慢性乙型肝炎与HLA-A和DRBl基因关联研究

乙肝病毒(HBV)的清除和预后转归在很大程度上取决于宿主的免疫应答。人类白细胞抗原(HLA)复合体是调节机体免疫应答的重要基因群，为此，我们利用基因芯片技术分析了上海地区慢性乙型肝炎患者HLA Ⅰ类中的A位点与HLA Ⅱ类中的DRB1位点的基因分布，以探索乙型肝炎慢性化与HLA-A和HLA-DRB1的可能关联。     

cDNA基因芯片数据分析软件的研发进展

数据分析与挖掘是基因芯片研究的关键和难点,而软件是数据分析方法实现的主要手段。我们从以下几个方面对cDNA基因芯片分析软件进行了综述。首先介绍了芯片数据的获取及分析的软件,然后概述了不同统计软件在芯片数据分析中的应用,并详细介绍几种常用的芯片数据分析软件,最后简述了基因网络分析及数据挖掘方面的软件。     

脂多糖诱导的小鼠腹腔巨噬细胞基因表达谱分析

目的　利用基因芯片技术分析脂多糖 (LPS)活化的小鼠腹腔巨噬细胞基因表达谱 ,以更全面地了解LPS诱导的巨噬细胞反应。方法　以未刺激的和用 1mg/LLPS刺激的小鼠腹腔巨噬细胞制备3 3 P标记的cDNA探针 ,分别与含有 1176个已知基因的小鼠cDNA芯片杂交。结果　活化组和未刺激组间的 2倍差异表达基因为 118个 ,3倍差异表达基因为 6 9个 ,其中 4 4个上调 ,2 5个下调。转录因子、细胞内信号调节蛋白、炎症细胞因子和细胞凋亡相关基因的转录发生明显的调节变化。结论提供了LPS活化的巨噬细胞综合基因表达信息 ,并筛选出一些新的可能与LPS活化相关的基因。     

基因芯片技术检测环境中常见致病菌的初步研究

目的：为了快速，准确地检测环境中存在的致病菌，建立一种采用基因芯片技术对环境中常见致病检测和鉴定的实验方法。方法：采用合成后点样的方法把自行设计合成的一系列寡核苷酸探针固定在经过醛基化修饰的显微镜载玻片上，制成用于致病菌检测的基因芯片。结果：在相同的条件下，扩增了涉及12个菌属的151株细菌的165rDNA基因片段并与基因芯片杂交，经Scan-Array3000芯片阅读仪扫描得到特异性的交杂图，归纳这些杂交图，得到一套属（种）特异的典型杂交图谱。待检的样品菌与基因芯片进行杂交，得到的杂交结果与典型图谱比对即可判断出样品的种类。用这样的方法对从实际样品中分离的细菌进行检测，准确率表达了96．2％（25／26）。结论：该项技术的建立为今后更大规模的检测研究奠定了基础，可以推广应用于感染性疾病诊断，环境监测，食品卫生监督，商品检验检疫等领域。     

滋养层细胞侵入相关基因在先兆子痫胎盘中的表达

探讨与滋养层侵入有关的细胞外基质分子相关基因在先兆子痫胎盘中的表达，采用分别点样有220余种人细胞因子相关基因和人类激素相关基因cDNA片段的两款基因芯片，检测经过严格配伍的先兆子痫和正常胎盘组织的基因表达谱差异。结果显示：钙粘蛋白、胶原、整合素、选择蛋白等18种细胞外基质分子基因的表达在先兆子痫和正常胎盘组织间相差2倍以上，且全部表现为在先兆子痫胎盘中的表达增强。先兆子痫患者的胎盘组织中基质金属蛋白酶(MMP)-10、-13、-15和金属蛋白酶组织抑制因子(TIMP)-2、TIMP-3、纤溶酶原、纤溶酶原激活物等的表达均较正常者高。提示胎盘中细胞外基质分子及其降解酶基因表达异常可能与先兆子痫的病理发生关系密切。     

应用基因表达谱芯片研究硫化砷作用后K562细胞基因表达的变化

目的：利用基因表达谱芯片检测K562细胞在硫化砷作用前后基因表达的差异性进行比较研究。方法：研究对象为人慢性粒细胞白血病细胞株K562,用cy3和cy5两种不同的荧光染料通过逆转录反应将K562经硫化砷作用前后的mRNA分别标记成两种探针,并与载有一组靶的基因表达谱芯片进行杂交,通过计算机扫描分析得到这些基因在经硫化处理前后的表达差异,结果：筛选出包括与DNA结合,转录和转录因子,蛋白翻译,细胞周期等相关表达差异的基因共11条,其中7条表达上调,4条表达下调,结论：周期素E2,周期素G2可能参与硫化砷诱导K562细胞凋亡发生机制。     

基因芯片技术及其应用

基因芯片的产生仅10年左右的时间,但在制备方法及应用方面都得到了极快的发展。本对基因芯片的产生及发展、主要制备原理以及应用作了概括的介绍。目前,基因芯片最常用的介质是表面修饰了特殊基团的玻片,使DNA分子通过共价键同玻片相连。通常被固定的元素是DNA片段或寡核苷酸。最常用的制备技术是直接点样法,即以针点或喷点的方式制备微矩阵基因芯片;此外,还有原位合成法及电定位法等制备芯片。基因芯片的应用概括起来有两大用处;检测基因的量及检测基因的结构（质）,前主要用于大规模检测基因表达的改变情况;后主要指DNA的序列分析,包括测序及再测序、SNP分析、突变检测等,因此在后基因组研究、分子诊断及分子检测方面具有广阔的应用前景。     

基因芯片在恶性胶质瘤研究中的应用

胶质瘤是一种恶性程度极高、侵袭性极强的肿瘤,临床治疗极为困难。目前肿瘤的基因治疗仍存在较多的理论和技术问题,主要原因在于未能从分子水平阐明胶质瘤的发生、发展及转移过程中基因的表达调控机制,因而,筛选恶性胶质瘤差异表达基因及寻找肿瘤相关基因显得尤为必要。基因芯片是最新发展起来的可应用于高效、快速的大规模筛选肿瘤相关基因的技术,将对肿瘤的分子病理分型和临床治疗、预后判断起到推动和促进作用。本文对基因芯     

微矩阵基因芯片筛选喉鳞癌相关基因的研究

目的：应用基因微矩阵方法筛选喉鳞癌相关基因。方法：按一步法抽提喉鳞癌和对照喉正常组织的总ＤＮＡ并纯化ｍＲＮＡ;将４０９６种人类基因ＰＣＲ产物用ＣａｒｔｅｓｉａｎＰｉｘｓｙｓ７５００点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上,制成基因芯片;将等量的对照组织和喉鳞癌组织ｍＲＮＡ分别逆转录合成荧光分子掺入的ｃＮＤＡ－链做探针,混合后杂交上述基因芯片,经严格洗片后用ＳｃａｎＡｒｒａｙ３０００扫描仪扫描芯片     

基因表达谱芯片在胰腺癌相关基因筛选中的应用研究

目的：探讨基因表达谱芯片技术在高通量筛查肿瘤相关基因群及研究胰腺癌分子病理变化中的应用价值。方法：应用含有４０９６条人类全长基因的ｃＮＤＡ表达谱芯片,对３例临床切除的胰腺癌及正常胰腺标本的基因表达谱进行分析。结果：在３例胰腺癌和正常胰腺组织中均有差异表达的基因３９８条,其中新基因２８９条,老基因１０９条。从老基因中筛选出有显著表达差异基因３７条,其中在胰腺癌组织中上调基因２０条,下调基因１７条。结