Genomic and single nucleotide polymorphism analysis of infectious bronchitis coronavirus

Infectious bronchitis virus (IBV) is a Gammacoronavirus that causes a highly contagious respiratory disease in chickens. A QX-like strain was analysed by high-throughput Illumina sequencing and genetic variation across the entire viral genome was explored at the sub-consensus level by single nucleotide polymorphism (SNP) analysis. Thirteen open reading frames (ORFs) in the order 5′-UTR-1a-1ab-S-3a-3b-E-M-4b-4c-5a-5b-N-6b-3′UTR were predicted. The relative frequencies of missense: silent SNPs were calculated to obtain a comparative measure of variability in specific genes. The most variable ORFs in descending order were E, 3b, 5′UTR, N, 1a, S, 1ab, M, 4c, 5a, 6b. The E and 3b protein products play key roles in coronavirus virulence, and RNA folding demonstrated that the mutations in the 5′UTR did not alter the predicted secondary structure. The frequency of SNPs in the Spike (S) protein ORF of 0.67% was below the genomic average of 0.76%. Only three SNPS were identified in the S1 subunit, none of which were located in hypervariable region (HVR) 1 or HVR2. The S2 subunit was considerably more variable containing 87% of the polymorphisms detected across the entire S protein. The S2 subunit also contained a previously unreported multi-A insertion site and a stretch of four consecutive mutated amino acids, which mapped to the stalk region of the spike protein. Template-based protein structure modelling produced the first theoretical model of the IBV spike monomer. Given the lack of diversity observed at the sub-consensus level, the tenet that the HVRs in the S1 subunit are very tolerant of amino acid changes produced by genetic drift is questioned.     

慢性支气管炎痰培养结果及病原菌分析

目的 了解反复感染慢性支气管炎患者的痰培养及病原菌分布情况。方法 采用无菌操作采集患者晨痰，1h内送检，接种于血琼脂平板上，经37％，24h培养，怀疑有致病菌生长者进行相关的生化鉴定和药物敏感试验。结果 在136例患者，共72例痰培养阳性，阳性率52．9％，痰培养连续3次为单一细菌者为16例，阳性率为11．8％。16例患者痰菌结果分别为：溶血性链球菌6例，绿脓杆菌4例，克雷伯杆菌2例，产气杆菌2例，阴沟杆菌2例，136例患者386例次痰菌培养，106例次阳性（27．5％），而连续3次以上培养为同一细菌，仅为42例次（10．8％）；非相同单一痰菌培养64例次，占16．6％。结论 慢性支气管炎是一种内科常见病，其急性发作期患者易发生肺心病、心力衰竭和呼吸衰竭，所以了解其病原菌组成，对指导临床用药是非常必要的。     

浓百合剂对慢性支气管炎大鼠肺组织中肿瘤坏死因子和内皮素含量的影响

目的探讨浓百合剂对实验性慢性支气管炎治疗作用的内在机制。方法采用改良烟熏法复制大鼠慢性支气管炎模型,实验分组为模型组,浓百合剂高剂量组、中剂量组、低剂量组、地塞米松组,并设不加处理的正常组。造模各组以高、中、低剂量浓百合剂、地塞米松、生理盐水进行干预,测定各组大鼠肺组织中肿瘤坏死因子(TNF)和内皮素(ET)的含量。结果模型组大鼠肺组织中TNF和ET的含量均较正常组明显升高(P<0.01)。与模型组相比较,治疗各组肺组织中TNF和ET含量均明显降低(P<0.05或P<0.01)。结论TNF和ET在慢性支气管炎的病理生理过程中起着重要作用,浓百合剂通过降低TNF和ET含量,控制炎症反应。     

丝裂原活化蛋白激酶亚族p38信号转导通路与慢性支气管炎的关系

丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)是体内四大信号转导系统之一,现已发现p38、ERK5/BMK1、ERK以及JNK/SAPK 4个亚族。它参与介导生长、发育、分裂、分化、死亡及细胞间功能同步等多种细胞过程,其中p38通路在炎症反应过程中起着非常重要的作用。在慢性支气管炎(chronic bronchitis)的进程中,p38通路通过对肺泡巨噬细胞(AM)等多种细胞的作用、对多种炎症因子生成的调控、对酶的诱导以及促进转录因子活化等机制来调节炎症过程的发生发展。该文就p38通路在慢支发病中的作用及研究进展作一综述。     

三家三级甲等医院急性支气管炎抗菌药物使用合理性分析

目的 讨论分析三家三甲医院在治疗急性支气管炎疾病过程中,抗菌药物的使用情况及合理性.方法随机抽取各医院在2006年1月至2006年7月间的病例,甲院57例,乙院69例,丙院60例.并利用各病例的血常规检查报告、体温、抗菌药物使用情况及住院费用等进行统计比较分析.结果三家医院抗茵药物选择与使用情况相近,但甲院稍合理些,但也都有需要改善的地方.甲院抗菌药物使用人次为94.74%,乙院与丙院均为100%.抗菌药物联合使用情况,甲院联合使用率为40%,乙院49%,丙院55%.结论 三家医院的抗菌药物使用都存在不合理性,均有待进一步提高.     

痰热清注射液治疗急性支气管炎的疗效观察

目的:观察痰热清注射液对治疗急性支气管炎的疗效,为临床用药提供参考。方法:采用随机对照实验,将72例患有急性支气管炎的患者随机分为两组,其中,对照组37例用常规抗菌药、抗病毒药等对症治疗。治疗组35例在常规用药的基础上加用痰热清注射液20mL,疗程均为5天。观察治疗前后临床症状改善情况、疗效及安全性。结果:在相同对症治疗的基础上加用痰热清注射液,治疗组和对照组的总显效率分别为82.9%和48.6%,两组总显效率差别有统计学意义(P<0.05),治疗组疗效明显优于对照组。结论:治疗急性支气管炎加用痰热清注射液可明显提高疗效。     

三子咳喘胶囊治疗慢性支气管炎痰湿阻肺证疗效观察

目的：验证三子咳喘胶囊对慢性支气管炎（痰湿阻肺证）的疗效,并对其安全性作出客观评价.方法：采用随机、双盲、平行对照试验,将慢性支气管炎痰湿阻肺证患者58例随机分为试验组43例,对照组15例.试验组口服三子咳喘胶囊2粒/次,空白模拟剂3粒/次,每日3次;对照组口服桂龙咳喘宁胶囊5粒/次,每日3次,疗程均为10天.结果：临床总体疗效：试验组临床控制率23.26%,显效率39.53%,有效率37.21%,愈显率62.79%;对照组临床控制率20.00%,显效率33.33%,有效率46.67%,愈显率53.33%.中医证候疗效：试验组临床控制率20.93%,显效率37.21%%,有效率41.86,愈显率58.14%;对照组临床控制率20.00%,显效率33.33%,有效率46.67%,愈显率53.33%.两组对咳嗽、咳痰、喘息均有明显疗效.以上疗效组间均无明显差异（P＞0.05）.结论：三子咳喘胶囊临床疗效确切,未发现明显毒副反应,与桂龙咳喘宁胶囊相仿.     

哮喘患者诱导痰嗜酸性细胞阳离子蛋白、嗜酸细胞趋化因子的改变及其意义

目的:探讨嗜酸性细胞阳离子蛋白(ECP)、嗜酸细胞趋化因子(eotaxin)在嗜酸细胞性气道炎症和气流阻塞发生中的作用。方法:收集单纯型慢性支气管炎(A组)、支气管哮喘(B组)急性发作期患者各30例和健康对照者(C组)20名,分别给予肺功能检测和痰诱导检查。用荧光免疫法和酶联免疫法(ELISA)分别测定诱导痰上清液中ECP、eotaxin浓度。结果:B组[(22.5±10.3)%]诱导痰嗜酸细胞占白细胞百分比(EOS/Leu%)分别与A组[(12.3±8.6)%]、C组[(1.4±0.9)%]比较,差异有显著性(P均<0.05);B组eotaxin浓度[(0.286±0.136)g/L]与A组[(0.142±0.018)g/L]、C组[(0.028±0.043)μg/l]比较,差异有显著性(P均<0.05);B组ECP浓度[(248.1±102.3)μg/l]与A组[(123.6±87.9)g/L]、C组[(30.9±18.5)μg/l]比较,差异有显著性(P均<0.05)。B组EOS/Leu%、eotaxin浓度和ECP浓度与一秒钟用力呼气容积占预计值百分比(FEV1%)均呈负相关(r分别=-0.769、-0.658、-0.524,P<0.001或0.005);B组ECP浓度与eotaxin浓度呈正相关(r=0.785,P<0.001),与EOS/Leu%呈正相关(r=0.614,P<0.001),eotaxin浓度与EOS/Leu%呈正相关(r=0.569,P<0.02)。结论:eotaxin可能通过对EOS的选择性趋化作用使其释放ECP等一系列炎性介质参与了嗜酸细胞性气道炎症和气流阻塞的发生机制。     

顺尔宁治疗儿童哮喘疗效观察及护理

目的：探讨白三烯受体拮抗剂-顺尔宁治疗儿童哮喘的疗效及护理。方法：对80例儿童哮喘患儿随机分为治疗组及对照组，治疗组在对照组的基础上加用顺尔宁，治疗过程中严密观察患者的症状、不良反应、呼气流量峰值占预计值的百分比（PEF％）及复发率。结果；治疗组症状缓解及肺部体征消失时间明显缩短，复发率低于对照组，PEF％1d、3d和5d均较对照组增高，20d时两组无显著性差异誊结论：顺尔宁在治疗儿童哮喘中疗效确切、依从性好、服用方便、副作用少，减少复发，可替代预防性激素吸入。