大数据时代的临床医学研究——机遇和挑战

临床医学研究是医学发展的核心驱动力。在大数据背景下,国家高度重视、重点支持,通过顶层设计为我国临床医学研究提供制度保障和资源支撑。多组学与信息技术的飞速发展,为我国临床医学研究提供了宝贵的资源,助力临床医学研究内容的持续创新,催化临床诊疗模式的不断变革,我国临床医学研究正面临新的机遇。然而,目前我国生物医学大数据还存在存储碎片化、数据交汇机制缺乏等问题,亟需建立政府主导的数据共享机制,寻求通力合作的研究模式。在新的时代背景下,依托大数据的真实世界研究将逐渐成为临床干预的重要证据来源,我们要加强临床数据资源和生物样本资源的积累,创新研究方法,打破传统思维模式,迎接新的机遇与挑战。     

Derlin⁃1对非酒精性脂肪肝形成的影响

目的：探讨内质网相关降解蛋白1（endoplasmic reticulum correlative protein 1,Derlin?1）在非酒精性脂肪肝组织中的表达情况及其通过对蛋白激酶R样内质网激酶（protein kinase R?like ER kinase,PERK）,即内质网应激中未折叠蛋白反应感受蛋白的影响,抑制非酒精性脂肪肝（non?alcoholic fatty liver disease,NAFLD）的发生机制。方法：通过免疫组织化学染色及Western bolt技术检测NAFLD小鼠肝脏组织中Derlin?1的表达;在HepG2细胞中利用质粒过表达Derlin?1,以Western blot技术检测其对内质网应激信号通路PERK的影响。结果：Derlin1在NAFLD肝组织中表达明显高于正常肝脏组织;过表达Derlin?1能抑制内质网应激信号通路的激活。结论：Derlin1在NAFLD肝组织的高表达提示其可能通过抑制内质网应激中未折叠蛋白反应感受蛋白PERK,减少内质网应激,阻止肝脏细胞脂肪变。     

NF⁃κB p65调控IRF⁃8基因启动子活性及其启动子结合元件的初步鉴定

目的：探讨大鼠核因子?κB（nuclear factor?κB,NF?κB）p65亚基在细胞内过表达和其活性变化对干扰素调节因子?8（interferon regulatory factor?8,IRF?8）基因启动的影响,并初步筛查IRF?8启动子上可能的p65结合元件。方法：采用聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）技术扩增大鼠p65基因蛋白编码区（complete sequence coding,CDS）序列,将其插入到空载pIRES2?EGFP质粒中,构建大鼠野生型（wild type,WT）p65过表达质粒（pIRES2?p65 WT）。在此基础上,将p65第535位丝氨酸（serine,S）突变为天冬氨酸（aspartic,D）或丙氨酸（alanine,A）,分别构建p65持续活化突变型质粒（pIRES2?p65 S535D）和p65显性负性突变型质粒（pIRES2?p65 S535A）。之后应用生物信息学软件预测IRF?8基因启动子区p65的结合元件,并据此构建IRF?8启动子全长（full?length,FL）和3个截短的荧光素酶报告质粒,即pGL3?IRF?8?FL（-1 892 ~ +174 nt）、pGL3?IRF?8?1（-1 360 ~ +174 nt）、pGL3?IRF?8?2（-752 ~ +174 nt）和pGL3?IRF?8?3（-68 ~ +174 nt）。将上述质粒行不同组合共转染人胚肾293T（human embryonic kidney 293T,HEK?293T）细胞,Western blot和荧光素酶实验分别检查p65的表达和IRF?8的启动子活性,并分析IRF?8启动子区可能的p65结合元件。结果：菌液PCR及测序证实上述质粒构建成功。分别将pIRES2?p65 WT、pIRES2?p65 S535D、pIRES2?p65 S535A和pGL3?IRF?8?FL共转染HEK?293T,发现过表达pIRES2?p65 WT或pIRES2?p65 S535D均可明显增加IRF?8启动子活性,且以pIRES2?p65 S535D更为显著;而过表达pIRES2?p65 S535A后,IRF?8启动子活性无明显变化。将pGL3?IRF?8?FL、pGL3?IRF?8?1~3和pIRES2?p65 S535D共转染HEK?293T后发现,pGL3?IRF?8?3的启动子活性显著低于pGL3?IRF?8?FL、pGL3?IRF?8?1和pGL3?IRF?8?2,提示大鼠IRF?8启动子-752~68 nt区域可能存在p65结合元件。结论：在HEK?293T细胞内过表达野生型或持续活化突变型p65可显著促进IRF?8基因的启动,且p65与IRF?8启动子的结合元件可能位于-752~-68 nt部位。     

肺隐球菌病75例回顾分析

目的：分析肺隐球菌病（pulmonary cryptococcosis,PC）的临床特征、实验室检查、影像学特点、诊断及治疗。方法：回顾性分析2009年6月—2019年6月在南京医科大学第一附属医院经病理确诊的75例PC患者的临床资料。根据免疫状态分为免疫正常组（43例）和免疫受损组（32例）。结果：75例患者中,男50例,女25例,年龄（48.2±12.4）岁（17~80岁）。主要临床症状为咳嗽、咳痰、发热。27例患者无症状。两组淋巴细胞计数、纤维蛋白原、癌胚抗原、细胞角蛋白19片段、红细胞沉降率水平比较,差异有统计学意义（P＜0.05）。PC影像学表现无特异性,结节肿块型33例、浸润实变型25例、混合型17例,两组在三者表现上比较,差异无统计学意义（P＞0.05）。截至2019年9月30日,除4例失访外,59例患者行单独抗真菌药物治疗,12例患者行手术联合抗真菌药物治疗,治愈48例,好转18例,死亡5例。单独接受氟康唑治疗的有效率为96.4%（53/55）。结论：PC在免疫正常患者中并不罕见,其临床及影像学表现无特异性。诊断主要依赖病理学检查。常用的抗真菌药物对PC治疗效果较好,多数患者预后良好。     

生物气溶胶研究进展

自2019年12月以来,新型冠状病毒肺炎（coronavirus disease 2019,COVID?19）已引起全球大流行。我国最新COVID?19诊疗方案指出,在相对封闭的环境中长时间暴露于高浓度气溶胶情况下存在经气溶胶传播的可能。气溶胶是固体或液体颗粒在气体中的悬浮物,由于其空气动力学直径小,易在下呼吸道沉积,与飞沫相比更易引起肺炎等严重疾病。本文对生物气溶胶作文献复习并阐述其对COVID?19防护带来的启示。     

CAR⁃T细胞技术研究进展及发展趋势

由于存在肿瘤异质性和免疫抑制微环境等因素,CAR?T细胞治疗实体瘤还未显示出明显的临床疗效。针对实体瘤治疗,近年在CAR?T细胞制备方面已有较大进展。本文就近年来在实体瘤治疗方面CAR?T细胞技术的研究进展和未来发展趋势进行评述。     

多组学数据整合分析的统计方法研究进展

复杂疾病往往是由环境因素、遗传因素（多个组学层面）共同作用所致。全面分析不同分子水平的信息对认识疾病的发生发展至关重要。多组学数据整合分析能够提高特征筛选检验效能、改善疾病预测精度。本文从统计学角度出发,对多组学数据整合分析的统计理论方法研究进展做一述评。     

肾功能亢进患者万古霉素血药浓度监测与临床疗效分析

目的：调查分析肾功能亢进（augmented renal clearance, ARC）患者使用万古霉素的用药剂量、谷浓度及临床疗效。方法：回顾性研究2013年7月-2017年3月在某院住院期间使用过万古霉素并进行了血药浓度监测的67例ARC患者和142例肾功能正常患者病历资料,比较2组万古霉素给药方案、谷浓度及临床疗效。结果：ARC组与肾功能正常组初始给药的日剂量分别为（2.0±0.3） g和（1.8±0.4） g,具有显著性差异（P=0.041）。ARC组初始给药方案下谷浓度均值（8.3±5.2） mg·L^-1明显低于肾功能正常组的谷浓度均值（14.3±8.4） mg·L^-1,有显著性差异（P=0.000）。ARC患者的初始给药方案谷浓度达标率为20.6%,肾功能正常组为40.1%,具有显著性差异（P=0.007）。ARC组万古霉素的临床总有效率和革兰阳性菌清除率分别为69.1%和67.6%,肾功能正常组为76.7%和81.6%,均无显著性差异（P=0.286;P=0.143）。结论：多数ARC患者初始方案万古霉素用药剂量不足,谷浓度达标率较肾功能正常患者更低。     

滁州市屈光不正幼儿生活环境因素分析

目的探讨影响屈光不正幼儿的生活环境因素。方法 2017年7-8月,采取随机整群抽样的方法选取滁州市儿童保健机构门诊中462名1～3岁儿童(924眼)为筛查对象,采用美国伟伦Sure Sight视力筛查仪筛查屈光状态,并对其家长进行问卷调查,了解和比较屈光正常与屈光不正幼儿的生活环境因素(饮食习惯、居住和睡眠环境、用眼习惯)的差异,再通过logistic回归模型分析找出关键影响因素。结果本次共筛选出343名屈光正常与119名屈光不正幼儿。与屈光正常幼儿相比,屈光不正幼儿经常吃鱼、胡萝卜、绿色蔬菜、硬质食物、家庭采光比较好、每日户外活动30 min以上的比例明显较低,而从不吃油炸、被动吸烟、开灯睡觉、经常哭闹、喜欢看亮的灯、看电视时眼睛与电视不同水平的比例明显较高,多因素logistic回归分析结果显示:经常吃绿色蔬菜(OR=0. 122)、经常吃硬质食物(OR=0. 357)是幼儿屈光不正的保护因素,看电视时眼睛与电视不在同一个水平(OR=1. 381)是屈光不正的危险因素。结论幼儿屈光不正与饮食、用眼习惯有关。     

南京市某地区大气多环芳烃污染及空气微生物多样性相关分析

目的：研究南京大气中多环芳烃污染水平,探究大气多环芳烃浓度与空气微生物群落的相关性。方法：采用气相色谱?质谱联用仪定量分析2019—2020年春秋季南京市大气中多环芳烃（polycyclic aromatic hydrocarbon,PAH）的浓度;同时采用16S rRNA测序测定空气中微生物群落,对大气PAH的浓度与微生物群落进行Pearson相关性分析。结果：通过分析2019年和2020年大气PAH浓度数据发现,大气中菲Phe、荧蒽Fla和芘Pyr占主要成分,2019年秋季大气PAH浓度明显高于春季。2019年大气总PAH浓度高于2020年。在微生物门水平上,厚壁菌门（Firmicutes）、放线菌门（Actinobacteria）、变形菌门（Proteobacteria）均为2019年和2020年的优势菌门。在微生物属水平上,芽胞杆菌属为2019年与2020年共同优势菌属。同时,PAH污染与微球菌属（放线菌门）和芽胞杆菌属（厚壁菌门）的丰度呈正相关。结论：大气PAH污染可能与空气微生物的种类和丰度的变化有关,并具有潜在的健康风险。