药率为10.0%(3/30)。阿奇霉素对脓肿分枝杆菌的MIC为0.125~64mg/L,其耐药率为30.0%(9/30)。GSK656对脓肿分枝杆菌分离株的MIC₅₀和MIC₉₀分别为0.25mg/L和2mg/L。在GSK656-克拉霉素联合中,6株(20.0%,6/30)表现为协同作用,23株(76.7%,23/30)为无关,1株(3.3%,1/30)为拮抗;在GSK656-阿奇霉素联合中,3株(10.0%,3/30)为协同,18株(60.0%,18/30)为无关,9株(30.0%,9/30)为拮抗,GSK656联合克拉霉素组与GSK656联合阿奇霉素组的联合效应差异有统计学意义(χ²=8.010,P=0.018)。结论 GSK656具有良好的体外抗脓肿分枝杆菌的活性。GSK656联合克拉霉素组与GSK656联合阿奇霉素组的联合效应有差异,其中拮抗效应在GSK656与阿奇霉素联合用药时更多见。     

三种因素对痰培养结果的影响

目的通过分析痰标本阳性级别、患者治疗情况和储存时间等三种因素对培养结果的影响,为基层实验室开展临床痰培养提供参考依据。方法对江苏连云港第四人民医院实验室2010年1～10月痰培养数据进行分析。结果该实验室涂阳患者痰培养共计611份,分别统计了痰标本阳性级别、患者治疗情况和储存时间对培养结果的影响,结果表明标本的储存时间对涂阳培阴率和污染率都有显著影响,痰标本的阳性级别和患者的治疗情况仅影响涂阳培阴率,而不影响污染率。结论基层实验室在开展痰培养临床诊断时应提高标本质量,并且在收集到标本3d内完成痰培养;此外,需要进一步摸索适用于低阳性级别和复治患者的痰培养的方法,以保证痰菌培养获得理想的结果。