环状RNA在肿瘤免疫中的作用研究进展

环状RNA（circRNAs）是一类具有共价闭合连续环结构的内源性非编码RNA，越来越多的证据表明circRNAs在多种肿瘤中异常表达，并参与肿瘤恶性进展。最近研究报道，circRNAs可以调节免疫细胞功能，募集免疫相关分子，影响肿瘤微环境，进而促进肿瘤细胞免疫逃逸。本文就circRNAs与免疫细胞、免疫相关分子以及circRNAs在肿瘤免疫中的作用研究作一综述。     

环状RNA在心血管系统中的表达与功能

环状RNA（circular RNAs,circRNAs）是一类首尾通过共价键衔接构成封闭环状的单链RNA分子。与线性的RNA分子不同,它没有5′端帽子和3′ 端poly(A)尾巴,传统的RNA检测手段不易识别。高通量测序技术的应用及日益成熟使得人们逐渐认识到circRNAs在哺乳动物各组织大量、稳定存在,并在多种疾病的发生发展过程中起着重要的作用。本文就circRNAs的生物合成、功能和其在心血管疾病发生发展中的作用及机制进行综述。     

环状RNA在免疫应答及肺部感染性疾病中的作用

环状RNA作为非编码RNA家族中的新成员,具有作为微RNA海绵、调控亲本基因的表达、结合RNA结合蛋白、编码蛋白质等重要功能。近年来,随着对环状RNA研究的不断深入,其在诸多疾病发生发展过程中所发挥的重要作用被不断揭示,大多集中在肿瘤、神经系统疾病、动脉粥样硬化和糖尿病等方面。目前发现环状RNA在与包括肺结核、急性呼吸窘迫综合征、病毒性肺炎在内的肺部感染性疾病中差异表达,可能与环状RNA作为微RNA海绵来调节免疫反应、巨噬细胞极化以及诱导先天免疫基因表达等机制有关。这提示环状RNA在肺部感染性疾病的治疗干预方面提供了新的潜力并且可以作为诊断标志物。     

胃癌组织环状RNA表达谱分析

目的: 研究胃癌组织环状RNA（circular RNAs,circRNAs）表达的变化,以及circRNAs-miRNAs-mRNAs的竞争性内源RNA网络调控的机制。方法: 从GEO（Gene Expression Omnibus）数据库中选出GSE78092、GPL19978（GSE83521和GSE89143）、GSE100170和STAD（未上传）共5个数据集,分析其差异表达circRNAs,并利用Starbase、TargetScan等数据库进行生物信息学分析。结果： 从胃癌组织与癌旁组织共获得734个差异表达的circ-RNAs,根据P＜0.05、差异表达倍数＞1.5倍筛选得到17个circRNAs。用Starbase数据库分析circRNAs和miRNAs的互作关系,共发现354个靶miRNAs,并利用GEO数据库（GSE23739）验证筛选得到46个miRNAs,利用TargetScan数据库分析其靶向的mRNAs。京都基因与基因组百科全书（kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）分析和基因本体论（gene ontology,GO）分析表明靶基因主要在转录调控、RNA代谢过程、细胞内信号级联和蛋白质定位等方面促进或者抑制胃癌的发生发展。结论： 差异分析表达的17个circRNAs形成circRNAs-miRNAs-mRNAs的竞争性内源RNA网络,可通过调控转录和RNA代谢等过程调节胃癌的发生发展。     

基因芯片筛选人牙周膜干细胞成骨分化生物学标记物的研究

目的：发现牙周膜干细胞（PDLSCs）骨向分化后显著高表达的环状RNA（circRNA）,探索circRNA在PDLSCs骨向分化中生物学标记物的作用。方法用酶消化法体外培养牙周膜细胞,通过免疫磁珠法分选出PDLSCs。用普通培养基和成骨诱导培养基分别培养PDLSCs 21 d,茜素红染色检测矿化结节的形成,RT－qPCR检测碱性磷酸酶（ALP）、骨钙素（OCN）和Runt相关转录因子2（Runx2）的表达。采用Arraystar公司的circRNA芯片检测PDLSCs骨向分化前后整体circRNAs的差异表达,将芯片中上调变化最显著的前10位circRNAs进行PCR引物设计,RT－qPCR检测circRNA的表达情况。结果 PDLSCs骨向诱导21 d后,茜素红染色阳性,有大量矿化结节形成,ALP、OCN和Runx2表达量明显升高。 Hsa＿circ＿0008433在PDLSCs骨向诱导21 d后显著高表达。结论Hsa＿circ＿0008433将来可能是PDLSCs骨向分化新的生物学标记物。     

调控食管胃结合部腺癌增殖、侵袭能力的关键环状RNA分子的筛选与初步鉴定

目的：利用RNA高通量测序和生物信息学分析筛选出调控食管胃结合部腺癌（adenocarcinoma of esophagogastric junc－tion,AEG）增殖、侵袭能力的关键环状RNA分子,并对其作用方式进行初步探究。方法：提取22对食管胃结合部腺癌组织及癌旁正常黏膜组织的RNA。采用RNA高通量测序（测序深度200×）,利用生物信息分析云平台进行差异基因筛选,同时对差异表达的基因构建共表达网络和circRNAs-miRNAs-mRNAs间的内源性RNA竞争机制（ceRNA）网络;利用RNA图谱共表达网络构建和内源性竞争RNA负相关分析,筛选出在AEG发生过程中可能发挥关键作用的circRNAs。并预测可与该circRNA存在ceRNA关系的miRNAs和mRNAs;通过qRT-PCR等方法对该circRNA在胃癌组织、癌旁组织中的表达进行验证。结果：通过RNA高通量测序,共预测得到46 553个circRNAs,对测序数据进行严格质控,得到26个差异表达的circRNAs（fold change≥2或fold change≤0.5,false discovery rate<0.05）,其中10个circRNAs表达上调,16个circRNAs 表达下调。对组织样本进行mRNA和miRNA测序分析,构建circRNAs-miRNAs-mRNAs间的ceRNA网络、RNA图谱共表达网络和内源性竞争RNA负相关分析。结果表明,has_circ_0007766在AEG肿瘤组织中特异性高表达,可能在AEG发生发展过程中起关键作用;同时发现,miR4492与circRNA0007766和MET mRNA均有结合位点。结论：has_circ_0007766可能通过miR4492-circRNA0007766-MET mRNA的ceRNA网调控食管胃结合部腺癌增殖、侵袭,是AEG发生发展的关键circRNA。     

环状RNA与支气管哮喘相关性研究

环状RNA（circular RNA，circRNA）是一类特殊的非编码RNA，参与许多细胞过程，与多种疾病的发生发展相关。circRNA在先天免疫、炎症反应中发挥重要作用，已有研究表明circRNA与慢性炎症性疾病关系密切。哮喘是一种慢性气道炎症，其发病机制尚不明确。本文就circRNA与哮喘的关系进行综述。     

microRNA在慢性阻塞性肺疾病中的研究进展*

【摘要】 微小RNA（microRNA）是一种非编码小分子单链非编码RNA，其通过与靶mRNA3＇非翻译区结合，使转录后的基因表达沉默的长度约为22个核苷酸的小RNA分子，从而在转录后水平调控基因的表达，参与炎症、免疫及肿瘤的发生。近年来，研究发现microRNA与慢性阻塞性肺疾病（chronic obstructive pulmonary disease，COPD）的发生发展密切相关，提示microRNA在COPD的预防和治疗中起着重要的作用，可为COPD的预防和治疗提供新的药物靶点及生物标记物。本文就microRNA与COPD的研究进展作一综述。     

环状RNA在结直肠癌中的研究进展

环状RNA是近年来发现的一类非编码竞争性内源RNA,它是一种无5'-3'结构和Poly A尾的闭合共价连续的环状结构。在哺乳动物体内大量存在,并在转录或者转录后水平通过与微小RNA和其他分子结合调节相关基因进而影响其功能的表达。尽管关于环状RNA的研究还不够清晰,但是越来越多的研究表明环状RNA与多个疾病相关,尤其在多个恶性肿瘤中异常表达,其与结直肠癌关联密切,有望成为新型结直肠癌标记物和靶点,并应用于结直肠癌的早期诊断和治疗中。     

环状RNA与环境相关疾病

人类疾病的发生发展是环境因素与遗传学因素相互作用的结果。环境有害暴露导致的机体功能紊乱和疾病发生，与细胞内环状RNA(circRNA)的表达异常有密切关系，circRNA的功能和作用是医学研究的热点领域。circRNA是表观遗传学的一类具有环状结构的RNA分子，由于其特殊的结构和复杂的功能，在调控疾病发生和病理过程中承担着重要角色。本文系统地介绍了circRNA的来源、功能，结合作者课题组的研究成就，综述了circRNA在环境有害暴露相关疾病中的作用和机制，探讨了circRNA作为潜在生物标志物在研究中所面临的挑战。     

A potential role of circular RNAs in bone destruction of rheumatoid arthritis

Bone destruction in rheumatoid arthritis (RA) is a pathological state that always accompanies the development of RA patients, which will cause severe deformation of their joints and decline in quality of life. Circular RNAs (circRNAs) are a class of RNA molecules with circular structure, which are widely existed in a variety of organisms and play special biological functions in a variety of diseases. There has been evidence that circRNAs can act as miRNA sponges and play an important role in the treatment of bone destruction in RA.In this paper, the potential relationship between circRNAs and bone destruction in RA was discussed in terms of the regulation of cell apoptosis, osteoblast and osteoclast differentiation, and the regulation of immune inflammation, so as to provide a new approach for studying the potential mechanism of bone destruction in RA and possible therapeutic methods.     

环状RNA研究进展及临床应用

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类产生于RNA剪切过程的封闭环形RNA分子,主要由外显子和(或)内含子构成,广泛存在于真核细胞内,具有稳定性、物种保守性以及细胞、组织特异性.环状RNA参与细胞内RNA调控网络,与疾病的发生和发展密切相关,可能成为新型的生物标记物及治疗靶点.近年来,关于环状RNA产生、调控、生物学特性、功能及其与疾病的关系等均取得了较大的研究进展.本文综述了真核细胞内源性环状RNA的研究进展及其与疾病的关联.     

环状RNA在胃癌中的研究现状*

环状RNA是一种以闭合共价环结构为特征的非编码RNA,广泛存在于各种真核生物中。近年研究表明,环状RNA并非简单的剪接副产物,其具有丰富的生物学作用,在多种肿瘤和慢性疾病的发生、发展中起到重要作用。胃癌是世界范围内普遍的癌症之一,尽管近年来胃癌的病死率有所下降,但仍是发病率居第4的恶性肿瘤以及癌症相关死亡的第3大原因。有研究表明,环状RNA与胃癌的发生、发展密切相关,该文就环状RNA在胃癌发生、发展过程中的作用以及作为胃癌诊断与预后的新型标志物方面作一综述。     

microRNA的研究进展

微小核糖核酸(miRNA)是一类长20～22个核苷酸的小分子非编码RNA,它通过与靶基因3'端非翻译序列结合促进靶基因降解或抑制翻译过程,从而抑制靶基因表达。miRNA参与生物体的生长、发育和凋亡的调控,并在疾病发生和发展过程中起着重要作用。现从miRNA的产生、作用机制、在生物体发育和疾病发生中的作用、作为生物学标记的研究进展以及病理状态下在胎盘中的差异表达等方面予以综述。     

斑马鱼环状RNA研究进展

环状RNA(circRNA)是一类由前体线性RNA通过反向剪接方式形成的具有环状闭合结构的小分子RNA。其具有结构稳定、高度保守等生物学特征,在各种生物不同发育阶段的生理病理过程中均表现出重要的调控作用。模式动物斑马鱼具有可用于高通量药物筛选、成本低等特点,circRNA及与其相关的发育和炎症疾病可在斑马鱼体内展开更高效的研究。近年来,斑马鱼中的circRNA不断得到鉴定并表征。研究发现,circRNA在斑马鱼的发育进程及炎症反应中扮演着重要的角色。本文就circRNA的分类和特点、生物学功能以及斑马鱼circRNA的研究进展进行综述。     

新型肿瘤靶标环状RNA的研究进展

环状RNA(circRNA)是内源非编码性RNA,多数circRNA被发现可通过发挥微小RNA(miRNA)海绵功能来调控基因表达,此外某些circRNA也会被翻译或与RNA结合蛋白互作发挥作用。circRNA广泛表达于组织和体液中,其表达量的改变与肿瘤的发生发展相关。circRNA的环化特性使其对核糖核酸酶R(RNase R)稳定而不易降解。由于circRNA稳定、种类丰富、可特异性调控肿瘤发生、在体液中高表达,因此有望成为肿瘤相关的诊断、预后和治疗靶标。目前对circRNA的认识相对较少,其发生机制和功能尚未完全解析,circRNA的注释也有待充实。本文总结了circRNA的发生机制、生物学功能和在肿瘤研究中的重要应用。     

冠状动脉旁路移植术后心房颤动患者ceRNA机制的研究

目的探讨环状RNA(circRNAs)在冠状动脉旁路移植(CABG)术后心房颤动(POAF)中的调控机制。方法从基因表达综合数据库(GEO)的数据集基因样本表达集97455(GSE97455)中获得circRNA表达谱,使用GEO2R工具在线分析GSE97455数据集中差异表达的circRNAs(DECs),然后把相应的探针名转换成国际标准circRNA名称,再利用多种生物信息学方法获取circRNAs的靶miRNAs和下游mRNA。筛选最为相关的circRNAs、miRNA及下游靶基因并对筛选结果进行RT-PCR实验验证。最后,利用Cytoscape 3.7.2构建circRNA-miRNA-hub基因调控网络图并可视化分析。结果共得到55个DECs,其中21个circRNAs表达上调,34个circRNAs表达下调。经过深入的分析,最终得到了一个由6个DECs、5个miRNAs和10个hub基因组成的circRNA-miRNA-hub基因网络图。结论本研究为circRNA和circRNA-miRNA-mRNA调控网络在POAF中的作用提供了新的视角,并经RT-PCR实验初步验证。     

Luminal亚型乳腺癌细胞与正常乳腺细胞的circRNA表达谱差异分析

目的探讨环状RNA（circRNA）在Luminal亚型乳腺癌细胞与正常乳腺细胞中表达谱的差异。方法分别提取Luminal亚 型细胞MCF7和正常乳腺细胞MCF10A的总RNA;使用NanoDrop ND-1000对total RNA质量进行检测,用核糖核酸酶R分解 total RNA以除去线性RNA并富集circRNA;利用随机引物法扩增富集的circRNA并转录成荧光cRNA;将荧光标记cRNA杂交 到circRNA微阵列芯片上,扫描得到两种细胞的circRNA表达谱;在Agilent Feature Extraction软件中进行原始数据提取,并对 采集到的阵列图像进行分位数归一化和后续数据处理,进行火山图和聚类热图分析;最后,选取差异表达倍数较高的3 条 circRNA进行实时荧光定量PCR（qPCR）鉴定。结果提取的MCF7和MCF10A细胞总RNA纯度高、完整度较好;扫描微阵列 芯片上标记的荧光信号,发现两种细胞的circRNA 表达谱明显不同;与MCF10A细胞相比,在MCF7 细胞的全部12 910 条 circRNA表达归一化结果中,有5964条上调,81条表达水平一致,6865条下调;表达差异（Log fold change）在2倍以上的有343 条,其中213 条上调,130 条下调;表达差异在5 倍以上的有9 条,其中8 条上调,分别为：hsa_circRNA_061260（6.02 倍）、 hsa_circRNA_103933（5.96倍）、hsa_circRNA_005239（5.84倍）、hsa_circRNA_100689（5.69倍）、hsa_circRNA_004087（5.60倍）、 hsa_circRNA_104420（5.25 倍）、hsa_circRNA_104421（5.13 倍）和hsa_circRNA_101222（5.03 倍）,1 条下调：hsa_circRNA_ 104864（5.09倍）;经qPCR鉴定hsa_circRNA_100689、hsa_circRNA_005239和hsa_circRNA_104864的差异表达趋势与芯片结 果相符。结论Luminal亚型乳腺癌细胞与正常乳腺细胞的circRNA表达差异较大,其中表达上调或下调的circRNA有望成为 Luminal亚型乳腺癌诊断的新靶标。     

microRNA在气道变应性疾病中的研究进展

microRNAs(miRNAs/miRs)是一类非编码的、作用于mRNAs、对蛋白质翻译起调节功能的小片段RNAs分子,在许多疾病(如变应性疾病、肿瘤及感染等)的发病中起着十分重要的作用。气道变态反应性疾病是以气道变应性炎症反应及高反应性为特征的一组慢性气道炎性疾病。近年研究表明,多种miRNAs参与了气道变应性疾病的一系列病理生理过程,包括炎症细胞浸润、细胞因子分泌、气道高反应性及平滑肌细胞增生和表型变化等。因此,miRNAs有望成为治疗此类疾病的新靶点。本文总结了miRNAs在哮喘和变应性鼻炎中的作用及分子生物学机制。