一个中国Usher综合征2型家系中USH2A基因的2个新的致病突变

目的为了扩大USH2A突变的范围并进一步揭示USH2A基因在2型Usher综合征（Usher syndrome type 2, USH2）中的作用,对中国的USH2患者进行了USH2A基因突变筛选。方法从收集到的中国USH2患者及其家属的外周血中提取基因组DNA,设计特异性引物扩增USH2A基因编码区（外显子2-72）并使用Sanger测序研究等位基因并与NCBI数据库中的标准序列进行比对。使用PolyPhen-2等预测软件对筛选出来的突变的致病性进行预测。结果在1例患者中检测到2个之前未报道过的致病的杂合突变c.230dupA(Phe78Valfs*30)和c.4085C＞T(p.Pro1362Leu)。结论通过全外显子测序鉴定了可能导致USH2的2个新的杂合USH2A基因致病突变。这一结果扩大了已知的USH2A基因致病突变的范围。     

两个多发性内分泌腺瘤病2A型家系RET基因突变研究

目的总结2个多发性内分泌腺瘤病2A（MEN2A）型家系的临床特点,及MEN2A家系RET基因突变类型。方法对2个MEN2A家系进行临床调查,分析其临床特点。提取2个家系成员外周血基因组DNA,扩增先证者RET原癌基因的外显子10、11,13—16,并行Sanger测序,测得突变所在的外显子后,将其亲属相应外显子的扩增产物进行测序。结果家系1的先证者及其哥哥的10q11．2外显子11（密码子634）RET原癌基因发生点突变：Cys643Trp。家系2的先证者其兄长存在10q11。2外显子11（密码子634）RET原癌基因发生点突变：Cys643Arg,筛查出1个家系成员为基因突变携带者。结论RET原癌基因第11外显子Cys643Trp杂合突变及Cys634Arg杂合突变,均为MEN2A的致病基因．此2个家系患者虽然突变类型不同,但两家系患者在起病方式、发病年龄及临床表现均相似。基因检测是诊断MEN2A的有效方法。     

一个纯合子Tyr503Cys突变导致的遗传性凝血因子Ⅺ缺陷症家系分析

目的：对一个纯合子Tyr503Cys错义突变导致的遗传性凝血因子XI（FXI）缺陷症家系进行表型和基因检测,寻找致病基因并初步探讨其分子致病机制。方法：检测先证者及其家系成员（共3代5人）的血浆凝血酶原时间（PT）、活化部分凝血活酶时间（APTT）、凝血因子Ⅷ促凝活性（FVIII:C）、凝血因子IX促凝活性（FIX:C）、FXI促凝活性（FXI:C）、凝血因子XII促凝活性（FXII:C）和FXI抗原（FXI:Ag）含量等指标以明确诊断。采用PCR直接测序法分析先证者F11基因所有外显子和侧翼序列,发现突变位点后用反向测序予以证实,并检测家系成员相应的突变位点区域。使用ClustalX-2.1-win软件分析氨基酸突变位点的保守性;用PolyPhen-2、PROVEAN和Mutation Taster软件分析突变对蛋白质功能的影响;用Swiss-PdbViewer软件对突变位点进行蛋白模型和氨基酸相互作用分析。结果：先证者APTT为59.3 s,明显延长,FXI:C降低至13%;其母亲、女儿和儿子的APTT均有不同程度延长,FXI:C降至37%～42%,该家系5人FXI:Ag均在参考值范围。基因分析发现先证者F11基因第13号外显子存在c.1562A＞G纯合错义突变,导致Tyr503Cys突变;其母亲、女儿和儿子存在Tyr503Cys突变杂合子。保守性分析结果表明,Tyr503在同源物种间高度保守。3种生物信息学软件对该突变的预测结果一致,均预示此突变很可能是有害突变,可引起相关疾病。突变蛋白模型分析显示,野生型Tyr503与Ile370、Lys554形成2个氢键;突变型Cys503与Lys554之间新增了一个氢键。结论：该先证者F11基因第13号外显子存在c.1562A＞G纯合错义突变,导致Tyr503Cys突变;推测该纯合突变遗传自具有血缘关系且均存在Tyr503Cys杂合子的父母,并与该家系FXI水平减低有关。     

云南玉溪市一家族性肥厚型心肌病家系致病基因筛查

目的 对云南省玉溪市一个家族性肥厚型心肌病的家系成员进行候选致病基因筛查, 分析基因型和表型之间的关系, 为家族性肥厚型心肌病的分子遗传学机制研究、早期筛查、早期干预治疗提供重要的理论基础.方法 对家系成员进行详细的病史采集、体格检查、常规十二导联心电图、心脏彩超检查;采集外周静脉血样本进行基因学检测.绘制家系遗传图谱, 分析家系遗传特点、基因型及临床表型.结果 该家系肥厚型心肌病的遗传方式以X连锁显性遗传为主.候选基因筛查发现家系中携带GLA、ZFPM2、SCN5A基因的错义突变, 且翻译的氨基酸发生改变.结论 X连锁显性遗传是该家系HCM主要的遗传方式.GLA c.167G>A (p.Cys56Tyr) 杂合或半合子错义突变可能是该家系肥厚型非梗阻性心肌病的主要致病突变.ZFPM2 c.1332G>C (p.Lys444Asn) 杂合错义突变和SCN5A c.5216G>A (p.Arg1739Gln) 杂合错义突变在该家系中临床意义未明.     

一个遗传性抗凝血酶缺陷症家系的表型与基因突变分析

目的：对一例遗传性抗凝血酶（AT）缺陷症患者及其家系成员进行凝血指标和基因表型分析,初步探讨其分子发病机制。方法：在Stago仪器上检测家系各成员外周血的血浆AT活性（AT:A）、AT抗原（AT:Ag）等凝血指标;提取外周血DNA并测序,定位基因突变位点;利用生物信息学软件分析突变对蛋白功能的影响。结果：先证者及其外祖母、父亲、母亲和弟弟的AT:A均有不同程度降低,且AT:Ag同步下降,所有家系成员蛋白S活性（PS:A）和蛋白C活性（PC:A）指标均无明显异常,表现为I型AT缺陷症。基因分析显示：先证者SERPINC1 基因存在第1号外显子c.1A＞G杂合错义突变（p.Tyr2stop）以及第5号外显子c.1005G＞A杂合同义突变;其父亲携带c.1A＞G杂合错义突变,其外婆、母亲和弟弟携带c.1005G＞A杂合同义突变。保守性分析显示,Tyr2在同源物种间高度保守;MutationTaster、PolyPhen-2和LRT三个在线生物信息学软件分析均显示p.Tyr2stop突变为“致病的、有害的”;蛋白模型分析显示,p.Tyr2stop突变会引起AT基因翻译过程提前终止,产生截短蛋白。结论：该先证者及家系成员AT:A和AT:Ag不同程度降低与SERPINC1 基因上存在的c.1A＞G杂合错义突变和c.1005G＞A杂合同义突变有关。     

KIF21A基因p.Arg954Trp突变引起先天性动眼神经麻痹

目的 在先天性动眼神经麻痹家系中定位相关致病基因并克隆该基因. 方法对1个先天性动眼神经麻痹家系(3代共16人)通过血液基因组提取和微卫星连锁分析寻找基因突变所在区域,计算有利连锁优势比的对数值(logarithm of the odds of linkage,LOD),并对该区域内的可能致病基因进行突变筛选和突变验证. 结果微卫星标记连锁分析发现位于12p11-12p12区域的D12S85和D12S345区域显示与该家系疾病紧密连锁,LOD值为2.4.对家系KIF21A基因全部外显子进行的突变检测分析显示21号外显子存在c.2680C＞T(p.Arg954Trp)的碱基改变. 结论 KIF21A基因c.2680C＞T(p.Arg954Trp)突变是导致该先天性动眼神经麻痹的致病因素.     

RET基因Cys 634 Trp突变致多发性内分泌腺瘤2A型

目的 明确一个多发性内分泌腺瘤2A型（MEN2A）家系致病基因PET的基因型。方法 应用PCR技术对RET基因的第10、11、13、14、15和16外显子进行扩增,将扩增产物纯化后双向测序。结果 先证者及其弟弟RET基因第10、13、14、15和16外显子均无异常,第11外显子的第14996位核苷酸存在C-G替代,其反义链测序为14996 G-C替代,这种替代（TGC-TGG）使编码的氨基酸由半胱氨酸突变为色氨酸（Cys 634 Trp,C 634 W）。正常对照RET基因的第10、11、13、14、15和16外显子区域均未见异常。结论 该MEN2A家系的遗传基础是RET基因Cys 634 Trp突变。     

家族性渗出性玻璃体视网膜病变患者TSPAN12基因新突变与表型研究

目的 家族性渗出性玻璃体视网膜病变是一组以视网膜周边血管发育异常为特征的遗传性致盲性眼病,采用二代基因测序技术对8个家族性渗出性玻璃体视网膜病变家系致病基因和临床表型进行研究。方法 选取8个FEVR家系成员行详细的眼科检查,采集先证者及家系成员外周静脉血5 mL,提取DNA,应用包含232个致病基因的遗传性视网膜疾病捕获芯片进行靶向捕获富集高通量测序。测序数据利用在线分析软件对可疑基因变异致病性进行预测,确定致病基因及突变位点,利用Sanger测序对先证者及家系成员进行共分离分析。结果 共收集8个FEVR家系,临床表型为轻至重度,其中4个家系筛查到致病性突变,1个家系发现FZD4基因的已知突变c.757C>T,突变导致第253位的精氨酸变为半胱氨酸;3个家系检测到TSPAN12突变,占75%,其中1个家系检测到TSPAN12基因的一个新的杂合错义突变：c.633T>A,p.Tyr211Ter突变。突变导致第211位的酪氨酸突变而提前终止转录,患者临床表型较轻。结论 此研究鉴定了TSPAN12基因一个新发终止子突变位点p.Tyr211Ter,丰富了TSPAN12基因突变谱,对...     

酪氨酸羟化酶基因新突变导致多巴反应性肌张力障碍家系分析

【目的】研究多巴反应性肌张力障碍（DRD）家系TH基因突变特点。【方法】提取先证者及其父母和两个姐姐外周血基因组DNA,使用高通量测序（NGS）的方法对已知肌张力及运动障碍相关的256个致病基因进行检测。【结果】家系中2例患者（先证者和其大姐）的酪氨酸羟化酶（TH）基因外显子14、9存在c.1481C>T（p.Thr494Met）、c.943G>A（p.Gly315Ser）复合杂合突变,父母分别携带一个杂合突变,其表型正常的二姐和50名正常对照者均未检测到该突变。【结论】TH基因c.1481C>T（p.Thr494Met）、c.943G>A（p.Gly315Ser）突变导致了该DRD家系的基因异常,并且发现了新的TH基因突变,扩展了DRD基因型与临床表型的关系谱,对DRD的早期精准诊断和治疗是改善预后的关键。     

一例Bainbridge-Ropers综合征患儿遗传病因分析

目的：运用遗传学检测方法分析一例具有重度发育迟缓合并先天性心脏病等多发畸形的罕见病患儿的遗传学病因。方法：采集患儿病史、进行临床辅助检查,提取患儿及父母的外周血基因组DNA。用Agilent SureSelect系统构建患儿DNA全外显子组测序文库,用Illumina平台进行测序,对检测到的疑似致病突变在患者及其父母亲血样中进行Sanger测序法验证。结果：全外显子组测序和家系验证发现患儿ASXL3基因存在c.1349dupT;p.I450fs杂合移码突变,为新发突变,根据ACMG变异解读标准与指南判定该变异为致病变异,该突变国内外未见报道。患儿具有喉骨软化、手指背屈特征,目前尚无Bainbridge-Ropers综合征（Bainbridge-Ropers syndrome,BRS）患者携带上述表型的报道。同时患儿DCHS1基因携带已知二尖瓣脱垂 2（mitral valve prolapse 2, MVP 2）杂合致病突变c.G7538A;p.R2513H,该突变已经过细胞和动物试验验证。敲除DCHS1基因可导致斑马鱼房室管畸形,因此DCHS1基因c.G7538A突变可能与患儿房间隔缺损（asparagine,Asn）有关。DCHS1基因突变遗传自患儿父亲,但其父经超声心动图和心电图检查未见心脏结构及功能异常,该致病突变在本家系中外显不全。结论：本研究丰富了ASXL3基因的致病突变谱和BRS表型谱,第一次报道了携带多个致病突变的BRS患者。     

Mutation Identification in A 5-Generation Pedigree with Autosomal Dominant Retinitis Pigmentosa

RetinitisPigmentosa (RP)referstoagroupofinheritedretinaldystrophiesthatarecharacterizedbyprogressivephotoreceptordegeneration InWesterncountriesRPhasareportedprevalenceof 19- 2 7per10 0 0 0 0 [1] Thesimilarprevalenceof 2 5 per 10 0 0 0 0wasalsoobservedinChina[2 ] GenescausingRPhavebeenidentifiedbyacombinationoflinkagemapping ,cloningandcandidatetesting Geneticheterogeneity ,allelicheterogeneityandclinicalheterogeneityhavebeendemonstratedamongpatientswithautosomaldominantRP (adRP) ,auto…     

Frequencies of 6 known mutations in phenylalanine hydroxylase gene and their application in prenatal gene diagnosis]

The known mutant alleles of human phenylalanine hydroxylase gene were analyzed in 25 phenylketonuria (PKU) families from North China by polymerase chain reaction combined with allele-specific oligonucleotide dot hybridization techniques. The results showed that the six mutation accounted for 62% of all PKU genes. The three most frequent mutations were Arg243-->Gln in exon 7, Arg413-->Pro in exon 12 and Tyr204-->Cys in exon 6. They accounted for 24%, 18% and 16% respectively of all PKU alleles. The frequencies of Arg111-->Ter mutation in exon 3, Tyr356-->Ter mutation in exon 11 and Trp326-->Ter mutation in exon 10 were somewhat lower in North China. They accounted for 4% of all PKU alleles. Among these 25 PKU families, prenatal gene diagnosis was possible in 10 families. In 11 families, 50% exclusive diagnosis was possible. Prenatal gene diagnosis was performed and confirmed in 2 families.     

视紫红质和Peripherin/RDS基因在视网膜色素变性家系中的突变检测

目的 对一常染色体显性视网膜色素变性(autosomal dominant retinitis pigmentosa,adRP) 家系进行视紫红质基因(rhodopsin,RHO)、盘膜边缘蛋白/ 视网膜变性慢基因(Peripherin/retinal degeneration slow,Peripherin/RDS)、视杆外节盘膜蛋白1 基因(retinal outer segment membrane protein 1,ROM1)、神经视网膜亮氨酸拉链基因(neural retinal leucine zipper,NRL) 和视锥杆细胞同源盒基(cone-rod homeobox-containing gene,CRX) 基因的突变检测.方法 采集一连续3 代发病的adRP 家系28 名成员外周血,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR) 和直接测序技术,对RHO、Peripherin/RDS、ROM1、NRL 和CRX 基因进行检测,结果与标准核酸序列进行比对和分析.结果 该家系成员在RHO、Peripherin/RDS、ROM1、NRL 和CRX 基因中未发现致病突变,但是在Peripherin/RDS 基因第1 外显子和第3 外显子编码区发现4 处单核苷酸改变.结论 该家系在RHO、Peripherin/RDS、ROM1、NRL 和CRX 基因中未检测到致病突变,Peripherin/RDS 基因外显子中4 处单核苷酸改变属于单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs).     

视网膜色素变性患者视紫红质基因突变分析

目的 研究中国人视网膜色素变性(RP)患者视紫红质(RHO)基因的突变频率及特征,探讨其在RP发病机制中的作用.方法 运用DNA直接测序法,对55例中国内地汉族RP先证者及55例对照者进行RHO全基因突变检测分析.结果 共检出7种碱基变异,其中2种为非致病错义突变,其余5种为非编码区单核苷酸多态性,RP组和对照组各单核苷酸多态性位点突变频率比较,差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 RHO基因在中国华南地区RP 患者中的突变率低于国外报道.检出的已报道的单核苷酸多态性位点与RP无显著相关性.     

Gene mapping of autosomal dominant retinitis pigmentosa in a Chinese family

Background The autosomal dominant form of retinitis pigmentosa （ADRP） can be caused by mutations in 14 genes and further loci remains to be identified. This study was intended to identify mutations in a Chinese pedigree with ADRP.
Methods A large Chinese family with retinitis pigmentosa was collected. The genetic analysis of the family suggested an autosomal dominant pattern. Microsatellite （STR） markers tightly linked to genes known to be responsible for ADRP were selected for linkage analysis. Exons along with adjacent splice junctions of PRPF31 were amplified by polymerase chain reaction （PCR） and screened by direct sequencing.
Results The caused gene of ADRP was mapped to 19q13.4 between markers D19S572 and D19S877, with a maximum LOD score of 3.01 at marker D19S418 （recombination fraction=0）.
Conclusion The affected gene linked to the 19q13.4 in a Chinese family with ADRP, which is different from other mutations at the same loci in other Chinese families.     

全外显子组测序发现一家族性扩张型心肌病致病基因

 目的 对一扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy, DCM)家系行全基因组外显子测序以寻找该家系的致病基因。方法 收集在复旦大学附属中山医院就诊的1位DCM患者及其家系成员的临床资料,采集相关家系成员外周血并抽提DNA,对该家系5名成员行全基因组外显子测序,寻找致病基因,用Sanger测序对家系其他成员进行验证。结果 通过对家系患者与正常人测序结果比对分析,同时经过多个生物数据库数据过滤,发现LMNA基因6号外显子上存在的杂合突变 c.961 C>T (p.Arg321Ter)为该家系的可能致病基因突变。LMNA c.961 C>T无义突变导致LMNA编码蛋白质过程提前终止,相应蛋白质功能异常,进而导致该家系中此突变基因的携带者出现心功能异常。结论 本研究应用全基因组外显子测序从一DCM家系中发现其致病基因及突变位点:LMNA c.961 C>T (p.Arg321Ter),突变导致该家系相关成员心功能异常。此位点在汉族人群中尚属首次报道。     

Two novel mutations of the retinitis pigmentosa GTPase regulator gene in two Chinese families with X-linked retinitis pigmentosa

目的：检测引起两个中国家系产生X连锁视网膜色素变性的RPGR基因突变。方法：以人类基因组DNA为模板,用位于内含子的引物扩增出RPGR基因外显子1-19的PCR片段。PCR产物经SSCP分析后直接进行测序。通过比较病人和正常人相应的DNA顺序,检出基因突变位点。结果：在两个家系检测到两个新突变c1536delC和E332X,它们分别位于RPGR基因的第12和第9外显子（这是两个外显子首次发现的突变）。两突变均可导致翻译提前终止,产生不具备正常功能的截短蛋白。结论：两个突变是相应空系产生视网膜色素变性的遗传学基础,所得结果有助于分析RPGR蛋白功能。