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目的 基于基因组Survey分析对刺果甘草Glycyrrhiza pallidiflora Maxim.基因组大小和杂合率进行估计,并通过叶绿体基因组序列特征对其在甘草属Glycyrrhiza L.中的系统发育位置进行研究。方法 使用二代测序技术对刺果甘草进行测序,采用K-mer方法对测序reads进行分析,估算刺果甘草基因组大小和杂合率,使用生物信息学方法进行叶绿体基因组组装、注释和系统发育分析。结果 Survey分析结果显示其基因组大小约为577.82 Mb,杂合度约为0.31%,重复序列比例约为53.72%。叶绿体基因组长度为127,267 bp,不具有典型的四分体结构,总GC含量为34.32%,包含110个基因,其中76个蛋白质编码基因,30个tRNA基因和4个rRNA基因。系统发育分析表明,刺果甘草与圆果甘草G. squamulosa Franch.亲缘较接近。结论 刺果甘草存在低杂合和重复序列较多的特点,为了更好地对全基因组进行序列拼接和组装,可尝试采用三代测序结合二代测序的分析策略进行基因组组装;刺果甘草叶绿体全基因组比对和系统发育分析,为后续开展甘草属遗传多样性研究和分子鉴定标记筛选提供了重要依据。 相似文献
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通过对12例因寒湿环境所致的工作相关浸渍足病例分析,探讨浸渍足的发病原因及临床特点,为工作相关浸渍足病的防治提供参考。 相似文献
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目的分析分泌性磷蛋白1(SPP1)在肝细胞癌中的表达,探索其对肝癌患者预后的影响。方法基于Oncomine数据库,对肝细胞癌中的SPP1差异表达情况进行分析,探讨其意义;利用Kaplan Meier-Plotter在线分析工具,对患者生存情况进行分析;基于String数据库在线构建蛋白互作网络。结果在筛选到的4项研究中,肝癌组SPP1基因的表达分别为4.92±0.24,0.35±0.30,-0.92±0.29和5.12±0.50,与相应正常组表达量1.96±0.28,-1.23±0.06,-2.93±0.13和1.89±0.31相比较均显著增高,差异均有统计学意义(均P <0.001);SPP1高表达组患者诊断后总体中位生存期为37.8个月,较SPP1低表达组(84.4个月)明显降低,差异有统计学意义(P <0.001);在男性(41.0个月vs 84.7个月)、亚洲人群(7.2个月vs 56.2个月)、GradeⅢ级(5.7个月vs23.7个月)或未感染肝炎病毒患者(25.2个月vs 70.5个月)亚组中的总体生存期均显著下降(错误发现率<5%,P <0.001)。透明质酸受体、整合素β1、基质金属蛋白酶7、金属蛋白酶组织抑制因子1、白细胞介素6和纤维连接蛋白1等是显著的节点基因。结论 SPP1与肝细胞癌进展显著相关,高SPP1表达与HCC患者的不良存活密切相关。 相似文献
64.
目的 Dof(DNA binding with one finger)家族是高等植物中特有的一类转录因子家族,参与植物中光、激素、非生物胁迫等多种胁迫响应调控。本研究基于全基因组数据对黄花蒿Dof(AaDof)转录因子家族进行鉴定及表达模式分析,探究Dof家族基因在青蒿素合成调控中的作用。方法 经PFAM数据库鉴定获得AaDof序列,通过生物信息学软件分析其理化性质、亚细胞定位、基因结构、蛋白保守结构以及启动子序列结合元件等,并基于赤霉素(Gibberellic acid, GA)、紫外线B(UV-B)及二者协同胁迫下黄花蒿转录组数据对其表达模式进行分析。结果 本研究从全基因组水平共鉴定出51个AaDof基因,均含有保守的C2-C2单锌指结构,依据系统发育分析分为8个亚族,同一亚族内基因结构与蛋白保守结构域相对保守。亚细胞定位预测显示12个AaDof蛋白定位在细胞外,其余均定位在细胞核。启动子元件分析发现AaDof家族基因启动子区富含光、激素等多种响应元件。对AaDof在GA、UV-B和GA+UV-B处理下的表达模式分析发现,AaDof基因对GA胁迫处理响应较弱,仅有少量基因敏感,其表达主要受到UV-B胁迫影响。C1及C2.1亚族大部分基因在UV-B胁迫下上调表达,而A亚族大部分基因在UV-B胁迫下下调表达。qRT-PCR验证表明AaDof1、AaDof17和AaDof44在GA和UV-B处理下表达量显著上调,推测其可能通过参与GA和UV-B调控网络,正向调控青蒿素生物合成。结论 本研究系统鉴定了黄花蒿AaDof家族基因并筛选了3个可能正向调控青蒿素生物合成的候选AaDof基因,为黄花蒿Dof家族基因功能研究及其在青蒿素生物合成中的调控机制解析奠定基础。 相似文献
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66.
67.
68.
熊雪丹 《实用中西医结合临床》2022,22(14)
目的:探索舒适干预实施在鼻窦炎中的临床效果及对其生活质量的影响分析。方法:选择100例鼻窦炎患者为试验对象,分成2组以简单随机化法进行,对照组50例,实验组50例,收治纳入时间为2020年1月-2021年12月;对照组给予常规干预,实验组实施舒适干预。比较两组的症状消失时间(鼻塞症状、流脓涕症状、头痛症状)、心理状态评分、临床效果、生活质量改善情况、舒适度评分、睡眠质量评分等。结果:实验组的干预后SAS评分及干预后SDS评分均低于对照组(P<0.05);实验组干预后躯体功能评分、生理功能评分、情感状况评分高于对照组;干预后临床干预总满意度、临床效果高于对照组(P<0.05);实验组的鼻塞症状消失时间、流脓涕症状消失时间、头痛症状消失时间均短于对照组(P<0.05);实验组的舒适度评分、睡眠质量评分明显优于对照组(P<0.05)。结论:在鼻窦炎干预中落实实施舒适干预的临床效果极佳,能够改善患者的负性情绪,改善症状,提升生活质量评分,且临床干预满意度高,值得推广。 相似文献
69.
70.
《中华医院管理杂志》2022,(3):184-190
目的分析2009年至2019年我国不同地区、医疗机构和人群住院率变化情况, 为国家制定相关决策提供参考。方法从我国历年卫生统计年鉴数据中获取2009年至2019年我国住院率的相关数据, 分析不同地区和不同医疗机构的住院率和每百门急诊入院人数、不同人群住院率及不同病种住院率变化情况。数据采用描述性分析和频数分析。结果我国住院率持续升高, 从2009年的9.95%升至2019年的19.03%。其中, 东、中、西部地区住院率分别由9.7%、9.9%、10.8%升至17.0%、19.3%、21.5%, 年平均增速分别为5.8%、6.9%和7.1%。公立医院住院量增加了1.2倍, 民营医院增加了4.5倍;三级、二级、一级医院及基层医疗机构住院量分别增长292.9%、80.8%、166.4%、4.5%; 2009年至2018年, 医院每百门急诊入院人数从4.5人增至5.7人, 2019年下降至5.6人。城市居民住院率增长幅度小于农村居民;0~4岁和≥55岁居民住院率增速最快。近年来出院疾病以肺炎、急性上呼吸道感染、糖尿病、高血压等常见病、慢性病和多发病为主。结论医改十年间我国住院率持续上升, 整体... 相似文献