错配PCR—RFLP检测乙型肝炎病毒X基因／C基因启动子变异

设计错配ＰＣＲ－限制性片段长度多态性分析（ＰＣＲ－ＲＦＬＰ）检测中国ＨＢＶ毒株Ｃ基因启动子（ＢＣＰ）区第２个ＡＴ丰富区的一对点突变；核苷酸（ｎｔ）１７６２的碱基由Ａ→Ｔ和１７６４的碱基由Ｇ→Ａ变异。结果发现在３２例慢性ＨＢＶ感染者中ＢＣＰ变异者有１０例总检出率为３１．２％。提示在我国ＨＢＶ毒株ＢＣＰ区这一联合估变较常见。ＰＣＲ－ＲＦＬＰ技术与序列分析结合，对于研究这一新发现的热点变异与临床的关系具     

乙型肝炎病毒核心启动子基因变异及其意义

研究乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）核心启动子（ｃｏｒｅｐｒｏｍｏｔｅｒ，ＣＰ）区基因变异及其意义。方法运用多聚酶链反应（ＰＣＲ）直接测序的方法，对我国４８株ＨＢＶＣＰ区核苷酸序列进行分析。结果６７％的标本在一个或一个以上位点发生了突变，常见变异分布于ｎｔ１７５４～１７６６及ｎｔ１８０１～１８１１；ｎｔ１７７７～１８００及ｎｔ１８１２～１８３６为保守区；ｎｔ１７６４变异多见于ＨＢｅＡｇ阴性患者；ＣＰ与ＨＢＶＸ基因重叠部分有１６个位点发生变异，其中９处导致Ｘ蛋白的氨基酸改变。结论ＨＢＶＣＰ区核苷酸变异较为常见，但与病毒基因转录密切相关的序列十分保守；ｎｔ１７６４变异与ＨＢｅＡｇ阴性变异株（Ｅ阴性变异株）形成有关，但并非重症肝炎的特征性变异；与Ｘ基因重叠处变异的意义需进一步研究。     

乙型肝炎病毒外膜基因插入变异株及野株的全序列测定和系统树分析

用核酸序列分析技术，测定１例乙型肝炎表面抗原（ＨＢｓＡｇ）阴性中国人感染的乙型肝炎病毒ＨＢＶ／ａｄｗ亚型全基因组序列。该变异株全序列为３２２４个碱基，与从同一地区２例ＨＢｓＡｇ阳性携带者得到的ａｄｗ和ａｄｒ全序列的同源性分别为９８．０％和９２．５％，与已出版的Ａ—Ｅ基因组比较，进行了病毒的系统树分析。该变异毒株除在外膜基因Ａ决定簇前有９个碱基插入外，在多种调控元件，包括启动子ＳＰＩ、ＳＰＩＩ、ＣＰ、ＸＰ、增强子ＥＮＩ和ＥＮＩＩ，均无独特的变异点。     

乙型肝炎病毒C基因启动子变异的意义

目的 了解Ｃ基因启动子区Ｔ１７５２Ａ１７６４变异对其启动子的影响。方法ＰＣＲ产物 直接测序，检测重症乙型肝炎患者乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）前Ｃ和Ｃ基因调节序列的Ｔ１７６２Ａ１７６４野株及变异；并将该调节序列插入到氯霉素乙酰转移酶（ＣＡＴ）表达质粒中，转染ＨepＧ２细胞并瞬时表达，比较Ｔ１７６２Ａ１７６４野株及变异株的Ｃ基因启动小区序列及ＣＡＴ表达水平。结果Ｔ１７６２Ａ１７６４变异在使ＣＡＴ表达下调中起主要     

乙型肝炎病毒前C变异体的体外转录和翻译

目的 明确乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）前Ｃ第１７位和２９位密码子突变体对ｅ抗原合成和分泌的影响。方法 用ＰＣＲ方法扩增ＨＢＶ前Ｃ／Ｃ基因区,克隆后测序及进行序列分析。将ＨＢＶ前Ｃ区Ｔ１８６２／Ａ１８９９位点突变体亚克隆入表达质粒ｐＧＥＭＴ中,经体外翻译后,比较野毒株和变异株的表达产物。结果 该前Ｃ区突变在体外仍能合成ＨＢＶｅ前体蛋白。结论 前Ｃ区Ｔ１８６２／Ａ１８９９突变并不能阻断ＨＢＶｅ抗原前体蛋白合成,ｅ抗原前体可能在分泌过程中受阻。     

乙型肝炎病毒C基因启动子变异的意义

目的了解Ｃ基因启动子区Ｔ１７６２Ａ１７６４变异对其启动子的影响。方法ＰＣＲ产物直接测序,检测重症乙型肝炎患者乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）前Ｃ和Ｃ基因调节序列的Ｔ１７６２Ａ１７６４变异;并将该调节序列插入到氯霉素乙酰转移酶（ＣＡＴ）表达质粒中,转染ＨｅｐＧ２细胞并瞬时表达,比较Ｔ１７６２Ａ１７６４野株及变异株的Ｃ基因启动小区序列及ＣＡＴ表达水平。结果Ｔ１７６２Ａ１７６４变异在使ＣＡＴ表达下调中起主要作用。结论Ｔ１７６２Ａ１７６４变异使Ｃ基因启动子活性下调中起重要作用。     

乙型肝炎病毒前C变异体的体外转录和翻译

目的明确乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）前Ｃ第１７位和２９位密码子突变体对ｅ抗原合成和分泌的影响。方法用ＰＣＲ 方法扩增ＨＢＶ前Ｃ／Ｃ基因区,克隆后测序及进行序列分析。将ＨＢＶ前Ｃ区Ｔ１８６２／Ａ１８９９位点突变体亚克隆人表达 质粒 ｐＧＥＭＴ中,经体外翻译后,比较野毒株和变异株的表达产物。结果该前 Ｃ区突变株在体外仍能合成 ＨＢＶ ｅ前体 蛋白。结论前 Ｃ区 Ｔ１８６２／Ａ１８９９突变并不能阻断 ＨＢＶ ｅ抗原前体蛋白合成,ｅ抗原前体可能在分泌过程中受阻。     

丙型肝炎病毒准种在单个核细胞和肝细胞内的分隔性分布

目的探讨丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）对单个核细胞感染在ＨＣＶ感染慢性化中的作用。方法通过对ＨＣＶ高度变异区（ＨＶＲ）基因的体外扩增后产物的直接测序,比较慢性丙型肝炎和接受肝移植的肝硬化患者血清、外周血单个核细胞（ＰＢＭＣ）、肝脏相关的单个核细胞（ＬＡＭＣ）和肝脏中ＨＣＶ准种（ｑｕａｓｉｓｐｅｃｉｅｓ）的分布。结果（１）３例肝移植和５例慢性肝炎患者ＰＢＭＣ中的主要ＨＣＶ准种不同于肝脏中的ＨＣＶ;（２）３例患者的ＰＢＭＣ和ＬＡＭＣ中ＨＶＲ有不同的基因替代;（３）ＨＶＲ基因的核苷酸突变主要位于Ｅ２基因的前５０个氨基酸内。结论（１）单个核细胞中的ＨＣＶＲＮＡ是由于ＨＣＶ的感染所致;（２）ＨＣＶ准种在肝细胞和单个核细胞中的分隔性分布可能与ＨＣＶ感染的慢性化密切相关。     

沈阳地区乙型肝炎病毒DNA前C区变异研究

用限制性酶切片段长度多态性分析对沈阳地区７０例血清经巢式聚合酶链反应扩增ＨＢＶ ＤＮＡ阳性的乙型肝炎患者的Ｃ基因前Ｃ区１８９６位点进行分析。结果：（１）急性乙型肝有Ｃ区变异检出率为４％（１／２０），慢性迁延肝炎为２５％（５／２０），慢性活动性肝炎为３８％（５／１３），肝硬化为３３％（４／１２）；（２）ＡＬＴ升高组中，ＨＢｅＡｇ及抗ＨＢｅ均阴性患者和ＨＢｅＡｇ阴性，抗ＨＢｅ阳性患者ＨＢＶ ＤＮＡ前Ｃ     

乙型肝炎病毒外膜基因插入变异株及野株的全序列测定和系…

用核酸序列分析技术，测定１例乙型肝炎表面抗原（ＨＢｓＡｇ）阴性中国人感染的乙型肝炎病毒ＨＢＶ／ａｄｗ亚型全基因充列。该变异株一列为３２２４个碱基戌从同一地区２例ＨＢｓＡｇ阳生携带者得到的ａｄｗ和ａｄｒ全序同源性分别为９８．０％和９２．５％，与已出版的Ａ－Ｅ基因组比较，进行了病毒的系统树分析，该变异毒株除在外膜基因Ａ决定族胶有９个碱基插入外，在多种调控元件，包括自动因子ＳＰＬＳＰＩＬＣＰ、ＸＰ、增强     

乙型肝炎病毒核心启动子热点突变与HBeAg存在状态

目的 :研究乙型肝炎病毒 (HBV)核心启动子 (BCP)区 176 2位和 176 4位热点突变对HBeAg存在状态的影响。方法 :采用错配引物的PCR结合限制性内切酶技术检测 90例不同HBeAg状态的HBV无症状携带者的HBVBCP热点突变。结果 :6 0例HBeAg阴性者中HBVBCP热点突变者 2 6例 (4 3.3% ) ,其中 2 0例伴有HBV前C区 (Pre C)区1896位热点突变 ;30例HBeAg阳性者中仅 3例 (10 % )出现HBVBCP热点突变 ;无HBVPre C区热点突变者中 ,19例HBeAg阴性者有 6例存在HBVBCP热点突变 (31.6 % ) ,2 8例HBeAg阳性者仅 2例有HBVBCP热点突变 (7.1% ) ,两组间比较差异具显著性 (P <0 .0 5 )。结论 :HBVBCP热点突变在HBeAg阴性HBV感染者中较常见 ,且常伴有HBVPre C区 1896位突变 ,HBVBCP热点突变可能是HBeAg阴性的另一原因     

乙型肝炎病毒核心启动子热点突变与HBcAg存在状态

目的：研究乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）核心启动子（ＢＣＰ）区１７６２位和１７６４位热点突变对ＨＢｅＡｇ存在状态的影响。方法：采用错配引物的ＰＣＲ结合限制性内切酶技术检测９０例不同ＨＢｅＧａ状态的ＨＢＶ无症状携带者的ＨＢＶＢＣＰ热点突变。结果：６０例ＨＢｅＡｇ阴性者中ＨＢＶＢＣＰ热点突变者２６例（４３．３％）,其中２０例伴有ＨＢＶ前Ｃ区（Ｐｒｅ－Ｃ）区１８９６位热点突变;３０例ＨＢｅＡｇ阳性者中仅３例（１     

慢性乙型肝炎病毒C区基因突变株对干扰素治疗的应答反应

[目的 ]探讨慢性乙型肝炎病毒C区基因突变株对干扰素治疗的应答反应 .[方法 ]对 5 8例慢性乙型肝炎患者用重组干扰素 α(总用量 5 2 2× 10 6U)治疗 .前C区基因停止密码 2 8的突变株由限定酶断片长短的多形性测定 .C区基因的变异是用增殖各患者的 5种乙型肝炎病毒DNA克隆的方法检测 .[结果 ]干扰素疗程结束 6个月后 ,前C区变异株 2 3例中 14例 (6 0 % )乙型肝炎病毒e抗原阴转 ,无变异的野生型 35例中 15例 (4 3 % )乙型肝炎病毒e抗原阴转 ,二组无显著性差异 ,而前C区野生型 35例中C区基因 5个克隆全变异组 (2 4例 )的乙型肝炎病毒e抗原阴转率高于C区基因 5克隆中至少 1个克隆未变异组 (11例 ) (5 8%与 9% ) .[结论 ]感染乙型肝炎病毒变异株的乙型肝炎病毒e抗原阳性患者对干扰素应答良好 ,但这种变异株并不一定非在前C区 ,而C区基因的变异株亦可通过干扰乙型肝炎病毒e抗原的合成和分泌 ,从而影响干扰素的应答反应     

HBV慢性感染者PC/BCP区变异特点及血清检测指标临床意义

目的探讨慢性乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染者前核心区(precore,PC)和基本核心启动子(basalcore promoter,BCP)变异特点以及变异株血清乙肝病毒e抗原(hepatitis B e antigen,HBeAg)、乙肝病毒表面抗原(hepatitis B surface antigen,HBsAg)、乙肝病毒脱氧核酸(HBV-DNA)检测的临床意义。方法采集138例慢性HBV感染者清晨空腹血,以免疫化学发光法检测血清HBeAg、HBsAg,并同时采用磁珠法检测HBV-DNA,应用半巢式聚合酶链反应检测PC/BCP区基因突变。结果 101例未经抗病毒治疗的慢性HBV感染者中,HBeAg阴性组PC、BCP、PC+BCP变异率高于HBeAg阳性组,差异有统计学意义(P0.05)。37例服用核苷类药物一年以上组PC、BCP、PC+BCP检出率要高于未经抗病毒治疗的HBeAg阳性HBV感染者组(P0.05)。HBeAg阴性HBV感染患者其PC、BCP和PC+BCP的变异率随着病程的增加而增加(P0.01)。PC、BCP和PC+BCP变异株组与野生株比较,慢性HBV感染者HBeAg含量减少(P0.05),DNA复制活跃、HBsAg含量增加(P0.01)。结论变异的发生使HBeAg阴性的慢性HBV感染患者越来越多,服用核苷类抗病毒药物和长的疾病病程可能是变异相关因素。对于HBeAg阴转的慢性HBV感染患者观察DNA、HBsAg含量,可了解体内病毒是否确实已被免疫清除。     

HBV 基因T1862突变真核表达载体的构建及在Cos7细胞中的表达

目的研究HBV T1862变异的生物学意义。方法采用分子生物学方法,构建HBV前C/C基因EB病毒真核表达载体,利用体外定点突变技术诱导前C/C基因T1862变异,经PCR-RFLP初筛并经测序终鉴定出阳性克隆后,以脂质体介导方法将突变前后的重组质粒转染Cos7细胞, 以ELISA 检测HBeAg的表达量。结果未突变的重组质粒可稳定表达HBeAg,突变后的重组质粒未能检测到HBeAg表达。结论 HBV前C/C基因1862点突变的真核表达载体的构建,为体外研究该点突变引起HBV的一系列生物学改变奠定基础。     

乙型肝炎病毒基因多态性检测芯片的临床应用

目的:评价临床应用乙型肝炎病毒(HBV)基因多态性芯片(中科院上海微系统和信息技术研究所等研制),检测HBV基因前C区1896、1814,基本C区启动子(BCP)1762和1764,P区的YMDD基序552位等的点突变的效能。方法:以该芯片检测49例不同临床类型乙型肝炎病人血清,并对部分血清的PCR扩增产物进行测序分析。结果:HBV前C区1896位在血清HBeAg阳性病例中,野生株、混合(野生/突变)株、突变株和未确定(无杂交信号)的检出率,分别为57.7％,38.5％,0和3.8％;血清抗HBe阳性病例中,相应为33.3％,22.2％,33.3％和11％,后者突变株显著高于前者(P<0.01)。所有病例HBV前C区的1814位均为野生,未检出突变。BCP 1762和1764双突变在慢性重型肝炎和肝炎肝硬化的检出率分别为66.7％和69.2％,显著高于慢性肝炎的19%(P<0.01)。10例拉米夫定治疗6月以上,HBV DNA仍阳性者中,7例检出P区YIDD或YVDD突变,1例兼有YIDD和YVDD突变,余2例无杂交信号。7例1 896,4例BCP,6例YMDD的测序和芯片检测结果一致,6例无信号位点的测序结果显示,这些位点附近,出现了与杂交探针错配的突变。结论:初步结果提示,该芯片适用于临床检测HBV前C区、P区一些已知热点的突变,并可用于研究这些突变与疾病严重性,及产生抗HBV药物耐药间的相互关系。     

乙型肝炎病毒核心启动子缺失变异对病毒抗原表达的影响

目的为研究乙型肝炎病毒(HBV)核心启动子(CP)20/21bp部分缺失(nt1748/1747至nt1767)及同时存在的A1896点变异对病毒抗原表达的影响。方法利用前期构建的HBV全基因的重组载体转染HepG2细胞后,对病毒抗原进行ELISA检测及Western-blotting分析。结果变异株分泌到细胞外的HBsAg、HBeAg及细胞内的HBcAg表达量较野毒株均明显减少。结论HBVCP20/21bp部分缺失株及同时存在的A1896点变异株的病毒抗原表达较野毒株显著下降。     

慢性HBV感染患者bcp/pc区点突变模式、pres区缺失及其临床意义

目的阐明HBV(hepatitis B virus,HBV)感染患者不同临床阶段bcp/pc(basic core promoter,BCP/precore,PC)点突变模式及pres区缺失突变规律,并探讨其临床意义。方法慢性HBV感染患者180例,其中,无症状HBV携带者13例,慢性乙型肝炎者75例,HBV相关肝硬化及肝癌分别为62、30例。Qiagen法提取血清HBV-DNA,常规PCR扩增目的基因,纯化PCR产物ABI377DNA自动测序仪直接双向测序。直接测序失败者,回收目的 DNA与PMD-18T载体连接,克隆质粒双向测序。DNAStar软件包的SeqMan软件进行生物信息分析。结果 Bcp/pc区点突变包括nt1753、nt1762、nt1764、nt1776、nt1803、nt1846、nt1896。HBV携带者、慢性乙型肝炎、HBV相关肝硬化及肝癌患者nt 1762(nt 1764)点突变率分别为7.7%、68.0%、72.7%(68.0%)及90.9%(81.8%),肝癌患者G1896A突变频率占54.6%。A1762T+G1764A联合突变占36%;A1762T、G1764A、G1896A联合突变占11%;T1753A/C、A1762T、G1764A、G1896A发生率为7%。克隆测序显示,肝硬化及肝癌患者bcp区起始点A1727G点突变率分别为72%、63%。HBeAg阴性患者存在更多的基因变异(P=0.022),G1776A和G1896A突变是HBeAg阴性的独立预测因素(P<0.05)。Bcp区点突变与HBeAg阴性无明显关系。肝硬化和肝癌患者pres基因缺失突变频率最高,肝癌及肝硬化患者pres1、pres2及pres1+s2缺失频率分别为7.1%、71.4%、7.1%及41.2%、58.8%、29.4%(P<0.05)。结论 A1727G、A1762T、G1764A及A1762T/G1764A联合突变、pres缺失在HBV相关肝硬化及肝癌患者多见,可能是肝脏疾病进展的危险因素,G1776A和G1896A突变是HBeAg阴性的独立预测因素。Bcp/pc点突变及pres区缺失可能为肝癌发生的早期预测因素,值得进一步研究。     

慢性乙肝病毒感染者HBV DNA前C区A83基因突变的研究

用错配聚合酶链反应（Ｍ－ＰＣＲ）及限制性片段长度多态性分析（ＲＦＬＰ）方法，对９７例慢性乙肝病毒感染（ＨＢＶ）者血中ＨＢＶ ＤＮＡ前Ｃ区Ａ８３基因突变进行检测。结果显示：共检出Ａ８３基因突变株感染３７例（３８．１％），其中重症肝炎和重度生肝炎患者的检出率均明显高于轻度慢性肝炎和ＨＢＶ携带者；ＡＬＴ明显升高者的检出率明显高于ＡＬＴ明显升高者的检出率明显高于ＡＬＴ正常或升高不明显者；ＨＢｅＡｂ（＋）者     

乙型肝炎病毒核心启动子缺失变异对病毒抗原表达的影响

目的：为研究乙型肝炎病毒（HBV）核心启动子（CP）20／21bp部分缺失（nt1748/1747至nt1767)及同时存在的A1896点变异对病毒抗原表达的影响。方法：利用前期构建的HBV全基因的重组载体转染HepG2细胞后,对病毒抗原进行ELISA检测及Western-blotting分析。结果：变异株分泌到细胞外的HBsAg,HBeAg及细胞内的HBcAg表达量较野毒株均明显减少。结论：HBV CP20／21bp部分缺失株及同时存在的A1896点变异株的病毒抗原表达较野毒株显著下降。