Phylogenetic analysis of severe fever with thrombocytopenia syndrome virus in Korean water deer (Hydropotes inermis argyropus) in the Republic of Korea

Severe fever with thrombocytopenia syndrome (SFTS) is an emerging zoonotic tick-borne disease caused by SFTS virus, which circulates among ticks and their host animals, including wildlife. However, few studies have examined SFTS virus infection in wildlife present in the Republic of Korea (ROK). We evaluated SFTS virus infection in tissue samples from Korean water deer (Hydropotes inermis argyropus), one of the most common wild ungulates in ROK. In this study, we evaluated tissue samples of 129 water deer carcasses collected in 2017 and detected SFTS viral RNA by conventional PCR. SFTS viral RNA was found in 3 of the 129 carcasses, showing a prevalence of 2.3 %; 2 of which were collected in Gyeongsangnam-do and 1 of which was in the Gangwon-do region. Among the 6 internal organs studied, only the spleen samples were positive. Phylogenetic analysis revealed close relationships between deer- and human-derived strains. The medium segments of the three positive cases clustered with genotype B, which is the predominant genotype in ROK. In the small segment, two cases clustered with genotype B, samples 17WD044 and 17WD065. The third sample, 17WD068 from Gangwon-do province, showed genotype A, which circulates mainly in China. The disagreement in the genotypes of the two tested segments suggests a potential reassortment between genotype A and B, resulting in genetic recombination as observed in sample 17WD068, which may be co-circulating in China and Korea. Further studies in wildlife and humans are necessary to understand the genetic characteristics of SFTS viruses circulating in ROK.     

四川省2004－2018年钩端螺旋体病流行特征分析

目的 了解2004-2018年四川省钩端螺旋体病（钩体病）流行病学特征,为防控策略提供依据。方法 钩体病数据来源于全国法定传染病疫情监测网络直报系统和11个监测点数据,采用描述性流行病学方法分析,采用ArcGIS 10.2软件进行地图绘制,采用SaTScan 9.1.1软件进行时空扫描分析,描述钩体病时空聚集性特征。结果 2004-2018年四川省报告钩体病发病2 834例,死亡41例,发病率0.23/10万,死亡率0.003/10万,发病趋势波动向下。发病有明显季节性,主要集中在8月下旬至9月底,较水稻收割时间晚1~2周。男性为主,男女性别比为2.05：1;发病率较高的为50~65岁组。职业以农民为主,占82.75%（2 345/2 834）;其次为学生,占12.74%（361/2 834）,但2011年后学生病例报告极少。高发地区在南部长江流域沿岸马边彝族自治县（马边县）、沐川县等和东部嘉陵江流域仪陇县之间不断交替。时空扫描聚集性分析发现2个高发聚集区域（P<0.001）。11个监测点2004-2018年平均鼠密度为5.44%（14 351/263 767）;主要野外鼠种有四川短尾鼩（占69.07%）、黑线姬鼠（占12.73%）等;其中黑线姬鼠密度介于4.60%~0.19%之间,呈持续下降趋势,2018年达最低水平。鼠肾标本培养钩体阳性率的各年度间也呈下降态势。2007-2018年健康人群血清钩体抗体阳性率平均为24.52%（3 271/13 339）,主要流行菌群为黄疸出血群,近年未出现菌群的更替。结论 2004-2018年四川省钩体病发病水平极低,季节特征符合稻田型流行特征,人群以老年农民为主;高发地区在长江和嘉陵江流域周边互相交替。黑线姬鼠密度和带菌率均较低;主要流行菌群持续以黄疸出血群为主,健康人群钩体抗体阳性率处于较低水平。     

发热伴血小板减少综合征疫情呈上升趋势:基于2015―2020年南京市报告病例数据

  目的  了解南京市发热伴血小板减少综合征(severe fever with thrombocytopenia syndrome, SFTS)的报告发病趋势、流行特征,探究重点防控人群、地区及影响因素,为指导制定防控策略、措施和采取干预行动提供科学依据。  方法  描述2015―2020年南京市SFTS流行趋势和季节、人群及空间分布特征,利用全局空间自相关分析、局部空间自相关分析和FleXScan扫描,探索乡镇/街道层面上报告发病的空间异质性和聚集性。  结果  共报告SFTS确诊病例194例,年均报告发病率为0.39/10万,年度变化百分比(annual percent change, APC)为33.43%(95% CI:5.41%~68.89%, P=0.03),2020年相比2019年增加115%(39例)。5―8月占79.38%,7月为高峰占28.87%。平均年龄为64(54, 71)岁,≥60岁占64.43%,45~＜60岁占27.32%。农民占61.34%,家务待业占12.89%,离退休人员占11.34%。溧水区报告病例数占46.39%。全局空间自相关Moran’s I=0.58(Z=9.97, P=0.001),局部空间自相关与FleXScan扫描结果显示,溧水区除和凤镇外的7个乡镇/街道与江宁区横溪街道为一级聚集区(LLR=150.24, P=0.001),浦口区江浦街道、桥林街道和星甸街道为二级聚集区(LLR=17.81, P=0.001)。  结论  南京市SFTS报告发病率呈上升趋势,≥45岁人群和农民为重点人群,溧水区为重点防控地区。建议及时开展基于危险因素和趋势研判的专题研究,同时强化和落实综合防控干预措施。     

2009―2019年甘肃省发热伴出疹症候群流行特征

  目的  了解2009―2019年甘肃省发热伴出疹症候群(rash and fever syndrome, RFS)的病原构成及季节流行性分布特征,为进一步疾病监测和科学防控提供参考。  方法  采用描述性流行病学方法分析2009―2019年甘肃省RFS病原构成及主要病原的季节性变化特征。  结果  甘肃省RFS病原构成以病毒为主,主要是肠道病毒(56.04%)、麻疹病毒(19.14%)、水痘-带状疱疹病毒(16.85%)和风疹病毒(7.33%);主要病原在不同年龄段、不同季节间的阳性率差异均有统计学意义(均有P＜0.05)。肠道病毒在0~＜5岁和5~＜15岁组阳性率较高(χ2 =393.04, P＜0.001),麻疹病毒在35~＜50岁组阳性率最高(χ2 =150.13, P＜0.001),风疹病毒在15~＜35岁组阳性率最高(χ2 =327.89, P＜0.001),而水痘-带状疱疹病毒在0~＜5岁组最低(χ2 =221.53, P＜0.001);冬季肠道病毒阳性率低于其他季节(χ2 =173.97, P＜0.001);春季麻疹病毒(χ2 =164.46, P＜0.001)和风疹病毒(χ2 =68.90, P＜0.001)阳性率较高;而冬季水痘-带状疱疹病毒阳性率高于其他季节(χ2 =32.90, P＜0.001)。  结论  2009―2019年甘肃省RFS病原构成以病毒为主,且主要病原具有明显的季节性特征,应对重点人群采取季节性针对性预防措施。     

安徽省滁州市发热伴血小板减少综合征危险因素的病例对照研究

目的 探讨安徽省滁州市发热伴血小板减少综合征的发病危险因素,为该病的防治工作提供科学依据。方法 采用性别、年龄、住址匹配的1:4配对病例对照研究,对安徽省滁州市的发热伴血小板减少综合征病例和选取的对照人群进行问卷调查,采用单因素和多因素的配对条件Logistic回归分析筛选危险因素。结果 单因素分析中有统计学意义的变量为:发病前1月与病例接触、接触身上有蜱虫的狗、被蜱虫叮咬、生活区周围有蜱虫和工作间歇坐卧草地（均有P<0.05）。进一步的多因素分析结果显示:发病前1月与病例接触（OR=5.44,95%CI:1.56~19.04,P=0.004）、接触身上有蜱虫的狗（OR=12.81,95%CI:3.20~51.25,P<0.001）和被蜱虫叮咬（OR=47.25,95%CI:6.94~321.53,P<0.001）是发热伴血小板减少综合征发病的主要危险因素。结论 与病例接触史、接触身上有蜱虫的狗和被蜱虫叮咬是发热伴血小板减少综合征的主要发病危险因素,需加强对高发人群健康宣教和个人防护指导。