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黄花蒿Dof基因家族鉴定及在GA-UV处理下对青蒿素生物合成的影响
引用本文:王星文,向丽,邬兰,马婷玉,尹青岗,师玉华.黄花蒿Dof基因家族鉴定及在GA-UV处理下对青蒿素生物合成的影响[J].世界科学技术-中医药现代化,2022,24(5):110-122.
作者姓名:王星文  向丽  邬兰  马婷玉  尹青岗  师玉华
作者单位:中国中医科学院中药研究所中药鉴定与安全性评估重点实验室,中国中医科学院中药研究所中药鉴定与安全性评估重点实验室,中国中医科学院中药研究所中药鉴定与安全性评估重点实验室,中国中医科学院中药研究所中药鉴定与安全性评估重点实验室,中国中医科学院中药研究所中药鉴定与安全性评估重点实验室,中国中医科学院中药研究所中药鉴定与安全性评估重点实验室
基金项目:中国中医科学院科研管理处中国中医科学院科技创新工程项目(CI2021A05103):基于青蒿药材的兽用产品开发,负责人:向丽;中国中医科学院科研管理处优秀青年科技人才(创新类)培养专项(ZZ13-YQ-101):应用CRISPR/Cas9基因编辑技术培育高青蒿素含量青蒿品种的研究,负责人:师玉华。
摘    要:目的 Dof(DNA binding with one finger)家族是高等植物中特有的一类转录因子家族,参与植物中光、激素、非生物胁迫等多种胁迫响应调控。本研究基于全基因组数据对黄花蒿Dof(AaDof)转录因子家族进行鉴定及表达模式分析,探究Dof家族基因在青蒿素合成调控中的作用。方法 经PFAM数据库鉴定获得AaDof序列,通过生物信息学软件分析其理化性质、亚细胞定位、基因结构、蛋白保守结构以及启动子序列结合元件等,并基于赤霉素(Gibberellic acid, GA)、紫外线B(UV-B)及二者协同胁迫下黄花蒿转录组数据对其表达模式进行分析。结果 本研究从全基因组水平共鉴定出51个AaDof基因,均含有保守的C2-C2单锌指结构,依据系统发育分析分为8个亚族,同一亚族内基因结构与蛋白保守结构域相对保守。亚细胞定位预测显示12个AaDof蛋白定位在细胞外,其余均定位在细胞核。启动子元件分析发现AaDof家族基因启动子区富含光、激素等多种响应元件。对AaDof在GA、UV-B和GA+UV-B处理下的表达模式分析发现,AaDof基因对GA胁迫处理响应较弱,仅有少量基因敏感,其表达主要受到UV-B胁迫影响。C1及C2.1亚族大部分基因在UV-B胁迫下上调表达,而A亚族大部分基因在UV-B胁迫下下调表达。qRT-PCR验证表明AaDof1AaDof17AaDof44在GA和UV-B处理下表达量显著上调,推测其可能通过参与GA和UV-B调控网络,正向调控青蒿素生物合成。结论 本研究系统鉴定了黄花蒿AaDof家族基因并筛选了3个可能正向调控青蒿素生物合成的候选AaDof基因,为黄花蒿Dof家族基因功能研究及其在青蒿素生物合成中的调控机制解析奠定基础。

关 键 词:黄花蒿  Dof转录因子  青蒿素  紫外线B  表达分析
收稿时间:2021/11/9 0:00:00
修稿时间:2022/6/16 0:00:00

Identification of Dof Gene Family in Artemisia Annua and Its Effect on Artemisinin Biosynthesis under GA-UV Treatment
Wang Xingwen,Xiang Li,Wu Lan,Ma Tingyu,Yin Qinggang and Shi Yuhua.Identification of Dof Gene Family in Artemisia Annua and Its Effect on Artemisinin Biosynthesis under GA-UV Treatment[J].World Science and Technology-Modernization of Traditional Chinese Medicine,2022,24(5):110-122.
Authors:Wang Xingwen  Xiang Li  Wu Lan  Ma Tingyu  Yin Qinggang and Shi Yuhua
Institution:Key Laboratory of Beijing for Identification and Safety Evaluation of Chinese Medicine, Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences,Key Laboratory of Beijing for Identification and Safety Evaluation of Chinese Medicine, Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences,Key Laboratory of Beijing for Identification and Safety Evaluation of Chinese Medicine, Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences,Key Laboratory of Beijing for Identification and Safety Evaluation of Chinese Medicine, Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences,Key Laboratory of Beijing for Identification and Safety Evaluation of Chinese Medicine, Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences,Key Laboratory of Beijing for Identification and Safety Evaluation of Chinese Medicine, Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences
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