基于网络药理学和分子对接研究三仁汤治疗肺癌的分子机制

目的：采用网络药理学方法筛选三仁汤君药药对（SRJMP）的活性成分及核心靶点，探讨三仁汤君药药对治疗肺癌的作用机制。方法：依托中药系统药理学分析平台（TCMSP），检索三仁汤 3 味中药相关的所有化学成分及预测作用靶点，采用STRING 数据库与 Cytoscape 软件构建“药物-活性成分-靶点”网络和蛋白互作网络，通过 ClusterProfiler、ClueGO、DAVID 数据库对核心靶点进行基因本体（GO）分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集。把候选作用靶点映射在 KEGG 通路图上分析结果，最后应用 AutoDock 软件进行分子对接。结果：共筛选出 40 个活性成分和 222 个相应蛋白靶点。首要分析核心靶点47 个，GO 分析共包含 117 条富集结果，KEGG 通路富集筛选出 30 条通路。结论：通过网络药理学验证了 SRJMP 多成分、多靶点、多通路的特点，其可能是通过调控免疫细胞分化，肿瘤相关信号通路以及干预细胞代谢过程，达到抗肿瘤作用。     

基于网络药理学预测“人参-五味子”药对治疗肺癌的作用机制

目的基于网络药理学方法预测"人参-五味子"配伍对防治肺癌的可能作用机制。方法依托TCMP数据库及平台,检索人参-五味子中药化学成分、作用靶点,并通过TCGA数据库获取肺癌差异基因,预测药对中肺癌相关的作用靶点,构建"化合物-靶点"网络模型。通过STRING平台构建蛋白互作网络(PPI),将筛选出的核心靶点提交到DAVID数据库进行基因富集分析,获得GO生物功能及KEGG信号通路注释结果,构建的"靶点-通路"网络。结果共筛选出29个候选活性成分,180个化合物靶点,39个肺癌相关潜在靶点;蛋白互作网络模型中,筛选出21个关键靶蛋白,基因富集分析显示,21个核心靶点涉及61个GO生物功能条目,包括:生物过程条目32个,细胞组成条目8个,分子功能条目21个;涉及KEGG信号通路共14条,涉及固醇类激素的合成、代谢途径、细胞色素P450代谢及钙信号通路。结论 "人参-五味子"配伍通过调控机体激素及致癌物质代谢、免疫耐药、炎症反应,对肺癌发生、转移及耐药发挥防治作用。     

基于网络药理学和分子对接探究枸杞子-菟丝子“异病同治”2型糖尿病性骨质疏松症和肾病综合征的作用机制

目的：运用网络药理学方法探讨枸杞子-菟丝子“异病同治”2型糖尿病性骨质疏松症（DOP）和肾病综合征（NS）的作用机制。方法：通过TCMSP数据库筛选枸杞子-菟丝子的主要活性成分和作用靶点,利用UniProt数据库及Perl语言进行规范以及转化为标准基因名称,利用Cytoscape3.9.1软件构建药物-活性成分-靶点网络。通过GeneCards、OMIM及PharmGkb数据库搜集DOP和NS相关疾病靶点,将疾病靶点与药物靶点取交集,通过STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用网络并筛选核心蛋白;对交集蛋白运用Rx4.1.3软件及R脚本进行GO功能富集和KEGG通路分析,运用Autodock 4.2软件进行分子对接。结果：筛选后得到枸杞子-菟丝子活性成分42个,作用靶点208个;DOP、NS疾病靶点分别为2834个、2114个,共有靶点915个,疾病和药物交集靶点86个。GO富集分析得到分子功能121条;KEGG通路富集分析获得126条信号通路,靠前的通路为糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、IL-17信号通路,...     

“远志-石菖蒲”药对治疗阿尔茨海默病的作用机制研究

目的:研究"远志-石菖蒲"药对治疗阿尔茨海默病的网络药理学作用机制。方法:采用网络药理学方法筛选远志、石菖蒲中的活性成分,并获取药物活性成分靶点与阿尔茨海默病的靶标蛋白。构建药物活性成分-阿尔茨海默病靶标网络,对靶点进行基因本体(GO)富集分析及基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果:远志-石菖蒲药对中共筛选出有效成分12个,相关靶标40个;筛选得到阿尔茨海默病相关靶点14个;富集分析结果筛选通路得到KEGG分析5条,GO分析2条。通路分析结果结合参考文献表明,远志-石菖蒲治疗阿尔茨海默病主要通过PI3K-Akt信号通路、ErbB信号通路、雌激素信号通路等发挥作用。结论:"远志-石菖蒲"药对治疗阿尔茨海默病具有多成分、多靶点、多途径的特点。该研究结果可为该药对的临床应用和进一步应用提供参考,并为进一步研究其治疗阿尔茨海默氏病(AD)的机理奠定基础。     

基于网络药理学探讨益智仁-乌药治疗糖尿病肾病的有效成分及作用机制

目的基于网络药理学探讨益智仁-乌药治疗糖尿病肾病的有效成分及作用机制。方法运用多个在线数据库查找并筛选益智仁和乌药的活性成分、益智仁和乌药活性成分作用的相关靶点、糖尿病肾病相关的基因;通过UniProt数据库查询靶点对应的基因名;运用Cytoscape 3.2.1构建益智仁-乌药药对化合物对应靶基因网络;运用韦恩图筛选活性成分对应靶点与疾病相关基因的交集基因,并将交集的基因构建蛋白互作关系(PPI)网络;最后用DAVID的数据库对交集的基因做GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析,并将GO与KEGG的结果进行可视化处理。结果共筛选出10个潜在活性成分和相应的108个靶蛋白;益智-乌药药对潜在活性成分靶点与DN的相关基因共有36个交集基因;交集蛋白之间相互作用关联度排名前十的包括:AR与NCOA2、NCOA2与PPARG及NR3C1与NCOA2等;分子功能(MF)的条目有15条、细胞成分(CC)的条目有12条、生物过程(BP)的条目有48条及信号通路有19条(P<0.05)。结论益智仁-乌药通过多成分、多靶点及多环节的协同作用治疗DN。     

桂枝-柴胡治疗慢性心衰伴抑郁的网络药理学研究

目的:运用网络药理学方法挖掘桂枝-柴胡治疗慢性心力衰竭(CHF)伴抑郁(MDD)的主要活性成分、靶点及信号通路,探究其潜在作用机制.方法:通过TCMSP数据库和相关文献检索桂枝-柴胡主要活性成分及其作用靶点,经BAT-MAN-TCM平台对预测靶点予以补充,构建药物靶点库;通过GeneCards、DisGeNET数据库分别获取CHF与抑郁相关靶标,二者取交集,建立疾病靶标库;利用R语言将药物靶点库与疾病靶标库取交集,构建Venn图;通过STRING数据库和Cytoscape 3.7.1软件及其内在插件构建化合物-靶标网络及PPI核心网络;最后利用DAVID数据库对核心网络靶点进行GO富集和KEGG通路注释分析.结果:筛选出桂枝-柴胡有27个活性成分,288个靶基因;筛选出CHF伴MDD相关靶基因882个,药物与疾病Venn图提取关键靶点83个,PPI核心网络构建筛选出12个关键基因;GO分析(P＜0.05且靶点基因富集度＞10％)得到19条生物过程,13条细胞组分表达过程,8个分子功能相关过程;KEGG分析(P＜0.05)显示72条信号通路,包括HIF-1信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、神经活性配体-受体相互作用信号通路等.结论:桂枝-柴胡活性成分通过多成分、多靶点、多通路发挥CHF伴MDD的治疗作用.     

基于网络药理学的苓桂术甘汤治疗阿尔茨海默病的潜在作用机制研究

目的利用网络药理学技术研究苓桂术甘汤治疗阿尔茨海默病(AD)的潜在作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)、Swiss、SuperPred和Stitch数据库寻找与苓桂术甘汤中4味中药相关的化学成分及其作用靶点,并以口服利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为阈值对化合物进行筛选,再通过文献查找加以补充;通过OMIM、TTD、GAD、Pharm Gkb数据库获取与AD疾病相关的靶标,并进一步筛选得到苓桂术甘汤治疗AD的潜在作用靶点;采用DAVID6.8数据库对相关潜在作用靶点进行GO分析及KEGG代谢通路富集分析;利用Cytoscape软件构建"单味药-活性成分-作用靶点"相互作用网络并进行度值和中介度分析,确认可能的关键靶点和关键通路。结果在苓桂术甘汤中,共筛选出126个与AD相关的潜在活性成分和120个潜在作用靶点;GO生物功能分析共包含565条富集结果,其中生物过程396条,分子功能121条,细胞组成48条,主要涉及蛋白结合、细胞、氧化还原过程等;KEGG富集得到67条代谢通路,主要包括神经活性配体-受体相互作用通路、癌症通路、5-羟色胺能突触通路和钙信号通路等。结论网络药理学研究结果揭示了苓桂术甘汤治疗AD的多成分、多靶点、多途径的作用特点,并预测了其可能的活性成分、作用通路和关键靶点,为其药效物质基础和作用机制研究提供了理论基础。     

湖南二号方调节机体免疫防治新型冠状病毒肺炎的网络药理学研究

目的:应用网络药理学方法探究湖南二号方通过增强免疫力防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19感染的作用与机制。方法:通过TCMSP等数据库筛选湖南二号方主要有效成分和潜在治疗靶点,通过GeneCards等数据库获取疾病基因,并将药物相关靶点与疾病靶点相互映射,通过Cytoscape3.8.0可视化筛选出核心基因,对共有靶点进行蛋白质相互作用网络构建、GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果:湖南二号方中药-成分-靶点-疾病网络包括5味中药、99种活性成分和73个疾病靶点。其中湖南二号方治疗新型冠状病毒肺炎的靶点主要包括IL-6、VEGFA、ALB、CXCL8、MMP9和AKT1等。GO功能富集分析共得到条目1962个,主要涉及氧化应激反应和活性氧代谢过程等。KEGG通路富集分析筛选出145条信号通路,包括HIF-1、PI3K-Akt、TNF等信号通路。结论:湖南二号方中的槲皮素、山奈酚、异鼠李素活性成分可能通过介导HIF-1、IL-17等多条信号通路影响IL-6、VEGFA、ALB、CXCL8等靶蛋白的表达,发挥防治COVID-19的作用。     

基于网络药理学和分子对接研究麻黄-五味子药对治疗肺纤维化的作用机制

目的：研究麻黄-五味子药对治疗肺纤维化的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台及文献补充收集麻黄-五味子的化学成分，利用Swiss Target Prediction平台预测成分相关靶标；采用MalaCards、TTD、OMIM及PharmGKB数据库收集肺纤维化相关靶蛋白，并与成分靶标比对，筛选潜在治疗疾病的交集靶标，进行京都基因和基因组数据库代谢通路富集和基因本体论生物功能分析，构建成分-靶标-通路网络。采用分子对接法验证该药对潜在活性成分与核心靶蛋白的相互作用。结果：从麻黄-五味子中共筛选得到62个活性成分对应1 022个靶标；与肺纤维化疾病匹配后得到37个共有靶标，涉及趋化因子受体、肿瘤坏死因子、基质金属蛋白酶等靶标，以及肿瘤坏死因子信号通路、缺氧诱导因子1信号通路、松弛素信号通路等相关通路。分子对接结果表明麻黄-五味子药对中的活性成分与关键靶标蛋白具有较强的结合能力。结论：麻黄-五味子药对治疗肺纤维化具有多靶标、多通路协同作用的特点。     

基于网络药理学和分子对接技术研究黄芪-白花蛇舌草治疗非小细胞肺癌的作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接技术，探讨黄芪-白花蛇舌草抗非小细胞肺癌(NSCLC)的潜在活性成分和作用机制。方法：利用TCMSP和Uniprot数据库获取黄芪-白花蛇舌草的主要活性成分及靶点基因；GeneCards、OMIM数据库获取NSCLC靶点基因；绘制韦恩图得到疾病和活性成分共同靶点；STRING数据库构建中药成分靶蛋白-疾病靶蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络；Cytoscape 3.9.1软件绘制成分-靶点网络图，通过网络拓扑分析筛选出关键靶点及成分；DAVID数据库及Bioinformatics平台进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析；PyMol软件和AotoDock软件绘制相应的分子对接图。结果：经筛选共得到653个黄芪-白花蛇舌草活性成分靶点和6178个疾病靶点，两者交集靶点154个。GO功能富集到747个生物过程、83个分子功能和150个细胞组分，KEGG通路富集分析得到167条信号通路。分子对接结果显示，PTGS1蛋白与活性成分槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素均结合稳定。结论：黄芪-白花蛇舌草可能通过槲皮素、山柰酚、芒柄花黄...     

从OPG/RANKL/RANK系统阐述补骨脂-蛇床子抑制乳腺癌骨转移的机制

目的 从OPG/RANKL/RANK系统探讨不同比例补骨脂-蛇床子抑制乳腺癌骨转移的机制,发掘补骨脂-蛇床子抑制乳腺癌骨转移最佳配伍比例。     

蛇床子止痒有效组分筛选及作用机制研究

目的:筛选蛇床子止痒的有效组分,并探讨其作用机制.方法:采用磷酸组胺致豚鼠瘙痒及低分子右旋糖酐致小鼠瘙痒模型,分别观察蛇床子醇提物、水提物及挥发油的止痒作用;通过其对组胺致离体回肠收缩的影响,探讨其作用机制.结果:蛇床子醇提物及挥发油可显著提高磷酸组胺致豚鼠致瘁闲,减少低分子右旋糖酐致小鼠瘙痒次数,缩短瘙痒时间,而水提物止痒作用不明显.醇提物及挥发油均能抑制磷酸组胺致离体回肠的收缩幅度.结论:蛇床子止痒的有效组分为其醇提物及挥发油,其止痒机制与拮抗组胺的释放相关.     

牛蒡子抗肿瘤活性成分及作用机制研究进展

牛蒡子是临床常用中药,具有抗肿瘤、抗病毒、抗炎、降血糖等多种药理作用。现代研究表明,木脂素类成分是牛蒡子中的主要抗肿瘤活性成分,其主要抗肿瘤作用机制包括:抑制肿瘤细胞增殖、诱导肿瘤细胞凋亡、直接细胞毒作用、抗肿瘤细胞转移、免疫增强作用、诱导分化作用以及抗突变作用等。对牛蒡子抗肿瘤主要活性成分及作用机制进行了综述,为牛蒡子在抗肿瘤方面的临床应用提供依据。     

五味子对CYP450活性的影响及其机制探讨

五味子为木兰科五味子属植物五味子Schisandra chinensis（Turcz.） Baill.的干燥成熟果实,在临床上主要用于与其他药物的联合治疗,研究其药物-药物相互作用对于今后的临床应用意义重大。本文对相关文献进行归纳,分析了五味子生药及其中主要活性成分木脂素对CYP450酶活性的作用,并对其作用途径进行了初步推测。结果表明,五味子中主要木脂素类成分甲素、乙素、醇乙于3个水平影响CYP450的活性分别为诱导CYP450基因表达、诱导CYP450 mRNA翻译及直接作用于酶蛋白并抑制蛋白活性。这3个水平的作用于宏观表现为五味子对CYP450活性的双重作用。6、9位亲脂取代基或者大基团取代基是抑制CYP450活性的结构基础。     

基于网络药理学探讨鸦胆子对肺癌的作用机制

目的：采用网络药理学方法探讨鸦胆子对肺癌的作用机制。方法：通过检索中药系统药理学数据库（TCMSP）提取鸦胆子的有效成分及其相关作用靶点；检索GeneCards和OMIM数据库提取肺癌疾病靶点；采用STRING数据库构建蛋白互作网络，Cytoscape构建化合物-靶点网络以及化合物-靶点-生物过程-通路网络，DAVID数据库对靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果：检索TCMSP得到并通过OB值和DL值筛选得到有效成分15中，有效靶点44个。检索GeneCards数据库和OMIM数据库得到疾病靶点21 729个，将化合物靶点与疾病靶点相映射得到交集靶点39个。将结果导入Cytoscape软件，构建“化合物-靶点”网络；再构建“药物-化合物-靶点-疾病”网络。将关键靶点导入STRING数据库，构建蛋白互作网络，其中度值较高且处于较核心位置的靶点有CASP3、CCND1、EGFR、IL6、AR等。再对39个关键靶点进行富集分析，结果显示鸦胆子治疗肺癌的关键靶点共富集为7个生物过程聚类，涉及58个条目，经过筛选剩余9个生物过程。对鸦胆子治疗肺癌的39个关键靶点进行通路富集，结果显示共有7个富集的通路聚类，涉及62个条目，经过筛选剩余12条通路。结论：鸦胆子治疗肺癌的临床疗效确切，基于数据库的机制分析也证实它不仅可以治疗小细胞肺癌，同时也可以作用于非小细胞肺癌。     

基于网络药理学的女贞子-黄芪药对的抗癌机制

目的:筛选女贞子-黄芪药对抗癌治疗的主要活性成分,预测活性成分的作用靶点,建立药物成分-活性成分-作用靶点网络,进一步探讨女贞子-黄芪药对抗癌治疗的潜在作用机制。方法:采用中药系统药理学技术平台(TCMSP)中筛选女贞子-黄芪的潜在活性成分,采用Dis Ge NET数据库与人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)预测和筛选其治疗癌症的作用靶点,采用omicshare平台(http://www. omicshare. com/)对药物靶点和疾病靶点进行匹配。借助Cytoscape软件构建"药物-活性成分-关键作用靶点"网络。采用String数据库构建蛋白质相互作用网络。采用DAVID数据库对女贞子-黄芪关键作用靶点进行生物功能及代谢通路分析。结果:通过筛选得到33个药物活性成分,共涉及203个作用靶点,与疾病靶点有关的活性成分为14个,主要通过调控ERBB2,AR,SRC,EGFR,ESR1等靶蛋白及癌症中的蛋白多糖通路、癌症通路、癌症中的微小mRNA(micro RNA)等通路等发挥抗癌治疗作用。结论:女贞子-黄芪药对对癌症的治疗作用体现了中药多成分-多靶点-多途径的特点,为阐释其抗癌治疗的作用机制与物质基础提供了科学依据。     

基于网络药理学探讨黄连-吴茱萸治疗胃癌的作用机制

目的:筛选黄连-吴茱萸配伍对胃癌治疗的主要活性成分,预测两者共同活性成分的作用靶点,建立药物活性成分-靶基因网络,进一步探讨药对黄连-吴茱萸对胃癌治疗的潜在作用机制。方法:采用中药系统药理学技术平台(TCMSP),筛选黄连-吴茱萸的潜在活性化学物质,借助基因组注释(Genecards)数据库平台,预测和筛选胃癌的作用靶点,采用Cytoscape(3. 7. 1)软件,构建"药物-活性化学物质-疾病-作用靶点"网络图,借助String数据库平台构建蛋白质相互作用网络。最后利用Bioconductor平台和R语言进行基因本体(GO)富集分析和基因相互作用(KEGG)通路分析。结果:通过筛选,得到黄连的潜在活性成分14个,吴茱萸的潜在活性成分15个,共涉及与胃癌相关作用靶点127个。黄连-吴茱萸-胃癌共同靶点33个,主要通过调控PTGS2,PTGS1,AR,RXRA,NOS2等靶基因及细胞凋亡,p53信号通路,白细胞介素(IL)-17信号通路等发挥对胃癌的治疗作用。结论:黄连-吴茱萸对胃癌的治疗作用体现了中药多成分-多靶点的特点,阐明了药对黄连-吴茱萸对胃癌治疗的作用机制与物质基础的科学内涵。     

诃子对川楝子所致肝毒性的减毒作用机制初探

目的:初步探讨诃子缓解川楝子所致肝毒性的作用机制.方法:以含有诃子和川楝子的复方三子汤中的药物为示例,将全部64只SD大鼠随机分为正常组、三子汤组、川楝子组、栀子组、诃子组、川楝子加诃子组、川楝子加栀子组和诃子加栀子组,每组8只.除正常组外,其余各给药组灌胃相应的药物溶液,连续给药21 d.观察各组药物对该组大鼠肝功能...     

补骨脂肝损伤机制及减毒方法研究进展

补骨脂为豆科植物补骨脂Psoralea corylifolia的干燥成熟果实。性温,味辛、苦,归肾、脾经。主要功效为温肾助阳、纳气平喘、温脾止泻等;外用可消风祛斑。临床上主要用于治疗肾虚阳痿、腰膝酸软冷痛、白癜风等。目前已有的研究表明补骨脂具有抗肿瘤、抗氧化、抗菌、抗炎、促进骨骼生长、保护心血管等多种药理作用。但同时,较多的国内外研究发现,长时间或大剂量服用补骨脂及其复方可导致肝损伤、光损伤、肾损伤等,其中最为常见的则是补骨脂致肝损伤,关于补骨脂致损伤的临床报道大部分均为致药物性肝损伤事件,这使得补骨脂在临床中的使用受到了限制,从而不能很好地发挥其应有的治疗作用。因此,充分了解补骨脂产生肝损伤的机制及减毒方法尤为重要。该文通过查阅近年来国内外报道补骨脂产生肝损伤的相关文献,对补骨脂致肝损伤临床报道、肝损伤成分、毒理机制及减毒方法4个方面进行综述,分别从胆汁酸淤积、氧化应激反应、线粒体损伤、肝脂肪变形等方面对补骨脂的肝损伤进行了论述,并从配伍减毒与炮制减毒等方面对补骨脂致肝损伤的减毒方法进行总结,旨在全面客观地阐明补骨脂致肝损伤的潜在机制和减毒方面的研究进展,以期为补骨脂致肝损伤的进一步研究及临床合理用药提供理论依据。     

基于网络药理学的佛手干预2型糖尿病潜在靶点机制研究

目的 基于网络药理学方法研究佛手干预2型糖尿病（type 2 diabetes mellitus，T2DM）的潜在作用靶点。方法 利用TTD数据库、Drugbank数据库、OMIM数据库和DisGeNET数据库筛选T2DM相关基因，借助 TCMSP 数据库筛选佛手有效化学成分作为候选药效成分，通过 COXPRESdb 数据库及 STRING 筛选关键蛋白，运用 Cytoscape 3.7.1软件构建疾病-药效成分-靶点-通路关系网络，使用 DAVID 6.8数据库进行基因本体（gene ontology，GO）功能富集分析和KEGG通路富集分析，通过Vina将佛手候选药效成分与关键蛋白进行分子对接。结果 ①筛选得到181个疾病靶点候选基因、佛手6种有效成分、药效成分和疾病相关的25个关键蛋白，构建疾病-药效成分-靶点-通路关系网络；②GO功能富集分析得到 GO条目 57个（P ≤ 0.05），其中生物过程条目43个，分子功能条目10个，KEGG通路富集得到10条通路（P ≤ 0.05）；③选取10个关键蛋白与佛手6个药效成分进行分子对接，结果显示其结合稳定。结论 通过网络药理学研究发现，佛手通过6种有效成分，影响25个潜在靶点、10条相关通路，调节胆固醇生物合成和胰岛素分泌功能干预T2DM，为佛手作为“调肝启枢化浊”法主要药味治疗糖脂代谢病提供了依据，为其进一步的临床应用和深入研究开发提供了思路和线索。